; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg004475 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg004475
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionRING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein, putative isoform 4
Genome locationscaffold9:11740815..11742416
RNA-Seq ExpressionSpg004475
SyntenySpg004475
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607555.1 PHD finger protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-4593.69Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGR VKV E+KGL+S KEEFPKRKRN RKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
        SERRE SGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
KAG7037193.1 PHD finger protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-4593.69Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGR VKV E+KGL+S KEEFPKRKRN RKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
        SERRE SGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
XP_022932462.1 uncharacterized protein LOC111438872 isoform X1 [Cucurbita moschata]1.2e-4593.69Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGR VKV E+KGL+S KEEFPKRKRN RKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
        SERRE SGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
XP_022973404.1 uncharacterized protein LOC111471956 isoform X1 [Cucurbita maxima]1.2e-4592.79Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGR VKV+E+KGL+S KEEFPKRKRN RKRRLALQGKGIKDIRKRRKTE+FTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
        SERRE SGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
XP_022973406.1 uncharacterized protein LOC111471956 isoform X3 [Cucurbita maxima]1.2e-4592.79Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGR VKV+E+KGL+S KEEFPKRKRN RKRRLALQGKGIKDIRKRRKTE+FTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
        SERRE SGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DP31 uncharacterized protein LOC111022980 isoform X25.6e-4692.79Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIE KGL+SQKEEFPKRKRN RKRRL+LQGKGIKDIRKRRK +MFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
         +RREASGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
A0A6J1DRZ6 uncharacterized protein LOC111022980 isoform X15.6e-4692.79Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIE KGL+SQKEEFPKRKRN RKRRL+LQGKGIKDIRKRRK +MFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
         +RREASGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
A0A6J1I8K0 uncharacterized protein LOC111471956 isoform X35.6e-4692.79Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGR VKV+E+KGL+S KEEFPKRKRN RKRRLALQGKGIKDIRKRRKTE+FTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
        SERRE SGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
A0A6J1IB99 uncharacterized protein LOC111471956 isoform X25.6e-4692.79Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGR VKV+E+KGL+S KEEFPKRKRN RKRRLALQGKGIKDIRKRRKTE+FTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
        SERRE SGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
A0A6J1IEH2 uncharacterized protein LOC111471956 isoform X15.6e-4692.79Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
        TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGR VKV+E+KGL+S KEEFPKRKRN RKRRLALQGKGIKDIRKRRKTE+FTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC
Subjt:  TNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDEC

Query:  SERREASGSDE
        SERRE SGSDE
Subjt:  SERREASGSDE
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32810.2 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein2.4e-0941.75Show/hide
Query:  TNSSRKRRKFDV--EESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRK-RRLALQGKGIKDIRKRR-KTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQD
        TNS +K+RK D   E+S+++E  KG   ++ +     SQ EEFPK KR  RK RRL++Q KGIK +RK+R + E+  +D+    SD+S+ S+F ++E ++
Subjt:  TNSSRKRRKFDV--EESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRK-RRLALQGKGIKDIRKRR-KTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQD

Query:  VDE
         +E
Subjt:  VDE

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGATTCCTTCTCTTCTTTTTACAAATTCAAGTAGGAAAAGGCGCAAATTCGACGTTGAAGAATCTGAGGATAGTGAATATGGTAAAGGGAGGACAGTGAAGGTTAT
AGAAAGTAAAGGCCTCGACTCCCAGAAAGAAGAGTTTCCAAAACGCAAGAGGAACATTCGAAAACGAAGATTAGCTCTTCAAGGAAAAGGTATAAAAGATATTAGGAAGA
GACGCAAGACAGAGATGTTTACTGACGATGATGTTGGACTGCTCTCTGATTCTAGTGATGGAAGCATGTTCAGTGAGGATGAGCTGCAGGATGTTGATGAATGTTCAGAA
AGAAGAGAAGCCTCAGGCTCAGATGAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTGATTCCTTCTCTTCTTTTTACAAATTCAAGTAGGAAAAGGCGCAAATTCGACGTTGAAGAATCTGAGGATAGTGAATATGGTAAAGGGAGGACAGTGAAGGTTAT
AGAAAGTAAAGGCCTCGACTCCCAGAAAGAAGAGTTTCCAAAACGCAAGAGGAACATTCGAAAACGAAGATTAGCTCTTCAAGGAAAAGGTATAAAAGATATTAGGAAGA
GACGCAAGACAGAGATGTTTACTGACGATGATGTTGGACTGCTCTCTGATTCTAGTGATGGAAGCATGTTCAGTGAGGATGAGCTGCAGGATGTTGATGAATGTTCAGAA
AGAAGAGAAGCCTCAGGCTCAGATGAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVIPSLLFTNSSRKRRKFDVEESEDSEYGKGRTVKVIESKGLDSQKEEFPKRKRNIRKRRLALQGKGIKDIRKRRKTEMFTDDDVGLLSDSSDGSMFSEDELQDVDECSE
RREASGSDE