; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg008167 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg008167
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionprotein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic-like
Genome locationscaffold2:18614760..18623018
RNA-Seq ExpressionSpg008167
SyntenySpg008167
Gene Ontology termsGO:0005524 - ATP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003439 - ABC transporter-like, ATP-binding domain
IPR003593 - AAA+ ATPase domain
IPR017871 - ABC transporter-like, conserved site
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588286.1 Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-119100Show/hide
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A0A1S3B8R6 protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic isoform X27.1e-12093.03Show/hide
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A0A5D3D8G1 Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 33.9e-11898.24Show/hide
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A0A6J1F2M5 protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic-like5.4e-120100Show/hide
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A0A6J1KHV9 protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic-like6.0e-11999.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P30769 Probable ribonucleotide transport ATP-binding protein mkl3.1e-3235.81Show/hide
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P63358 Probable ribonucleotide transport ATP-binding protein mkl8.3e-3336.24Show/hide
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P9WQL4 Probable ribonucleotide transport ATP-binding protein mkl8.3e-3336.24Show/hide
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P9WQL5 Probable ribonucleotide transport ATP-binding protein mkl8.3e-3336.24Show/hide
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Q9AT00 Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic2.1e-10887.22Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65410.1 non-intrinsic ABC protein 111.5e-10987.22Show/hide
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AT1G67940.1 non-intrinsic ABC protein 36.3e-2032.17Show/hide
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AT2G47000.1 ATP binding cassette subfamily B42.6e-1834.23Show/hide
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        IR G+ V ++G SG+GKST++ ++     PD GE+ + G +    I    L  LR   GLV Q   LF+  T+R N+ +    ++S SE   SA ++   
Subjt:  IRHGEAVGVIGPSGTGKSTILKIIAGLLSPDKGEVYIRGRKRVGLIDDEELSGLR--IGLVFQSAALFDSLTVRQNVGFLLYENSSLSEDQISALVTENL

Query:  AAV-GLKGVEDRLPSE----LSGGMKKRVALARSIIFDNTRKEIEPEVLLYDEPTAGLDPIASTVVEDLIRSVHIKGEDASGKPGKIASYIVVTHQHSTI
          + GL+   D +  E    LSGG K+RVA+AR+I+ D       P+VLL DE T+ LD  +  VV+D +  V +             + IVV H+ STI
Subjt:  AAV-GLKGVEDRLPSE----LSGGMKKRVALARSIIFDNTRKEIEPEVLLYDEPTAGLDPIASTVVEDLIRSVHIKGEDASGKPGKIASYIVVTHQHSTI

Query:  RRAVDRLLFLYEGKVVWQGMTD
        + A D +  +  G +V +G  D
Subjt:  RRAVDRLLFLYEGKVVWQGMTD

AT3G13220.1 ABC-2 type transporter family protein1.3e-1725.4Show/hide
Query:  FLDTHPIKSR---IIVKLGNLDIDINDSESKAAEWRWICCYVTVLLSGYRSSPLPFYRIDHTSECFIRHGEAVGVIGPSGTGKSTILKIIAGLLSPDKGE
        F+ T+P++     I +K  +++  + +S + +A    +   V+ +++     P  +  I          GE + ++GPSG+GK+T+LKI+ G L+ +   
Subjt:  FLDTHPIKSR---IIVKLGNLDIDINDSESKAAEWRWICCYVTVLLSGYRSSPLPFYRIDHTSECFIRHGEAVGVIGPSGTGKSTILKIIAGLLSPDKGE

Query:  VYIRGRKRVGLIDDEELSGLRIGLVFQSAALFDSLTVRQNVGFLLYEN--SSLSEDQISALVTENLAAVGLK-----GVEDRLPSELSGGMKKRVALARS
          ++G+     I        RIG V Q   L   LTV + + F  +    SS+S++Q  A +   +  +GL+      V       +SGG +KR ++A  
Subjt:  VYIRGRKRVGLIDDEELSGLRIGLVFQSAALFDSLTVRQNVGFLLYEN--SSLSEDQISALVTENLAAVGLK-----GVEDRLPSELSGGMKKRVALARS

Query:  IIFDNTRKEIEPEVLLYDEPTAGLDPIASTVVEDLIRSVHIKGEDASGKPGKIASYIVVTHQHST-IRRAVDRLLFLYEGKVVWQGM---TDEFTTSTNP
        I+       ++P +LL DEPT+GLD  ++T +  +++ V         K G+  + I   HQ S+ +    D+LL + EG   + G    + E+ +S   
Subjt:  IIFDNTRKEIEPEVLLYDEPTAGLDPIASTVVEDLIRSVHIKGEDASGKPGKIASYIVVTHQHST-IRRAVDRLLFLYEGKVVWQGM---TDEFTTSTNP

Query:  IVQQELNPGPY
        + +  +NP  +
Subjt:  IVQQELNPGPY

AT5G46540.1 P-glycoprotein 75.9e-1830.84Show/hide
Query:  IRHGEAVGVIGPSGTGKSTILKIIAGLLSPDKGEVYIRGRKRVGLIDDEELS----GLRIGLVFQSAALFDSLTVRQNVGFLLYENSSLSEDQI-SALVT
        + +G  V ++G SG+GKST++ +I     P+ GEV I G      ID ++        +IGLV Q   LF + T+R+N+   +Y     S+ +I +AL  
Subjt:  IRHGEAVGVIGPSGTGKSTILKIIAGLLSPDKGEVYIRGRKRVGLIDDEELS----GLRIGLVFQSAALFDSLTVRQNVGFLLYENSSLSEDQI-SALVT

Query:  ENLA------AVGLKGVEDRLPSELSGGMKKRVALARSIIFDNTRKEIEPEVLLYDEPTAGLDPIASTVVEDLIRSVHIKGEDASGKPGKIASYIVVTHQ
         N +        GL+ +     ++LSGG K+R+A+AR+I+ +       P++LL DE T+ LD  +  +V+D +  + +             + +VV H+
Subjt:  ENLA------AVGLKGVEDRLPSELSGGMKKRVALARSIIFDNTRKEIEPEVLLYDEPTAGLDPIASTVVEDLIRSVHIKGEDASGKPGKIASYIVVTHQ

Query:  HSTIRRAVDRLLFLYEGKVVWQGMTDE
         +TIR A D +  + +GKV+ +G  DE
Subjt:  HSTIRRAVDRLLFLYEGKVVWQGMTDE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGATTATGGTGGAATATGTTTGATGTTTTTCACTTCTTAGTGGCCCATTCAGAGGAATACATATTAAAAAATTCAAGGACTCAATCTCTACCTTCGCAGCAACTCTG
TCAGGTTGCAATTCTGTCGAATGGAGTTCATGTTCAAGAGAAACTAGCGAAAGTTACTAGACTTGACAAGGTGGAGCACCATTGTTCTTTAGAAAATTTTCCAATTCTCT
TTGAGAAGGCTTTGTTCCCCTTTCTAAATTATTCGGCCCGTGATTCCTCTGGCTTTTTAAGTACCGAGGAATTCGATAACAGTCCAGATTGTGATCCACGTTTAGCTTTC
CTCAGCTTCCTGGATACCCATCCAATAAAAAGTAGGATTATTGTCAAGCTTGGGAACCTTGATATTGATATAAATGACTCTGAGAGTAAGGCAGCAGAGTGGAGATGGAT
CTGTTGCTATGTAACAGTTCTGCTCTCTGGTTATCGCTCTTCTCCTTTGCCTTTCTACAGAATTGATCACACTAGCGAATGTTTTATTAGACATGGAGAAGCTGTGGGAG
TAATTGGGCCTTCTGGTACTGGGAAGTCTACAATACTGAAGATCATTGCAGGTCTTCTTTCTCCAGACAAGGGAGAGGTATATATTCGAGGTAGAAAGCGAGTTGGTTTG
ATCGATGATGAGGAGCTATCTGGTCTTCGAATTGGATTGGTTTTTCAGAGTGCAGCACTCTTTGACTCATTAACTGTTCGACAAAATGTTGGTTTCCTTTTGTATGAAAA
TTCAAGCTTGTCTGAAGATCAAATTTCAGCATTGGTAACTGAGAACTTAGCTGCTGTTGGGCTGAAGGGAGTTGAGGACCGGTTACCTTCTGAATTATCAGGTGGAATGA
AGAAACGAGTTGCTTTAGCTAGGTCTATAATTTTTGATAACACAAGGAAAGAAATTGAGCCAGAGGTCCTCTTGTATGATGAACCAACTGCTGGACTTGACCCAATTGCA
TCAACTGTTGTCGAAGATCTTATACGTTCTGTACATATTAAGGGTGAGGATGCAAGTGGGAAGCCTGGGAAGATTGCATCTTATATTGTAGTCACCCACCAACATAGTAC
CATTAGGCGAGCTGTTGACAGGTTATTGTTTTTATATGAGGGAAAGGTTGTCTGGCAAGGAATGACTGATGAATTTACAACATCTACAAATCCAATCGTTCAACAGGAAT
TAAACCCTGGACCGTATTCAGAGACGGTCTCCTTTGGTGTTAGGCCCGCAGTGGTTCCTTGTGTGTATGAGGCACTGGTAGGATATTGGCCACTTGTTGTGGGGATGTCA
GTTTACTCATGCTCTATGGAGCAATTGCTTAAAGTCATTCAATTCGCATCGGGAAGCCTGGATGGTCCGATTAAATCTGGAACGAAACCTAGATCTGGGTTTGGTTCCAG
ATCTGAAACGAAGGGGATTGCCCCTTCGTTTCAAGCTAGAATCGAAGGGTTTCATGGCATGAGGCGTGAGTTTCGTTCGTTTCAAGCCGAGAGAAAGCATAGGAGAGACT
GGTTCGAGGTCAGATCTGGAACGAGCCAACTTCAACATCTAGGCAATTCCAACGACGAACTAACCTGCCGCTTCGACACCCACATGCTTTCCTTGAGTTTTGGCGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGATTATGGTGGAATATGTTTGATGTTTTTCACTTCTTAGTGGCCCATTCAGAGGAATACATATTAAAAAATTCAAGGACTCAATCTCTACCTTCGCAGCAACTCTG
TCAGGTTGCAATTCTGTCGAATGGAGTTCATGTTCAAGAGAAACTAGCGAAAGTTACTAGACTTGACAAGGTGGAGCACCATTGTTCTTTAGAAAATTTTCCAATTCTCT
TTGAGAAGGCTTTGTTCCCCTTTCTAAATTATTCGGCCCGTGATTCCTCTGGCTTTTTAAGTACCGAGGAATTCGATAACAGTCCAGATTGTGATCCACGTTTAGCTTTC
CTCAGCTTCCTGGATACCCATCCAATAAAAAGTAGGATTATTGTCAAGCTTGGGAACCTTGATATTGATATAAATGACTCTGAGAGTAAGGCAGCAGAGTGGAGATGGAT
CTGTTGCTATGTAACAGTTCTGCTCTCTGGTTATCGCTCTTCTCCTTTGCCTTTCTACAGAATTGATCACACTAGCGAATGTTTTATTAGACATGGAGAAGCTGTGGGAG
TAATTGGGCCTTCTGGTACTGGGAAGTCTACAATACTGAAGATCATTGCAGGTCTTCTTTCTCCAGACAAGGGAGAGGTATATATTCGAGGTAGAAAGCGAGTTGGTTTG
ATCGATGATGAGGAGCTATCTGGTCTTCGAATTGGATTGGTTTTTCAGAGTGCAGCACTCTTTGACTCATTAACTGTTCGACAAAATGTTGGTTTCCTTTTGTATGAAAA
TTCAAGCTTGTCTGAAGATCAAATTTCAGCATTGGTAACTGAGAACTTAGCTGCTGTTGGGCTGAAGGGAGTTGAGGACCGGTTACCTTCTGAATTATCAGGTGGAATGA
AGAAACGAGTTGCTTTAGCTAGGTCTATAATTTTTGATAACACAAGGAAAGAAATTGAGCCAGAGGTCCTCTTGTATGATGAACCAACTGCTGGACTTGACCCAATTGCA
TCAACTGTTGTCGAAGATCTTATACGTTCTGTACATATTAAGGGTGAGGATGCAAGTGGGAAGCCTGGGAAGATTGCATCTTATATTGTAGTCACCCACCAACATAGTAC
CATTAGGCGAGCTGTTGACAGGTTATTGTTTTTATATGAGGGAAAGGTTGTCTGGCAAGGAATGACTGATGAATTTACAACATCTACAAATCCAATCGTTCAACAGGAAT
TAAACCCTGGACCGTATTCAGAGACGGTCTCCTTTGGTGTTAGGCCCGCAGTGGTTCCTTGTGTGTATGAGGCACTGGTAGGATATTGGCCACTTGTTGTGGGGATGTCA
GTTTACTCATGCTCTATGGAGCAATTGCTTAAAGTCATTCAATTCGCATCGGGAAGCCTGGATGGTCCGATTAAATCTGGAACGAAACCTAGATCTGGGTTTGGTTCCAG
ATCTGAAACGAAGGGGATTGCCCCTTCGTTTCAAGCTAGAATCGAAGGGTTTCATGGCATGAGGCGTGAGTTTCGTTCGTTTCAAGCCGAGAGAAAGCATAGGAGAGACT
GGTTCGAGGTCAGATCTGGAACGAGCCAACTTCAACATCTAGGCAATTCCAACGACGAACTAACCTGCCGCTTCGACACCCACATGCTTTCCTTGAGTTTTGGCGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRLWWNMFDVFHFLVAHSEEYILKNSRTQSLPSQQLCQVAILSNGVHVQEKLAKVTRLDKVEHHCSLENFPILFEKALFPFLNYSARDSSGFLSTEEFDNSPDCDPRLAF
LSFLDTHPIKSRIIVKLGNLDIDINDSESKAAEWRWICCYVTVLLSGYRSSPLPFYRIDHTSECFIRHGEAVGVIGPSGTGKSTILKIIAGLLSPDKGEVYIRGRKRVGL
IDDEELSGLRIGLVFQSAALFDSLTVRQNVGFLLYENSSLSEDQISALVTENLAAVGLKGVEDRLPSELSGGMKKRVALARSIIFDNTRKEIEPEVLLYDEPTAGLDPIA
STVVEDLIRSVHIKGEDASGKPGKIASYIVVTHQHSTIRRAVDRLLFLYEGKVVWQGMTDEFTTSTNPIVQQELNPGPYSETVSFGVRPAVVPCVYEALVGYWPLVVGMS
VYSCSMEQLLKVIQFASGSLDGPIKSGTKPRSGFGSRSETKGIAPSFQARIEGFHGMRREFRSFQAERKHRRDWFEVRSGTSQLQHLGNSNDELTCRFDTHMLSLSFGV