CuGenDBv2

Gene ID	Spg002956
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, putative
Genome location	scaffold6:1152024..1152596
RNA-Seq Expression	Spg002956
Synteny	Spg002956
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR021855 - PAM68-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6574203.1 putative protein PAM68-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

7.4e-79

81.68

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKD-DGGDYDDEIPEAVAKRIITRI
        MK LVCSFR AL LSK PPWK RSRI++ST TKNL  FTRTSR QIQLNAKGFTGSPAT KDRETA +K  GQN+S+D  GGD DDEIPEAVAKRIITRI
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKD-DGGDYDDEIPEAVAKRIITRI

Query:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN
        LAFVGIPMAFGVTL+KI EA+  Q LW VPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEKEGTLFGW++ ++NWVEMWKEEDEANR GN
Subjt:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN

KAG7013265.1 putative protein PAM68-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

4.3e-79

82.11

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL
        MK LVCSFR ALDLSK PPWK RSRI++ST TKNL  FTRTSR QIQLNAKGFTGSPAT KDRETA +K  GQN+S+D GG  DDEIPEAVAKRIITRIL
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL

Query:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN
        AFVGIPMAFGVTL+KI EA+  Q LW VPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEKEGTLFGW++ ++NWVEMWKEEDEANR GN
Subjt:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN

XP_022944901.1 uncharacterized protein PAM68-like [Cucurbita moschata]

5.7e-79

81.58

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL
        MK LVCSFR AL LSK PPWK RSRI++ST TKNL  FTRTSR QIQLNAKGFTGSPAT KDRETA +K  GQN+S+D GGD DDEIPEAVAKRIITRIL
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL

Query:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN
        AFVG+PMAFGVTL+KI EA+  Q LW VPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEKEGTLFGW++ ++NWVEMWKEEDEANR GN
Subjt:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN

XP_022968628.1 uncharacterized protein PAM68-like [Cucurbita maxima]

6.3e-78

82.11

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL
        MK LVCSFR ALDLSK PPWK RSRI+NST TKNL  FT TSR QIQLNAKGFTGSPAT KDRETA +KL  QN+S+ DGGD DDEIPEAVAKRIITRIL
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL

Query:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN
        AFVGIPMAFGVTL+KI EA+  Q LW VPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEKEGTLFGW++ ++NWVEMWKEEDEANR G+
Subjt:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN

XP_023541387.1 uncharacterized protein PAM68-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.5e-79

81.05

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL
        MK LVCSFR ALDLSK PPWK RSRI++ST TKNL  FTRTSR QIQLNAKGFTGSPAT KDRETA +K  GQN+S+  GG  DDEIPEAVAKRIITRIL
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL

Query:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN
        AFVG+PMAFGVTL+KI EA+  Q LW VPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEKEGTLFGW++ ++NWVEMWKEEDEANR GN
Subjt:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3AZ57 uncharacterized protein PAM68-like

3.4e-69

74.47

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRS-RINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRI
        MK+  CSFRQAL L K PP   R+  IN+ST+TKNLSNFT TSR Q+Q+NAKGFTGSPAT K+RETAA+ L GQN+++DD    DDEIPEAV  RIITRI
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRS-RINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRI

Query:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANR
        LAFVGIPMAFGVTLLKIF+AIK QNLWDVPIW+PF T FLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEK+G++ GWE+ ++NWVEMWKEEDE +R
Subjt:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANR

A0A5A7STB5 Putative Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein

3.4e-69

74.47

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRS-RINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRI
        MK+  CSFRQAL L K PP   R+  IN+ST+TKNLSNFT TSR Q+Q+NAKGFTGSPAT K+RETAA+ L GQN+++DD    DDEIPEAV  RIITRI
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRS-RINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRI

Query:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANR
        LAFVGIPMAFGVTLLKIF+AIK QNLWDVPIW+PF T FLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEK+G++ GWE+ ++NWVEMWKEEDE +R
Subjt:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANR

A0A6J1CGP3 uncharacterized protein PAM68-like

2.1e-71

73.26

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL
        MK L+CS+RQAL LS+ PPWK RSRIN+ST+TKNL+N +R +R  +++NAKGFTG+PAT K+RE AA K+ GQN+S +D    DDEI EAV+ RIITRIL
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL

Query:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANR
        AFVG+PMAFGV LLKIFE IK Q +WDVPIWLPFLT FLTFGAST+GIAYGTLSASLDPEKEG+LFGWE+ ++NWVEMWKEEDEA+R
Subjt:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANR

A0A6J1FZC0 uncharacterized protein PAM68-like

2.7e-79

81.58

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL
        MK LVCSFR AL LSK PPWK RSRI++ST TKNL  FTRTSR QIQLNAKGFTGSPAT KDRETA +K  GQN+S+D GGD DDEIPEAVAKRIITRIL
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL

Query:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN
        AFVG+PMAFGVTL+KI EA+  Q LW VPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEKEGTLFGW++ ++NWVEMWKEEDEANR GN
Subjt:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN

A0A6J1HYL3 uncharacterized protein PAM68-like

3.0e-78

82.11

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL
        MK LVCSFR ALDLSK PPWK RSRI+NST TKNL  FT TSR QIQLNAKGFTGSPAT KDRETA +KL  QN+S+ DGGD DDEIPEAVAKRIITRIL
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRIL

Query:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN
        AFVGIPMAFGVTL+KI EA+  Q LW VPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLS SLDPEKEGTLFGW++ ++NWVEMWKEEDEANR G+
Subjt:  AFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O49668 Protein PAM68, chloroplastic

4.4e-18

32.75

Show/hide

Query:  KLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNA-KGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDE----------IPEAVAKRIITRILAFVGIPMAF
        K +S++  S    N    +R +     +N+ KGF   P   K +++   K   Q+   DD  D DD+          IPE V  R+I+R+   VG+P+  
Subjt:  KLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNA-KGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDE----------IPEAVAKRIITRILAFVGIPMAF

Query:  GVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWK
        G+     F  +KV    DVP W+PF+  F+ FG +  G++YG +S+S DP +EG+L GW + ++NW   W+
Subjt:  GVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWK

Q9LTD9 Uncharacterized protein PAM68-like

3.4e-26

39.89

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINN-STLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRI
        M+ L+CS R  L LS      ++++ +N  TL  N  N  R   + +    KGF  S  + K         PG+    D   + D  IP+ V +R++ RI
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINN-STLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRI

Query:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEE
        +  VG P+  GV +LK+ E +K +N+WDVP+W+P+LT  +TFG+S +GIAYG+LS +LDP K  +LFG ++ + NWVEMWKE+
Subjt:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEE

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G19100.1 Protein of unknown function (DUF3464)

3.2e-19

32.75

Show/hide

Query:  KLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNA-KGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDE----------IPEAVAKRIITRILAFVGIPMAF
        K +S++  S    N    +R +     +N+ KGF   P   K +++   K   Q+   DD  D DD+          IPE V  R+I+R+   VG+P+  
Subjt:  KLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNA-KGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDE----------IPEAVAKRIITRILAFVGIPMAF

Query:  GVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWK
        G+     F  +KV    DVP W+PF+  F+ FG +  G++YG +S+S DP +EG+L GW + ++NW   W+
Subjt:  GVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWK

AT5G52780.1 Protein of unknown function (DUF3464)

2.4e-27

39.89

Show/hide

Query:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINN-STLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRI
        M+ L+CS R  L LS      ++++ +N  TL  N  N  R   + +    KGF  S  + K         PG+    D   + D  IP+ V +R++ RI
Subjt:  MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINN-STLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRI

Query:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEE
        +  VG P+  GV +LK+ E +K +N+WDVP+W+P+LT  +TFG+S +GIAYG+LS +LDP K  +LFG ++ + NWVEMWKE+
Subjt:  LAFVGIPMAFGVTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAAAACTCTGGTGTGTTCCTTTCGTCAAGCTCTCGACCTCTCGAAGCATCCACCATGGAAACTGAGAAGCCGAATCAACAACTCAACACTCACGAAGAATCTCAGCAA
TTTCACAAGAACATCCAGACGCCAGATCCAACTAAACGCCAAGGGCTTCACAGGTTCTCCGGCGACGGGGAAAGACAGAGAAACCGCCGCGGAAAAACTTCCCGGCCAAA
ACAGCAGCAAAGACGACGGGGGCGACTACGACGATGAAATTCCAGAGGCCGTAGCCAAGAGGATCATAACGAGAATCTTGGCTTTCGTCGGAATTCCGATGGCGTTCGGT
GTGACGTTACTGAAGATTTTCGAGGCGATCAAGGTGCAGAACCTGTGGGATGTGCCGATCTGGCTGCCATTTTTGACGATATTTTTGACATTTGGAGCTTCGACGATGGG
AATTGCTTACGGGACGTTATCGGCGAGTTTGGATCCGGAGAAGGAAGGGACTCTGTTTGGATGGGAACAGGTGGAGAGGAATTGGGTAGAGATGTGGAAGGAGGAAGATG
AAGCCAATCGCCGAGGAAACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKTLVCSFRQALDLSKHPPWKLRSRINNSTLTKNLSNFTRTSRRQIQLNAKGFTGSPATGKDRETAAEKLPGQNSSKDDGGDYDDEIPEAVAKRIITRILAFVGIPMAFG
VTLLKIFEAIKVQNLWDVPIWLPFLTIFLTFGASTMGIAYGTLSASLDPEKEGTLFGWEQVERNWVEMWKEEDEANRRGN

Spg002956 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome