CuGenDBv2

Gene ID	Spg000792
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	scaffold8:47296416..47300270
RNA-Seq Expression	Spg000792
Synteny	Spg000792
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAG6570379.1 hypothetical protein SDJN03_29294, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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A0A0A0L1X8 Uncharacterized protein

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        MPMDR+QA+SESPS+RL+VLSIEC+KGSSRADEWTGDMLQTGDIVEELTIGSSLCVR+PFKNGRSGIQ+ILH SFKDKQTSIVVRVRRG DEFSELQACI
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Query:  VPNDSAGKKQYVLRSITDPNYVVGFLDRTESECFDLQGNVKIAASRSDRMVSALARTRLQDGYVSYHWERRMHDSLSVPYSSSFLSILLLPKAANEVATR
        VPNDS GKKQYVLRSITDPNYVVGF+DRTESECFDLQ      ASRSDRMVSAL R+RLQDGYVSYHWERRMH+SLSVP SSSFLSILLLPKAANEVATR
Subjt:  VPNDSAGKKQYVLRSITDPNYVVGFLDRTESECFDLQGNVKIAASRSDRMVSALARTRLQDGYVSYHWERRMHDSLSVPYSSSFLSILLLPKAANEVATR

Query:  YNDLEDTLARANAWLNSAQSTGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYSPLGGELPIEIKLKE
        YNDLEDTLARANAWLNSAQ+TGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWY+PLGGELPIEIKLKE
Subjt:  YNDLEDTLARANAWLNSAQSTGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYSPLGGELPIEIKLKE

Query:  GDSKLGFSIGRTEEGFIYVSAVDEDDNAPSTRSGLNHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVPIFLHVFLWD
        GDSKLGFSIGRTEEGFIYV+AVDED N+PSTRSGLN+LYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVPIFLH+FLWD
Subjt:  GDSKLGFSIGRTEEGFIYVSAVDEDDNAPSTRSGLNHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVPIFLHVFLWD

Query:  RELLASLTSPAPIRQRPTASQPAAPARLALPAEVQLARQPNDNQIQPLPADVFSETGSVSTDESSERTERNAAGELSFRFHEFSLSSNW
        REL+ASL + A  RQRPTASQPAAP RLALPAEVQL RQPNDNQIQPLPAD FSE+G+VSTDESS RTER+AAGELSFRFHEFSLSSNW
Subjt:  RELLASLTSPAPIRQRPTASQPAAPARLALPAEVQLARQPNDNQIQPLPADVFSETGSVSTDESSERTERNAAGELSFRFHEFSLSSNW

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G12070.1 unknown protein

9.5e-162

61.32

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Query:  MDRIQATSESPSSR---LMVLSIECIKGSSRADEWTGDMLQTGDIVEELTIGS---SLCVRSPFKNGRSGIQKILHASFKDKQTSIVVRVRRGRDEFSEL
        MDR     ESP++R    +VLSI+C+KGSS+++EW+GDMLQTGDIVEE+ IGS   S   ++PFK G++ +QK+LH SF++K+TSIVVRVRRG D+FS+L
Subjt:  MDRIQATSESPSSR---LMVLSIECIKGSSRADEWTGDMLQTGDIVEELTIGS---SLCVRSPFKNGRSGIQKILHASFKDKQTSIVVRVRRGRDEFSEL

Query:  QACIVPNDSAGKKQYVLRSITDPNYVVGFLDRTESECFDLQGNVKIAASRSDRMVSALARTRLQDGYVSYHWERRMHDSLSVPYSSSFLSILLLPKAA--
         ACIVPN+SAGK+QY+LRSI DPNY VGF DRTES+C  LQ       SR  RMV AL + +LQDGYVSY WERRM ++L +  SS+FLSIL LPKA+  
Subjt:  QACIVPNDSAGKKQYVLRSITDPNYVVGFLDRTESECFDLQGNVKIAASRSDRMVSALARTRLQDGYVSYHWERRMHDSLSVPYSSSFLSILLLPKAA--

Query:  NEVATRYNDLEDTLARANAWLNSAQSTGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYSPLGGELPI
            +RYNDLEDTLARANAWL+ +Q+ GVPIVFMNIQTESLLTKISG+TAS+TV+  SLSDLSNLAN SLYGFEDYHGVDIGVVR+VRLW++PLG E P+
Subjt:  NEVATRYNDLEDTLARANAWLNSAQSTGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYSPLGGELPI

Query:  EIKLKEGDSKLGFSIGRTEEGFIYVSAV--DEDDNAPSTRSGLNHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVPI
        EIKLK+ D+KLGFSI RTEEGFIYVS+V   ED++AP+ RSGL+ LY+EA  AS+ L++SRV NQKVLPW+VSSTGAIRC+DTVSLSQKLSLHRHAKV I
Subjt:  EIKLKEGDSKLGFSIGRTEEGFIYVSAV--DEDDNAPSTRSGLNHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVPI

Query:  FLHVFLWDRELLASLTSPAPIRQRPT----ASQPAAPARLALPAEVQLARQPNDNQIQPLPADVFSETGSVSTDESSERTERNAAGELSFRFHEFSLSS
         LHVFLWD    A  +SP       T    +++           EV   RQ  D Q+ PLP            DE   R ER  AG  SF+F E   ++
Subjt:  FLHVFLWDRELLASLTSPAPIRQRPT----ASQPAAPARLALPAEVQLARQPNDNQIQPLPADVFSETGSVSTDESSERTERNAAGELSFRFHEFSLSS

Sequences

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CDS sequence

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ATGCCCATGGACCGAATCCAGGCAACCTCCGAGTCTCCGAGCAGCCGGCTCATGGTTCTGTCCATCGAATGCATCAAAGGAAGCTCACGCGCCGACGAGTGGACCGGCGA
CATGCTTCAGACCGGCGACATAGTCGAGGAGCTGACCATCGGCTCCTCTCTCTGCGTCAGATCCCCTTTCAAGAACGGCCGCTCCGGAATTCAAAAAATCCTTCACGCTT
CCTTCAAGGATAAGCAGACCTCCATCGTCGTCCGTGTCCGGCGAGGCCGAGACGAGTTCTCCGAGTTGCAGGCCTGTATTGTCCCCAACGACTCGGCCGGCAAAAAGCAG
TACGTCCTACGCTCCATCACTGACCCGAACTACGTGGTCGGGTTCCTGGATCGAACCGAGTCCGAATGCTTCGACCTTCAAGGTAATGTGAAAATTGCAGCATCTCGGAG
TGACAGAATGGTGAGTGCATTGGCAAGAACAAGGCTTCAAGATGGATATGTATCGTATCACTGGGAAAGAAGAATGCACGATTCGCTCTCTGTTCCATATTCCAGCTCTT
TTCTTTCCATTCTTCTTCTCCCAAAAGCTGCTAATGAAGTTGCCACTCGCTACAATGATTTGGAAGACACCCTTGCCAGAGCCAATGCTTGGCTCAATTCAGCTCAGTCC
ACTGGCGTTCCAATTGTCTTTATGAACATTCAAACTGAGTCCCTCTTGACAAAGATATCTGGAGATACAGCTTCTTCCACCGTGAGTGCTGGTTCCTTGTCTGATTTGTC
CAATCTCGCCAATGCCAGTCTCTACGGTTTTGAAGACTACCATGGGGTCGATATCGGTGTGGTTCGATCTGTTCGTCTATGGTATTCTCCTCTCGGAGGTGAGCTTCCCA
TTGAGATCAAGCTAAAAGAAGGAGATTCAAAGCTGGGGTTTTCCATTGGTCGCACGGAAGAGGGATTCATCTATGTTTCAGCGGTGGATGAAGATGACAATGCGCCATCT
ACAAGGTCAGGGCTGAACCATCTGTACAAGGAAGCTGAAAATGCATCAAAATTACTTATAATCTCAAGGGTTTCGAATCAAAAGGTTCTTCCATGGATAGTATCTTCAAC
AGGCGCAATTCGATGCTTTGACACAGTTTCACTCAGCCAGAAGCTGTCGTTGCACAGGCACGCCAAGGTCCCAATCTTCTTGCACGTCTTTTTGTGGGACAGAGAATTGT
TGGCTTCTTTAACCAGCCCCGCCCCAATTAGGCAAAGACCCACGGCGTCGCAGCCGGCGGCTCCGGCGCGATTGGCCTTGCCTGCAGAGGTTCAGTTGGCTCGCCAACCA
AATGATAACCAAATACAGCCACTGCCGGCGGATGTGTTCAGTGAGACTGGAAGCGTGAGTACTGACGAGTCGTCGGAAAGAACAGAACGAAACGCTGCCGGTGAACTTTC
CTTCAGATTTCACGAATTTTCCCTATCGAGCAACTGGTTTCCTGATGAGAAGCTCAGTACTCTTCTGGTACTTACGGATCTCTCTCAAAGCCACCGTCCCTGGCCTGAAC
CTGTGTGGCTTCTTCACTCCGCCGGTGGCCGGAGCCGATTTCCTAGCGGCCTTGGTGGCCAGTTGCTTCCTCGGAGCCTTTCCTCCGGTTGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MPMDRIQATSESPSSRLMVLSIECIKGSSRADEWTGDMLQTGDIVEELTIGSSLCVRSPFKNGRSGIQKILHASFKDKQTSIVVRVRRGRDEFSELQACIVPNDSAGKKQ
YVLRSITDPNYVVGFLDRTESECFDLQGNVKIAASRSDRMVSALARTRLQDGYVSYHWERRMHDSLSVPYSSSFLSILLLPKAANEVATRYNDLEDTLARANAWLNSAQS
TGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYSPLGGELPIEIKLKEGDSKLGFSIGRTEEGFIYVSAVDEDDNAPS
TRSGLNHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVPIFLHVFLWDRELLASLTSPAPIRQRPTASQPAAPARLALPAEVQLARQP
NDNQIQPLPADVFSETGSVSTDESSERTERNAAGELSFRFHEFSLSSNWFPDEKLSTLLVLTDLSQSHRPWPEPVWLLHSAGGRSRFPSGLGGQLLPRSLSSG

Spg000792 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome