CuGenDBv2

Gene ID	Spg007244
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1
Genome location	scaffold9:46955182..46962552
RNA-Seq Expression	Spg007244
Synteny	Spg007244
Gene Ontology terms	GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001680 - WD40 repeat IPR015943 - WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily IPR036322 - WD40-repeat-containing domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004142532.1 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1 [Cucumis sativus]

6.1e-88

84.46

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSG        SADGELRIWDTAQ+RT+SSAWVH AAHGIIS+ACSRSIGTN+VVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDR LSRVP+V+IKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGP CI+D DEKPVE   LGCSG+KAQG+STEH+ RSE DGLKYVA++GEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

XP_022153328.1 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1 [Momordica charantia]

9.4e-89

87.05

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFH SEPLLFSG        SADGELRIWDTAQHRT+SSAWVH AAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPS FSSH+DGPKCI +IDEKPVE ET   SGE+ QG+STEHACRSEA+GLKYVA+AGEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

XP_022941332.1 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1 [Cucurbita moschata]

1.7e-85

84.97

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASV DVSFHPSEPLLFSG        SADGELRIWDTAQHRT+SSAWVH AAHGIISIACSRSIGTN+VVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDRALSRVPSVTI TNAYHFCKLSLVKQPSDFS H+ GPK  +DID+ PVEVETL CSGEK Q  STE AC SEADGLKYVA+AGEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

XP_022981925.1 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1 [Cucurbita maxima]

8.8e-87

85.49

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASV DVSFHPSEPLLFSG        SADGELRIWDTAQHRT+SSAWVH AAHGIISIACSRSIGTN+VVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDRALSRVPSVTI TNAYHFCKLSLVKQPSDFS H+ GPKC +DID+ PVEVETL CSGEK Q  STE AC SEADGLKYVA+AGEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

XP_023525400.1 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.7e-85

84.97

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASV DVSFHPSEPLLFSG        SADGELRIWDTAQHRT+SSAWVH AAHGIISIACSRSIGTN+VVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDRALSRVPSVTI TNAYHFCKLSLVKQPSDFS H+ GPK  +DID+ PVEVETL CSGEK Q  STE AC SEADGLKYVA+AGEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0M3H0 WD_REPEATS_REGION domain-containing protein

2.9e-88

84.46

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSG        SADGELRIWDTAQ+RT+SSAWVH AAHGIIS+ACSRSIGTN+VVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDR LSRVP+V+IKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGP CI+D DEKPVE   LGCSG+KAQG+STEH+ RSE DGLKYVA++GEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

A0A1S3CI26 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1

1.0e-85

83.42

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSG        SADGELR+WDTAQ+RT+SSAWVH AAHGIIS+ACSRSIGTN+VVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDR LSRVP+V+IKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCI+D DEKP E   LGCSG+KAQG+STE +  SE DGLKYVA+AGEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

A0A6J1DH68 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1

4.5e-89

87.05

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFH SEPLLFSG        SADGELRIWDTAQHRT+SSAWVH AAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPS FSSH+DGPKCI +IDEKPVE ET   SGE+ QG+STEHACRSEA+GLKYVA+AGEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

A0A6J1FM56 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1

8.0e-86

84.97

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASV DVSFHPSEPLLFSG        SADGELRIWDTAQHRT+SSAWVH AAHGIISIACSRSIGTN+VVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDRALSRVPSVTI TNAYHFCKLSLVKQPSDFS H+ GPK  +DID+ PVEVETL CSGEK Q  STE AC SEADGLKYVA+AGEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

A0A6J1J156 protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1

4.2e-87

85.49

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHRASV DVSFHPSEPLLFSG        SADGELRIWDTAQHRT+SSAWVH AAHGIISIACSRSIGTN+VVSQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        DDRALSRVPSVTI TNAYHFCKLSLVKQPSDFS H+ GPKC +DID+ PVEVETL CSGEK Q  STE AC SEADGLKYVA+AGEQSSEV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

F1DLK1 Protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1

4.4e-49

54.64

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRP PDPV+VLRGHRASV D+ FHPS  +LFSG        S DGELRIW+T Q+RT+SSAWVH AAHGII +A S  +G NKV+SQGRDGTVKCWD 
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGL-STEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
            LSR P +TIKTN+YHFCKLS+ K PS+          IDD++   + V+ +    +  Q   S +   +   +G KYVA+AGEQ+S V I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGL-STEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

Q3MV14 Protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1

1.2e-49

53.3

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHR SVMDVSFHPS+ LLF+G        SADGELRIWDT QHR +SSAW H  A+G++++A S  +G +K++SQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQP----SDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        +D  LSR P + ++T AYHFCK SLVK+P     +  SH+ G    D  D   V++       E+  GL  +   +  A+G  +VA+ GEQ +EV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQP----SDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G29860.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein

8.3e-51

53.3

Show/hide

Query:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI
        MSKRPPPDPVAVLRGHR SVMDVSFHPS+ LLF+G        SADGELRIWDT QHR +SSAW H  A+G++++A S  +G +K++SQGRDGTVKCWDI
Subjt:  MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDI

Query:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQP----SDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI
        +D  LSR P + ++T AYHFCK SLVK+P     +  SH+ G    D  D   V++       E+  GL  +   +  A+G  +VA+ GEQ +EV I
Subjt:  DDRALSRVPSVTIKTNAYHFCKLSLVKQP----SDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAGTAAGAGGCCTCCGCCGGACCCCGTAGCCGTGCTTCGAGGCCATCGGGCCTCTGTCATGGACGTTTCTTTCCATCCATCTGAACCTCTTCTTTTTTCGGGCGCTGT
AATTGCAATTCATATTAGCTCTGCAGATGGCGAGTTGCGTATTTGGGACACGGCTCAGCATAGAACGATATCATCGGCATGGGTGCATTGTGCGGCACACGGAATTATTA
GCATTGCTTGTAGTCGTTCTATTGGGACAAACAAAGTTGTCAGTCAGGGTAGGGATGGAACTGTAAAGTGCTGGGATATTGATGATAGAGCTTTGTCCAGAGTTCCCTCT
GTCACAATCAAGACAAATGCCTATCATTTTTGCAAACTCTCCTTAGTGAAGCAGCCTTCTGATTTTTCAAGCCATAATGATGGTCCTAAGTGTATTGATGATATAGATGA
GAAACCTGTTGAGGTGGAAACTTTGGGCTGCAGTGGTGAAAAGGCTCAAGGACTTTCTACTGAGCATGCATGCAGATCAGAAGCTGATGGGCTAAAGTACGTGGCTCTTG
CGGGGGAGCAATCTTCAGAGGTTTATATAAAGATTATTCTTGTTTATGTTTACCCATATACCTTTCAATATCTAAAACCTGATTTCTTAATCCCTTTGGTGATTGATGGA
AGGTTGAAATTTGGGATCTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSKRPPPDPVAVLRGHRASVMDVSFHPSEPLLFSGAVIAIHISSADGELRIWDTAQHRTISSAWVHCAAHGIISIACSRSIGTNKVVSQGRDGTVKCWDIDDRALSRVPS
VTIKTNAYHFCKLSLVKQPSDFSSHNDGPKCIDDIDEKPVEVETLGCSGEKAQGLSTEHACRSEADGLKYVALAGEQSSEVYIKIILVYVYPYTFQYLKPDFLIPLVIDG
RLKFGI

Spg007244 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome