; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg004428 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg004428
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDNA primase
Genome locationscaffold9:9464498..9471298
RNA-Seq ExpressionSpg004428
SyntenySpg004428
Gene Ontology termsGO:0006269 - DNA replication, synthesis of RNA primer (biological process)
GO:0005658 - alpha DNA polymerase:primase complex (cellular component)
GO:0003896 - DNA primase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002755 - DNA primase, small subunit
IPR014052 - DNA primase, small subunit, eukaryotic/archaeal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039338.1 DNA primase, small subunit [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-17188.29Show/hide
Query:  VAKMVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENS
        VAKMV   VENG SDMVIDGNEQKPKK V DGFDANYLKIYYGKLFPY DFFKWMSYGNDGKHPGSD+SYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFN+LSEME S
Subjt:  VAKMVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENS

Query:  IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCW
        IKE+CPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAGDNVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCW
Subjt:  IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCW

Query:  VCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRG
        VCDGKARRLSNEQRAAI+EYFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSY +VL+D FES+LLC QKIFSTEERYEKILDMI DE        +ITS+LRG
Subjt:  VCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRG

Query:  RWQENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE
        RWQ+NRR SK DVNS+RWEQLKN+LQSGKHK +
Subjt:  RWQENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE

KAG6592333.1 DNA primase small subunit, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-17188.48Show/hide
Query:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
        MV+E  ENG SDMVIDGNEQKPK IV +GFDANYLKIYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KE
Subjt:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE

Query:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
        KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAG NVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVID+TLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD

Query:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ
        GKARRLSNEQRAAI++YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYI+VL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEK+LDMIHDE        +ITSELRGRWQ
Subjt:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ

Query:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE
        +NRRPSK DVN VRWEQLKNMLQSGKHK +
Subjt:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE

XP_022925368.1 DNA primase small subunit [Cucurbita moschata]2.5e-17189.33Show/hide
Query:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
        MV+E  ENG SDMVIDGNEQKPK IV +GFDANYL+IYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KE
Subjt:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE

Query:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
        KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAG NVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD

Query:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ
        GKARRLSNEQRAAI++YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYI+VL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDE        +ITSELRGRWQ
Subjt:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ

Query:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHK
        +NRRPSK DVN VRWEQLKNMLQSGKHK
Subjt:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHK

XP_023535939.1 DNA primase small subunit [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.3e-17188.79Show/hide
Query:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
        MV+E  ENG SDMVIDGNEQKPK IV + FDANYLKIYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KE
Subjt:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE

Query:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
        KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAG NVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD

Query:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ
        GKARRLSNEQRAAI++YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYI+VL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDE        +ITSELRGRWQ
Subjt:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ

Query:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE
        +NRRPSK DVN VRWEQLKNMLQSGKHK +
Subjt:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE

XP_038889665.1 DNA primase small subunit [Benincasa hispida]2.1e-17088.18Show/hide
Query:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
        MV   +ENG SDMVIDGNEQKPK  V DGFDANYLKIYYGKLFPY DFFKWMSYGNDGKHPG+D+SYFGRREFSFTLDND+YLRFQSFNSLSEMENSIKE
Subjt:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE

Query:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
        KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAGDNVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGA VCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD

Query:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ
        GKARRLSNEQRAAI+EYFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYI+VL+D FES+LL SQKIFSTEERYEKILDMIHDE        +ITSELRG+WQ
Subjt:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ

Query:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE
        +NRR SK DVNSVRWE+LKNMLQSGK+K +
Subjt:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUP7 DNA primase4.8e-16887.27Show/hide
Query:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
        MV   VENG SDMVIDGNEQKPK  V DGFDANYLKIYYGKLFPY DFFKWMSYGNDGKHPGSD+SYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFN+LSEME SIKE
Subjt:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE

Query:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
        KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYA DNVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVI TTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD

Query:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ
        GKARRLSNEQRAAI+EYFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFL RSY +VL+D FES+LLCSQKIFSTEERYEKILDMI DE        +ITS+LRGRWQ
Subjt:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ

Query:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE
        +NRR SK DVNS+RWEQLK++LQSGKHK +
Subjt:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE

A0A5A7T8Y3 DNA primase1.6e-17188.29Show/hide
Query:  VAKMVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENS
        VAKMV   VENG SDMVIDGNEQKPKK V DGFDANYLKIYYGKLFPY DFFKWMSYGNDGKHPGSD+SYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFN+LSEME S
Subjt:  VAKMVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENS

Query:  IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCW
        IKE+CPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAGDNVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCW
Subjt:  IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCW

Query:  VCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRG
        VCDGKARRLSNEQRAAI+EYFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSY +VL+D FES+LLC QKIFSTEERYEKILDMI DE        +ITS+LRG
Subjt:  VCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRG

Query:  RWQENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE
        RWQ+NRR SK DVNS+RWEQLKN+LQSGKHK +
Subjt:  RWQENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE

A0A6J1CKZ3 DNA primase7.4e-16986.97Show/hide
Query:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
        M+ E VENG  DM IDG EQKP+K+VPDGFD NYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSD+SYFGRREFSFTL+NDIYLR+QSFN+LSEMENSIKE
Subjt:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE

Query:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
        KCPFKIDIG VYSVD AKRHAYAGDNVFTP+EREL+FDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD

Query:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ
        GKARRLSNEQRAAI+E+FHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSY +VL+D FES LLCSQKIFSTEERYEKILDMI DE        ++TSELRGRWQ
Subjt:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ

Query:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE
        ENR+PSKKDVN VRWEQLK+MLQS KHK +
Subjt:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKRE

A0A6J1EEZ9 DNA primase1.2e-17189.33Show/hide
Query:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
        MV+E  ENG SDMVIDGNEQKPK IV +GFDANYL+IYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KE
Subjt:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE

Query:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
        KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAG NVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD

Query:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ
        GKARRLSNEQRAAI++YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYI+VL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDE        +ITSELRGRWQ
Subjt:  GKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQ

Query:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHK
        +NRRPSK DVN VRWEQLKNMLQSGKHK
Subjt:  ENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHK

A0A6J1I8T4 DNA primase2.1e-16889.69Show/hide
Query:  SDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGS
        +DMVIDGNEQKPK IV +GFDANYLKIYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KEKCPFKIDIG 
Subjt:  SDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGS

Query:  VYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ
        VYSVDPAKRHAYAG NVFTP+ERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ
Subjt:  VYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ

Query:  RAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQENRRPSKKDV
        RAAI++YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYI+VL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDE        +ITSELRGRWQ+NRRPSK DV
Subjt:  RAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQENRRPSKKDV

Query:  NSVRWEQLKNMLQSGKHKRE
        N VRWEQLKNMLQSGKHK +
Subjt:  NSVRWEQLKNMLQSGKHKRE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O14215 DNA primase small subunit3.4e-5435.95Show/hide
Query:  KMVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYG----NDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME
        K ++E++ NG     +DG +Q          D+  +  YY  LFP+   F+W+++G    ND          F  REF+FTL ND Y+R+ SF++  E++
Subjt:  KMVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYG----NDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME

Query:  NSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVH
              CP + ++G VYS +P  R      + F PL++ELVFDIDMTDYDDVR CCS  ++C  CWP +T A++V+D    +DFGF HILWV+SGRRG+H
Subjt:  NSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVH

Query:  CWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGN-ENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSE
         W+CD  A  L +  R  I+ Y  +  GN +   + I+     LHP L RS +++L+  F   +L  Q  ++++E  E +L ++ D+         + S 
Subjt:  CWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGN-ENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSE

Query:  LRGRWQENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSG
        LR +W+ +   S K+    +W  +  +L SG
Subjt:  LRGRWQENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSG

P20664 DNA primase small subunit4.9e-6944.78Show/hide
Query:  LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERE
        LK+YY +LFPY  +++W++YG      G  ++YF  REFSFTL +DIY+R+QSFN+ SE+E  +++  P+KIDIG+VYS  P  +H       F   E+E
Subjt:  LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERE

Query:  LVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLT
        LVFDIDMTDYDDVR CCS AD+C  CW LMT A+++ID  L++DFGF H LWV+SGRRGVHCWVCD   R+LS+  R+ I EY  L +G ++ +KK+ L 
Subjt:  LVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLT

Query:  SPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKREE
          V HPF+ +S I++++  FE   L  Q I   +E ++KIL ++         P  I  EL+  +Q      K   +  RWE L+ +  S ++ + +
Subjt:  SPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQENRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKREE

P49642 DNA primase small subunit6.4e-6946.88Show/hide
Query:  LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERE
        LK+YY +LFPY+ +++W++YG      G  ++YF  REFSFTL +DIY+R+QSFN+ S++E  +++  P+KIDIG+VYS  P  +H       F   E+E
Subjt:  LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERE

Query:  LVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLT
        LVFDIDMTDYDDVR CCS AD+C  CW LMT AI++ID  L++DFGF H LWV+SGRRGVHCWVCD   R+LS+  R+ I EY  L +G ++ +KK+ L 
Subjt:  LVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLT

Query:  SPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQENRRPSKKDVNSV-RWEQLKNM
        S  +HPF+ +S I++++  FE   L +Q I   +E ++KIL ++         P  I  EL+  +Q       K  NS+ RWE LK +
Subjt:  SPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQENRRPSKKDVNSV-RWEQLKNM

Q24317 DNA primase small subunit1.3e-5843.22Show/hide
Query:  LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERE
        L +YY +LFP+  F++W+SYG+      S+ + F  RE SFTL +DIY+R+  F++ +E+E  I  + P KIDIG V    P    +  G    TP++RE
Subjt:  LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERE

Query:  LVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHL-----YQGNENSRK
        LVFDIDMTDYD+VR CCSGA VCL CW  M  A +V+D  LR+DFGF HI+W+FSGRRG+HCWVCD +AR L    R A++EY ++     + G  + R 
Subjt:  LVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHL-----YQGNENSRK

Query:  KISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQEN
         +    P  H  L R+ + ++E  FE  +L  Q +F T +   K+L+M+HD+        A   EL    Q+N
Subjt:  KISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQEN

Q7KQM1 DNA primase small subunit4.3e-4941.45Show/hide
Query:  NYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGND--GKHPG-SDRSYFGRREFSFTL------DNDIYLRFQSFNSLSEMENS-IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAY
        N L  YY  L P  D + W++Y ND  GK+   +D  +F +REFSFT         +IY+R+ SF++  E +N  + +  P K DIG++Y+  P  +   
Subjt:  NYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGND--GKHPG-SDRSYFGRREFSFTL------DNDIYLRFQSFNSLSEMENS-IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAY

Query:  AGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQ
         GD +F P+++EL+FDIDM DYDD+R CC+   VC  CW  +T AI ++DT LR+DF F HILWV+SGRRG+HCWV D   R  + + RAA+++Y ++  
Subjt:  AGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQ

Query:  GNENSRKKISLTSPVLHPFLARS------YIDVL
        G++  +KK+S+     +P   R+      Y DVL
Subjt:  GNENSRKKISLTSPVLHPFLARS------YIDVL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G41880.1 DNA primases;DNA primases9.6e-12162.35Show/hide
Query:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
        M  E  E    DM+ID     PK  + + F+ +YL+IYYG LFPYTD  KW+SYG+DGKHPG D  YFGRREFSFTL+ND+YLR++SF + S ME +IK 
Subjt:  MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE

Query:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYA--GDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWV
          P+KIDIG+VYSVDP KRHAYA  G N+FTP+ERELVFDID+TDYDDVRYCCSGADVC  CWPLMT AIKVIDT+LR+DFGF HILWVFSGRRGVHCWV
Subjt:  KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYA--GDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWV

Query:  CDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGR
        CD KARRL+NEQR+A++EYF +Y+GNEN+ KK+ L    LHPFLARSY+D ++  FE +L  +Q IFS++E+YEKIL MI DE         I ++LRG+
Subjt:  CDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGR

Query:  WQENRRP--SKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHK
        W+ + R   S++  + +RWEQLK  LQS ++K
Subjt:  WQENRRP--SKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGAGACCCACGACCATCCGCTTCAGATCTGCGGCTTCACGGCGAACGGACGACAGCTTCATGGCCATCCGTACTGTAGCGAAAATGGTTAACGAAGTGGTTGAGAA
TGGAGTAAGCGATATGGTAATTGATGGTAACGAACAAAAGCCGAAGAAAATTGTGCCTGATGGGTTCGATGCTAATTATCTCAAAATTTACTACGGGAAGCTTTTTCCGT
ATACTGATTTTTTCAAATGGATGTCTTATGGAAATGATGGAAAGCATCCAGGCAGTGACCGATCCTATTTTGGCCGAAGAGAGTTCTCATTCACGTTGGATAATGATATT
TATCTACGATTCCAATCTTTCAACAGTTTGTCTGAAATGGAAAATTCGATCAAGGAAAAGTGTCCGTTTAAGATTGATATTGGGTCTGTATACAGCGTGGATCCTGCAAA
GAGACACGCATATGCTGGTGATAATGTATTTACTCCACTGGAGAGAGAGCTTGTTTTTGATATAGATATGACCGATTATGATGATGTTAGATATTGTTGTTCAGGAGCTG
ATGTTTGCTTGGATTGCTGGCCTTTAATGACTGCTGCTATCAAAGTGATTGATACTACCCTCAGAGATGACTTTGGATTTAACCACATATTGTGGGTATTTAGTGGTCGA
CGTGGTGTTCACTGTTGGGTCTGTGATGGCAAAGCAAGAAGGTTGTCTAATGAACAGAGAGCTGCCATTTCTGAATATTTCCATTTATATCAGGGTAACGAAAATAGTCG
CAAGAAAATTTCACTAACGAGTCCAGTTCTTCATCCATTTCTTGCGAGATCATACATAGACGTTCTCGAGGATTGCTTTGAATCAAAATTGCTTTGTAGTCAAAAAATTT
TCTCAACTGAGGAGAGATATGAGAAAATCTTAGATATGATTCATGATGAATATACTAATAGAGTTGCCCCTGTAGCCATTACCTCAGAGCTTCGTGGAAGGTGGCAAGAG
AATAGGCGACCCTCTAAAAAAGATGTTAATTCCGTAAGATGGGAGCAACTAAAAAATATGTTGCAATCAGGGAAACATAAGAGGGAAGAAGGGCAGACGGGATTGTCTGT
TGATTTTGGGATTGCACCCTTGTCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACGAGACCCACGACCATCCGCTTCAGATCTGCGGCTTCACGGCGAACGGACGACAGCTTCATGGCCATCCGTACTGTAGCGAAAATGGTTAACGAAGTGGTTGAGAA
TGGAGTAAGCGATATGGTAATTGATGGTAACGAACAAAAGCCGAAGAAAATTGTGCCTGATGGGTTCGATGCTAATTATCTCAAAATTTACTACGGGAAGCTTTTTCCGT
ATACTGATTTTTTCAAATGGATGTCTTATGGAAATGATGGAAAGCATCCAGGCAGTGACCGATCCTATTTTGGCCGAAGAGAGTTCTCATTCACGTTGGATAATGATATT
TATCTACGATTCCAATCTTTCAACAGTTTGTCTGAAATGGAAAATTCGATCAAGGAAAAGTGTCCGTTTAAGATTGATATTGGGTCTGTATACAGCGTGGATCCTGCAAA
GAGACACGCATATGCTGGTGATAATGTATTTACTCCACTGGAGAGAGAGCTTGTTTTTGATATAGATATGACCGATTATGATGATGTTAGATATTGTTGTTCAGGAGCTG
ATGTTTGCTTGGATTGCTGGCCTTTAATGACTGCTGCTATCAAAGTGATTGATACTACCCTCAGAGATGACTTTGGATTTAACCACATATTGTGGGTATTTAGTGGTCGA
CGTGGTGTTCACTGTTGGGTCTGTGATGGCAAAGCAAGAAGGTTGTCTAATGAACAGAGAGCTGCCATTTCTGAATATTTCCATTTATATCAGGGTAACGAAAATAGTCG
CAAGAAAATTTCACTAACGAGTCCAGTTCTTCATCCATTTCTTGCGAGATCATACATAGACGTTCTCGAGGATTGCTTTGAATCAAAATTGCTTTGTAGTCAAAAAATTT
TCTCAACTGAGGAGAGATATGAGAAAATCTTAGATATGATTCATGATGAATATACTAATAGAGTTGCCCCTGTAGCCATTACCTCAGAGCTTCGTGGAAGGTGGCAAGAG
AATAGGCGACCCTCTAAAAAAGATGTTAATTCCGTAAGATGGGAGCAACTAAAAAATATGTTGCAATCAGGGAAACATAAGAGGGAAGAAGGGCAGACGGGATTGTCTGT
TGATTTTGGGATTGCACCCTTGTCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTRPTTIRFRSAASRRTDDSFMAIRTVAKMVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDI
YLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPLERELVFDIDMTDYDDVRYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGR
RGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAISEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIDVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDEYTNRVAPVAITSELRGRWQE
NRRPSKKDVNSVRWEQLKNMLQSGKHKREEGQTGLSVDFGIAPLS