; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg002870 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg002870
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description60S ribosomal protein L13
Genome locationscaffold6:3078825..3081299
RNA-Seq ExpressionSpg002870
SyntenySpg002870
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001380 - Ribosomal protein L13e
IPR018256 - Ribosomal protein L13e, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008453835.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L13-3 [Cucumis melo]3.5e-8596.53Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVK+TE+MKSFKAYDKLRVERMN RHVGARLKKAAEAEKEDKK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

XP_011653106.1 60S ribosomal protein L13-3 [Cucumis sativus]3.9e-8495.38Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI+VDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVK+TEEMKSFKAYDKLRVER N RHVGARLK+AAEAEKEDKK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

XP_022923040.1 60S ribosomal protein L13-1 [Cucurbita moschata]8.6e-8494.8Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI+VDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVK+TEEMKSFKAYDKLR+ER NERHVGARLK+AAEAEKE+KK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

XP_022984589.1 60S ribosomal protein L13-1 [Cucurbita maxima]3.9e-8495.38Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVK+TEEMKSFKAYDKLR+ER NERHVGARLK+AAEAEKE+KK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

XP_022990054.1 60S ribosomal protein L13-1-like [Cucurbita maxima]6.6e-8494.8Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VE+VK+TEEMKSFKAYDKLR+ER NERHVGARLK+AAEAEKE+KK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU76 60S ribosomal protein L131.9e-8495.38Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI+VDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVK+TEEMKSFKAYDKLRVER N RHVGARLK+AAEAEKEDKK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

A0A1S3BWP2 60S ribosomal protein L131.7e-8596.53Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVK+TE+MKSFKAYDKLRVERMN RHVGARLKKAAEAEKEDKK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

A0A5A7TNJ5 60S ribosomal protein L131.7e-8596.53Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVK+TE+MKSFKAYDKLRVERMN RHVGARLKKAAEAEKEDKK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

A0A6J1J2K7 60S ribosomal protein L131.9e-8495.38Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVK+TEEMKSFKAYDKLR+ER NERHVGARLK+AAEAEKE+KK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

A0A6J1JSD3 60S ribosomal protein L133.2e-8494.8Show/hide
Query:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
        ++ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK
Subjt:  QSARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFK

Query:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VE+VK+TEEMKSFKAYDKLR+ER NERHVGARLK+AAEAEKE+KK
Subjt:  AGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P41127 60S ribosomal protein L13-17.6e-7582.46Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRR+NRSLE LQ NVQRLKTYK K+V+FPRRARK KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ER N+RH GAR K+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

P41128 60S ribosomal protein L13-19.3e-7380.7Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELK+AGIPKKLAPTIGIAVDHRR+NRSLE LQ+NVQRLKTYKAK+V+FPRRARK KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DST EELANATQVQG Y+PI REK + ELVK+T EMKS KA+DK+R+ER N+RH GAR K+AA+AEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

P41129 60S ribosomal protein L13-21.2e-7280.12Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI++DHRR+NRSLE LQ+NVQRLKTYKAK+V+FPRRARK KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DST EELANATQVQG Y+PI REK ++ELVK+T EMKS  AYDK+R+ER N+RH GAR K+AA+AEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

Q9FF90 60S ribosomal protein L13-31.2e-7279.53Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVRAG+GF+LEELK AGIPKKLAPTIGI+VDHRR+NRSLE LQ+NVQRLKTYKAK+VVFPRR+R+ KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DSTPEELANATQVQG Y+PI   KA++ELVK+T ++K+FKAYDK+R+ER N RH GAR K+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

Q9SMT4 Putative 60S ribosomal protein L13-22.7e-6472.51Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ KAVK FPRPTAGP+RP+VH QTL YNMKVRAG+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI+VDH R+NRSLE  Q NVQRLKTYKAK+V+FPR AR  K G
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DS  +ELANATQVQ  ++PI RE  ++ELVK+T +MK F AYDK+R+E +N+RH G R K+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G49010.1 breast basic conserved 15.4e-7682.46Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRR+NRSLE LQ NVQRLKTYK K+V+FPRRARK KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ER N+RH GAR K+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

AT3G49010.2 breast basic conserved 15.4e-7682.46Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRR+NRSLE LQ NVQRLKTYK K+V+FPRRARK KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ER N+RH GAR K+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

AT3G49010.3 breast basic conserved 15.4e-7682.46Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRR+NRSLE LQ NVQRLKTYK K+V+FPRRARK KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ER N+RH GAR K+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

AT3G49010.4 breast basic conserved 15.1e-7481.87Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRR+NRSLE LQ NVQRLKTYK K+V+FPRRAR  KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ER N+RH GAR K+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK

AT5G23900.1 Ribosomal protein L13e family protein8.6e-7479.53Show/hide
Query:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        ARQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVRAG+GF+LEELK AGIPKKLAPTIGI+VDHRR+NRSLE LQ+NVQRLKTYKAK+VVFPRR+R+ KAG
Subjt:  ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK
        DSTPEELANATQVQG Y+PI   KA++ELVK+T ++K+FKAYDK+R+ER N RH GAR K+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGGTTCCGGTTAGCGAGGATTCAGTGGCTGGAAGTCGAAAGAGAAAGGTCACTCTGCTCCGCCGCGTTAAGTTCGTTCGTCTCGATTCTCTTCCTGCGATTGCATT
CCCTTATTCAAGTATCTTTCCAGGAACTTACCGCTTTACATCTTCACTCACATACGCAGTAAAAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAGCGGCCACTTCAGGAAGCAC
TGGCAGAACTATGTCAGAACCTGGTTCAACCAACCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAAATGGTGGGTGTTATATCGAATTCTGACTATTGACTTGATGAATCTACAATCA
GCTCGTCAGGAGAAAGCTGTGAAGAACTTTCCTCGCCCAACTGCTGGACCACTCCGCCCCATTGTTCATGGGCAGACATTGAAGTACAACATGAAAGTGAGAGCTGGTAG
GGGCTTTTCTCTGGAGGAGTTGAAGGCTGCTGGTATTCCCAAGAAACTAGCACCAACAATCGGAATAGCAGTTGACCACCGTCGTAGGAATCGCTCTCTTGAAAGCCTAC
AGGCAAACGTGCAGAGGCTGAAGACATACAAGGCTAAGGTGGTCGTCTTCCCAAGACGTGCTCGCAAGTTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCGGAGGAGCTAGCAAATGCC
ACCCAAGTCCAAGGACCATACCTGCCTATTGGACGTGAGAAGGCATCGGTTGAGCTTGTGAAGATCACCGAGGAGATGAAATCCTTCAAGGCATACGACAAGCTACGTGT
TGAGAGGATGAATGAACGACATGTTGGTGCTAGATTGAAGAAGGCAGCCGAGGCCGAGAAGGAAGACAAGAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGGTTCCGGTTAGCGAGGATTCAGTGGCTGGAAGTCGAAAGAGAAAGGTCACTCTGCTCCGCCGCGTTAAGTTCGTTCGTCTCGATTCTCTTCCTGCGATTGCATT
CCCTTATTCAAGTATCTTTCCAGGAACTTACCGCTTTACATCTTCACTCACATACGCAGTAAAAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAGCGGCCACTTCAGGAAGCAC
TGGCAGAACTATGTCAGAACCTGGTTCAACCAACCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAAATGGTGGGTGTTATATCGAATTCTGACTATTGACTTGATGAATCTACAATCA
GCTCGTCAGGAGAAAGCTGTGAAGAACTTTCCTCGCCCAACTGCTGGACCACTCCGCCCCATTGTTCATGGGCAGACATTGAAGTACAACATGAAAGTGAGAGCTGGTAG
GGGCTTTTCTCTGGAGGAGTTGAAGGCTGCTGGTATTCCCAAGAAACTAGCACCAACAATCGGAATAGCAGTTGACCACCGTCGTAGGAATCGCTCTCTTGAAAGCCTAC
AGGCAAACGTGCAGAGGCTGAAGACATACAAGGCTAAGGTGGTCGTCTTCCCAAGACGTGCTCGCAAGTTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCGGAGGAGCTAGCAAATGCC
ACCCAAGTCCAAGGACCATACCTGCCTATTGGACGTGAGAAGGCATCGGTTGAGCTTGTGAAGATCACCGAGGAGATGAAATCCTTCAAGGCATACGACAAGCTACGTGT
TGAGAGGATGAATGAACGACATGTTGGTGCTAGATTGAAGAAGGCAGCCGAGGCCGAGAAGGAAGACAAGAAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRVPVSEDSVAGSRKRKVTLLRRVKFVRLDSLPAIAFPYSSIFPGTYRFTSSLTYAVKNEAQQCYPERPLQEALAELCQNLVQPTCQENQKKKWWVLYRILTIDLMNLQS
ARQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIAVDHRRRNRSLESLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAGDSTPEELANA
TQVQGPYLPIGREKASVELVKITEEMKSFKAYDKLRVERMNERHVGARLKKAAEAEKEDKK