CuGenDBv2

Gene ID	Spg009407
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Photosystem II CP47 reaction center protein
Genome location	scaffold166:8574..10094
RNA-Seq Expression	Spg009407
Synteny	Spg009407
Gene Ontology terms	GO:0009772 - photosynthetic electron transport in photosystem II (biological process) GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process) GO:0009523 - photosystem II (cellular component) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function) GO:0045156 - electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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X2F2N4 Photosystem II CP47 reaction center protein

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100

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SwissProt top hits

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Q2MIG2 Photosystem II CP47 reaction center protein

2.6e-307

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Q2QD63 Photosystem II CP47 reaction center protein

1.5e-307

99.21

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        PTTKRV
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Q33C06 Photosystem II CP47 reaction center protein

2.6e-307

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        PTTKR
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Q3C1K3 Photosystem II CP47 reaction center protein

2.6e-307

98.81

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Q7FNS4 Photosystem II CP47 reaction center protein

2.6e-307

98.81

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        PTTKR
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

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ATCG00280.1 photosystem II reaction center protein C

1.6e-22

22.61

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        G  W+  +  ++N  G+LL  H+ H  L+  WAG+M L+E+A F P      PM+ QG+ ++P +  L       GW +  GG + +   +   GV   H
Subjt:  GLPWYRVHTVVLNDPGRLLSVHIMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLDPMWRQGMFVIPFMTRLGITNSWGGWSI-TGGTITNPGIWSYEGVAGAH

Query:  IVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDER------TGKPSLDLPKIFGIHLFLSGLGCF--GFGAFHVTGLY---GPGIWVSDPYGLTGRVQAVNPAWGVEG
        ++ S +     I+H +     +  +E         K    +  I GIHL L G+G F   F A +  G+Y    PG    D   +T    + +  +G   
Subjt:  IVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDER------TGKPSLDLPKIFGIHLFLSGLGCF--GFGAFHVTGLY---GPGIWVSDPYGLTGRVQAVNPAWGVEG

Query:  FDPFVPGG----------IASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGY
          PF   G          I   H+  G++ I  G++H+  +P     + L + + E  LS S+AA+    F+    +W+ +   P E +GPT  +  Q  
Subjt:  FDPFVPGG----------IASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGY

Query:  FQQEIYRRVSAGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPVFRDKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIVRA
               +    L  +Q L               Y+  +P    +F   +M   D +   WL     R   G +L                      ++ 
Subjt:  FQQEIYRRVSAGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPVFRDKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIVRA

Query:  DV-PFRRAESKYSVEQVGVTVEFYGGELNGVSYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFRDV
        D+ P++   S                              +Y   A LG +  +     + + V   SPR W +  H       F GH+WH  R   R  
Subjt:  DV-PFRRAESKYSVEQVGVTVEFYGGELNGVSYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFRDV

Query:  FAGIDPDLDAQVE
         AG +  +D   E
Subjt:  FAGIDPDLDAQVE

ATCG00680.1 photosystem II reaction center protein B

7.7e-307

98.22

Show/hide

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Query:  IVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDERTGKPSLDLPKIFGIHLFLSGLGCFGFGAFHVTGLYGPGIWVSDPYGLTGRVQAVNPAWGVEGFDPFVPGGIAS
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        PTTKR
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GVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFRDVFAGIDPDLDAQVEFGAFQKLGDPTTKRV

Spg009407 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome