| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7031855.1 putative RNA-binding protein ARP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 5.9e-78 | 62.55 | Show/hide |
Query: LFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASATPPQ
+FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFG+ILEAVII+DKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARR SRSASATPPQ
Subjt: LFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASATPPQ
Query: GPQPGKSLMKLVNSLLDNGILDRTAVGRERRQQEHRETTCSGTTRRGLIRRRFTISLIRPSLSMDTP-QAPP----TLQPISVTTTIKYVTFGETGLHE-
GPQPG NG RT H + C T P+ P QA P + P + T I Y E G++E
Subjt: GPQPGKSLMKLVNSLLDNGILDRTAVGRERRQQEHRETTCSGTTRRGLIRRRFTISLIRPSLSMDTP-QAPP----TLQPISVTTTIKYVTFGETGLHE-
Query: RALHADVSGTGYGRGEHIDANVPAVSLPSITRDGDAGPHIPSQSHGGGPFRGGPTHFHYVQTGLRWSQPRSVLVS
RAL AD+SG G+G GEHIDA+VP VSLPSIT DGDAG HIP++S GG GG THFHYV+T +RW QPRSV S
Subjt: RALHADVSGTGYGRGEHIDANVPAVSLPSITRDGDAGPHIPSQSHGGGPFRGGPTHFHYVQTGLRWSQPRSVLVS
|
|
| XP_022941687.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 [Cucurbita moschata] | 2.5e-52 | 94.78 | Show/hide |
Query: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
M +NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Subjt: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Query: ASATPPQGPQ-PGKS
ASATPPQ PQ PG +
Subjt: ASATPPQGPQ-PGKS
|
|
| XP_022992897.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 [Cucurbita maxima] | 2.5e-52 | 94.78 | Show/hide |
Query: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
M +NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Subjt: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Query: ASATPPQGPQ-PGKS
ASATPPQ PQ PG +
Subjt: ASATPPQGPQ-PGKS
|
|
| XP_038891949.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 [Benincasa hispida] | 2.5e-52 | 91.13 | Show/hide |
Query: MTMMS-------NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLAS
MTMMS NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLAS
Subjt: MTMMS-------NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLAS
Query: LGARR-GSRSASATPPQGPQPGKS
LGARR GSRSASATPPQ PQPG +
Subjt: LGARR-GSRSASATPPQGPQPGKS
|
|
| XP_038891950.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 [Benincasa hispida] | 2.5e-52 | 91.13 | Show/hide |
Query: MTMMS-------NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLAS
MTMMS NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLAS
Subjt: MTMMS-------NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLAS
Query: LGARR-GSRSASATPPQGPQPGKS
LGARR GSRSASATPPQ PQPG +
Subjt: LGARR-GSRSASATPPQGPQPGKS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3BD62 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 | 2.3e-51 | 89.43 | Show/hide |
Query: MTMM------SNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
MTMM + NAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF+KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Subjt: MTMM------SNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Query: GARR-GSRSASATPPQGPQPGKS
GARR GSRSASATPPQ PQPG +
Subjt: GARR-GSRSASATPPQGPQPGKS
|
|
| A0A5A7SY01 Putative RNA-binding protein ARP1 isoform X1 | 2.3e-51 | 89.43 | Show/hide |
Query: MTMM------SNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
MTMM + NAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF+KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Subjt: MTMM------SNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Query: GARR-GSRSASATPPQGPQPGKS
GARR GSRSASATPPQ PQPG +
Subjt: GARR-GSRSASATPPQGPQPGKS
|
|
| A0A6J1FN68 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 | 1.2e-52 | 94.78 | Show/hide |
Query: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
M +NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Subjt: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Query: ASATPPQGPQ-PGKS
ASATPPQ PQ PG +
Subjt: ASATPPQGPQ-PGKS
|
|
| A0A6J1FUE8 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 | 2.3e-51 | 48.61 | Show/hide |
Query: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
M +NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Subjt: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Query: ASATPPQGPQ-PGKSLMKLVNSLLDNGILDRTAVGRERRQQEHRETTCSGTTRRGLIRRRFTISLIRPSLSMDTPQAPP----TLQPISVTTTIKY-VTF
ASATPPQ PQ PG NG RT + SG ++ + S QA P + P + T I Y
Subjt: ASATPPQGPQ-PGKSLMKLVNSLLDNGILDRTAVGRERRQQEHRETTCSGTTRRGLIRRRFTISLIRPSLSMDTPQAPP----TLQPISVTTTIKY-VTF
Query: GETGLHERALHADVSGTGYGRGEHIDANVPAVSLPSITRDGDAGPHIPSQSHGGGPFRGGPTHFHYVQTGLRWSQPRSVLVSSPTANWPPWVPRGQLDPP
G H R ++ + G AN P + QSH G P H + + P S ++S P + P G++
Subjt: GETGLHERALHADVSGTGYGRGEHIDANVPAVSLPSITRDGDAGPHIPSQSHGGGPFRGGPTHFHYVQTGLRWSQPRSVLVSSPTANWPPWVPRGQLDPP
Query: VVQLEEDAEDDDD-DGKRRAEKN
+Q +E+ EDDDD DGKRRA+KN
Subjt: VVQLEEDAEDDDD-DGKRRAEKN
|
|
| A0A6J1JR76 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 | 1.2e-52 | 94.78 | Show/hide |
Query: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
M +NNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Subjt: MMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRS
Query: ASATPPQGPQ-PGKS
ASATPPQ PQ PG +
Subjt: ASATPPQGPQ-PGKS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q5ZJX4 RNA-binding protein 38 | 4.8e-22 | 57.65 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
DTT TK+FVGGL + T ++R +FE FG+I EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
|
|
| Q6GQD3 RNA-binding protein 24-A | 6.3e-22 | 57.65 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
DTT TK+FVGGL + T ++R +FE FG+I EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
|
|
| Q76LC6 RNA-binding protein 24 | 3.7e-22 | 58.82 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
DTT TK+FVGGL + T ++R +FE FGEI EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT D +A +AC+D PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
|
|
| Q9BX46 RNA-binding protein 24 | 3.7e-22 | 58.82 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
DTT TK+FVGGL + T ++R +FE FGEI EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
|
|
| Q9M1S3 Probable RNA-binding protein ARP1 | 3.3e-39 | 71.93 | Show/hide |
Query: MTMMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGS
MT +N G FGDT LTKVFVGGLAW+T KEAM DHF K+G+ILEAVIISDKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACEDS PIINGRRANCNLASLG R
Subjt: MTMMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGS
Query: RSASATPPQGPQPG
+P QGP+ G
Subjt: RSASATPPQGPQPG
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G22910.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.9e-35 | 60 | Show/hide |
Query: MSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA
M+ GL GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG + RS
Subjt: MSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA
Query: SATPPQGPQPGKSLMKLVNSLLDNG
+TP G + M+++ S + G
Subjt: SATPPQGPQPGKSLMKLVNSLLDNG
|
|
| AT1G22910.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.9e-35 | 60 | Show/hide |
Query: MSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA
M+ GL GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG + RS
Subjt: MSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA
Query: SATPPQGPQPGKSLMKLVNSLLDNG
+TP G + M+++ S + G
Subjt: SATPPQGPQPGKSLMKLVNSLLDNG
|
|
| AT1G22910.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.9e-35 | 60 | Show/hide |
Query: MSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA
M+ GL GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG + RS
Subjt: MSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA
Query: SATPPQGPQPGKSLMKLVNSLLDNG
+TP G + M+++ S + G
Subjt: SATPPQGPQPGKSLMKLVNSLLDNG
|
|
| AT1G76460.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.6e-34 | 75 | Show/hide |
Query: FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARR
FGDTT TKVFVGGLAWET E +R HFE++GEILEAV+I+DK TGRSKGYGFVTF+D E+A++AC D PII+GRRANCNLASLG R
Subjt: FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARR
|
|
| AT3G54770.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-40 | 71.93 | Show/hide |
Query: MTMMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGS
MT +N G FGDT LTKVFVGGLAW+T KEAM DHF K+G+ILEAVIISDKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACEDS PIINGRRANCNLASLG R
Subjt: MTMMSNNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGS
Query: RSASATPPQGPQPG
+P QGP+ G
Subjt: RSASATPPQGPQPG
|
|
