; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg001427 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg001427
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionTaste receptor type 1 member 1 like
Genome locationscaffold8:40208876..40212484
RNA-Seq ExpressionSpg001427
SyntenySpg001427
Gene Ontology termsGO:0010228 - vegetative to reproductive phase transition of meristem (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7010788.1 hypothetical protein SDJN02_27584 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.6e-16581.42Show/hide
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XP_022943893.1 uncharacterized protein LOC111448482 [Cucurbita moschata]1.3e-16481.42Show/hide
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XP_022985722.1 uncharacterized protein LOC111483692 [Cucurbita maxima]2.7e-16280.33Show/hide
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XP_023511914.1 uncharacterized protein LOC111776784 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-16581.42Show/hide
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XP_038901494.1 uncharacterized protein LOC120088343 [Benincasa hispida]6.0e-16281.13Show/hide
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        MITN NLISCNFFSPSLPLRIS L I H    QT TR  QKLRS  II F       P+FNIR  SSS+KMGLLQKWRSASGSQT GDPV EK SPVESE
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        IHAMSIDFMLLSSFAPFWVYNDM+ARKWYD+GSWLLP SLVPFLGPALYLVLRPLP TTPVPLNPAASEP+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA76 Uncharacterized protein9.7e-15879.13Show/hide
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        FLVLSFFLGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEED LKRWPLNFLESKFTAG                  I FA GLGILFY GLAGE++WKEFYQYFRESRFIH
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A0A1S3CKU4 uncharacterized protein LOC1035021034.4e-15879.67Show/hide
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A0A6J1CIN4 uncharacterized protein LOC1110113185.7e-15879.51Show/hide
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          GGGNGGEGRDWTTSILLFVFWA LM+YVFNLAPNQTPS DLYFLKKLL LKSDDGF MN+VLVSLWY+MGLWPLVYGMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLV
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        LS FLGAYGLLPYFVLWKPPPPP+EED LKRWPLNFLESKFTAG                  I FA GLGI+FYAGLAGE+ WKEFYQYFRESRFIHAMS
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A0A6J1FXH1 uncharacterized protein LOC1114484826.3e-16581.42Show/hide
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A0A6J1J5P7 uncharacterized protein LOC1114836921.3e-16280.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04360.1 unknown protein2.0e-9151.35Show/hide
Query:  MITNANLISCNFFSPSLPLRISKLGIAHQTPTRNPQKLRSQIIPFKRSISVCPSFNIRRDSSSSKMGLLQKWRSASGSQTAGDPVGEKASPV-----ESE
        M+ + +LISCNF    LP R+ K       P+  PQ L                       SSS + LLQ   S+S  + A  P  EK          S 
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Query:  RDGSDGSGGGNGGEGRDWTTSILLFVFWAGLMFYVFNLAPNQTPSMDLYFLKKLLNLKSDDGFIMNDVLVSLWYIMGLWPLVYGMLLLPSGRSSNSNVPV
         +  +        EGRDW++SILLF  W  L++Y FNLAP+QTP+ DLYFLKKLLNLK DDGF MN +LV LWYIMGLWPLVY MLLLP+G    S  P 
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Query:  WPFLVLSFFLGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEEDQLKRWPLNFLESKFTAGVMENPSPYHQCIWNPHTLIIFATGLGILFYAGLAGENSWKEFYQYFRESRF
        WPF+VLSFF G Y LLPYF LW PP PPV E +L++WPLN LESK TAGV               TL+    GLGI+ Y+ +     W EFYQYFRES+F
Subjt:  WPFLVLSFFLGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEEDQLKRWPLNFLESKFTAGVMENPSPYHQCIWNPHTLIIFATGLGILFYAGLAGENSWKEFYQYFRESRF

Query:  IHAMSIDFMLLSSFAPFWVYNDMTARKWYDKGSWLLPFSLVPFLGPALYLVLRPLPTTTPVPLNPAASEP
        IH  S+DF LLS+FAPFWVYNDMT RKW+DKGSWLLP S++PFLGP+LYL+LRP  + T  P + A+S+P
Subjt:  IHAMSIDFMLLSSFAPFWVYNDMTARKWYDKGSWLLPFSLVPFLGPALYLVLRPLPTTTPVPLNPAASEP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAACCAATGCCAATCTTATCTCCTGCAACTTCTTCTCCCCATCTCTTCCTTTAAGAATCTCGAAGCTTGGAATCGCCCACCAAACTCCTACCCGAAACCCCCAAAA
ATTACGCTCCCAGATTATCCCCTTCAAGCGTTCGATTTCGGTCTGCCCCAGTTTCAACATTCGTCGAGATTCCAGCTCCAGTAAGATGGGTCTGCTCCAAAAATGGCGGA
GTGCATCGGGAAGTCAGACTGCCGGAGACCCAGTTGGGGAAAAAGCGAGCCCGGTTGAAAGTGAGCGCGACGGTAGCGACGGCAGCGGCGGCGGAAATGGTGGTGAGGGA
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A
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