CuGenDBv2

Gene ID	Spg001208
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	scaffold8:39223449..39223907
RNA-Seq Expression	Spg001208
Synteny	Spg001208
Gene Ontology terms	GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6604946.1 hypothetical protein SDJN03_02263, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

3.6e-68

94.08

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNN+DVESLLDKLHMDGFSSKD PQTSPSE+ SSVDDGFVIEER TS IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

XP_022947464.1 uncharacterized protein LOC111451320 [Cucurbita moschata]

3.6e-68

94.74

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD PQTSPSE+ SSVDDGFVIEER TS IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

XP_022971121.1 uncharacterized protein LOC111469888 [Cucurbita maxima]

1.4e-67

93.42

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD PQTSPSE+  SVDDGFVIEER TS IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PITIALTPPIARLLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

XP_022986110.1 uncharacterized protein LOC111483951 [Cucurbita maxima]

2.6e-66

92.11

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQ QTSP E ASSVDDG VIEE   SE QSTVAQEPRTR
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PITI LTPPIAR+LARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

XP_023533856.1 uncharacterized protein LOC111795580 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.2e-68

94.74

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVS+ASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD PQTSPSE+ SSVDDGFVIEER TSEIQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CXM4 uncharacterized protein LOC111015379

2.1e-66

92.11

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQT PSE  SS DDGFVIEER  SE QST  QEPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PITIALTPPI+RLLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

A0A6J1FU56 uncharacterized protein LOC111448454

1.4e-62

88.82

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQ QTSP       DDG VIEE   S+IQSTVAQEPRTR
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PITI LTPPIAR+LARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC111451320

1.7e-68

94.74

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD PQTSPSE+ SSVDDGFVIEER TS IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

A0A6J1I2F7 uncharacterized protein LOC111469888

6.6e-68

93.42

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD PQTSPSE+  SVDDGFVIEER TS IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PITIALTPPIARLLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

A0A6J1JD52 uncharacterized protein LOC111483951

1.2e-66

92.11

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQ QTSP E ASSVDDG VIEE   SE QSTVAQEPRTR
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PITI LTPPIAR+LARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

1.5e-32

54.86

Show/hide

Query:  RFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTRNRTAELAA
        R +E+++KYGKVA+GVHFSVS  SI+G Y+AIKNNVDVESLL+K  +  FSSK+ P  +PS      + G V  +                 N+T +LA 
Subjt:  RFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTRNRTAELAA

Query:  STGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG
        S GGALALAVLCNKAL PIRVPIT+ALTPPIAR L +R I+++G
Subjt:  STGGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTTCTTCACCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGTACGGGAAGGTCGCAATCGGAGTTCATTTCTCAGTGTCGGCGGCGTCGATCACTGGCCTCTA
CGTCGCCATCAAGAATAATGTCGATGTTGAATCGCTACTCGATAAGTTACACATGGATGGATTCTCTTCCAAGGATCAGCCGCAGACAAGTCCCTCCGAAGTCGCATCGT
CGGTAGATGATGGATTCGTGATCGAAGAAAGAACTACGTCGGAAATTCAATCGACGGTGGCGCAGGAGCCGAGGACGAGGAATCGTACTGCCGAGCTCGCAGCGTCGACT
GGCGGTGCGTTGGCTTTGGCCGTGCTTTGCAACAAGGCATTGCTGCCGATTCGGGTTCCTATCACGATTGCACTGACACCGCCGATTGCGAGGCTGCTGGCGAGGCGAGG
GATCATGAGGAGTGGTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAFFTGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQPQTSPSEVASSVDDGFVIEERTTSEIQSTVAQEPRTRNRTAELAAST
GGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

Spg001208 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome