; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg006286 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg006286
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptiontransmembrane protein 256 homolog
Genome locationscaffold4:4691414..4700391
RNA-Seq ExpressionSpg006286
SyntenySpg006286
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006696 - Protein of unknown function DUF423


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572230.1 hypothetical protein SDJN03_28958, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-3696.2Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPLHWHKVA ISG AALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

XP_022135760.1 transmembrane protein 256 homolog [Momordica charantia]2.1e-3596.2Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPL WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALL APSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

XP_022953076.1 transmembrane protein 256 homolog [Cucurbita moschata]2.5e-3696.2Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPLHWHKVA ISGVAALGLGTYG+HVFKPQNPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

XP_022969303.1 transmembrane protein 256 homolog [Cucurbita maxima]3.8e-3798.73Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

XP_023554646.1 transmembrane protein 256 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-3797.47Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPLHWHKVAAISGV+ALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K1T6 Uncharacterized protein1.7e-3594.94Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPL+WHKVAAISGVAALGLGTYGAH FKP+NPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

A0A1S3CG60 transmembrane protein 256 homolog1.7e-3594.94Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPL+WHKVAAISGVAALGLGTYGAH FKP+NPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

A0A6J1C1Y8 transmembrane protein 256 homolog1.0e-3596.2Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPL WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALL APSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

A0A6J1GM00 transmembrane protein 256 homolog1.2e-3696.2Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPLHWHKVA ISGVAALGLGTYG+HVFKPQNPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

A0A6J1I0K9 transmembrane protein 256 homolog1.8e-3798.73Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTA+LYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4K526 Transmembrane protein 256 homolog4.9e-1143.42Show/hide
Query:  WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFK--PQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        W ++ A+SG  A+  G YGAH F+   ++   KE+++T   YH +H+ ALLA P  + P + G LLT+GI+ FSGT
Subjt:  WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFK--PQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

Q2KI29 Transmembrane protein 2561.8e-0536.49Show/hide
Query:  WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        + ++ A+SG  ALGL +YGAH  +  +   KE++     +H +H+ ALLA P  + P   G LL +G   F  T
Subjt:  WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

Q568J8 Transmembrane protein 2563.6e-0638.36Show/hide
Query:  KVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPA--YKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSG
        +VA ISG  A+  G YGAH F+    +   +E++ TA  YH  H+ ALL A   + P + G +L  G+  F G
Subjt:  KVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPA--YKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSG

Q5F285 Transmembrane protein 2564.7e-0638.03Show/hide
Query:  WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAF
        + ++ A+SG  ALGL +YGAH  +  +   KE++  A  +H +H+ ALL  PS + P   G LL +G   F
Subjt:  WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAF

Q8N2U0 Transmembrane protein 2561.4e-0537.84Show/hide
Query:  WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        + ++ A+SG AALG  +YGAH  +  +   KE++  A  +H +H+ ALL  P  + P      L AG+L  SGT
Subjt:  WHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04900.1 unknown protein2.2e-3584.81Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT
        M+P  WHKVAAISG+AALGLGTYGAHVFKP+NP+YK+VWQTA+LYHLVHTAAL++APSTK PNIFGGLLTAGI+AFSGT
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT

AT2G04900.2 unknown protein8.5e-3584.62Show/hide
Query:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSG
        M+P  WHKVAAISG+AALGLGTYGAHVFKP+NP+YK+VWQTA+LYHLVHTAAL++APSTK PNIFGGLLTAGI+AFSG
Subjt:  MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACCCACTTCACTGGCACAAAGTCGCTGCGATTTCTGGCGTTGCAGCTCTTGGATTGGGTACGTACGGCGCCCATGTCTTCAAACCCCAAAACCCAGCTTATAAAGA
GGTTTGGCAAACGGCAGCTCTGTATCATTTGGTTCACACAGCGGCTCTGCTTGCTGCCCCTTCGACCAAGAACCCTAACATTTTTGGAGGCCTTTTGACTGCTGGAATTC
TTGCATTTTCGGGCACGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACCCACTTCACTGGCACAAAGTCGCTGCGATTTCTGGCGTTGCAGCTCTTGGATTGGGTACGTACGGCGCCCATGTCTTCAAACCCCAAAACCCAGCTTATAAAGA
GGTTTGGCAAACGGCAGCTCTGTATCATTTGGTTCACACAGCGGCTCTGCTTGCTGCCCCTTCGACCAAGAACCCTAACATTTTTGGAGGCCTTTTGACTGCTGGAATTC
TTGCATTTTCGGGCACGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNPLHWHKVAAISGVAALGLGTYGAHVFKPQNPAYKEVWQTAALYHLVHTAALLAAPSTKNPNIFGGLLTAGILAFSGT