; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg009871 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg009871
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionelongator complex protein 6
Genome locationscaffold7:7777410..7779977
RNA-Seq ExpressionSpg009871
SyntenySpg009871
Gene Ontology termsGO:0002098 - tRNA wobble uridine modification (biological process)
GO:0050789 - regulation of biological process (biological process)
GO:0033588 - Elongator holoenzyme complex (cellular component)
InterPro domainsIPR018627 - Elongator complex protein 6
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031849.1 Elongator complex protein 6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.1e-13487.06Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        M RMTSNLLDEA+G+DD T  SPL+GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSF HYDRVLRKL         GCNLAAQRDS R
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        FFF DMLT+GCSGEKTS        FLLPD SGKET EGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK HVTIVIDDI LLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        SIIAL+HEDVY+DIERPLILQMEYLAD+LIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQ+NLRNRVHNF FYIKENGTEFFYSGSRA
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

XP_022139240.1 elongator complex protein 6 [Momordica charantia]1.9e-12683.16Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        MDRM SN+LDEALGLDDP KPSPLIGRLLLVEDCVETSGAF+LHHLLKR+ SSP SSNAVIF+AFSQ FAHYDRVLRKL         GCNL AQRDSGR
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        F FFDMLTLGCS                 D SGKET EGVLVGLYCKIQRAV+ALIQ+NKKHVTIVIDDI LLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSR
        S+IALNHEDVYMD ERP ILQMEYLAD+LIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRV NF FYIKENGTEFFYSGSR
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSR

XP_022957322.1 elongator complex protein 6 isoform X1 [Cucurbita moschata]8.4e-12783.57Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        M RMTSNLLDEA+G+DD T  SPL+GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSF HYDRVLRKL         GCNLAAQRDS R
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        FFF DMLT+GCS                 D SGKET EGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK+HVTI+IDDI LLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        SIIAL+HEDVY+DIERPLILQMEYLA+ILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQ+NLRNRVHNF FYIKENGTEFFYSGSRA
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

XP_023533346.1 elongator complex protein 6 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-12884.27Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        M RMTSNLLDEA+GLDD T  SPL+GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIF+AFSQSF HYDRVLRKL         GCNLAAQRDS R
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        FFF DMLT+GCS                 D SGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK+HVTIVIDDI LLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        SIIAL+HEDVY+DIERPLILQMEYLAD+LIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQ+NLRNRVHNF FYIKENGTEFFYSGSRA
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

XP_038893352.1 elongator complex protein 6 [Benincasa hispida]6.2e-13084.27Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        M+RMTSNLLDEA+G DDPTKPSPLIGR+LLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIF+AFSQSF HYDRVLRKL         GCNLAAQRDSGR
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        F FFDMLTLGCS                 D SGKE+GEGVLVGLYCKIQRAV+ALIQENK+HVTI+IDDI LLEVAANGSS HVLDFLHYCHTLTSEIGC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        SIIALNHEDVY+DIERPLILQMEYLAD+LIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPV GLQD LRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGS+A
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KLF1 Uncharacterized protein6.5e-12582.87Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        MDRMTSNLLDEA+G DDPT   PLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSN VIF+AFSQSF HYDR+LRKL         GCNLAAQRDSGR
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        F FFDMLTLGCS                 D SGKETGEGVLVGLYCKIQRAV ALIQENKKHVTIVIDDI+LLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTL SE+GC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        SIIAL+HEDVYMDIERPL LQ+EYLAD+LIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPV GLQD LRNRV NF FYIKENGTEFFYSGSRA
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

A0A5A7SX52 Elongator complex protein 64.7e-12381.12Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        MDRM SNLLD A+G DDPT PSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSP+SSNAVIF+AFSQSF HYDR+LRKL         GCNLAAQRD+GR
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        F FFDMLTLGCS                 D SGKET EGVLVGLYCKIQRAV ALIQENKKHVTIVIDDI+LLEVAANGSSN VLDFLHYCHTL SE+GC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        SII+L+HEDVYMDI+RPL LQ+EYLAD+LIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPV GLQD LRNRV NF FYIKENGTEFFYSGSRA
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

A0A6J1CBS2 elongator complex protein 69.1e-12783.16Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        MDRM SN+LDEALGLDDP KPSPLIGRLLLVEDCVETSGAF+LHHLLKR+ SSP SSNAVIF+AFSQ FAHYDRVLRKL         GCNL AQRDSGR
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        F FFDMLTLGCS                 D SGKET EGVLVGLYCKIQRAV+ALIQ+NKKHVTIVIDDI LLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSR
        S+IALNHEDVYMD ERP ILQMEYLAD+LIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRV NF FYIKENGTEFFYSGSR
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSR

A0A6J1GYT6 elongator complex protein 6 isoform X14.1e-12783.57Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        M RMTSNLLDEA+G+DD T  SPL+GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSF HYDRVLRKL         GCNLAAQRDS R
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        FFF DMLT+GCS                 D SGKET EGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK+HVTI+IDDI LLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        SIIAL+HEDVY+DIERPLILQMEYLA+ILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQ+NLRNRVHNF FYIKENGTEFFYSGSRA
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

A0A6J1JAX8 elongator complex protein 6 isoform X21.5e-12683.22Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        M RMTSNLLDEA+GLDD T  SPL+GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIF+AFSQSF HY+RVLRKL         GCNLAAQRDS R
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC
        FFF DMLT+GCS                 D SGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK+HVTIVIDDI LLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIG 
Subjt:  FFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGC

Query:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        SIIAL+HEDVY+DIERPLILQMEYLAD+LIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGL++NLRNRVHNF FYIKENGTEFFYSGSRA
Subjt:  SIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B2RYG8 Elongator complex protein 61.5e-1430.22Show/hide
Query:  GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGRFFFFDMLTLGCSGEKTSV-LLDMIQ
        G+L L+ D  +T G+F++HH L        ++  V FVA  QSF+HY+ V +KL         G +L A R+ G+  F +       G K+SV +L   Q
Subjt:  GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGRFFFFDMLTLGCSGEKTSV-LLDMIQ

Query:  IFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK--KHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCH-TLTSEIGCSIIALNHEDVYMDIERPLIL-
            P    +E G G L  LY  IQ  +          K   +++D++++L ++    +  VLDF+ YC  T+  E+  +++AL H+    + E   IL 
Subjt:  IFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK--KHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCH-TLTSEIGCSIIALNHEDVYMDIERPLIL-

Query:  -QMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSG-SRA
          + + + ++++   LATG  KDVHGQL++L +         R R   + + I++    FF  G SRA
Subjt:  -QMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSG-SRA

Q0IHA2 Elongator complex protein 65.3e-1527.46Show/hide
Query:  LDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGRFFFFDML-
        L+  LG+   T  +  +G+  L+ D   T G+F++HH L        +   V FVA  QSF+HY+ V +KL         G NL++ +D G+  F + L 
Subjt:  LDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGRFFFFDML-

Query:  --TLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCH-TLTSEIGCSIIA
          T    G+K+         FL   S         L  LY  +  A++    +  K   +++DD+++L ++   +S  VLDF+HYC  T+ ++   +++ 
Subjt:  --TLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCH-TLTSEIGCSIIA

Query:  LNH-EDVYMDIERPLILQ-MEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
        L H  +   D E  L+L+ + + + ++++   L+TG  KDVHGQL ++   V   +   +N+   + + I++    FF  G  A
Subjt:  LNH-EDVYMDIERPLILQ-MEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

Q8BK75 Elongator complex protein 64.0e-1529.81Show/hide
Query:  GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGRFFFFDMLTLGCSGEKTSV-LLDMIQ
        G L L+ D  +T G+F++HH L        ++  V FVA  QSF+HY+ V +KL         G +L A RD G+  F +       G K+SV +L   Q
Subjt:  GRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGRFFFFDMLTLGCSGEKTSV-LLDMIQ

Query:  IFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK--KHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCH-TLTSEIGCSIIALNH--EDVYMDIERPLI
            P    +E G G L  LY  IQ  +     E    K+  +++D++++L ++    +  VLDF+ YC  T+  E+  +++AL H  E    +    L+
Subjt:  IFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENK--KHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCH-TLTSEIGCSIIALNH--EDVYMDIERPLI

Query:  LQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVL-NKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSG
          + + + ++++   LATG  KDVHGQL++L  +P        R +   + + I++    FF  G
Subjt:  LQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVL-NKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSG

Q8L9Y2 Elongator complex protein 63.2e-6849.31Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTK-PSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSG
        MDR + NLLD ALG D+    PSPL G+++L+EDCVETSG+FVLH L+KR  SS +SS+A+IF+AF++ F+HYDR+LRKL         GCNLA  + + 
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTK-PSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSG

Query:  RFFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGS-SNHVLDFLHYCHTLTSEI
        R  FFDML + CS                 D    E     +  L+ +IQ  V  L      ++T+++DD++LLE+A  GS S+HVLDFLHYCHTL+SE 
Subjt:  RFFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGS-SNHVLDFLHYCHTLTSEI

Query:  GCSIIALNHEDVYMDIERP-LILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGL-QDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
         CS++ LNHED+Y  +ERP  +LQM  LAD++IK  PLA+G+A DVHGQLTVLNK +    + + RN++ NF F IKENG ++FY G R+
Subjt:  GCSIIALNHEDVYMDIERP-LILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGL-QDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA

Q9GPT6 Elongator complex protein 62.4e-1525.97Show/hide
Query:  DPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNA----------------VIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR
        +P K  P  G+L+LV D +E+ G+F++H+ L+  F +  S+N+                   +  +QS  +Y  V RKL         G NL  + + G 
Subjt:  DPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNA----------------VIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGR

Query:  FFF-----------------------------FDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSS------GKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHV--
        F F                              D ++ G +   T  L+D   I     SS       K      L  +  KI    +  I ++KK V  
Subjt:  FFF-----------------------------FDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSS------GKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHV--

Query:  -------TIVIDDIALLE----VAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSE--IGCSIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVL
                 +ID + LLE       +GS+  +L+FL YCH    E    CS+I L H D   D +      ++Y +D+ I +  L +G +KD+ GQL  +
Subjt:  -------TIVIDDIALLE----VAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSE--IGCSIIALNHEDVYMDIERPLILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVL

Query:  NKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSR
         K     ++N   RV+  H+   +N   FF  GSR
Subjt:  NKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G10090.1 elongator protein 62.2e-6949.31Show/hide
Query:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTK-PSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSG
        MDR + NLLD ALG D+    PSPL G+++L+EDCVETSG+FVLH L+KR  SS +SS+A+IF+AF++ F+HYDR+LRKL         GCNLA  + + 
Subjt:  MDRMTSNLLDEALGLDDPTK-PSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSG

Query:  RFFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGS-SNHVLDFLHYCHTLTSEI
        R  FFDML + CS                 D    E     +  L+ +IQ  V  L      ++T+++DD++LLE+A  GS S+HVLDFLHYCHTL+SE 
Subjt:  RFFFFDMLTLGCSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGS-SNHVLDFLHYCHTLTSEI

Query:  GCSIIALNHEDVYMDIERP-LILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGL-QDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA
         CS++ LNHED+Y  +ERP  +LQM  LAD++IK  PLA+G+A DVHGQLTVLNK +    + + RN++ NF F IKENG ++FY G R+
Subjt:  GCSIIALNHEDVYMDIERP-LILQMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGL-QDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCGAATGACTTCGAATTTGCTTGACGAAGCTCTAGGTCTCGATGATCCGACCAAACCCTCGCCTCTGATCGGCCGTCTGTTGCTCGTCGAGGATTGCGTTGAAAC
AAGCGGTGCTTTTGTTCTTCACCACCTCCTCAAGCGCGCCTTTTCTTCTCCTCACTCTTCCAATGCCGTCATCTTCGTTGCATTCTCTCAGTCCTTCGCCCACTACGACC
GCGTGCTCCGGAAATTGGTAACTTCTCGCTCTCTCGCTGTTTCTGGGTGTAACTTAGCTGCTCAAAGGGACAGCGGTAGGTTCTTTTTCTTTGACATGCTTACGCTGGGC
TGTTCAGGTGAGAAAACCAGTGTCCTCCTTGATATGATACAAATTTTTCTGTTACCAGATAGTAGTGGAAAGGAAACTGGTGAAGGTGTTCTTGTTGGGCTGTACTGCAA
AATTCAGAGAGCTGTTAGTGCCTTAATTCAAGAGAACAAAAAGCATGTCACCATTGTGATAGATGATATAGCTCTTTTGGAGGTTGCTGCCAATGGCTCTTCAAATCATG
TCTTGGACTTCCTTCATTATTGCCACACTTTAACATCAGAAATTGGTTGTTCCATAATTGCACTTAATCACGAAGATGTGTACATGGACATTGAGAGGCCACTGATTCTA
CAGATGGAATACCTTGCTGATATTTTGATAAAAGTAGGACCACTAGCCACTGGTATAGCAAAGGACGTTCATGGACAGCTGACAGTTTTGAACAAACCAGTTGGAGGCCT
GCAAGACAACTTAAGAAACAGAGTGCATAATTTTCACTTTTACATCAAGGAAAATGGTACTGAGTTTTTTTATTCTGGAAGCAGAGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCGAATGACTTCGAATTTGCTTGACGAAGCTCTAGGTCTCGATGATCCGACCAAACCCTCGCCTCTGATCGGCCGTCTGTTGCTCGTCGAGGATTGCGTTGAAAC
AAGCGGTGCTTTTGTTCTTCACCACCTCCTCAAGCGCGCCTTTTCTTCTCCTCACTCTTCCAATGCCGTCATCTTCGTTGCATTCTCTCAGTCCTTCGCCCACTACGACC
GCGTGCTCCGGAAATTGGTAACTTCTCGCTCTCTCGCTGTTTCTGGGTGTAACTTAGCTGCTCAAAGGGACAGCGGTAGGTTCTTTTTCTTTGACATGCTTACGCTGGGC
TGTTCAGGTGAGAAAACCAGTGTCCTCCTTGATATGATACAAATTTTTCTGTTACCAGATAGTAGTGGAAAGGAAACTGGTGAAGGTGTTCTTGTTGGGCTGTACTGCAA
AATTCAGAGAGCTGTTAGTGCCTTAATTCAAGAGAACAAAAAGCATGTCACCATTGTGATAGATGATATAGCTCTTTTGGAGGTTGCTGCCAATGGCTCTTCAAATCATG
TCTTGGACTTCCTTCATTATTGCCACACTTTAACATCAGAAATTGGTTGTTCCATAATTGCACTTAATCACGAAGATGTGTACATGGACATTGAGAGGCCACTGATTCTA
CAGATGGAATACCTTGCTGATATTTTGATAAAAGTAGGACCACTAGCCACTGGTATAGCAAAGGACGTTCATGGACAGCTGACAGTTTTGAACAAACCAGTTGGAGGCCT
GCAAGACAACTTAAGAAACAGAGTGCATAATTTTCACTTTTACATCAAGGAAAATGGTACTGAGTTTTTTTATTCTGGAAGCAGAGCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDRMTSNLLDEALGLDDPTKPSPLIGRLLLVEDCVETSGAFVLHHLLKRAFSSPHSSNAVIFVAFSQSFAHYDRVLRKLVTSRSLAVSGCNLAAQRDSGRFFFFDMLTLG
CSGEKTSVLLDMIQIFLLPDSSGKETGEGVLVGLYCKIQRAVSALIQENKKHVTIVIDDIALLEVAANGSSNHVLDFLHYCHTLTSEIGCSIIALNHEDVYMDIERPLIL
QMEYLADILIKVGPLATGIAKDVHGQLTVLNKPVGGLQDNLRNRVHNFHFYIKENGTEFFYSGSRA