; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg005785 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg005785
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionsister chromatid cohesion protein SCC4
Genome locationscaffold11:43418..47866
RNA-Seq ExpressionSpg005785
SyntenySpg005785
Gene Ontology termsGO:0007064 - mitotic sister chromatid cohesion (biological process)
InterPro domainsIPR019440 - Chromatid cohesion factor MAU2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052897.1 MAU2 chromatid cohesion factor-like protein [Cucumis melo var. makuwa]8.4e-3784.69Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESST A
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
XP_022158435.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 [Momordica charantia]1.3e-3785.71Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
XP_031738038.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 isoform X1 [Cucumis sativus]8.4e-3784.69Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESST A
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
XP_031738040.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 isoform X4 [Cucumis sativus]8.4e-3784.69Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESST A
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
XP_031738617.1 sister chromatid cohesion protein SCC4-like, partial [Cucumis sativus]8.4e-3784.69Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESST A
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4R7 Uncharacterized protein4.1e-3784.69Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESST A
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
A0A1S3BJ17 LOW QUALITY PROTEIN: MAU2 chromatid cohesion factor homolog4.1e-3784.69Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESST A
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
A0A5A7UEF7 MAU2 chromatid cohesion factor-like protein4.1e-3784.69Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESST A
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
A0A5D3CHS2 MAU2 chromatid cohesion factor-like protein4.1e-3784.69Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESST A
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
A0A6J1DVU1 sister chromatid cohesion protein SCC46.3e-3885.71Show/hide
Query:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        + K  +    S  V A +ALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
Subjt:  KEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FGN7 Sister chromatid cohesion protein SCC45.7e-2869.89Show/hide
Query:  LSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        L    S  V A +ALV MKNWF RFPTILQA E MIEMLRGQY+H VGCY EA FH IEA KLTES S+QA CQ +AAVSY+ IGDAESS++A
Subjt:  LSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G51340.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein4.0e-2969.89Show/hide
Query:  LSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA
        L    S  V A +ALV MKNWF RFPTILQA E MIEMLRGQY+H VGCY EA FH IEA KLTES S+QA CQ +AAVSY+ IGDAESS++A
Subjt:  LSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQA

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAGGCGGTTGCGAGAGAGACGTCGACGATGGTAGGGATAGAGATGAAAAGGAGAAGGAGAATTTGTCGTCGCCAGAATCCGCCGCTGTCGTCGCCGCCAAGGCCTT
GGTGCAGATGAAGAATTGGTTCTTGCGCTTTCCTACAATTTTACAGGCATGTGAGAGTATGATTGAGATGCTTAGAGGCCAGTATGCTCATTACGTTGGTTGTTACCATG
AAGCAACCTTCCATTATATTGAAGCCGCGAAGCTTACAGAGAGCAAATCAATTCAAGCAATGTGCCAAGTTTATGCGGCTGTCTCTTATATTTGTATTGGCGATGCGGAA
TCATCCACACAGGCTGACGTCCTCCTTTGTTCAAATGCATTATTTGTTCAAATGGTAACAGGAGAAGGGAAAAAGTATGATGTATCAGAGATTAATGGCGAGGAAGAAAA
GAATGTGCTGTTTGAAGTCTCGTATGTTTTACTAGTAAAGGAAAAGGCTAGTGATTTGTGGGTTAAGGGAAGTGTCGAAAGGGAAAAGGAGAGTGGACACTGGGCCACCT
CAATTGATGGGCCTAAAAACCCTAGTGATAAGCAAAGGACTAGCATTAGTGGGTTGTTTGATGAAAAATCTAGTGGGTTTAGGAAAAGTGAAAAGCAGAGCATGGGGGGG
GATATGGAGGAGGGGGTGATTTCGGGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATAGGCGGTTGCGAGAGAGACGTCGACGATGGTAGGGATAGAGATGAAAAGGAGAAGGAGAATTTGTCGTCGCCAGAATCCGCCGCTGTCGTCGCCGCCAAGGCCTT
GGTGCAGATGAAGAATTGGTTCTTGCGCTTTCCTACAATTTTACAGGCATGTGAGAGTATGATTGAGATGCTTAGAGGCCAGTATGCTCATTACGTTGGTTGTTACCATG
AAGCAACCTTCCATTATATTGAAGCCGCGAAGCTTACAGAGAGCAAATCAATTCAAGCAATGTGCCAAGTTTATGCGGCTGTCTCTTATATTTGTATTGGCGATGCGGAA
TCATCCACACAGGCTGACGTCCTCCTTTGTTCAAATGCATTATTTGTTCAAATGGTAACAGGAGAAGGGAAAAAGTATGATGTATCAGAGATTAATGGCGAGGAAGAAAA
GAATGTGCTGTTTGAAGTCTCGTATGTTTTACTAGTAAAGGAAAAGGCTAGTGATTTGTGGGTTAAGGGAAGTGTCGAAAGGGAAAAGGAGAGTGGACACTGGGCCACCT
CAATTGATGGGCCTAAAAACCCTAGTGATAAGCAAAGGACTAGCATTAGTGGGTTGTTTGATGAAAAATCTAGTGGGTTTAGGAAAAGTGAAAAGCAGAGCATGGGGGGG
GATATGGAGGAGGGGGTGATTTCGGGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIGGCERDVDDGRDRDEKEKENLSSPESAAVVAAKALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAE
SSTQADVLLCSNALFVQMVTGEGKKYDVSEINGEEEKNVLFEVSYVLLVKEKASDLWVKGSVEREKESGHWATSIDGPKNPSDKQRTSISGLFDEKSSGFRKSEKQSMGG
DMEEGVISG