; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg007754 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg007754
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionX8 domain-containing protein
Genome locationscaffold4:9236757..9238799
RNA-Seq ExpressionSpg007754
SyntenySpg007754
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572453.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-10593.15Show/hide
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KAG7012047.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.5e-10294.71Show/hide
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XP_023554113.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.7e-10492.24Show/hide
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XP_038887351.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.0e-10595.83Show/hide
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XP_038887352.1 major pollen allergen Ole e 10-like isoform X2 [Benincasa hispida]7.0e-10595.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3M5 X8 domain-containing protein6.6e-10190.83Show/hide
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A0A0A0K8Y4 X8 domain-containing protein7.8e-10292.17Show/hide
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        Q+LLLLT+VSLRL H N
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A0A1S4DWJ2 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like6.0e-10293.52Show/hide
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        QLL LT+VSL LLH+N
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A0A5A7SSE1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like8.4e-9695.45Show/hide
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A0A6J1D2V3 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like2.0e-9787.1Show/hide
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        GHTRELNHE +KF+SPVSTTQRDITTPITTVPTIILSNPTASTP INPTSTSD+YSP ME+PK+SSPPSSG SWCIASQS SQTALQ+A+DYACGYGG D
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q84V39 Major pollen allergen Ole e 102.2e-1642.15Show/hide
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Query:  FGGTAVITSTDPSTMACQYTS
        F GT  ITS+DPS  +C + S
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Q8VYE5 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 126.3e-1635.75Show/hide
Query:  NPTSTSDTYSPTMESPKRSSPP---------------SSGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDHASYAFNSYYQKN
        N T  S T S T  SP  SS P                    WCIAS  AS T LQ ALD+ACG G  DCSA+Q  Q C+ P+T+  HASYAFN+YYQ++
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           +  C+F G +V    DPS   C Y     +     T       + G + +  SP A+        +Q+++   V L
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 13.9e-1843.2Show/hide
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        S ASWC+     S T LQ  LDYACG  G DC+  +  QSC+NP+ +  H +YA NS++Q K   P SCNF GTA  T++DPS   C + ++++ SS   
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Query:  --VLNTTNSKGSTVFGAVPSSPSPS
             TTN KGS     +P S + S
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Q9SD84 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 28.2e-1639.23Show/hide
Query:  SGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDHASYAFNSYYQ-KNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVLN
        + ASWC+     S + LQ  LDYACG  G DC+      SC+NP+ +  H +YA NS++Q K     SCNF GTA +T+TDPS   C + S+++ SS   
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Query:  TT-------NSKGSTVFGAVPSSPSPSAAT
        +T       + KGS      P   SP + T
Subjt:  TT-------NSKGSTVFGAVPSSPSPSAAT

Q9ZU91 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 38.8e-1838.1Show/hide
Query:  SSGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDHASYAFNSYYQK-NPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVL
        ++  ++CIA +   +  LQ ALD+ACG G  DCSA+  G+SCY P+ +  H++YAFN+YYQK      SC+F G A +T+TDPS   C +  ++ S+  L
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Query:  -NTTN----SKGSTVFGAVPSSPSPSAATCQEINVLQQLLLLTMVSL
         N T+    S  ST  G +P       A+  ++ +L  LL++ +V L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein6.9e-2643.33Show/hide
Query:  PVSTTQRDITTPITTVPTIILSNPTASTPFINPTSTSDTYSPTMESPKRSSPPS-SGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPN
        PV T      TP  T P   ++NP    P   P+ T     P +  P  S+ PS SG SWC+A   ASQ +LQ ALDYACG    DCS +Q G +CY+P 
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Query:  TIHDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQY---TSTSTSSSVLNTTNSKGSTVFGAVPSSPSPSAAT
        ++  HAS+AFNSYYQKNP P SC+FGG A + +T+PST +C Y   +STST  +   TT +  +      P + +P   T
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.0e-2955.93Show/hide
Query:  WCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVLNTTNSK
        WCIA  +AS T+LQ+ALDYACGYGG DC  IQ G +CY PNTI DHAS+AFNSYYQK+P  +SCNFGG A +TSTDPS  +C ++S+S + S  +  +  
Subjt:  WCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVLNTTNSK

Query:  GSTVFGAVPSSPSPSAAT
            F + PSS  P   T
Subjt:  GSTVFGAVPSSPSPSAAT

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.9e-3646.52Show/hide
Query:  QRDITTPITTVPTIILSNPTASTPFINPTSTSDTYSP-TMESPKRSSPPSSGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDH
        ++DITTP+ T PT   + PT   P  +  +++   +P T+ S           SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G +CYNPN++  H
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Query:  ASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVLNTTNSKGSTVFGAVPS--SPSPSAATCQEINVLQQLLLL
        AS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DPS  +C + STSTS S+LN T+  G  +FG +PS  +P P A+T     ++  L  L
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AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein5.6e-2850Show/hide
Query:  QRDITTPITTVPTIILSNPTASTPFINPTSTSDTYSP-TMESPKRSSPPSSGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDH
        ++DITTP+ T PT   + PT   P  +  +++   +P T+ S           SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G +CYNPN++  H
Subjt:  QRDITTPITTVPTIILSNPTASTPFINPTSTSDTYSP-TMESPKRSSPPSSGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDH

Query:  ASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPS
        AS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DPS
Subjt:  ASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPS

AT4G13600.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.3e-2047.86Show/hide
Query:  SSGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDHASYAFNSYYQKNPV-PNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVL
        SS A WC+A    +  ALQ ALDYAC   G DC+ IQ    C+ PNT+  HASYAFNSY+Q+  + P SCNF GT+ I  TDPS  +C Y      +SV 
Subjt:  SSGASWCIASQSASQTALQLALDYACGYGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDHASYAFNSYYQKNPV-PNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVL

Query:  NTTNSKGSTVFGAVPSS
        N   S  +T  G  PS+
Subjt:  NTTNSKGSTVFGAVPSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAGGACACACAAGAGAGCTAAACCATGAGAATCAGAAATTCAGTTCTCCAGTTTCCACCACTCAAAGGGATATAACTACCCCTATAACAACCGTTCCCACAATAAT
TCTTTCCAATCCCACTGCATCAACTCCATTTATCAATCCAACTTCAACCTCAGACACGTATTCTCCAACCATGGAATCTCCCAAAAGATCATCTCCACCGTCGTCGGGGG
CTAGTTGGTGCATTGCTAGTCAAAGTGCATCACAAACGGCATTGCAACTTGCTCTGGACTATGCATGTGGCTATGGTGGTACTGATTGTTCAGCAATTCAAGCTGGTCAG
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CGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACAGGACACACAAGAGAGCTAAACCATGAGAATCAGAAATTCAGTTCTCCAGTTTCCACCACTCAAAGGGATATAACTACCCCTATAACAACCGTTCCCACAATAAT
TCTTTCCAATCCCACTGCATCAACTCCATTTATCAATCCAACTTCAACCTCAGACACGTATTCTCCAACCATGGAATCTCCCAAAAGATCATCTCCACCGTCGTCGGGGG
CTAGTTGGTGCATTGCTAGTCAAAGTGCATCACAAACGGCATTGCAACTTGCTCTGGACTATGCATGTGGCTATGGTGGTACTGATTGTTCAGCAATTCAAGCTGGTCAG
AGCTGTTACAACCCAAACACCATTCATGACCATGCCTCTTACGCCTTCAATAGCTACTATCAAAAGAATCCTGTTCCAAATAGCTGTAACTTTGGTGGGACTGCTGTCAT
TACTAGCACTGACCCAAGTACTATGGCCTGTCAGTATACATCCACTAGCACAAGTTCATCAGTTCTAAACACCACAAATTCCAAGGGTTCAACAGTTTTTGGTGCTGTAC
CCTCAAGTCCCTCTCCTTCAGCAGCAACTTGTCAAGAAATAAATGTACTGCAACAGTTACTGCTGTTGACCATGGTTTCTCTCAGATTATTACACAGCAACGACCGCGAT
CGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SCYNPNTIHDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSVLNTTNSKGSTVFGAVPSSPSPSAATCQEINVLQQLLLLTMVSLRLLHSNDRD
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