CuGenDBv2

Gene ID	Spg006759
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic
Genome location	scaffold1:56503576..56505607
RNA-Seq Expression	Spg006759
Synteny	Spg006759
Gene Ontology terms	GO:0045727 - positive regulation of translation (biological process) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0003924 - GTPase activity (molecular function) GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domains	IPR004161 - Translation elongation factor EFTu-like, domain 2 IPR006297 - Elongation factor 4 IPR009000 - Translation protein, beta-barrel domain superfamily IPR035647 - EF-G domain III/V-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6595718.1 Translation factor GUF1-like, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.7e-82

97.52

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITH+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

XP_022158375.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Momordica charantia]

1.6e-83

98.76

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEV ELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHY RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

XP_022925039.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Cucurbita moschata]

1.7e-82

97.52

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITH+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

XP_031740278.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic isoform X4 [Cucumis sativus]

1.7e-82

96.27

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGI EILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DGRIK+GDRIYFMAS+KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITH+GRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

XP_038889419.1 translation factor GUF1 homolog, chloroplastic [Benincasa hispida]

2.7e-83

97.52

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADR LRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIK+GDRIYFMAS+KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHYGRKA+DSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BMN9 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

1.1e-82

96.27

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGI EILNAIVERVPPPRNTA+RPLRALIFDSYYD YRGVIVYFRVVDGRIK+GDRIYFMAS+KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITH+GRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

A0A6J1DVN5 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

7.5e-84

98.76

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEV ELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHY RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

A0A6J1EAZ6 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

8.3e-83

97.52

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITH+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

A0A6J1HRW4 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

8.3e-83

97.52

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVP PRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMAS KDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITH+ RKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

A0A7J7DZN0 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

2.3e-80

92.55

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVPPPRNTAD PLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG+IKKGDRIYFMASEKDY ADE+GVLSPNQ+EVEELYAGEVGYLSASIR+
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHYGRKAE+SLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQF +LRD+LEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A5B4D2 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

7.5e-81

89.44

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIV+R+PPP +TA+RPLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG IKKGDRIYFMAS+KDYFADE+GVLSPNQL+ +ELYAGEVGYL+ASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHYGRKAE+SLPGYEEATPMVFCGLFPVDAD+FP+LRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

B8AI54 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

2.9e-72

80.98

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEIL+AIV ++PPP+NTA  PLRALIFDSYYD YRGVIVYFRVVDG IKKGD+I FMAS K+Y ADE+GVLSPNQ++V ELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKVI
        VADARVGDTITH  ++AE +LPGY +ATPMVFCGLFP+DADQF ELR+ALEKLQLNDAALK +
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKVI

B9GHA6 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

2.0e-81

91.93

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEILNAIVERVPPPR+TA  PLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG IKKGDRIYFMASEKDY+ADE+GVLSPNQ++VEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHY RKAE SLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQF ELRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

B9RHQ5 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

7.0e-79

87.58

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGI +ILNAIVER+P PRNTA+ PLR LIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG IKKGDRIYFMAS+KDYFADE+GVLSPNQ++VEELYAGEVGYLSASIRS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHY R+A+ SLPGY+EATPMVFCGLFPVDADQFPE+RDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

Q9FNM5 Translation factor GUF1 homolog, chloroplastic

6.0e-78

85.71

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEIL+AIV+R+P P +TA +PLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG++KKGDRI+FMAS KDYFADEVGVLSPNQ++V+ELYAGEVGY++AS+RS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHY RKAE SLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFP+LRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G08650.1 Small GTP-binding protein

4.2e-79

85.71

Show/hide

Query:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS
        EGIGITEIL+AIV+R+P P +TA +PLRALIFDSYYD YRGVIVYFRV+DG++KKGDRI+FMAS KDYFADEVGVLSPNQ++V+ELYAGEVGY++AS+RS
Subjt:  EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRS

Query:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK
        VADARVGDTITHY RKAE SLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFP+LRDALEKLQLNDAALK
Subjt:  VADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALK

AT5G39900.1 Small GTP-binding protein

2.2e-35

41.1

Show/hide

Query:  GIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSV
        G+G+  +L A++ER+PPP   ++ PLR L+FDS+++ Y+GVI Y  VVDG + KGD++ F AS + Y   +VG++ P       L  G+VGY+   +R+ 
Subjt:  GIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSV

Query:  ADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKVIK
         +AR+GDTI +  +   + LPG++    MVF G++P D   F  L  A+EKL  NDA++ V K
Subjt:  ADARVGDTITHYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKVIK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

GAGGGAATAGGTATAACTGAAATTTTAAATGCAATTGTTGAAAGAGTTCCTCCACCTCGTAATACTGCTGATAGGCCACTCAGAGCATTAATATTTGATAGTTATTATGA
TTCATATAGGGGCGTGATAGTTTATTTTCGAGTTGTTGATGGGAGAATAAAGAAAGGTGATAGAATATATTTCATGGCTAGTGAAAAGGATTATTTTGCTGATGAAGTTG
GAGTCTTATCTCCCAATCAGTTGGAAGTGGAGGAACTTTATGCTGGAGAGGTTGGCTATCTTTCAGCTTCTATAAGATCAGTAGCTGATGCTAGAGTTGGGGACACCATT
ACTCACTATGGTAGAAAGGCCGAAGACTCACTACCTGGATATGAGGAAGCCACTCCAATGGTATTCTGTGGCCTTTTTCCAGTCGATGCAGACCAATTCCCAGAATTACG
TGATGCTCTTGAAAAGCTGCAACTTAATGATGCTGCGTTGAAGGTTATTAAAGCATTGATTTTATTTGATATATTTCAGTTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

EGIGITEILNAIVERVPPPRNTADRPLRALIFDSYYDSYRGVIVYFRVVDGRIKKGDRIYFMASEKDYFADEVGVLSPNQLEVEELYAGEVGYLSASIRSVADARVGDTI
THYGRKAEDSLPGYEEATPMVFCGLFPVDADQFPELRDALEKLQLNDAALKVIKALILFDIFQF

Spg006759 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome