; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg008451 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg008451
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold10:30724417..30724902
RNA-Seq ExpressionSpg008451
SyntenySpg008451
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601790.1 hypothetical protein SDJN03_07023, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-6786.14Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH
        M D SSNKRLR+DS DSESD+PEVKRLK DLLGLLDDADPDP VQDLDSVIQSFADEISPVSS     AA  +SLPELGYLL+ASDDELGLPPS+ASTSH
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH

Query:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        G EAE AEL RASSESSG+GEIWGFEDAIPSYESFELGEG RFYNDTEYVA DGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

KAG7016709.1 hypothetical protein SDJN02_21819, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-6687.35Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH
        MED SSNKRLRVDS DSESDSPEVKRLK DLL LLDDADPDP VQDLDSVIQSFADEISPVSS     AAPG+SLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTS 
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH

Query:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        G E+EVAEL RASSESSG+GEIWGFEDAIP   SFELGEGERFY+D+EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

XP_022993320.1 uncharacterized protein LOC111489362 [Cucurbita maxima]2.6e-6988.55Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH
        MED SS KRLRVDS DSESDSPEVKRLK DLL LLDDADPDP VQDLDSVIQSFADEISPVSS     AAPG+SLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTS 
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH

Query:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        G E+EVAEL RASSESSG+GEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFY+D+EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

XP_023538923.1 uncharacterized protein LOC111799678 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.2e-6786.14Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH
        M D SSNKRLR+DS DSESD+PEVKRLK DLLGLLDDADPDP VQDLDSVIQSFADEISPVSS     AA  +SLPELGYLL+ASDDELGLPPS+ASTSH
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH

Query:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        G EAE AEL RASSESSG+GEIWGFEDAIPSYESFELGEG RFYNDTEYVA DGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

XP_038885926.1 uncharacterized protein LOC120076234 [Benincasa hispida]5.0e-6886.39Show/hide
Query:  MEDH-SSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSAAP------GDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDAST
        M++H SSNKRLRVDS DSESDSPEVKRL+ DLLGLLDDADPDP VQDLDS+IQSFADEISPVSS  P      GDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDAST
Subjt:  MEDH-SSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSAAP------GDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDAST

Query:  SHGSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYND-TEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        SHG E EV ELARASSESSGIGEIWGFED +PSYE+FELGEGERFYND TEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  SHGSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYND-TEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K873 Uncharacterized protein4.4e-6280.98Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSAAPGDSLP-ELGYLLLASDDELGLPPSDASTSHGSEA
        M+ HS NKRLRVDS DSESDSPEVKRL+ DLLGLLDD+DPDP VQDLDS+IQSFADEISPVSS  P  + P ELGYLLLASDDELGLPPS ASTSHG + 
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSAAPGDSLP-ELGYLLLASDDELGLPPSDASTSHGSEA

Query:  EVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFEL-GEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        EV ELAR SS+SSGIG+IWGFEDA+PSYE+ EL G+GERFYN+ EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  EVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFEL-GEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

A0A1S3BDY1 uncharacterized protein LOC1034886142.3e-6382.82Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSAAPGDSLP-ELGYLLLASDDELGLPPSDASTSHGSEA
        M++HS NKR RVDS DSESDSPEVKRL+ DLLGLLDD+DPDP VQDLDSVIQSFADEISPVSS  P  + P ELGYLLLASDDELGLPPSDASTSHG E 
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSAAPGDSLP-ELGYLLLASDDELGLPPSDASTSHGSEA

Query:  EVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFEL-GEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        EV E+AR SSESSGIGEIWGFEDA+PSYE+ EL G GERFYN+ EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  EVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFEL-GEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

A0A6J1FGC2 uncharacterized protein LOC1114451641.0e-6385.54Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH
        MED SSNKRLRV   DSESDSPEVKRLK DLL LLD ADPDP VQDLDSVIQSFADEISPVSS     AAPG+SLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTS 
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH

Query:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        G E+EVAEL RASSESSG+GEIWGFEDAIP   SFELGEGERFY+D+EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

A0A6J1H3R7 uncharacterized protein LOC1114444677.8e-6785.54Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH
        M D SSNKRLR+DS DSESD+PEVKRLK DLLGLL+DADPDP VQDLDSVIQSFADEISPVSS     AA  +SLPELGYLL+ASDDELGLPPS+ASTSH
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH

Query:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        G EAE AEL RASSESSG+GEIWGFEDAIPSYESFELGEG RFYNDTEYVA DGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

A0A6J1JY78 uncharacterized protein LOC1114893621.3e-6988.55Show/hide
Query:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH
        MED SS KRLRVDS DSESDSPEVKRLK DLL LLDDADPDP VQDLDSVIQSFADEISPVSS     AAPG+SLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTS 
Subjt:  MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSS-----AAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSH

Query:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        G E+EVAEL RASSESSG+GEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFY+D+EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  GSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13360.1 unknown protein2.6e-3048.19Show/hide
Query:  DHSSNKRLRVDS-EDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVS------SAAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDA----
        D +  KR+R +S +++  DSPEVKRL+ DL  +LDD+DP+P  QDLDSV++SF DE+S V+      S+  G++ P+LGYLL ASDDELGLPP  +    
Subjt:  DHSSNKRLRVDS-EDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVS------SAAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDA----

Query:  --STSHGSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSD
          +    +   V +L RASS+SSGI EIWGFED + +Y   + G G    +  +YVA +GLFE SD
Subjt:  --STSHGSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSD

AT1G13360.2 unknown protein2.4e-2846.06Show/hide
Query:  DHSSNKRLRVDS-EDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVS------SAAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDA----
        D +  KR+R +S +++  DSPEVKRL+ DL  +LDD+DP+P  QDLDSV++SF DE+S V+      S+  G++ P+LGYLL ASDDELGLPP  +    
Subjt:  DHSSNKRLRVDS-EDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVS------SAAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDA----

Query:  --STSHGSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHS
          +    +   V +L RASS+SSGI EIWGFED + +Y   + G G    +  +YVA +G F ++
Subjt:  --STSHGSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHS

AT1G13360.3 unknown protein2.4e-2847.59Show/hide
Query:  DHSSNKRLRVDS-EDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVS------SAAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDA----
        D +  KR+R +S +++  DSPEVKRL+ DL  +LDD+DP+P  QDLDSV++SF DE+S V+      S+  G++ P+LGYLL ASDDELGLPP  +    
Subjt:  DHSSNKRLRVDS-EDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVS------SAAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDA----

Query:  --STSHGSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGL-FEHS
          +    +   V +L RASS+SSGI EIWGFED + +Y   + G G    +  +YVA +GL F HS
Subjt:  --STSHGSEAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGL-FEHS

AT3G25870.1 unknown protein2.9e-2144.1Show/hide
Query:  DHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSA-APGDSLPELGYLLLASDDELGLP----PSDASTSHGS
        D   NKR+R   +  + DSP+VKRL+ D   L DD+  DP  QDLDSV++SF +E+S  ++A + G++ P+LGYL  ASDDELGLP    P         
Subjt:  DHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSA-APGDSLPELGYLLLASDDELGLP----PSDASTSHGS

Query:  EAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYS
        E  V EL RASS+SS +GE+ GFED +  +   +LG+   F    EY  FDG  +  D++S
Subjt:  EAEVAELARASSESSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGATCACTCCTCAAACAAACGCCTCCGAGTCGACTCGGAAGACTCCGAATCCGACTCGCCGGAGGTCAAGCGTCTCAAACACGACCTCCTCGGCCTCCTCGACGA
CGCCGACCCCGATCCCGCCGTTCAGGATCTCGATTCCGTCATCCAGAGTTTCGCCGACGAGATCTCCCCGGTCTCCTCGGCGGCCCCCGGCGACTCCTTGCCGGAGCTCG
GGTACCTTCTCCTGGCGTCCGACGACGAGCTCGGCCTCCCGCCGTCCGACGCCTCCACCAGCCACGGCAGCGAGGCGGAGGTCGCCGAACTGGCGCGGGCGTCGTCGGAG
TCGTCCGGGATCGGAGAGATTTGGGGATTCGAAGATGCGATTCCGAGTTACGAGTCGTTCGAGTTGGGGGAGGGAGAGAGATTTTACAACGATACGGAATATGTGGCGTT
CGATGGACTGTTTGAACATTCCGATGTGTACTCCGTTTTCTCGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGATCACTCCTCAAACAAACGCCTCCGAGTCGACTCGGAAGACTCCGAATCCGACTCGCCGGAGGTCAAGCGTCTCAAACACGACCTCCTCGGCCTCCTCGACGA
CGCCGACCCCGATCCCGCCGTTCAGGATCTCGATTCCGTCATCCAGAGTTTCGCCGACGAGATCTCCCCGGTCTCCTCGGCGGCCCCCGGCGACTCCTTGCCGGAGCTCG
GGTACCTTCTCCTGGCGTCCGACGACGAGCTCGGCCTCCCGCCGTCCGACGCCTCCACCAGCCACGGCAGCGAGGCGGAGGTCGCCGAACTGGCGCGGGCGTCGTCGGAG
TCGTCCGGGATCGGAGAGATTTGGGGATTCGAAGATGCGATTCCGAGTTACGAGTCGTTCGAGTTGGGGGAGGGAGAGAGATTTTACAACGATACGGAATATGTGGCGTT
CGATGGACTGTTTGAACATTCCGATGTGTACTCCGTTTTCTCGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDHSSNKRLRVDSEDSESDSPEVKRLKHDLLGLLDDADPDPAVQDLDSVIQSFADEISPVSSAAPGDSLPELGYLLLASDDELGLPPSDASTSHGSEAEVAELARASSE
SSGIGEIWGFEDAIPSYESFELGEGERFYNDTEYVAFDGLFEHSDVYSVFS