| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7022543.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 5.8e-127 | 89.46 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+R RSRSRSRSLDRSDRDRRG RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSP------------SPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRSRGRSRSV+SASPGRRSP SPRRSLSP+RSLSP+RSPSPRGESPERNG+GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSP------------SPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 1.4e-128 | 92.88 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRD+DY+RRSRSRSRSRSLD++DRDRRG RERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRSRSRGRSRSVDS SPGRRSPSPRRS SPRRSLSP+RSPSPR ESPERNGNG GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 6.2e-129 | 93.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG RERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRSRSRGRSRSVDS SPGRRSPSPRRS SPRRSLSP+RSPSPR ESPERNGN GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 2.0e-127 | 89.8 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+R RSRSRSRSLDRSDRDRRG RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------RSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRSRGRSRSV+SASPGRRSPSPRRSLSPR RSLSP+RSPSPRGESPERNG+GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------RSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 6.8e-128 | 91.93 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDER--RSR
IHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRR+RDDYRDRDY+RRSRSRSRSRS DRSDRDRRG RER+YRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDER--RSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SRSRSRSRGRSRSVDS SPGR+SPSPRRS SPRRSLSP+RSPSPRG SPERNGN GGRSPT RSVSPRG+P DSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 6.7e-129 | 92.88 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRD+DY+RRSRSRSRSRSLD++DRDRRG RERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRSRSRGRSRSVDS SPGRRSPSPRRS SPRRSLSP+RSPSPR ESPERNGNG GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 3.0e-129 | 93.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG RERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRSRSRGRSRSVDS SPGRRSPSPRRS SPRRSLSP+RSPSPR ESPERNGN GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 1.5e-125 | 91.2 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD RDRDY+RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: --SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SRS+SRG+SRSVDSASPG RRS SPRRSLSPQRSPSPRGESP RNG+GGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: --SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 9.6e-128 | 89.8 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+R RSRSRSRSLDRSDRDRRG RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------RSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRSRGRSRSV+SASPGRRSPSPRRSLSPR RSLSP+RSPSPRGESPERNG+GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------RSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 5.8e-125 | 87 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+YRDRDY+R RSRSRSRSLDRSDRDRRG RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG----RERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------------RSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRSRGRSRSV+SASPGRRSPSPRRSLSPR RSLSP+RSPSPRGESPERNG+GGRSPTPRSVSPRGQ ADSRSPSPQNSDV+
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------------RSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.0e-29 | 46.69 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRS
+G + S Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R +SRS R S SK R R + + S SRSRSRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRS
Query: RGRSRSVDSASPGRRSPSP---RRSLSPRRSLSPQRSPSPRG
R RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: RGRSRSVDSASPGRRSPSP---RRSLSPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.5e-29 | 46.28 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R +SRS R S SK R R + + S SRSRSRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRS
Query: RGRSRSVDSASPGRRSPSP---RRSLSPRRSLSPQRSPSPRG
R RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: RGRSRSVDSASPGRRSPSP---RRSLSPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.8e-29 | 45.19 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRS
+G + Y RSRSPRRR R RSRSRSRSRS RS R R RSRS S S+ R + + SRSRSRSRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRS
Query: RGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRG
R RSRS A S R S S RS SP +SP G
Subjt: RGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.5e-29 | 46.28 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R +SRS R S SK R R + + S SRSRSRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRS
Query: RGRSRSVDSASPGRRSPSP---RRSLSPRRSLSPQRSPSPRG
R RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: RGRSRSVDSASPGRRSPSP---RRSLSPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 9.7e-69 | 60.97 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPD
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DY R RSRSRS DR +R ++RD+RRR+RS R SPD
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPD
Query: YSKGRGRGRYEDERRSRSRSRS----RSRGRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSP-RG
K R RGRY++E RS SRS S R RS S SP R RSPSPRRSLSPR + SPS + SPER N RSP+P S +P R
Subjt: YSKGRGRGRYEDERRSRSRSRS----RSRGRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSP-RG
Query: QPADSRSPSP
A SRS SP
Subjt: QPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 5.4e-14 | 39.55 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ + + E R+R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSASPGRR
R R+P R + R R R R RSRSRS D R R RSISPR D + R D SR RS + RG+SRS+
Subjt: SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSASPGRR
Query: SPSPRRSL--SPRRSLSP----QRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SPSPRRS+ SPRRS SP RS SPR S R+ RSP S +PA SRS SP D
Subjt: SPSPRRSL--SPRRSLSP----QRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 5.9e-13 | 38.21 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRGR
+ E SR+R R R+P R + R R R R RSRSRS D R R RSISPR D + R D SR RS + RG+
Subjt: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRGR
Query: SRSVDSASPGRRSPSPRRSL--SPRRSLSP----QRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SRS+ SPSPRRS+ SPRRS SP RS SPR S R+ RSP S +PA SRS SP D
Subjt: SRSVDSASPGRRSPSPRRSL--SPRRSLSP----QRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 4.1e-14 | 38.32 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSR
+ + +S R++ R RSP R R R RRSRSRSR + + R +SRS+SP+ RYE E RS SRS
Subjt: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSR
Query: GRSRSVDSASPGR---RSPSPRRSLSPR--RSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS
SR V S SPGR S SPRRS+SPR RS +P+++ R +SP + RSPTP PRG RSPS
Subjt: GRSRSVDSASPGR---RSPSPRRSLSPR--RSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.9e-70 | 60.97 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPD
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DY R RSRSRS DR +R ++RD+RRR+RS R SPD
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPD
Query: YSKGRGRGRYEDERRSRSRSRS----RSRGRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSP-RG
K R RGRY++E RS SRS S R RS S SP R RSPSPRRSLSPR + SPS + SPER N RSP+P S +P R
Subjt: YSKGRGRGRYEDERRSRSRSRS----RSRGRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSP-RG
Query: QPADSRSPSP
A SRS SP
Subjt: QPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.9e-70 | 60.97 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPD
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DY R RSRSRS DR +R ++RD+RRR+RS R SPD
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERDYRRRSRSISPRRPSPD
Query: YSKGRGRGRYEDERRSRSRSRS----RSRGRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSP-RG
K R RGRY++E RS SRS S R RS S SP R RSPSPRRSLSPR + SPS + SPER N RSP+P S +P R
Subjt: YSKGRGRGRYEDERRSRSRSRS----RSRGRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPQRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSP-RG
Query: QPADSRSPSP
A SRS SP
Subjt: QPADSRSPSP
|
|
