; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg009306 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg009306
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionNAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic
Genome locationscaffold32:69498..75353
RNA-Seq ExpressionSpg009306
SyntenySpg009306
Gene Ontology termsGO:0042773 - ATP synthesis coupled electron transport (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001750 - NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, membrane subunit
IPR018393 - NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QIT04096.1 NADH dehydrogenase subunit F [Luffa aegyptiaca]1.1e-8674.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

QKX48522.1 NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 5 [Luffa acutangula]1.1e-8674.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

YP_009752047.1 NADH dehydrogenase subunit F [Cionosicys macranthus]1.1e-8674.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

YP_009752712.1 NADH dehydrogenase subunit F [Ampelosycios humblotii]1.1e-8674.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

YP_009752966.1 NADH dehydrogenase subunit F [Momordica sessilifolia]1.1e-8674.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6H0ERV9 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic5.5e-8774.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

A0A6H0ESJ2 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic5.5e-8774.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

A0A6H0ETA8 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic5.5e-8774.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

A0A6H0EUP7 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic5.5e-8774.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

A0A7D4XNN8 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic5.5e-8774.12Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0Z4S2 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic5.5e-8469.14Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR------------------------------------------------------AVAKSAQF
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRP AA ACQKAFVTNR                                                      AVAKSAQF
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR------------------------------------------------------AVAKSAQF

Query:  PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALF
        PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF++ PYIMNLI+LIGIITVL GATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALG+GSYRAALF
Subjt:  PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALF

Query:  HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMES+VGYSPDKSQNMVLMGGL KHVPITK AFL+
Subjt:  HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

B0Z506 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic5.5e-8469.14Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR------------------------------------------------------AVAKSAQF
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRP AA ACQKAFVTNR                                                      AVAKSAQF
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR------------------------------------------------------AVAKSAQF

Query:  PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALF
        PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF++ PYIMNLI+LIGIITVL GATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALG+GSYRAALF
Subjt:  PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALF

Query:  HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMES+VGYSPDKSQNMVLMGGL KHVPITK AFL+
Subjt:  HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

Q0ZIX1 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic1.1e-8469.26Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-------------------------------------------------------AVAKSAQ
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRP AANACQKAFVTNR                                                       AVAKSAQ
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-------------------------------------------------------AVAKSAQ

Query:  FPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAAL
        FPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARL PLFIVIPYIMNLI+LIGIIT+L GATLALAQKDIK+SLAYSTMSQLGY MLALG+GSYRAAL
Subjt:  FPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAAL

Query:  FHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        FHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSME++VGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKN FLL
Subjt:  FHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

Q2QD43 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic2.8e-8872.94Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRPTAANACQKAFVTNR                                                     AVAKSAQFP
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR-----------------------------------------------------AVAKSAQFP

Query:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH
        LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFI IPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALG+GSY+AALFH
Subjt:  LHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFH

Query:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
Subjt:  LITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

Q9MTI4 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic5.5e-8469.14Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR------------------------------------------------------AVAKSAQF
        +I+  + ++ M S  L GFWFTRP AA ACQKAFVTNR                                                      AVAKSAQF
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR------------------------------------------------------AVAKSAQF

Query:  PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALF
        PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF++ PYIMNLI+LIGIITVL GATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALG+GSYRAALF
Subjt:  PLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALF

Query:  HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMES+VGYSPDKSQNMVLMGGL KHVPITK AFL+
Subjt:  HLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00890.1 NADH-Ubiquinone/plastoquinone (complex I) protein2.5e-0728.89Show/hide
Query:  FVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEG-PTPISALIHAATMVAAGIFLVARL-LPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGY
        F+T     K +  P H W PD  EG PTP+ A +   + VAA         +P +        L+ ++ I++++FG  +A+ Q  +KR LAYS++ Q+GY
Subjt:  FVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEG-PTPISALIHAATMVAAGIFLVARL-LPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGY

Query:  MMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSII
        +++ + +G        +IT+      + LG+ + I
Subjt:  MMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSII

ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein1.9e-7691.41Show/hide
Query:  VAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIG
        +AKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIP IM +I+LIGIITVL GATLALAQKDIKR LAYSTMSQLGYMMLALG+G
Subjt:  VAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIG

Query:  SYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
        SYR+ALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSME++VGYSPDKSQNM+LMGGLTKHVPITK AFL+
Subjt:  SYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL

ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein5.5e-0760.53Show/hide
Query:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR
        +++  + ++ M S  L GFWFTRP AANACQKAFVTNR
Subjt:  KIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNR

ATMG00060.1 NADH dehydrogenase subunit 5C1.3e-3543.12Show/hide
Query:  GMAIPIPKIFTTFSILSMASL-----ALPGFWFTRPTAANACQK--AFVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF
        G+A+ I   FT F  +  +++     A    W +     NA       +   AV KSAQ   H W PDAMEGPTP+SA IHAATMV AG+F++AR  PLF
Subjt:  GMAIPIPKIFTTFSILSMASL-----ALPGFWFTRPTAANACQK--AFVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF

Query:  IVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLM
           P  + +I   G  T    AT  + Q D+KR +AYST SQLGYM+ A GI +Y  ++FHL+ HA+ KALLFL +GS+IH+M           Q+M  M
Subjt:  IVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLM

Query:  GGLTKHVPITKNAFLLES
        GGL    P+T    L+ S
Subjt:  GGLTKHVPITKNAFLLES

ATMG00513.1 NADH dehydrogenase 5A1.3e-3543.12Show/hide
Query:  GMAIPIPKIFTTFSILSMASL-----ALPGFWFTRPTAANACQK--AFVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF
        G+A+ I   FT F  +  +++     A    W +     NA       +   AV KSAQ   H W PDAMEGPTP+SA IHAATMV AG+F++AR  PLF
Subjt:  GMAIPIPKIFTTFSILSMASL-----ALPGFWFTRPTAANACQK--AFVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF

Query:  IVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLM
           P  + +I   G  T    AT  + Q D+KR +AYST SQLGYM+ A GI +Y  ++FHL+ HA+ KALLFL +GS+IH+M           Q+M  M
Subjt:  IVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLM

Query:  GGLTKHVPITKNAFLLES
        GGL    P+T    L+ S
Subjt:  GGLTKHVPITKNAFLLES

ATMG00665.1 NADH dehydrogenase 5B1.3e-3543.12Show/hide
Query:  GMAIPIPKIFTTFSILSMASL-----ALPGFWFTRPTAANACQK--AFVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF
        G+A+ I   FT F  +  +++     A    W +     NA       +   AV KSAQ   H W PDAMEGPTP+SA IHAATMV AG+F++AR  PLF
Subjt:  GMAIPIPKIFTTFSILSMASL-----ALPGFWFTRPTAANACQK--AFVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLF

Query:  IVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLM
           P  + +I   G  T    AT  + Q D+KR +AYST SQLGYM+ A GI +Y  ++FHL+ HA+ KALLFL +GS+IH+M           Q+M  M
Subjt:  IVIPYIMNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLM

Query:  GGLTKHVPITKNAFLLES
        GGL    P+T    L+ S
Subjt:  GGLTKHVPITKNAFLLES


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGATCACTTCGGAACTCGATGAAATGGGCGGAATGGCTATCCCAATTCCAAAAATATTCACGACTTTCAGTATCTTATCGATGGCTTCCCTTGCATTGCCGGGTTT
TTGGTTCACTCGACCTACTGCGGCGAATGCTTGTCAAAAGGCATTTGTAACTAATCGTGCGGTTGCTAAATCTGCTCAATTTCCTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTA
TGGAGGGTCCTACCCCGATTTCAGCTCTTATACATGCTGCTACGATGGTAGCTGCGGGAATTTTTCTTGTCGCTCGGCTTCTTCCGCTTTTTATAGTAATACCTTACATC
ATGAATCTAATAGCTTTGATAGGTATAATAACAGTACTATTTGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGATATTAAGAGAAGTTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATT
GGGTTATATGATGTTAGCTTTGGGTATAGGGTCTTATCGGGCTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCAAAAGCGTTGTTGTTTTTAGGATCTGGGTCCATTA
TTCACTCAATGGAATCCGTTGTTGGATATTCTCCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAACAAAGCATGTGCCAATTACAAAAAATGCTTTTTTATTA
GAATCTCCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGATCACTTCGGAACTCGATGAAATGGGCGGAATGGCTATCCCAATTCCAAAAATATTCACGACTTTCAGTATCTTATCGATGGCTTCCCTTGCATTGCCGGGTTT
TTGGTTCACTCGACCTACTGCGGCGAATGCTTGTCAAAAGGCATTTGTAACTAATCGTGCGGTTGCTAAATCTGCTCAATTTCCTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTA
TGGAGGGTCCTACCCCGATTTCAGCTCTTATACATGCTGCTACGATGGTAGCTGCGGGAATTTTTCTTGTCGCTCGGCTTCTTCCGCTTTTTATAGTAATACCTTACATC
ATGAATCTAATAGCTTTGATAGGTATAATAACAGTACTATTTGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGATATTAAGAGAAGTTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATT
GGGTTATATGATGTTAGCTTTGGGTATAGGGTCTTATCGGGCTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCAAAAGCGTTGTTGTTTTTAGGATCTGGGTCCATTA
TTCACTCAATGGAATCCGTTGTTGGATATTCTCCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAACAAAGCATGTGCCAATTACAAAAAATGCTTTTTTATTA
GAATCTCCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRITSELDEMGGMAIPIPKIFTTFSILSMASLALPGFWFTRPTAANACQKAFVTNRAVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYI
MNLIALIGIITVLFGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGIGSYRAALFHLITHAYSKALLFLGSGSIIHSMESVVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKNAFLL
ESP