; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg001908 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg001908
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationscaffold8:32344238..32346408
RNA-Seq ExpressionSpg001908
SyntenySpg001908
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004151059.1 GDSL esterase/lipase At2g30310 [Cucumis sativus]1.3e-3165.32Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH+ATGRFSDGKLIP                            GVSFASAGTGFDD TA ISKVI VMKQI+ F+NYIQRLQG+VGVDES+RII NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTND+NINFYDLPTRQ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

XP_008463830.1 PREDICTED: GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucumis melo]9.2e-3060.48Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GHVATGRFSDGKLIP                            GVSFASAG+GFD+ TA++S VI VMKQI++F+NYI+RLQGIVGVDES++I+ +ALV+
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTNDVNINFYDLPTRQ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

XP_016902930.1 PREDICTED: GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucumis melo]1.1e-3064.52Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH+ATGRFSDGKLIP                            GVSFASAGTGFDD TA ISKVI VMKQI+ F+NYIQRLQG+VGV ES+RII NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTND+NINFYDLPTRQ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

XP_022947820.1 GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucurbita moschata]1.6e-2961.29Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH+ATGRFS+GKLIP                            GVSFASAGTGFDD TATISKVI VMKQI+LF+NY QRLQ I GVDES++IIG+ALV+
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTND+NINFYD+PTR+ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

XP_023006812.1 GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucurbita maxima]4.9e-3163.71Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH+ATGRFS+GKLIP                            GVSFASAGTGFDD TATISKVI VMKQI+LF+NYIQRLQ IVGVDES++IIG+ALV+
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTND+NINFYDLPTR+ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNE2 Uncharacterized protein6.2e-3265.32Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH+ATGRFSDGKLIP                            GVSFASAGTGFDD TA ISKVI VMKQI+ F+NYIQRLQG+VGVDES+RII NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTND+NINFYDLPTRQ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

A0A1S4E4N0 GDSL esterase/lipase At2g30310-like5.3e-3164.52Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH+ATGRFSDGKLIP                            GVSFASAGTGFDD TA ISKVI VMKQI+ F+NYIQRLQG+VGV ES+RII NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTND+NINFYDLPTRQ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

A0A5A7UVN0 GDSL esterase/lipase4.5e-3060.48Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GHVATGRFSDGKLIP                            GVSFASAG+GFD+ TA++S VI VMKQI++F+NYI+RLQGIVGVDES++I+ +ALV+
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTNDVNINFYDLPTRQ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

A0A5A7VF47 GDSL esterase/lipase5.3e-3164.52Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH+ATGRFSDGKLIP                            GVSFASAGTGFDD TA ISKVI VMKQI+ F+NYIQRLQG+VGV ES+RII NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTND+NINFYDLPTRQ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

A0A6J1KWV5 GDSL esterase/lipase At2g30310-like2.4e-3163.71Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH+ATGRFS+GKLIP                            GVSFASAGTGFDD TATISKVI VMKQI+LF+NYIQRLQ IVGVDES++IIG+ALV+
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI
        IS GTND+NINFYDLPTR+ +Y I
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22918 GDSL esterase/lipase At2g302209.0e-2045.9Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLI----------------------------PGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH A GRFS+GKLI                             GV FASAG G+DD+T+  SK I V +Q ++F+NYI RL+GIVG  ++  II NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGKLI----------------------------PGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY
        IS G ND  +NFYD+P R+ +Y
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY

O22927 GDSL esterase/lipase At2g303109.0e-2044.26Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGK----------------------------LIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH A GR+S+GK                            ++ GVSFASAG G+DD+++  SK I V +Q ++F+NYI RL+GIVG  ++  II NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGK----------------------------LIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY
        IS G ND  +NFYD+PTR+ +Y
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY

Q9LMJ3 GDSL esterase/lipase At1g069904.9e-1840.5Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH ATGRFS+GKLIP                            GV FASAG+G+D+ T   +  + V KQ ++ ++Y++RL  IVG +++  I+  ALV+
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQK
        +S GTND N+N YD P+R+QK
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQK

Q9SIQ2 GDSL esterase/lipase At2g315502.4e-1747.19Show/hide
Query:  SDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTIL
        SD  ++ GV FASAG G+DD T+  ++ I V +Q N+F++YI RL+GIVG  ++  II NA VV+S G ND  +N+YD+P+R+ +Y  +
Subjt:  SDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTIL

Q9SJA9 GDSL esterase/lipase At2g245605.5e-1748.84Show/hide
Query:  SDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY
        SD +++ GV FASAG G+DD T+  ++ I V+ Q  +F+NYI RL+ IVG  ++  II NALVVIS G ND  +N+YD+P+R+ ++
Subjt:  SDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06990.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein3.5e-1940.5Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH ATGRFS+GKLIP                            GV FASAG+G+D+ T   +  + V KQ ++ ++Y++RL  IVG +++  I+  ALV+
Subjt:  GHVATGRFSDGKLIP----------------------------GVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQK
        +S GTND N+N YD P+R+QK
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQK

AT2G24560.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein3.9e-1848.84Show/hide
Query:  SDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY
        SD +++ GV FASAG G+DD T+  ++ I V+ Q  +F+NYI RL+ IVG  ++  II NALVVIS G ND  +N+YD+P+R+ ++
Subjt:  SDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY

AT2G30220.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein6.4e-2145.9Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGKLI----------------------------PGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH A GRFS+GKLI                             GV FASAG G+DD+T+  SK I V +Q ++F+NYI RL+GIVG  ++  II NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGKLI----------------------------PGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY
        IS G ND  +NFYD+P R+ +Y
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY

AT2G30310.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein6.4e-2144.26Show/hide
Query:  GHVATGRFSDGK----------------------------LIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV
        GH A GR+S+GK                            ++ GVSFASAG G+DD+++  SK I V +Q ++F+NYI RL+GIVG  ++  II NALVV
Subjt:  GHVATGRFSDGK----------------------------LIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVV

Query:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY
        IS G ND  +NFYD+PTR+ +Y
Subjt:  ISEGTNDVNINFYDLPTRQQKY

AT2G31540.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein5.1e-1846.07Show/hide
Query:  SDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTIL
        SD  ++ GV FASAG G+DD T+  ++ I V +Q N+F++YI RL+GIVG  ++  II NA VV+S G ND  +N+Y++P+R+ +Y  +
Subjt:  SDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTIL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAATTGGAAAATTCCCGTTGAAAATCTAGGCCACGTTGCTACTGGAAGGTTCAGTGATGGAAAACTCATCCCAGGAGTCAGTTTCGCATCAGCTGGCACGGGCTT
CGATGATCAAACGGCCACTATATCCAAAGTCATTCATGTGATGAAGCAAATTAATCTTTTCCAAAACTACATTCAAAGGCTGCAAGGGATTGTGGGTGTGGATGAAAGTC
AGAGGATTATTGGCAATGCTTTGGTTGTTATTAGCGAAGGAACCAATGACGTAAACATCAATTTCTATGACCTTCCTACACGGCAGCAGAAGTACACAATATTAGTGGTT
ACCAAGATTACTTACAAAATAGACTACAAAGCTTGGTCAAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAATTGGAAAATTCCCGTTGAAAATCTAGGCCACGTTGCTACTGGAAGGTTCAGTGATGGAAAACTCATCCCAGGAGTCAGTTTCGCATCAGCTGGCACGGGCTT
CGATGATCAAACGGCCACTATATCCAAAGTCATTCATGTGATGAAGCAAATTAATCTTTTCCAAAACTACATTCAAAGGCTGCAAGGGATTGTGGGTGTGGATGAAAGTC
AGAGGATTATTGGCAATGCTTTGGTTGTTATTAGCGAAGGAACCAATGACGTAAACATCAATTTCTATGACCTTCCTACACGGCAGCAGAAGTACACAATATTAGTGGTT
ACCAAGATTACTTACAAAATAGACTACAAAGCTTGGTCAAGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENWKIPVENLGHVATGRFSDGKLIPGVSFASAGTGFDDQTATISKVIHVMKQINLFQNYIQRLQGIVGVDESQRIIGNALVVISEGTNDVNINFYDLPTRQQKYTILVV
TKITYKIDYKAWSR