; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg003536 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg003536
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionprotein SPEAR1
Genome locationscaffold4:48332045..48334966
RNA-Seq ExpressionSpg003536
SyntenySpg003536
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR040356 - SPEAR family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008458547.1 PREDICTED: protein SPEAR1 [Cucumis melo]4.7e-8188.08Show/hide
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XP_011648648.1 protein SPEAR1 [Cucumis sativus]4.4e-7986.08Show/hide
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XP_023522169.1 protein SPEAR1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-7078.28Show/hide
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XP_023537409.1 protein SPEAR1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.7e-6875.92Show/hide
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        MNMGN DKRRSGSPAAAA GRRGRKGGGGEKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEMGCA YGH YPNLSA                                 
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XP_038889470.1 protein SPEAR1-like [Benincasa hispida]1.3e-8386.93Show/hide
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         Y FHQNFMG+GEYERGS RYGDSQPTT+S RWDPSNTFLETQHFGQPNMTGHLFNPHVQDS+HKNMNTKYGSDS+GSSSQNSESSET+ELDLELRLSI
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFV0 SPOROCYTELESS-like EAR-containing protein 12.1e-7986.08Show/hide
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        M N +KRRSGSP+AA  GRRGRKGGGGEKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEMGCAAY H YPNLSA DD RMQT  + +FSYS+T +SS+SSP SYGFHQN
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        FMGMGEYERGSFRYGDSQ TTT S+RWDPSNTFLETQHFGQPNM+GHLFNPHVQDSM HKN+NTKYGSDS+GSSSQNSESSETQELDLELRLSI
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A0A1S3C7M3 protein SPEAR12.3e-8188.08Show/hide
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        M N +KRRSGSPAAA  GRRGRKGGGGEKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEMGCAAY H YPNLSA DDMRMQT   S+FSYS+TQSSSSSP SYGFHQNF
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A0A6J1FCT6 protein SPEAR1-like4.6e-6674.35Show/hide
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        MNMGN DKRRS SPAAAA GRRGRKGGGGEKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEMGCA YGH YP LSA                                 
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         GMGEYERGSFRYGDSQPTTTSIRW+ SNT LETQHFG+PNMTGHL NP V DSMHKNMNTKYGSDSIGSSSQNS+SSET ELDLELRLSI
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A0A6J1HQB1 protein SPEAR1-like6.4e-6875.39Show/hide
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         GMGEYERGSFRYGDSQPTTTSIRW+ SNT +ETQHFG+PNMTGHL NP V DSMHKNMNTKYGSDSIGSSSQNSESSET ELDLELRLSI
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A0A6J1KB48 protein SPEAR3-like isoform X14.1e-6777.72Show/hide
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        MNMGN   DKRRSGS   AA  RRGRKGGGGEKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEMGCAAYGH YP LSASDDMR++TA           SSSSPSYGFHQ
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        NFMGMGE+ERGS R GDSQP TTS+RWDPS+TFLET HFGQPNMTGHLFN HVQDS+  N+N KYGSDS+  S QNSESS   ELDLELRLSI
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6IDB0 Protein SPEAR39.9e-2644.79Show/hide
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        S SP ++++   +RG+   G +KPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGE  C ++ + YP+   S   +D+R+Q       +SS S+S   SS     YGFH N 
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        M      +YER + RYGDSQP      W+PS   LE+QHF +PN T H         +H++      + S+GS  QN E+SE  ELDLELRL
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Q84X40 Protein SPEAR12.9e-2545.11Show/hide
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        S SP ++++    RRG+K  G EKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEM C ++    P+L   +D+RMQ       YS+  S SS+P YGF+ N M MG + 
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Query:  RGSFRYGDSQPTTTSIRWDPSNTFLETQHFGQPNMTGHLFNPHVQDSMHKNMNTKYGSDSIGSSSQNSESSETQELDLELRLSI
                 Q    ++ W+PS   LE+QH  +PN+T H  N     +  +       S S+GS  Q+S SSE QE+DLELRLS+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20080.1 unknown protein2.0e-2645.11Show/hide
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        S SP ++++    RRG+K  G EKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEM C ++    P+L   +D+RMQ       YS+  S SS+P YGF+ N M MG + 
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                 Q    ++ W+PS   LE+QH  +PN+T H  N     +  +       S S+GS  Q+S SSE QE+DLELRLS+
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AT2G20080.2 unknown protein5.4e-1938.04Show/hide
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        S SP ++++    RRG+K  G EKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEM C ++    P+L                          P  G H++     +Y+
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        R             ++ W+PS   LE+QH  +PN+T H  N     +  +       S S+GS  Q+S SSE QE+DLELRLS+
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AT4G28840.1 unknown protein7.0e-2744.79Show/hide
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        S SP ++++   +RG+   G +KPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGE  C ++ + YP+   S   +D+R+Q       +SS S+S   SS     YGFH N 
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Query:  M---GMGEYERGSFRYGDSQPTTTSIRWDPSNTFLETQHFGQPNMTGHLFNPHVQDSMHKNMNTKYGSDSIGSSSQNSESSETQELDLELRL
        M      +YER + RYGDSQP      W+PS   LE+QHF +PN T H         +H++      + S+GS  QN E+SE  ELDLELRL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATATGGGGAATACTGATAAGAGGAGGAGTGGGTCGCCGGCGGCGGCGGCGACAGGGCGGAGAGGGAGGAAGGGCGGCGGCGGAGAGAAACCGAAACAGCCGCAGAG
AGGGTTGGGAGTTGCTCAGTTGGAGAAGATCAGATTGCATGGCGAAATGGGCTGTGCTGCTTATGGCCACTTGTATCCAAATCTCTCCGCCAGCGATGATATGAGAATGC
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TTCAGATATGGGGATTCTCAGCCAACAACAACTTCTATAAGATGGGACCCAAGTAATACATTCCTGGAGACCCAACATTTTGGGCAACCAAACATGACTGGACACCTTTT
CAATCCTCATGTACAGGATTCAATGCACAAGAACATGAATACAAAATATGGGAGTGATTCAATTGGTTCAAGCAGTCAGAATTCTGAATCAAGTGAGACTCAAGAGCTAG
ATTTGGAGCTGAGATTGTCAATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FRYGDSQPTTTSIRWDPSNTFLETQHFGQPNMTGHLFNPHVQDSMHKNMNTKYGSDSIGSSSQNSESSETQELDLELRLSI