; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg007465 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg007465
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold2:347937..348608
RNA-Seq ExpressionSpg007465
SyntenySpg007465
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057761.1 hypothetical protein E6C27_scaffold274G00440 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-4256.33Show/hide
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        ML      +D+LISSL RHG  P    S WKIRTNQLA ++IRRERR AI SG L+ R+LSYDDA  M   L N DFLHG+Y +   Q DQI +    SS
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        DSGE             EK EQVPVCLN LSYS ASS    SSSSSS  L+  +  E+ A  AK+EENVT  VGEK+ E  N CKIGK +VGLAWLA+AS
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        V M++FS+RCLG   +DE+   PFLLVPT
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KAG6589372.1 hypothetical protein SDJN03_14795, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-6063.06Show/hide
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        L +DSPP+DDLISSL RHG A FSASSTWKIRTN+LA++EI RERR A+  G+   R+LS+DD  MG  LN + LHGNYWNG +QDQI  P + SSDS +
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           +N NRE   +E+EE+VPVCLN LSYSSASSSSS SS S +              K EENV  SVG KRE GN C+IG  EVGLA LAIASV MLIFS
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         RCL  GAY+EERL PFLLVPT
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KGN63472.1 hypothetical protein Csa_014116 [Cucumis sativus]1.5e-3555Show/hide
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        D +LIS+L RH     + SS+WKIRTNQLA EEIR ERR AI SG L+AR+LSYDDA  M   LN +F LHG+Y +   QD   + P  SSD GEE AE 
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                       VCLN LSYS A      SSSSSS   +  +M EQ AAK  +EENV   VGE K E  N CKIG  +VGLA LAIASV M+IFS+R
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        CLGL  +DEE   PFLLVPT
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TYJ98442.1 hypothetical protein E5676_scaffold350G00430 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-4155.65Show/hide
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        ML      +D+LISSL RHG  P    S WKIRTNQLA ++IRRERR AI SG L+ R+LSYDDA  M   L N DFLHG+Y +      DQI +    S
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        SDSGE             EK EQVPVCLN LSYS ASSS   SSSSSS  L+  +  E+ A  AK+EENVT  VGEK+ E  N CKIGK +VGLAWLA+A
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        SV M++FS+RCL    +DE+   PFLLVPT
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XP_022134742.1 uncharacterized protein LOC111006938 [Momordica charantia]3.7e-1344.83Show/hide
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        MLHN+S P+D  +LIS LQR G A  S SSTWKIRTN+LA+ E RRERR A  +  + ARKLSY+D                             +LSS+
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         G                ++Q PVCLN LSYSSASSSSS ++SSS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LRR5 Uncharacterized protein7.5e-3655Show/hide
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        D +LIS+L RH     + SS+WKIRTNQLA EEIR ERR AI SG L+AR+LSYDDA  M   LN +F LHG+Y +   QD   + P  SSD GEE AE 
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                       VCLN LSYS A      SSSSSS   +  +M EQ AAK  +EENV   VGE K E  N CKIG  +VGLA LAIASV M+IFS+R
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        CLGL  +DEE   PFLLVPT
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A0A5A7UWC4 Uncharacterized protein4.9e-4356.33Show/hide
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        V M++FS+RCLG   +DE+   PFLLVPT
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A0A5D3BFC1 Uncharacterized protein5.4e-4255.65Show/hide
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A0A6J1C0G4 uncharacterized protein LOC1110069381.8e-1344.83Show/hide
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A0A7N2MM31 Uncharacterized protein3.5e-0934.08Show/hide
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        DS P   L+SSLQ+    P  A   WK+RTN LA EEIRRER+  I+SGRL+ R+L      +  MG    +   +G      L  +  V  +   DS +
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        +  EN      G      +PVC     +    SSSS  SS SS  L  + +  +   + E+ V  SV  +R+       G+R  V + WLAIAS+   I 
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         V     G Y +E     +LVPT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCCACAACGATTCACCTCCAGACGACGATCTCATCTCCTCGCTTCAGCGCCATGGAGATGCGCCATTCTCGGCTTCATCCACATGGAAGATTCGAACCAACCAGTT
GGCTAAGGAAGAGATTCGAAGAGAACGAAGGGACGCCATTGATAGCGGCAGGTTGAGAGCCCGAAAGCTTTCTTACGATGATGCCCACATGGGTCCTGATCTAAACGACG
ATTTCTTACATGGGAATTACTGGAATGGGGTTCTTCAGGATCAGATCTTCGTTCCACCGATTCTATCATCTGATTCGGGCGAAGAGTGTGCAGAGAACTGCAACAGAGAA
TTTTTAGGCAAAGAAAAAGAAGAACAAGTTCCTGTTTGTTTAAACGATTTGTCTTATTCCTCTGCCTCATCCTCTTCTTCTGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGTCT
GTTATGCAAGAAAATGAACGAACAAAAGGCAGCCAAGATAGAAGAAAATGTGACGCCGAGTGTTGGTGAGAAGAGAGAATTTGGGAATTGGTGCAAAATAGGTAAGCGGG
AAGTGGGTTTAGCGTGGCTTGCCATTGCTTCGGTTGCTATGCTTATATTTTCAGTGCGTTGTTTAGGGTTAGGAGCATATGATGAAGAACGACTGCCTCCATTTCTGTTA
GTTCCAACTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTCCACAACGATTCACCTCCAGACGACGATCTCATCTCCTCGCTTCAGCGCCATGGAGATGCGCCATTCTCGGCTTCATCCACATGGAAGATTCGAACCAACCAGTT
GGCTAAGGAAGAGATTCGAAGAGAACGAAGGGACGCCATTGATAGCGGCAGGTTGAGAGCCCGAAAGCTTTCTTACGATGATGCCCACATGGGTCCTGATCTAAACGACG
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GTTCCAACTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FLGKEKEEQVPVCLNDLSYSSASSSSSVSSSSSSSCLLCKKMNEQKAAKIEENVTPSVGEKREFGNWCKIGKREVGLAWLAIASVAMLIFSVRCLGLGAYDEERLPPFLL
VPT