; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg001846 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg001846
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionprotein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1
Genome locationscaffold10:116749..125781
RNA-Seq ExpressionSpg001846
SyntenySpg001846
Gene Ontology termsGO:0007155 - cell adhesion (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005540 - hyaluronic acid binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006968 - Root UVB sensitive family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022148171.1 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]8.8e-4794.34Show/hide
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XP_022148172.1 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]8.8e-4794.34Show/hide
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XP_023528607.1 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.7e-4695.15Show/hide
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XP_038881395.1 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic [Benincasa hispida]3.0e-4798.06Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D4C3 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X24.3e-4794.34Show/hide
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A0A6J1D4K5 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X14.3e-4794.34Show/hide
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A0A6J1F1U0 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X16.2e-4680.31Show/hide
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        TRL   C   P   L   E ++    +
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A0A6J1F2S0 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X22.1e-4695.15Show/hide
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A0A6J1J7M2 protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X26.8e-4593.2Show/hide
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         RL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q499P8 RUS family member 16.4e-0830.53Show/hide
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Q7X6P3 Protein root UVB sensitive 1, chloroplastic3.1e-3471.57Show/hide
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         +
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Q86K80 RUS family member 11.4e-0728.7Show/hide
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        L +V AK  +Q      +GM+L + +++ I  +TSL   +  F   T +H+FCN ++  ++QL+++N YRA L++  ++ + G +PS  +++  E +  +
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Q91W34 RUS family member 16.4e-0830.53Show/hide
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        + +V AK  +Q  V    G+++ + +   +    SL+ GCF ++T +H++ N ++ +++ L TLN  R  LV   +L  GEV      N  EPL+
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Q9SJX7 Protein root UVB sensitive 2, chloroplastic4.9e-0834Show/hide
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        L ++ AKGEA   +    G+  GI LA+ I SS        SI++++H++  ++  + + + TLNP R +L+ + +L +G+VPS  D+  +E L FP  P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13770.1 Protein of unknown function, DUF6471.8e-0526.6Show/hide
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        ++ AK  +Q  ++  +GM LG+ LA     +    +  F  +T+ HM+ N ++ + + L +LN  R+S++ + ++ +G+V S + V++ E + P
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AT1G13770.2 Protein of unknown function, DUF6471.8e-0526.6Show/hide
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AT2G31190.1 Protein of unknown function, DUF6473.5e-0934Show/hide
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        L ++ AKGEA   +    G+  GI LA+ I SS        SI++++H++  ++  + + + TLNP R +L+ + +L +G+VPS  D+  +E L FP  P
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AT2G31190.2 Protein of unknown function, DUF6473.5e-0934Show/hide
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AT3G45890.1 Protein of unknown function, DUF6472.2e-3571.57Show/hide
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         +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATTTCTTAATACAAGACTTACTTCTGGTTGCGTTGTTACCCCTCCGACGAGCTTAAATGTTCAAGAGGAAGAAGACGAGTTAGAAGAAGTAATTGCTGGGAACTTTGTGG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQIPPAARVTHARRFPTIGDDASTLLTVALLPSDIEPSFCNWVLHHIPLKEVIAKGEAQGMVSKSIGMMLGITLANRIRSSTSLAFGCFSIVTLIHMFCNLKSYKSIQLR
TLNPYRASLVFSEYLLSGEVPSIKDVNNEEPLFPAVPFLNTRLTSGCVVTPPTSLNVQEEEDELEEVIAGNFVEIAEEKDEELEVPMEEAPRLSSSVMAKGNAESHRDGE
EATTV