; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg003369 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg003369
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDUF4050 domain-containing protein
Genome locationscaffold4:47622365..47626156
RNA-Seq ExpressionSpg003369
SyntenySpg003369
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025124 - Domain of unknown function DUF4050


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004139307.1 uncharacterized protein LOC101220352 [Cucumis sativus]6.1e-5584.13Show/hide
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XP_008465549.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503177 isoform X2 [Cucumis melo]2.7e-5584.92Show/hide
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XP_016903413.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503177 isoform X1 [Cucumis melo]1.3e-5783.46Show/hide
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XP_038889429.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X1 [Benincasa hispida]1.4e-5685.83Show/hide
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XP_038889430.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X2 [Benincasa hispida]1.9e-5687.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFZ6 Uncharacterized protein2.9e-5584.13Show/hide
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A0A1S3CQL1 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X21.3e-5584.92Show/hide
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A0A1S4E5A2 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X16.3e-5883.46Show/hide
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A0A6J1G589 uncharacterized protein LOC1114508501.4e-5278.91Show/hide
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        RG K AP ISGNNLNSRM SMSDD WSTSTCDLDE+LTLQSRQNSFI++ ++NPNHGG TD LSNHSDFVNHG +LWTQTRLRW+GN ESAKRTK+ H+T
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A0A6J1KGB3 uncharacterized protein LOC1114936401.8e-5278.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15350.1 unknown protein5.4e-0933.63Show/hide
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        + PS+S+D WSTST D+D  +T  S+ +  ++S N   +      N +   ++VN G +LW QTR RW+G  +       +    L+W   T + LL S 
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AT1G15350.2 unknown protein5.4e-0933.63Show/hide
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        + PS+S+D WSTST D+D  +T  S+ +  ++S N   +      N +   ++VN G +LW QTR RW+G  +       +    L+W   T + LL S 
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        K F + IPL+ ++
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AT3G15770.1 unknown protein5.4e-0934.21Show/hide
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        R PS+  S+D W+ +T D++   +      S I++ N   +  G   + +  ++FVNHG VLW QTR +W+G++ S  R        L+  +T E LL S
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         K F R IPL  ++
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AT5G25360.1 unknown protein1.7e-1542.86Show/hide
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        + PS+S+D WSTSTC++D   TLQS+++    S  +N +    T   SN ++FVNHG  LW QTR +W+ N  S K+ K    T +SW  T E LL   K
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AT5G25360.2 unknown protein1.7e-1542.86Show/hide
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         F R IPL  ++
Subjt:  PFHRRIPLSILI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTAAGTCAGCAAGTAGAACAATGGGAAGCAAGAGAGTGTTCAGAGGCGATCCAGGGCTGAACCGAGTGGAACTGGGGCGACCAGGGGTAGCAGGGACCGAACGGGG
ACGGAAGGACTCGGCCCACGCAAGTGGGCCGAGTGGTCGGCCTCGACCTTGGGGGCAGGCCGACCATATGGGAAACAAAATCCATGATAATCCAAGGAAAAATATAACCG
GATTTTTCTCGTCTTGGCAATTTTCTGACCCATTGAAGATGATGGACTATACATCTCTAAGTAAATGTTTTCAACATGGTTCTAACAGAGGAAGTGTTTCTTTTGGTAGG
GGTATTAAACCTGCACCTGCTATCTCTGGGAATAATCTGAATTCTAGGATGCCAAGCATGTCAGATGATCTTTGGAGTACAAGCACATGTGATCTCGATGAGCTTCTTAC
GCTTCAATCTCGACAAAACTCATTTATCAATTCAATAAACCACAACCCTAATCATGGAGGTGGCACTGACAATTTGAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTG
TTCTTTGGACTCAGACCAGGCTCCGCTGGATCGGAAATCGTGAGTCTGCTAAACGAACTAAAAAAAGTCATGTTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTCTTG
CTGGAAAGCAAAAAACCTTTTCATCGCCGTATACCTTTATCTATATTAATCTCTAAAACAAACTCTCTAGTTTTGAATTCTGATAATACTGAGCTTGGATTTTGTGGTGA
TATTGCTGTCAACTGTGTTGGATGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTAAGTCAGCAAGTAGAACAATGGGAAGCAAGAGAGTGTTCAGAGGCGATCCAGGGCTGAACCGAGTGGAACTGGGGCGACCAGGGGTAGCAGGGACCGAACGGGG
ACGGAAGGACTCGGCCCACGCAAGTGGGCCGAGTGGTCGGCCTCGACCTTGGGGGCAGGCCGACCATATGGGAAACAAAATCCATGATAATCCAAGGAAAAATATAACCG
GATTTTTCTCGTCTTGGCAATTTTCTGACCCATTGAAGATGATGGACTATACATCTCTAAGTAAATGTTTTCAACATGGTTCTAACAGAGGAAGTGTTTCTTTTGGTAGG
GGTATTAAACCTGCACCTGCTATCTCTGGGAATAATCTGAATTCTAGGATGCCAAGCATGTCAGATGATCTTTGGAGTACAAGCACATGTGATCTCGATGAGCTTCTTAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKSASRTMGSKRVFRGDPGLNRVELGRPGVAGTERGRKDSAHASGPSGRPRPWGQADHMGNKIHDNPRKNITGFFSSWQFSDPLKMMDYTSLSKCFQHGSNRGSVSFGR
GIKPAPAISGNNLNSRMPSMSDDLWSTSTCDLDELLTLQSRQNSFINSINHNPNHGGGTDNLSNHSDFVNHGFVLWTQTRLRWIGNRESAKRTKKSHVTGLSWYMTKELL
LESKKPFHRRIPLSILISKTNSLVLNSDNTELGFCGDIAVNCVGW