; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg004301 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg004301
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptiontranslation initiation factor IF-2
Genome locationscaffold6:6861601..6864771
RNA-Seq ExpressionSpg004301
SyntenySpg004301
Gene Ontology termsGO:0006413 - translational initiation (biological process)
GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR026960 - Reverse transcriptase zinc-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600462.1 hypothetical protein SDJN03_05695, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.0e-17885.07Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS
        MSRSIGRKVPGLSFLSNAN+L FVPF SSSSSSSGGHGRGRGRGGSP+HGGPFDF+SRVPGQEDSN SK ESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSS ILPS SS
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS

Query:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENR
        F+PSVKSSSAGRGR DGS PIRSP        SDSE KKPVFFSKDNAGDSAGS  PG LDR  GER+LPDS LSVLSG GRGKPMKQPV +AQPKQENR
Subjt:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENR

Query:  HLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGG-FRTGERGERGRVQDMEDGYAAGL
        HLRPRQE+GGRG  GP RG GGGPR+SRDE VRNTGR+M RGGPDGEDGGGRGRGGFR RG     GRFRGRGRGG FRTGERG+RGR QDMEDGYA+GL
Subjt:  HLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGG-FRTGERGERGRVQDMEDGYAAGL

Query:  HVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEE
        ++GDNADGE LAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSP+EE Y++ + TNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEE
Subjt:  HVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEE

Query:  WE
        WE
Subjt:  WE

XP_022136793.1 uncharacterized protein LOC111008406 [Momordica charantia]1.3e-18387.41Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF--SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSH--GGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPS
        MSRSIGRKVPGLSFL NA +LSFVPF  SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSH  GGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDS GTSGLGHGRGKP PSSPILPS
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF--SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSH--GGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPS

Query:  FSSFSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIR-------SPGSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQ
        FSSF+PSVKSSSAGRGRV GSPPIR       S  SD EPKKPVFFSKDNA +SA STR G LDRG GERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPV + QPKQ
Subjt:  FSSFSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIR-------SPGSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQ

Query:  ENRHLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGED-GGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYA
        ENRHLRPRQESGGRG GGPVRGVGGGPRMSRDE VRNTGR++SRGGPDGED GGGRGRGGFR RGGFRGRG FRGRGRG FRTGERGERGR QDMEDGYA
Subjt:  ENRHLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGED-GGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYA

Query:  AGLHVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQS
        AGL++GDNADGE LAKRIGTE+MNQLVEGFEEMSGR LPSP+EEEYLDG+HTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDE PPIPLRD LE  KPFLMAYE IQS
Subjt:  AGLHVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQS

Query:  HEEWE
        HEEWE
Subjt:  HEEWE

XP_022942601.1 uncharacterized protein LOC111447586 [Cucurbita moschata]1.8e-17784.54Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS
        MSRSIGRKVPGLSFLSNAN+L FVPF SSSSSSSGGHGRGRGRGGSP+HGGPFDF+SRVPGQEDSN SK ESVDSRGTSGLGHG GKPSPSS ILPS SS
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS

Query:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENR
        F+PSVKSS AGRGR DGS PIRSP        SDSE  KPVFFSKDNAGDSAGS RPG LDR  GER+LPDS LSVLSG GRGKPMKQPV +AQPKQENR
Subjt:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENR

Query:  HLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLH
        HLRPRQE+GGRG  GP RG GGGPR+SRDE VRNTGR+M RGGPDGEDGGGRGRGGFR RG     GRFRGRGRG FRTGERG+RGR QDMEDGYA+GL+
Subjt:  HLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLH

Query:  VGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEW
        +GDNADGE LAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSP+EE Y++ + TNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEW
Subjt:  VGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEW

Query:  E
        E
Subjt:  E

XP_022980643.1 uncharacterized protein LOC111479946 [Cucurbita maxima]2.9e-18085Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSSF
        MSRSIGRKVPGLSFLSNAN+L FVPFSSSSSSSGGHGRGRGR GSP+HGGPFDF+SRVPGQEDSN SK ESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSS ILPS SSF
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSSF

Query:  SPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRH
        +PSVKSSSAGRGR DGS PIRSP       GSDSE KKPVFFSKDNA DSAGS RPG LDR  GERNLPDS LSVLSG GRGKPMKQP+ ++QPKQENRH
Subjt:  SPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRH

Query:  LRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHV
        LRPRQE+GGRG  GP RG GGGPR+SRDE VRNTGR+MSRGGPDGEDGGGRG      RGGFRGRGRFRGRGRG FRTGERGERGR QDMEDGYA+GL++
Subjt:  LRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHV

Query:  GDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE
        GDNADGE LAKRIGTEHMNQLVEG EEMSGRVLPSP+EE Y++ +  NYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE
Subjt:  GDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE

XP_023544535.1 uncharacterized protein LOC111804080 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.4e-17984.79Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS
        MSRSIGRKVPGLSFLSNAN+L FVPF SSSSSSSGGHG+GRGRGGSP+HGGPFDF+SRVPGQEDSN SK ESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSS ILPS SS
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS

Query:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENR
        F+PSVKSSSAGRGR DGS PIRSP       GSDSE KKPVFFSKDNAGDSAGS RPG L   AGERNLPDS LSVLSG GRGKPMKQP+ ++QPKQENR
Subjt:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENR

Query:  HLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLH
        HLRPRQE+GGRG  GP RG GGGPR+SRDE VRNTGR+MSRGGPDGEDGGGRGRGGFR RG     GRFRGRGRG FRTGERG+RGR QDMEDGYA+GL+
Subjt:  HLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLH

Query:  VGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEW
        +GDNADGE LAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSP+EE Y++ + TNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGI+SHEEW
Subjt:  VGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEW

Query:  E
        E
Subjt:  E

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVG1 Uncharacterized protein2.1e-14474.43Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSS-SSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS
        MSRSIGRKV G S LSNAN+L  VPFSSS SSSSGGHGRGRGRG  PS  GPFDFT  VP QE SNASKQE +DSR T GLGHGRGKP+PSSP+ PSFSS
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSS-SSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS

Query:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSPGS-DSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRHLRPRQ
        FSPSV+ SS GRGR D SP IRSP   DSEPKKPVFFSK+NAGDSA ST  G L R +GERNLP+SL S  SGVGRGKPMKQPV + QPKQENRHLRPRQ
Subjt:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSPGS-DSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRHLRPRQ

Query:  ESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHVGDNAD
        E  G GAG   RG G  PR+ R EP RNT R++S+ GPDGE GGGRG  G+R RG    RG +R   RG FRTGER ER    D EDGYAAGL++G+N D
Subjt:  ESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHVGDNAD

Query:  GENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE
        GE LAKRIGTE+MN+LVEGFEEMSGRVLPSP+ ++YLDG+ TN+MIECEPEYLMGDFE+NPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYE IQSHEEWE
Subjt:  GENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE

A0A5D3CZK6 Translation initiation factor IF-25.7e-14274.11Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSSF
        MSRSIGRKVPG S LSNAN+L  VPF  SSSSSGGHGRGRGRG  PS  GPFDFT  VP QE  NASKQE +DSR T GLGHGRG P+PSSPI PSFSSF
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSSF

Query:  SPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSPGS-DSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRHLRPRQE
        SPSV+ SS GRGR D SP IRSP   DSEPKKPVFFS++NAGDSA ST  G L R +GERNLPDSL S  SGVGRGKPMKQPV + QPKQENRHLRPRQE
Subjt:  SPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSPGS-DSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRHLRPRQE

Query:  SGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHVGDNADG
          GRGAGG  R  G  PR+ R EP RNT R+ SRGGPDGE GGGRG  G+R RG    RG FR   RG FRTGER +R   QD EDGYAAGL++G+N DG
Subjt:  SGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHVGDNADG

Query:  ENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE
        E LAK++G E MNQLVEGFEEMSGRVLPSP+E+  LDG+  N+MIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPI LRDA EKMKPFLMAYE IQSHEEWE
Subjt:  ENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE

A0A6J1C8I7 uncharacterized protein LOC1110084066.1e-18487.41Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF--SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSH--GGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPS
        MSRSIGRKVPGLSFL NA +LSFVPF  SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSH  GGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDS GTSGLGHGRGKP PSSPILPS
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF--SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSH--GGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPS

Query:  FSSFSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIR-------SPGSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQ
        FSSF+PSVKSSSAGRGRV GSPPIR       S  SD EPKKPVFFSKDNA +SA STR G LDRG GERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPV + QPKQ
Subjt:  FSSFSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIR-------SPGSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQ

Query:  ENRHLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGED-GGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYA
        ENRHLRPRQESGGRG GGPVRGVGGGPRMSRDE VRNTGR++SRGGPDGED GGGRGRGGFR RGGFRGRG FRGRGRG FRTGERGERGR QDMEDGYA
Subjt:  ENRHLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGED-GGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYA

Query:  AGLHVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQS
        AGL++GDNADGE LAKRIGTE+MNQLVEGFEEMSGR LPSP+EEEYLDG+HTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDE PPIPLRD LE  KPFLMAYE IQS
Subjt:  AGLHVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQS

Query:  HEEWE
        HEEWE
Subjt:  HEEWE

A0A6J1FPB3 uncharacterized protein LOC1114475868.5e-17884.54Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS
        MSRSIGRKVPGLSFLSNAN+L FVPF SSSSSSSGGHGRGRGRGGSP+HGGPFDF+SRVPGQEDSN SK ESVDSRGTSGLGHG GKPSPSS ILPS SS
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-SSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSS

Query:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENR
        F+PSVKSS AGRGR DGS PIRSP        SDSE  KPVFFSKDNAGDSAGS RPG LDR  GER+LPDS LSVLSG GRGKPMKQPV +AQPKQENR
Subjt:  FSPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENR

Query:  HLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLH
        HLRPRQE+GGRG  GP RG GGGPR+SRDE VRNTGR+M RGGPDGEDGGGRGRGGFR RG     GRFRGRGRG FRTGERG+RGR QDMEDGYA+GL+
Subjt:  HLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLH

Query:  VGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEW
        +GDNADGE LAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSP+EE Y++ + TNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEW
Subjt:  VGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEW

Query:  E
        E
Subjt:  E

A0A6J1IZW9 uncharacterized protein LOC1114799461.4e-18085Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSSF
        MSRSIGRKVPGLSFLSNAN+L FVPFSSSSSSSGGHGRGRGR GSP+HGGPFDF+SRVPGQEDSN SK ESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSS ILPS SSF
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSSF

Query:  SPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRH
        +PSVKSSSAGRGR DGS PIRSP       GSDSE KKPVFFSKDNA DSAGS RPG LDR  GERNLPDS LSVLSG GRGKPMKQP+ ++QPKQENRH
Subjt:  SPSVKSSSAGRGRVDGSPPIRSP-------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRH

Query:  LRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHV
        LRPRQE+GGRG  GP RG GGGPR+SRDE VRNTGR+MSRGGPDGEDGGGRG      RGGFRGRGRFRGRGRG FRTGERGERGR QDMEDGYA+GL++
Subjt:  LRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSRDEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHV

Query:  GDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE
        GDNADGE LAKRIGTEHMNQLVEG EEMSGRVLPSP+EE Y++ +  NYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE
Subjt:  GDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53645.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein3.8e-4535.77Show/hide
Query:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-------SSSSSSSGGHGRGRGR---GGSPSHG-GPFDFTSR--VPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKP
        M  +IGR+    +  + A+ +   PF        SSSS S G GRGRG    GG P+ G G F       VPG+E S+A            G GHGRG+P
Subjt:  MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPF-------SSSSSSSGGHGRGRGR---GGSPSHG-GPFDFTSR--VPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKP

Query:  SPSSPILPSFSSFSPSVKSSSAGRGR----------VDGSPPIRSP-----------------------------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTR
          S  I P+F+SF  S  S S GRGR              PP +SP                              +D     PVF       D+  S  
Subjt:  SPSSPILPSFSSFSPSVKSSSAGRGR----------VDGSPPIRSP-----------------------------GSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTR

Query:  PGVLDRGAGERNLPDSLLSVL-------SGVGRGKPMKQ--PVQDAQPKQENRHLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGG---PRMSRDEPVRNTGRVMSRGGP
        P   +   G+ + PD++ + L       SG GRGKP+ +  P++    +Q  R   P Q+   +        V  G   P++S +E  R     +SRG  
Subjt:  PGVLDRGAGERNLPDSLLSVL-------SGVGRGKPMKQ--PVQDAQPKQENRHLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGG---PRMSRDEPVRNTGRVMSRGGP

Query:  DGEDGGGR-GRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYL
        +G   GGR GRG  R RG    RGR RGRG  G+R  ++ E G  + M       +  GD+ADGE  A+++G E M  L EGFEE+  + LPS   +  +
Subjt:  DGEDGGGR-GRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPVEEEYL

Query:  DGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE--VSFSVTKSPFFDYFVLEY
        D   TN MIECEPEY+M DF SNPDIDE PP+ LR+ LEK+KPF++AYEGI+  EEWE  ++ ++T++P     V  Y
Subjt:  DGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWE--VSFSVTKSPFFDYFVLEY

AT3G25270.1 Ribonuclease H-like superfamily protein2.0e-0929.86Show/hide
Query:  IWKHRSPKKVKVFLWSLLYGSLNTDDRLQRKFKHWSLSPSGCRLCLKRGEDLDHLFLHCEFASKAWNFIA----NLLGVSFCFPRRIEDWLIEGLHGWNF
        IWK ++  K+K FLW LL G+L T D L+R  +H    P  C  C +  E   HLF  C +A + W         L         ++E  L   L     
Subjt:  IWKHRSPKKVKVFLWSLLYGSLNTDDRLQRKFKHWSLSPSGCRLCLKRGEDLDHLFLHCEFASKAWNFIA----NLLGVSFCFPRRIEDWLIEGLHGWNF

Query:  HGKARVMASCAFRATLWSLWMERNSITFEDKSSSFDIFCNHVQN
          +   + + A    LW LW  RN + F+ KS S+       +N
Subjt:  HGKARVMASCAFRATLWSLWMERNSITFEDKSSSFDIFCNHVQN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTAGATCAATCGGAAGAAAGGTTCCAGGACTTTCATTTCTATCCAATGCGAACAGACTAAGCTTTGTACCATTTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCCGGTGGTCATGG
CCGTGGCCGAGGTAGAGGTGGCTCTCCCTCCCATGGCGGACCCTTTGATTTCACTTCTCGAGTTCCGGGTCAGGAAGATTCAAATGCGTCTAAGCAAGAATCTGTAGATT
CTCGTGGTACTTCTGGGCTTGGACATGGCCGTGGAAAGCCCAGTCCTTCGTCCCCAATTCTTCCGTCTTTCTCTTCCTTTTCGCCCTCTGTTAAGTCCTCGTCTGCTGGT
CGGGGAAGAGTTGATGGTTCACCACCGATTCGGTCCCCTGGATCGGATTCGGAGCCTAAGAAACCTGTGTTTTTCTCGAAGGATAATGCGGGTGACTCGGCTGGAAGTAC
TCGGCCTGGTGTATTGGACAGGGGTGCAGGGGAGAGAAATTTGCCTGATAGTTTGCTTTCTGTGTTATCTGGTGTTGGACGAGGAAAACCCATGAAGCAACCAGTCCAGG
ATGCTCAACCGAAGCAGGAGAATCGTCATCTGAGACCTAGACAAGAGTCGGGTGGCCGTGGAGCTGGTGGGCCTGTAAGGGGTGTTGGCGGCGGCCCAAGAATGAGCCGT
GATGAACCTGTGAGGAACACTGGTAGGGTGATGTCAAGAGGGGGGCCTGATGGTGAAGATGGCGGTGGTAGAGGGAGAGGCGGGTTCCGGGATAGAGGAGGGTTTCGAGG
CAGAGGAAGGTTCAGAGGGAGAGGAAGAGGTGGATTTAGAACTGGGGAGAGAGGGGAGAGAGGAAGAGTTCAAGATATGGAGGATGGATATGCAGCAGGGCTTCATGTAG
GCGACAATGCAGATGGTGAGAACCTAGCAAAGAGGATTGGAACTGAACATATGAACCAGCTGGTTGAAGGTTTTGAAGAGATGAGTGGTAGAGTGCTGCCTTCGCCAGTG
GAGGAAGAGTATTTGGATGGGGTGCATACGAATTATATGATAGAGTGTGAGCCGGAGTACTTGATGGGGGATTTTGAAAGTAATCCTGATATTGATGAGAATCCACCTAT
TCCTCTTCGGGATGCACTTGAGAAGATGAAACCTTTCTTAATGGCGTATGAAGGCATCCAAAGCCACGAAGAGTGGGAGGTATCTTTTTCTGTTACGAAGTCACCATTTT
TCGATTACTTTGTTCTCGAGTATTTTCTACTTGTTAATTTTCTTCGTAGAGGTTTGTTTGATAGGGAAATCCCTAGCTGGGCTGGTTTAGTTTCGATCTTAAATGACATT
CATCTGTCGGATGAGCATGATAAAATCAGGTGGAACGCTGACCCGACTGGTGTTTTCTCCACAAAATCTCTTTTCTCCAACCTTTTCCAGTCTTCTCCAAGGCTCGACCT
CCCTATTACCAATTTGATTTGGAAGCATAGAAGTCCAAAGAAGGTTAAGGTCTTTTTATGGTCTCTATTGTATGGTAGCCTCAACACGGACGACCGACTCCAAAGAAAAT
TTAAGCATTGGTCCCTCTCTCCCTCAGGATGTCGGTTATGTTTGAAAAGGGGGGAAGATCTTGATCACCTTTTCCTCCATTGTGAGTTTGCTTCAAAGGCATGGAATTTC
ATAGCAAACCTGCTGGGCGTGTCCTTTTGCTTCCCCCGGAGAATTGAGGATTGGCTTATCGAGGGGCTTCACGGATGGAACTTCCATGGAAAAGCTAGAGTGATGGCTAG
TTGTGCTTTTAGAGCTACTTTATGGTCCTTATGGATGGAAAGGAACTCCATAACTTTTGAGGATAAATCTTCTAGCTTTGATATTTTTTGTAATCATGTCCAAAATTCGG
CCTCGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTAGATCAATCGGAAGAAAGGTTCCAGGACTTTCATTTCTATCCAATGCGAACAGACTAAGCTTTGTACCATTTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCCGGTGGTCATGG
CCGTGGCCGAGGTAGAGGTGGCTCTCCCTCCCATGGCGGACCCTTTGATTTCACTTCTCGAGTTCCGGGTCAGGAAGATTCAAATGCGTCTAAGCAAGAATCTGTAGATT
CTCGTGGTACTTCTGGGCTTGGACATGGCCGTGGAAAGCCCAGTCCTTCGTCCCCAATTCTTCCGTCTTTCTCTTCCTTTTCGCCCTCTGTTAAGTCCTCGTCTGCTGGT
CGGGGAAGAGTTGATGGTTCACCACCGATTCGGTCCCCTGGATCGGATTCGGAGCCTAAGAAACCTGTGTTTTTCTCGAAGGATAATGCGGGTGACTCGGCTGGAAGTAC
TCGGCCTGGTGTATTGGACAGGGGTGCAGGGGAGAGAAATTTGCCTGATAGTTTGCTTTCTGTGTTATCTGGTGTTGGACGAGGAAAACCCATGAAGCAACCAGTCCAGG
ATGCTCAACCGAAGCAGGAGAATCGTCATCTGAGACCTAGACAAGAGTCGGGTGGCCGTGGAGCTGGTGGGCCTGTAAGGGGTGTTGGCGGCGGCCCAAGAATGAGCCGT
GATGAACCTGTGAGGAACACTGGTAGGGTGATGTCAAGAGGGGGGCCTGATGGTGAAGATGGCGGTGGTAGAGGGAGAGGCGGGTTCCGGGATAGAGGAGGGTTTCGAGG
CAGAGGAAGGTTCAGAGGGAGAGGAAGAGGTGGATTTAGAACTGGGGAGAGAGGGGAGAGAGGAAGAGTTCAAGATATGGAGGATGGATATGCAGCAGGGCTTCATGTAG
GCGACAATGCAGATGGTGAGAACCTAGCAAAGAGGATTGGAACTGAACATATGAACCAGCTGGTTGAAGGTTTTGAAGAGATGAGTGGTAGAGTGCTGCCTTCGCCAGTG
GAGGAAGAGTATTTGGATGGGGTGCATACGAATTATATGATAGAGTGTGAGCCGGAGTACTTGATGGGGGATTTTGAAAGTAATCCTGATATTGATGAGAATCCACCTAT
TCCTCTTCGGGATGCACTTGAGAAGATGAAACCTTTCTTAATGGCGTATGAAGGCATCCAAAGCCACGAAGAGTGGGAGGTATCTTTTTCTGTTACGAAGTCACCATTTT
TCGATTACTTTGTTCTCGAGTATTTTCTACTTGTTAATTTTCTTCGTAGAGGTTTGTTTGATAGGGAAATCCCTAGCTGGGCTGGTTTAGTTTCGATCTTAAATGACATT
CATCTGTCGGATGAGCATGATAAAATCAGGTGGAACGCTGACCCGACTGGTGTTTTCTCCACAAAATCTCTTTTCTCCAACCTTTTCCAGTCTTCTCCAAGGCTCGACCT
CCCTATTACCAATTTGATTTGGAAGCATAGAAGTCCAAAGAAGGTTAAGGTCTTTTTATGGTCTCTATTGTATGGTAGCCTCAACACGGACGACCGACTCCAAAGAAAAT
TTAAGCATTGGTCCCTCTCTCCCTCAGGATGTCGGTTATGTTTGAAAAGGGGGGAAGATCTTGATCACCTTTTCCTCCATTGTGAGTTTGCTTCAAAGGCATGGAATTTC
ATAGCAAACCTGCTGGGCGTGTCCTTTTGCTTCCCCCGGAGAATTGAGGATTGGCTTATCGAGGGGCTTCACGGATGGAACTTCCATGGAAAAGCTAGAGTGATGGCTAG
TTGTGCTTTTAGAGCTACTTTATGGTCCTTATGGATGGAAAGGAACTCCATAACTTTTGAGGATAAATCTTCTAGCTTTGATATTTTTTGTAATCATGTCCAAAATTCGG
CCTCGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRSIGRKVPGLSFLSNANRLSFVPFSSSSSSSGGHGRGRGRGGSPSHGGPFDFTSRVPGQEDSNASKQESVDSRGTSGLGHGRGKPSPSSPILPSFSSFSPSVKSSSAG
RGRVDGSPPIRSPGSDSEPKKPVFFSKDNAGDSAGSTRPGVLDRGAGERNLPDSLLSVLSGVGRGKPMKQPVQDAQPKQENRHLRPRQESGGRGAGGPVRGVGGGPRMSR
DEPVRNTGRVMSRGGPDGEDGGGRGRGGFRDRGGFRGRGRFRGRGRGGFRTGERGERGRVQDMEDGYAAGLHVGDNADGENLAKRIGTEHMNQLVEGFEEMSGRVLPSPV
EEEYLDGVHTNYMIECEPEYLMGDFESNPDIDENPPIPLRDALEKMKPFLMAYEGIQSHEEWEVSFSVTKSPFFDYFVLEYFLLVNFLRRGLFDREIPSWAGLVSILNDI
HLSDEHDKIRWNADPTGVFSTKSLFSNLFQSSPRLDLPITNLIWKHRSPKKVKVFLWSLLYGSLNTDDRLQRKFKHWSLSPSGCRLCLKRGEDLDHLFLHCEFASKAWNF
IANLLGVSFCFPRRIEDWLIEGLHGWNFHGKARVMASCAFRATLWSLWMERNSITFEDKSSSFDIFCNHVQNSAS