| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575809.1 Exopolygalacturonase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.6e-127 | 62 | Show/hide |
Query: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
G ++NS G VA+N KAA+DL G G A+F V+KYGAKA+GK+D+AQAFMT WI ACR T GPAKFLIP+GTFLVGPV FAGPC+S PITIEIQGTVKA
Subjt: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
Query: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
TTDISEYSSP+W SIE ITGLILTGSGVFDGQGASA
Subjt: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
Query: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
IGTGDDCVSIG CEKITVTN+TCGP HGIS+GSLG Y EKSV DVLVQNCTIFNATNG RIKTWA T+SGSA GIIFD+
Subjt: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
Query: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
IVM VK IIIDQTYGTKK KASKWKIS+VHFKNIRGTS TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG +LKNTTIVSSCLNAK+ G + C +
Subjt: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| KAG7014351.1 Exopolygalacturonase-like 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 3.3e-127 | 62.25 | Show/hide |
Query: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
G ++NS G VA+N KAA+DL G G A+F V+KYGAKA+GK+D+AQAFMT WI ACR T GPAKFLIP+GTFLVGPV FAGPC+S PITIEIQGTVKA
Subjt: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
Query: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
TTDISEYSSP+W SIE ITGLILTGSGVFDGQGASA
Subjt: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
Query: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
IGTGDDCVSIG CEKITVTN+TCGP HGIS+GSLG Y EKSV DVLVQNCTIFNATNGARIKTWA T+SGSA GIIFD+
Subjt: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
Query: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
IVM VK IIIDQTYGTKK KASKWKIS+VHFKNIRGTS TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG +LKNTTIVSSCLNAK+ G + C +
Subjt: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| XP_022953910.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita moschata] | 4.8e-126 | 62 | Show/hide |
Query: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
G ++NS G VA+N KAA+DL G G A+F V+KYGAKA+GK+D+AQAFMT WI ACR T GPAKFLIP+GTFLVGPV FAGPC+S PITIEIQGTVKA
Subjt: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
Query: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
TTDISEYSSP+W SIE ITGLILTGSGVFDGQGASA
Subjt: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
Query: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
IGTGDDCVSIG CEKITVTN+TCGP HGIS+GSLG Y EKSV DVLVQNCTIFNATNGARIKTWA T+SGSA GIIFD+
Subjt: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
Query: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
IVM VK IIIDQTYGTKK KASKWKIS+V FKNIRGTS TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG +LKNTTIVSSCLNAK+ G + C +
Subjt: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| XP_022991773.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita maxima] | 3.1e-125 | 61.87 | Show/hide |
Query: SNSDGNVAVNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDI
+N G+VA+N KAA+ L G G A+F V+KYGAKA+GK+D+AQAFMT WI ACR T GPAKFLIP+G FLVGPVTFAGPCKS+PITIEIQGTVKATTDI
Subjt: SNSDGNVAVNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDI
Query: SEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA--------------------------------------------------------------------
SEYSSP+W SIE ITGLILTGSGVFDGQGASA
Subjt: SEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA--------------------------------------------------------------------
Query: -------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMY
IGTGDDCVSIG CEKITVTN+TCGP HGIS+GSLG Y EKSV DVLVQNCTIFNATNGARIKTWA T+SGSA GI+FD+IVM
Subjt: -------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMY
Query: NVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
VK IIIDQTYGTK+ KASKWKISDVHFKNIRGTS TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG +LKNTT VSSCLNAK+ G + C +
Subjt: NVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| XP_023549400.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 6.2e-126 | 62.5 | Show/hide |
Query: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
G ++NS G VA+N KAA+ L G G A+F V+KYGAKA+GKTD+AQAFMT WI ACR T GPAKFLIP+GTFLVGPV FAGPCKS PITIEIQGTVKA
Subjt: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
Query: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
TTDISEYSSP+W SIE ITGLILTGSGVFDGQGASA
Subjt: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
Query: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
IGTGDDCVSIG CEKITVTNITCGP HGIS+GSLG Y EKSV DVLVQNCTIFNATNGARIKTWA T+SGSA GIIFD+
Subjt: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
Query: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
IVM VK IIIDQTYGTKK KASKWKIS+VHFKNIRGTS TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG + KNTTIVSSCLNAK+ G + C +
Subjt: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TQ89 Exopolygalacturonase-like | 1.1e-120 | 60.82 | Show/hide |
Query: VNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEW
VND++A I LN GG++F V K+GAKADG+TD+AQAFMT WI ACR TVGPAKFLIP+GT+LVGPVTFAGPCKS PIT+E QGTVKATTDISEYSSPEW
Subjt: VNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEW
Query: FSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------------------
FSIE ITG ILTGSGVFDGQG +
Subjt: FSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------------------
Query: -----CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIII
VIGTGDDCVSIG E I VTN+TCGP HG+SVGSLG Y KEKSV++VLV+NCTIFNATNGARIKTWA +SG A+GIIF+DIVMYNVK III
Subjt: -----CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIII
Query: DQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
DQTYGTKK K S WKISDVHFKNIRGTS TNVAVLLECS L PC+GVELRDINLTYGG NL+NTTIVSSC NAK+ G + C +
Subjt: DQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| A0A5A7U4W1 Exopolygalacturonase-like | 1.1e-120 | 60.82 | Show/hide |
Query: VNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEW
VND++A I LN GG++F V K+GAKADG+TD+AQAFMT WI ACR TVGPAKFLIP+GT+LVGPVTFAGPCKS PIT+E QGTVKATTDISEYSSPEW
Subjt: VNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEW
Query: FSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------------------
FSIE ITG ILTGSGVFDGQG +
Subjt: FSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------------------
Query: -----CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIII
VIGTGDDCVSIG E I VTN+TCGP HG+SVGSLG Y KEKSV++VLV+NCTIFNATNGARIKTWA +SG A+GIIF+DIVMYNVK III
Subjt: -----CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIII
Query: DQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
DQTYGTKK K S WKISDVHFKNIRGTS TNVAVLLECS L PC+GVELRDINLTYGG NL+NTTIVSSC NAK+ G + C +
Subjt: DQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| A0A5D3C9J8 Exopolygalacturonase-like | 1.4e-120 | 59.64 | Show/hide |
Query: NVAVNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSS
N+ +D+ DLNG GG++F+V K+GAKADGKTD+AQAF+T WIEACR TVGPAK LIP GT+LVGPVT AGPCKS PIT+E QGTVKATTDIS+YSS
Subjt: NVAVNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSS
Query: PEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA-------------------------------------------------------------------------
PEWFSIE ITG ILTGSGVFDGQG +A
Subjt: PEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA-------------------------------------------------------------------------
Query: --------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYS
+IGTGDDCVSIG EKITVTN+TCGP HG+SVGSLG YP+EK V+DVLV+NCTIFNATNGARIKT+A +SGSA+GIIF+DIVMYNVKY
Subjt: --------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYS
Query: IIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
IIIDQTY T +NK SKWK+SDVHFKNIRGTS TNVAVLL+CS L PC+GVELRDI+LTYGG +LKNTTIVSSC NAK+ G + C
Subjt: IIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
|
|
| A0A6J1GQZ3 exopolygalacturonase-like | 2.3e-126 | 62 | Show/hide |
Query: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
G ++NS G VA+N KAA+DL G G A+F V+KYGAKA+GK+D+AQAFMT WI ACR T GPAKFLIP+GTFLVGPV FAGPC+S PITIEIQGTVKA
Subjt: GRVSNSDGNVAVNDVKAAIDLNGR-KGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKA
Query: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
TTDISEYSSP+W SIE ITGLILTGSGVFDGQGASA
Subjt: TTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------
Query: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
IGTGDDCVSIG CEKITVTN+TCGP HGIS+GSLG Y EKSV DVLVQNCTIFNATNGARIKTWA T+SGSA GIIFD+
Subjt: -----------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDD
Query: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
IVM VK IIIDQTYGTKK KASKWKIS+V FKNIRGTS TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG +LKNTTIVSSCLNAK+ G + C +
Subjt: IVMYNVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| A0A6J1JX85 exopolygalacturonase-like | 1.5e-125 | 61.87 | Show/hide |
Query: SNSDGNVAVNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDI
+N G+VA+N KAA+ L G G A+F V+KYGAKA+GK+D+AQAFMT WI ACR T GPAKFLIP+G FLVGPVTFAGPCKS+PITIEIQGTVKATTDI
Subjt: SNSDGNVAVNDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDI
Query: SEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA--------------------------------------------------------------------
SEYSSP+W SIE ITGLILTGSGVFDGQGASA
Subjt: SEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA--------------------------------------------------------------------
Query: -------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMY
IGTGDDCVSIG CEKITVTN+TCGP HGIS+GSLG Y EKSV DVLVQNCTIFNATNGARIKTWA T+SGSA GI+FD+IVM
Subjt: -------------CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMY
Query: NVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
VK IIIDQTYGTK+ KASKWKISDVHFKNIRGTS TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG +LKNTT VSSCLNAK+ G + C +
Subjt: NVKYSIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P24548 Exopolygalacturonase (Fragment) | 3.0e-54 | 37.88 | Show/hide |
Query: DNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASACV------
D+ QA TAW EAC + P+ L+P+G F VG +T GPCKS I +++QGT+KA D S+ W ++ I L + G GVFDGQG SA V
Subjt: DNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQGASACV------
Query: ----------------------------------------------------------------------------IGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITC
I TGDDC+S+G G + I +TNITC
Subjt: ----------------------------------------------------------------------------IGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITC
Query: GPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGT
GP HGISVGSLG Y E+SV + V+NCTI + NG RIKTW + G A+ + F DI M +V I+IDQ Y S K+S + FKNI+GT
Subjt: GPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGT
Query: SVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
S T AV L CS FPC GVEL DI+LTY G K S C N K I G ++ A+C
Subjt: SVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
|
|
| P35339 Exopolygalacturonase | 1.1e-53 | 35.97 | Show/hide |
Query: NDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSS-PEW
ND KA+ G F + K GA +GKTD+ +A AW AC T G LIP+G FLVGP+ F GPCK +TI++ G + ATTD+S+Y W
Subjt: NDVKAAIDLNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSS-PEW
Query: FSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------------------
I + L++TG G DGQG +
Subjt: FSIEYITGLILTGSGVFDGQGASA----------------------------------------------------------------------------
Query: -----CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSG-SATGIIFDDIVMYNVKYSII
VIG GDDC+SIG G K+ +T +TCGP HGIS+GSLG Y EK V D+ V++CT+ NG RIK + S +A+ I +++I M + Y II
Subjt: -----CVIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSG-SATGIIFDDIVMYNVKYSII
Query: IDQTYGTKK----NKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCC
ID Y K N ASK + DV FKNI GTS T AV L C+A PC GV + D+N+ Y G N K + C NAK + GC L L C
Subjt: IDQTYGTKK----NKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCC
|
|
| P49062 Exopolygalacturonase clone GBGE184 | 7.5e-58 | 36.57 | Show/hide |
Query: LNGRKGGA-------IFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFS
L GR+G A ++ + K+GA DG T+ +AF+ WI+ C V PA L+P+GTFL GPV FAGPCKS +T+ + GT+ ATT S Y++PEWF
Subjt: LNGRKGGA-------IFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFS
Query: IEYITGLILTGSGVFDGQG-----ASAC------------------------------------------------------------------------
E + L+LTG+G F G+G A C
Subjt: IEYITGLILTGSGVFDGQG-----ASAC------------------------------------------------------------------------
Query: ----VIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQ
I TGDDCVS+G+G +TV + CGP HG+SVGSLG Y E+ V + V NCT+ NG RIKTW G+ A I F++I+M +VK IIIDQ
Subjt: ----VIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQ
Query: TYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTY----GGNNLKNT--TIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCC
YG++ S+ ISD+ FKNIRGT++T V + CS PC+GV + D+NL Y GG ++ + + C NA + I G KL+ C
Subjt: TYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTY----GGNNLKNT--TIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCC
|
|
| Q39766 Polygalacturonase | 9.2e-56 | 36.39 | Show/hide |
Query: VRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQ
V K+GAKADGKTD ++ F+ AW EAC +V P+ +IP+GT+L+ V GPCK+ PI I +QGT++A D S + P W + + G G+FDGQ
Subjt: VRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQ
Query: GA---------------------------------------------------------------------------------SACVIGTGDDCVSIGQG
G+ A I TGDDC+SIG G
Subjt: GA---------------------------------------------------------------------------------SACVIGTGDDCVSIGQG
Query: CEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----GTKKNKASKWKI
+ + + ITCGP HGIS+GSLG + E+ V + + NCTI N +NGARIKTW G G+ + I F+DI M NV I+IDQ Y KKN+ SK K+
Subjt: CEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----GTKKNKASKWKI
Query: SDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCC
S++ FKNIRGTS A+ CS PC+ VEL DI++ + G S CLN K +G KL + C
Subjt: SDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCC
|
|
| Q39786 Polygalacturonase | 5.4e-56 | 36.59 | Show/hide |
Query: VRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQ
V K+GAKADGKTD ++ F+ AW EAC +V P+ +IP+GT+L+ V GPCK+ PI I +QGT++A D S + P W + + G G+FDGQ
Subjt: VRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDGQ
Query: GA---------------------------------------------------------------------------------SACVIGTGDDCVSIGQG
G+ A I TGDDC+SIG G
Subjt: GA---------------------------------------------------------------------------------SACVIGTGDDCVSIGQG
Query: CEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----GTKKNKASKWKI
+ + + ITCGP HGIS+GSLG + E+ V + + NCTI N +NGARIKTW G G+ + I F+DI M NV I+IDQ Y KKN+ SK K+
Subjt: CEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----GTKKNKASKWKI
Query: SDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAK
S++ FKNIRGTS A+ CS PC+ VEL DI++ + G S CLN K
Subjt: SDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G02790.1 polygalacturonase 4 | 5.3e-59 | 36.57 | Show/hide |
Query: LNGRKGGA-------IFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFS
L GR+G A ++ + K+GA DG T+ +AF+ WI+ C V PA L+P+GTFL GPV FAGPCKS +T+ + GT+ ATT S Y++PEWF
Subjt: LNGRKGGA-------IFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFS
Query: IEYITGLILTGSGVFDGQG-----ASAC------------------------------------------------------------------------
E + L+LTG+G F G+G A C
Subjt: IEYITGLILTGSGVFDGQG-----ASAC------------------------------------------------------------------------
Query: ----VIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQ
I TGDDCVS+G+G +TV + CGP HG+SVGSLG Y E+ V + V NCT+ NG RIKTW G+ A I F++I+M +VK IIIDQ
Subjt: ----VIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQ
Query: TYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTY----GGNNLKNT--TIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCC
YG++ S+ ISD+ FKNIRGT++T V + CS PC+GV + D+NL Y GG ++ + + C NA + I G KL+ C
Subjt: TYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTY----GGNNLKNT--TIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCC
|
|
| AT2G33160.1 glycoside hydrolase family 28 protein / polygalacturonase (pectinase) family protein | 1.5e-48 | 33.86 | Show/hide |
Query: IFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVF
IF VR YGA+AD + DNA AF AW EAC+ + G + IP G F + VTF+GPCKS IT I+GT+ A + + EW +Y+ L +TG G+
Subjt: IFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPEWFSIEYITGLILTGSGVF
Query: DGQGASA---------------------------------------------------------------------------------CVIGTGDDCVSI
DGQG+ + IGTGDDC++I
Subjt: DGQGASA---------------------------------------------------------------------------------CVIGTGDDCVSI
Query: GQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSG-SATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY------GTKKNK
G + ++++ CGP HGISVGSLG Y +EK+V + V+N I T+G RIKTWA +VS S + ++++I M NV I+IDQ Y +
Subjt: GQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSG-SATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY------GTKKNK
Query: ASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
AS +I DV + NI GTS + A+ ++CS FPC+ VEL +INL Y G ++ + + C N +I G + A C I
Subjt: ASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALCCI
|
|
| AT3G07850.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 1.1e-51 | 35.16 | Show/hide |
Query: LNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPE--WFSIEYIT
++G K GA V+ GAK D KTD++ AF AW EAC + +P+G ++V + F GPCK P+T+E+ G KA + + + P W E I
Subjt: LNGRKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPE--WFSIEYIT
Query: GLILTGS-GVFDGQGASA---------------------------------------------------------------------------------C
L G+ +FDGQG+ A
Subjt: GLILTGS-GVFDGQGASA---------------------------------------------------------------------------------C
Query: VIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY--
I TGDDCVSIG G E + V N+ CGP HGIS+GSLG YP E+ V V V+ C I N NG RIKTW G+ G A+ I+F+DI M NV ++IDQ Y
Subjt: VIGTGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY--
Query: --GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
K S+ K+SDV K I+GTS T VAV L CS PC + L DINL + G K VS+C N K + G + A C
Subjt: --GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
|
|
| AT3G14040.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 3.4e-53 | 35.96 | Show/hide |
Query: RKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPE--WFSIEYITGLI
+ GGA V+ GAK DGKTD++ AF AW EAC + +P+G +LV + F GPCK P+T+E+ G KA + + + P W E +
Subjt: RKGGAIFYVRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEYSSPE--WFSIEYITGLI
Query: LTGS-GVFDGQGASA---------------------------------------------------------------------------------CVIG
L G+ +FDGQG+ A I
Subjt: LTGS-GVFDGQGASA---------------------------------------------------------------------------------CVIG
Query: TGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----G
TGDDCVSIG G E + V N+ CGP HGIS+GSLG YP E+ V V V+ C I N NG RIKTW G+ G A+ I+F+DI M NV ++IDQ Y
Subjt: TGDDCVSIGQGCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVSGSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----G
Query: TKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
K SK K+SDV KNI+GTS T VAV L CS PC + L DINL + G K VS+C N K + G + A C
Subjt: TKKNKASKWKISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
|
|
| AT4G18180.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 3.2e-56 | 36.84 | Show/hide |
Query: VRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEY-SSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDG
VR +GA+A+ D+ +AF+ AW +AC+ + +IPRG F VG + F+GPC ++ + VKA+TD+S+Y S W +I GL LTG G FDG
Subjt: VRKYGAKADGKTDNAQAFMTAWIEACRKTVGPAKFLIPRGTFLVGPVTFAGPCKSLPITIEIQGTVKATTDISEY-SSPEWFSIEYITGLILTGSGVFDG
Query: QGASA-----CV----------------------------------------------------------------------------IGTGDDCVSIGQ
QGA A C I TGDDCVSIGQ
Subjt: QGASA-----CV----------------------------------------------------------------------------IGTGDDCVSIGQ
Query: GCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVS-GSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----GTKKNKASKW
G +IT+T+I CGP HGISVGSLG YP EK V ++V++C I TNG RIKTWA + +AT + F++I+M NV IIIDQ+Y N SK
Subjt: GCEKITVTNITCGPRHGISVGSLGNYPKEKSVFDVLVQNCTIFNATNGARIKTWAGTVS-GSATGIIFDDIVMYNVKYSIIIDQTY----GTKKNKASKW
Query: KISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINL----TYGG----NNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
++S+++FKNIRGTS + VAV L CS PCK V L +++L + GG +N N + SSC N + N +G ++ C
Subjt: KISDVHFKNIRGTSVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINL----TYGG----NNLKNTTIVSSCLNAKLNIMGCKLAALC
|
|
