CuGenDBv2

Gene ID	Spg003400
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Heat shock protein DnaJ, cysteine-rich domain containing protein
Genome location	scaffold4:47662381..47665498
RNA-Seq Expression	Spg003400
Synteny	Spg003400
Gene Ontology terms	GO:0061077 - chaperone-mediated protein folding (biological process) GO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component) GO:0101031 - chaperone complex (cellular component) GO:0044183 - protein folding chaperone (molecular function)
InterPro domains	IPR036410 - Heat shock protein DnaJ, cysteine-rich domain superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6586393.1 Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_004139310.1 protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic [Cucumis sativus]

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XP_022938233.1 uncharacterized protein LOC111444376 [Cucurbita moschata]

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XP_023537582.1 uncharacterized protein LOC111798573 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

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A0A0A0LFZ2 Uncharacterized protein

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A0A1S3C5F0 uncharacterized protein LOC103497244

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A0A5A7V544 Chaperone protein DnaJ-like

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A0A6J1FIB2 uncharacterized protein LOC111444376

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A0A6J1HSG2 uncharacterized protein LOC111465718

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SwissProt top hits

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Q9SN73 Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic

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Q9XF14 Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic

5.3e-23

46.28

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Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT3G47650.1 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein

1.6e-27

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Sequences

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CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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AAATGAAGTGTTTCAAAGAACAAACCCCAGTAAGCTTTTGTCTTTTGAGGTCAAGGCTTCAGATGGTGCAGATAGTAACCAAAGCACAAAATACAAAAGCATAGTTTGCA
CAGACTGCGATGGAAATGGTGCTATCCTGTGTTCTCAGTGTAAAGGGACAGGAGTTAATTCAGAGGATCACTTCAATGGAAGGTTTAAAGCTGGTGGCTTATGCTGGCTG
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CATCCTTTGTGGAGGCTGTAATGGAGCTGGTTTTGTTGGTGGATTTATGAGTACAGCTGATAGTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAYSICSSTPICSFNASSKPKPGVFVGNSVPQKAFRINEVFQRTNPSKLLSFEVKASDGADSNQSTKYKSIVCTDCDGNGAILCSQCKGTGVNSEDHFNGRFKAGGLCWL
CSAPLVLGYEFIASIVNESNPVSFYLEFSLHLLGKRDILCGGCNGAGFVGGFMSTADS

Spg003400 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome