; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg001881 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg001881
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1645)
Genome locationscaffold10:3234372..3235295
RNA-Seq ExpressionSpg001881
SyntenySpg001881
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012442 - Protein of unknown function DUF1645, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022726.1 hypothetical protein SDJN02_16461, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-12578.98Show/hide
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XP_022989165.1 uncharacterized protein LOC111486318 [Cucurbita maxima]1.1e-12778.9Show/hide
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        RASPLWSI
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XP_023531558.1 uncharacterized protein LOC111793758 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-12779.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DX71 uncharacterized protein LOC1110253792.2e-12680.78Show/hide
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A0A6J1ERP1 uncharacterized protein LOC1114352512.0e-12778.34Show/hide
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A0A6J1F8Z7 uncharacterized protein LOC1114419098.5e-11579.93Show/hide
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A0A6J1J5P2 uncharacterized protein LOC1114815267.7e-11679.79Show/hide
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A0A6J1JLM8 uncharacterized protein LOC1114863185.2e-12878.9Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23710.1 Protein of unknown function (DUF1645)3.1e-2433.58Show/hide
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        S+   + S   N  +E +E++F F  +   G      +    G I PVFP+FN DLL E    E  +  + + ++    R  L KL + DR+ +     +
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          S      E  P G YC W   ++   +   C+KS STG S  K W  RDL+ RS+SDG+ ++V    S   T + S+       +E    K + EKK 
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Query:  HSGEAHVGGKSSGRRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGCWTNVSGLGR
          G+      S  ++     K   SAHE  Y+RNR +KEE K +SYLPYK   VG +TNV+GL R
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AT1G70420.1 Protein of unknown function (DUF1645)3.4e-2332.95Show/hide
Query:  NRAEESDEDDFEFVSLQKSGD----CDVSRGGLIAPVFPIFNSDLLLEERQVERAEIDDRDSAIVQRIRIPLEKLIIRDRDNDPPSPSSSSSSSVDELEG
        ++ +E  E+DF F S+          +    G I PV+P+FN ++  ++ +              + +R PL+KL +            S+++  +E E 
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Query:  VPSGTYCVWKPKSI--GTPNLACKKSRSTGSSSTKRWGIRDLLRRSHSDGKHSYV------SFTPSTSSNSTKKVKEIKSETKPAKELKEKKFHSGEAHV
           G YC W  +++   +P   C+KS STG S  K W  RDL+ RS+SDGK ++V      S T STSS + +    +KS  K  ++ K  K        
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Query:  GGKSSGRRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGCWTNVSGLGR
                   D+ R  SAHE  Y+RNR ++EEGKR+SYLPYK   VG +TNV+GL R
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AT3G27880.1 Protein of unknown function (DUF1645)2.1e-2831.94Show/hide
Query:  MREEEEDFGMCPSFNSYSTGTTADAARRASREFSGGCSFFDFDRSSSLNRAEESDEDDFEFVSLQKSGDCDVSRGGLIAPVFPIFNSDLLLEERQVERAE
        M +++      PSF++YS     + A R                       +E  + +FEF +   S   D   GGL   VFP+FN +L+  +   E+  
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Query:  IDDRDSAIVQRIRIPLEKLIIRDR-DNDPPSPSSSSSSSV----DELEGVPSGTYCVWKP---KSIGTPNLACKKSRSTGSS-----STKRWGIRDLLRR
                     IPL+ L +R+R D  PP  + SSSS      DE + +PS  YC W P    +  +P+  C+KS+STGSS     STKRW +RD L+R
Subjt:  IDDRDSAIVQRIRIPLEKLIIRDR-DNDPPSPSSSSSSSV----DELEGVPSGTYCVWKP---KSIGTPNLACKKSRSTGSS-----STKRWGIRDLLRR

Query:  SHSDGKHSYVSFTPSTSSNSTKKVKEIKSETKPAKELKEKKFHSGEAHVGGKSSGRRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGCWT
        S SDGK S     P+   +  +  K  K  +                                   SAHE FY+RN+ +KEE KRKSYLPYK DLVG ++
Subjt:  SHSDGKHSYVSFTPSTSSNSTKKVKEIKSETKPAKELKEKKFHSGEAHVGGKSSGRRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGCWT

Query:  NVSGLGRASP
        N+   G+  P
Subjt:  NVSGLGRASP

AT3G62630.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.8e-0833.14Show/hide
Query:  PKSIGTPNLACKKSRST--GSSSTKRWGIRDLLRRSHSDGK-------HSYVSFTPSTSSNSTKKVKEIKSETKP----------AKELKEKKFHSGEAH
        P +  TP+ +   SRS+  G +S K   ++DLL RS S+G+        S +SF+PS   +  KK+K  + E KP          +K+ K+K+  + +A 
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Query:  VGGKSSG--RRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGC-------WTNVSGLGRA
        V GK +    +  G Q    SAHE  Y  NR   EE K+++YLPY+  L GC       ++ ++GL R+
Subjt:  VGGKSSG--RRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGC-------WTNVSGLGRA

AT5G62770.1 Protein of unknown function (DUF1645)3.8e-1429.61Show/hide
Query:  PSFNSYSTGTTADAARRASREFSGGCSFFDFDRSSSLNRAEESDEDDFEFVSLQKSGDC--------DVSRGGLIAPVFPIFNSDLLLEERQVERAEIDD
        PSF S+S  +  D A  A+R       F D D++ S +     D++D +F     S  C        ++   G I P+ P   +        VE      
Subjt:  PSFNSYSTGTTADAARRASREFSGGCSFFDFDRSSSLNRAEESDEDDFEFVSLQKSGDC--------DVSRGGLIAPVFPIFNSDLLLEERQVERAEIDD

Query:  RDSAIVQRIRIPLEKLIIRDRDNDPPSPSSSSSSSVDE-LEGVPSGTYCVWKPKS-----------IGTPNLACKKSRSTGSSSTKRWGIRDLLR-RSHS
          +   +R R  L KL+  DRD     P+S+SSS  +E L GVP  TYCVWKPK              +P+ +  KS S G S  KRW +R+LL  RS S
Subjt:  RDSAIVQRIRIPLEKLIIRDRDNDPPSPSSSSSSSVDE-LEGVPSGTYCVWKPKS-----------IGTPNLACKKSRSTGSSSTKRWGIRDLLR-RSHS

Query:  DGKHSYVSFTPSTSSNSTKKVKEIKSETKPAKELKEKKFHSGEAHVGGKSSGRRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGCWTNVS
        +G    V   P   ++ T  V + + E +P  +            V G+  GR                       +EE KR++Y+PY+ D++G   NV+
Subjt:  DGKHSYVSFTPSTSSNSTKKVKEIKSETKPAKELKEKKFHSGEAHVGGKSSGRRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGCWTNVS

Query:  GLGR
        GL R
Subjt:  GLGR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCATGTCTCTGCAAATGCGAGAAGAAGAAGAAGATTTCGGAATGTGTCCAAGCTTCAACAGTTACTCCACCGGAACAACAGCAGATGCCGCCAGAAGAGCCAGCCG
CGAGTTCTCCGGCGGCTGCTCTTTCTTCGATTTCGATCGATCGTCATCGCTGAACAGAGCAGAGGAGAGCGACGAGGATGATTTCGAATTCGTCTCGCTCCAGAAATCTG
GCGACTGCGATGTATCTCGCGGCGGTTTGATCGCTCCTGTGTTTCCGATTTTCAATTCCGATCTTCTGTTAGAGGAACGTCAGGTTGAAAGAGCGGAAATCGACGATCGA
GATTCGGCAATCGTGCAGCGGATTCGAATTCCTCTGGAGAAGCTTATAATCAGAGATCGCGATAACGATCCGCCGTCGCCTTCGTCGTCGTCTTCATCGTCGGTGGACGA
ATTGGAAGGAGTTCCGTCTGGAACGTACTGCGTGTGGAAACCTAAATCGATCGGAACGCCAAATTTGGCGTGCAAGAAGAGCCGATCCACCGGATCGTCTTCGACGAAGC
GTTGGGGAATCCGAGACCTTCTACGGAGAAGCCACAGCGACGGAAAGCACTCATACGTCTCCTTCACGCCGTCGACGAGTTCAAACTCAACGAAAAAGGTAAAAGAAATC
AAATCAGAGACGAAGCCGGCGAAGGAACTGAAGGAGAAGAAATTTCACTCCGGCGAGGCGCACGTCGGCGGCAAATCGAGTGGCCGGAGATCTGCCGGAGATCAGAAGAG
GATTTTCTCTGCACACGAATCATTCTACGTGAGGAATCGTACGTTGAAAGAAGAAGGTAAGAGAAAATCGTATCTCCCTTACAAGCCTGACCTGGTTGGTTGTTGGACTA
ACGTCAGTGGATTGGGCAGAGCCAGTCCGTTATGGAGCATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCATGTCTCTGCAAATGCGAGAAGAAGAAGAAGATTTCGGAATGTGTCCAAGCTTCAACAGTTACTCCACCGGAACAACAGCAGATGCCGCCAGAAGAGCCAGCCG
CGAGTTCTCCGGCGGCTGCTCTTTCTTCGATTTCGATCGATCGTCATCGCTGAACAGAGCAGAGGAGAGCGACGAGGATGATTTCGAATTCGTCTCGCTCCAGAAATCTG
GCGACTGCGATGTATCTCGCGGCGGTTTGATCGCTCCTGTGTTTCCGATTTTCAATTCCGATCTTCTGTTAGAGGAACGTCAGGTTGAAAGAGCGGAAATCGACGATCGA
GATTCGGCAATCGTGCAGCGGATTCGAATTCCTCTGGAGAAGCTTATAATCAGAGATCGCGATAACGATCCGCCGTCGCCTTCGTCGTCGTCTTCATCGTCGGTGGACGA
ATTGGAAGGAGTTCCGTCTGGAACGTACTGCGTGTGGAAACCTAAATCGATCGGAACGCCAAATTTGGCGTGCAAGAAGAGCCGATCCACCGGATCGTCTTCGACGAAGC
GTTGGGGAATCCGAGACCTTCTACGGAGAAGCCACAGCGACGGAAAGCACTCATACGTCTCCTTCACGCCGTCGACGAGTTCAAACTCAACGAAAAAGGTAAAAGAAATC
AAATCAGAGACGAAGCCGGCGAAGGAACTGAAGGAGAAGAAATTTCACTCCGGCGAGGCGCACGTCGGCGGCAAATCGAGTGGCCGGAGATCTGCCGGAGATCAGAAGAG
GATTTTCTCTGCACACGAATCATTCTACGTGAGGAATCGTACGTTGAAAGAAGAAGGTAAGAGAAAATCGTATCTCCCTTACAAGCCTGACCTGGTTGGTTGTTGGACTA
ACGTCAGTGGATTGGGCAGAGCCAGTCCGTTATGGAGCATCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMSLQMREEEEDFGMCPSFNSYSTGTTADAARRASREFSGGCSFFDFDRSSSLNRAEESDEDDFEFVSLQKSGDCDVSRGGLIAPVFPIFNSDLLLEERQVERAEIDDR
DSAIVQRIRIPLEKLIIRDRDNDPPSPSSSSSSSVDELEGVPSGTYCVWKPKSIGTPNLACKKSRSTGSSSTKRWGIRDLLRRSHSDGKHSYVSFTPSTSSNSTKKVKEI
KSETKPAKELKEKKFHSGEAHVGGKSSGRRSAGDQKRIFSAHESFYVRNRTLKEEGKRKSYLPYKPDLVGCWTNVSGLGRASPLWSI