| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036008.1 Retrotransposon gag protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.6e-20 | 60.82 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EEENQC +ST+ R SAF+RLS+STSKK R STS FDRLK+T+DQ QR+M + + K F E + D K+ S VPSRMKRK V INTEGS ++
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| KAA0044978.1 retrotransposon gag protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.5e-20 | 61.86 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EEENQC ST+ R SAF+RLS+STSKK R STS FDRLK+T+DQ QR+M +L+ K F E + D K+ S VPSRMKRK V INTEGS ++
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| KAA0050734.1 gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.5e-20 | 61.86 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EEENQC ST+ R SAF+RLS+STSKK R STS FDRLK+T+DQ QR+M +L+ K F E + D K+ S VPSRMKRK V INTEGS ++
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| KAA0063719.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.5e-20 | 61.86 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EEENQC ST+ R S F+RLS+STSKK R STS FDRLK+T+DQ QR+M L+ K F E + D K+ S VPSRMKRK V INTEGS L+
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| TYK00108.1 retrotransposon gag protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.3e-20 | 60.82 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EE+NQC ST TR SAF+RLS+STSKK R STS FDR+K+ +DQ QR+M +L+ K F E + D K+ S VPSRMKRK FV INTEGS ++
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SZJ7 Retrotransposon gag protein | 2.7e-20 | 60.82 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EEENQC +ST+ R SAF+RLS+STSKK R STS FDRLK+T+DQ QR+M + + K F E + D K+ S VPSRMKRK V INTEGS ++
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| A0A5A7TQ06 Retrotransposon gag protein | 1.2e-20 | 61.86 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EEENQC ST+ R SAF+RLS+STSKK R STS FDRLK+T+DQ QR+M +L+ K F E + D K+ S VPSRMKRK V INTEGS ++
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| A0A5A7VDY3 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 4.6e-20 | 61.86 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EEENQC ST+ R S F+RLS+STSKK R STS FDRLK+T+DQ QR+M L+ K F E + D K+ S VPSRMKRK V INTEGS L+
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| A0A5D3BBF9 Gag protease polyprotein | 1.2e-20 | 61.86 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EEENQC ST+ R SAF+RLS+STSKK R STS FDRLK+T+DQ QR+M +L+ K F E + D K+ S VPSRMKRK V INTEGS ++
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
| A0A5D3BLW3 Retrotransposon gag protein | 3.5e-20 | 60.82 | Show/hide |
Query: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
+SMA EE+NQC ST TR SAF+RLS+STSKK R STS FDR+K+ +DQ QR+M +L+ K F E + D K+ S VPSRMKRK FV INTEGS ++
Subjt: MSMAAIEEENQCLVSTFTRPSAFQRLSVSTSKKSRSSTSVFDRLKVTDDQPQRKMDNLEVKLFDELSSDRKLQSIVPSRMKRKFFVLINTEGSCALR
|
|
