; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg007319 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg007319
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionQWRF motif-containing protein 2
Genome locationscaffold2:37120169..37122281
RNA-Seq ExpressionSpg007319
SyntenySpg007319
Gene Ontology termsGO:0051225 - spindle assembly (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005880 - nuclear microtubule (cellular component)
GO:0008017 - microtubule binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031360.1 QWRF motif-containing protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
TYK06812.1 QWRF motif-containing protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
XP_004136940.1 QWRF motif-containing protein 2 [Cucumis sativus]3.6e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
XP_008455028.1 PREDICTED: QWRF motif-containing protein 2 [Cucumis melo]3.6e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
XP_038888480.1 QWRF motif-containing protein 2-like [Benincasa hispida]3.6e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7R4 Uncharacterized protein1.8e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
A0A1S3C019 QWRF motif-containing protein 21.8e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
A0A5A7SKU8 QWRF motif-containing protein 21.8e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
A0A5D3C689 QWRF motif-containing protein 21.8e-2597.1Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
A0A6J1JDT2 QWRF motif-containing protein 25.1e-2575.79Show/hide
Query:  PTCMSPTWMLWIIASVSNTKWAVSHSVTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        P  M+P     I +   N   A    VT  RSLSVSFQGEAFSLPISKTKAT+TPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Subjt:  PTCMSPTWMLWIIASVSNTKWAVSHSVTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8GXD9 Protein SNOWY COTYLEDON 34.5e-1053.57Show/hide
Query:  ASVSNTKWAVSHS----VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQ
        ++VS+T+  +S +    +T  RSLSVSFQGEAFS PISK K TATP    + +  TPERRRATP+RD       Q ENSK +DQ
Subjt:  ASVSNTKWAVSHS----VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQ
Q94AI1 QWRF motif-containing protein 24.5e-1059.42Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        +T  RSLSVSFQGEAFSLPISK K T +  +S+ +  STPERRR+TP+RD       Q ENSK +DQ R
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49890.1 Family of unknown function (DUF566)3.2e-1159.42Show/hide
Query:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
        +T  RSLSVSFQGEAFSLPISK K T +  +S+ +  STPERRR+TP+RD       Q ENSK +DQ R
Subjt:  VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR
AT3G19570.1 Family of unknown function (DUF566)3.2e-1153.57Show/hide
Query:  ASVSNTKWAVSHS----VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQ
        ++VS+T+  +S +    +T  RSLSVSFQGEAFS PISK K TATP    + +  TPERRRATP+RD       Q ENSK +DQ
Subjt:  ASVSNTKWAVSHS----VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQ
AT3G19570.2 Family of unknown function (DUF566)3.2e-1153.57Show/hide
Query:  ASVSNTKWAVSHS----VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQ
        ++VS+T+  +S +    +T  RSLSVSFQGEAFS PISK K TATP    + +  TPERRRATP+RD       Q ENSK +DQ
Subjt:  ASVSNTKWAVSHS----VTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLSNARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQ

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTATCGTCGCGACGCTGCGACGACTTGGAGCCCAAGAAAAGATGACGTCAGAGCGTCGCGACGCTGTGACGTAGCGTCTCGACGCTACGCCTGCTGGGAGCCTATAAA
AGGGGCCATTTGCATCCAAGTTTTGTGTGCCAATTTGTGGGATACCCCCACTTGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAAGTGGG
CCGTATCACATAGTGTCACCAAGATAAGGAGTTTATCGGTTTCGTTTCAAGGGGAGGCGTTTTCACTTCCGATTAGTAAGACGAAGGCCACTGCGACGCCGAGTTTGAGC
AATGCGAGGAAGGGTTCGACGCCAGAACGACGTAGGGCGACTCCACTTAGGGATAAGAGCGATGGGTCTGGTGTTCAAGTGGAGAATTCGAAATTACTTGATCAACATCG
CTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTATCGTCGCGACGCTGCGACGACTTGGAGCCCAAGAAAAGATGACGTCAGAGCGTCGCGACGCTGTGACGTAGCGTCTCGACGCTACGCCTGCTGGGAGCCTATAAA
AGGGGCCATTTGCATCCAAGTTTTGTGTGCCAATTTGTGGGATACCCCCACTTGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAAGTGGG
CCGTATCACATAGTGTCACCAAGATAAGGAGTTTATCGGTTTCGTTTCAAGGGGAGGCGTTTTCACTTCCGATTAGTAAGACGAAGGCCACTGCGACGCCGAGTTTGAGC
AATGCGAGGAAGGGTTCGACGCCAGAACGACGTAGGGCGACTCCACTTAGGGATAAGAGCGATGGGTCTGGTGTTCAAGTGGAGAATTCGAAATTACTTGATCAACATCG
CTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYRRDAATTWSPRKDDVRASRRCDVASRRYACWEPIKGAICIQVLCANLWDTPTCMSPTWMLWIIASVSNTKWAVSHSVTKIRSLSVSFQGEAFSLPISKTKATATPSLS
NARKGSTPERRRATPLRDKSDGSGVQVENSKLLDQHR