; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg011600 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg011600
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1
Genome locationscaffold1:2642610..2645971
RNA-Seq ExpressionSpg011600
SyntenySpg011600
Gene Ontology termsGO:0033615 - mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component)
InterPro domainsIPR010591 - ATP11


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7034627.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.8e-12389.3Show/hide
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XP_022925840.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Cucurbita moschata]1.5e-12490.53Show/hide
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XP_022978750.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Cucurbita maxima]2.6e-12490.12Show/hide
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XP_023544293.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.8e-12489.71Show/hide
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XP_038883536.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Benincasa hispida]4.7e-12691.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AZK5 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 14.0e-12389.71Show/hide
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A0A5A7UBA1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 12.0e-12289.3Show/hide
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        WLLETTQSFYLNDVRYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQAL+MPIL
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A0A6J1CLK5 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 16.8e-12389.43Show/hide
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        HLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRA+DCRYFV+PLWRGSGYT+MF+QV MPHIL TGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKD+VLIRGDIVFTSKLTD 
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        EAEWLLETTQSFYLNDVRYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEMPIL
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A0A6J1EJC6 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 17.3e-12590.53Show/hide
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        LRT+RT+AGSAK  L SASPAVRQ SRSYFANVS+EKLQKEAIPCDFLKWCS+GFFRTSRFA+GF PLQ KPLDSI+DMERAKDRSPEDLASIWDDYHLG
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        RGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCR+FV+PLWRGSGYT+MFVQVQMP+ILFTGLEDYKARGTQAAPYFTV+YYKEFAESKD+VLIRGDIVFTSKLTD EAE
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        WLLETTQSFYLND RYKLVERFN+QT +FEFKDVLQALEMPIL
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A0A6J1IR42 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 11.2e-12490.12Show/hide
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        RGHIGASMKAKLYHLLEQRA+DCR+FV+PLWRGSGYT+MFVQVQMP+IL TGLEDYKARGTQAAPYFTV+YYKEFAESKD+VLIRGDIVFTSKLTD EAE
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        WLLETTQSFYLND RYKLVE+FN+QTRDFEFKDVLQALEMPIL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P87127 Protein atp11, mitochondrial5.2e-1128.18Show/hide
Query:  LDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDYHLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRG-SGYTSMFVQVQMP-----HILFTGLEDYKARGTQAAPY
        L+  ID+E+ K+     +  +W   ++G   + A +  ++Y  +  RA    YFVLPL RG  G  S F+Q   P     H+L T L +YK +G+ AAP+
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Query:  FTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFY-------LNDVRYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEM
          + ++ +    K + L+R       KL+  + + L+   Q FY       L   R  L+  F++   DF+   V   ++M
Subjt:  FTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFY-------LNDVRYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEM

Q5TC12 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 16.3e-1730.6Show/hide
Query:  LLTSASPAV---RQPSRSYFANVSI-EKLQKEAIPCDFLKWCSLGFFRTSRFATGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDYHLGRGHIGASMK
        LL  + PA    R   RS F    +    Q + I C   K  +LG    +R   GFT  + K L SI ++E  K+++ E++  IW  Y   +  + A + 
Subjt:  LLTSASPAV---RQPSRSYFANVSI-EKLQKEAIPCDFLKWCSLGFFRTSRFATGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDYHLGRGHIGASMK

Query:  AKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSGYTSMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSF
        A+ + L+  RA  C  F+  L R  GY     Q     + FT L + + RG  AA    + +Y E  E K +VL+  ++  T  L   EA+ +    Q F
Subjt:  AKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSGYTSMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSF

Query:  YLNDVR--YKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALE
        Y  D +  Y LVE FN +  +F++  V+  LE
Subjt:  YLNDVR--YKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALE

Q66JD1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 17.8e-1529.13Show/hide
Query:  LKWCSLGFFRTSRFA------------TGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDYHLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSG
        LK   LG+ + + FA             GF+  + K LDSI+++E  KD+  +++  IW  Y   R  + A +  + + L+ +RA  C  F+  L R  G
Subjt:  LKWCSLGFFRTSRFA------------TGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDYHLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSG

Query:  YTSMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLND--VRYKLVERFNRQTRDFEFKD
        Y     Q     + FT L + +  G  A     + +Y EF + K +VL+  +I  T  L   +A+ L    Q FY +D    + LVE+FN ++ +F++  
Subjt:  YTSMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLND--VRYKLVERFNRQTRDFEFKD

Query:  VLQALE
        V+  LE
Subjt:  VLQALE

Q811I0 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 13.2e-1630.54Show/hide
Query:  QKEAIPCDFLKWCSLGFFRTSRFATGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDYHLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSGYTS
        Q + I C   K  +LG    S+   GFT  + K L S+ ++E  KD++ E++  IW  Y   +  + A +  + + L+  RA  C  F+  L R  GY  
Subjt:  QKEAIPCDFLKWCSLGFFRTSRFATGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDYHLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSGYTS

Query:  MFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLNDVR--YKLVERFNRQTRDFEFKDVLQ
           Q     + FT L + + RG  AA    + +Y E  E K +VL+  ++  T  L   EA+ +    Q FY  D +  Y LVE FN +  +F++  V+ 
Subjt:  MFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLNDVR--YKLVERFNRQTRDFEFKDVLQ

Query:  ALE
         LE
Subjt:  ALE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34050.1 INVOLVED IN: protein complex assembly; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATP11 (InterPro:IPR010591); Has 304 Blast hits to 304 proteins in 167 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 101; Fungi - 112; Plants - 39; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 52 (source: NCBI BLink).5.8e-9063.01Show/hide
Query:  RTVRTVAGSAKTLLTSASPA----VRQPSRSYFANVSIEKLQKEAIPCDFLKWCSLGFFRTSRFATGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDY
        R V +++  AK  L+S+S +    +     S +   +  KL + ++P + +KW SLG  R SRFA+GFTPLQ KPLDSI+D+ RAK +SPE+L SIWDDY
Subjt:  RTVRTVAGSAKTLLTSASPA----VRQPSRSYFANVSIEKLQKEAIPCDFLKWCSLGFFRTSRFATGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDY

Query:  HLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSGYTSMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDP
        HLGRGHIG +MKA+LY LLEQRA++CRYFV+PLWRG+GY +MF QV+ PH++FTGLEDYKARGTQAAPY T ++Y E +E+KD+V IRGD+VFTSKLTD 
Subjt:  HLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSGYTSMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDP

Query:  EAEWLLETTQSFYLNDVRYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEMPIL
        EA+W++ET QSFYLND RYKL+ERFN+ T DFEFKDVLQAL+MP+L
Subjt:  EAEWLLETTQSFYLNDVRYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEMPIL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGAAGATTACGAACAGTGAGGACCGTTGCTGGTTCTGCGAAAACTCTTCTCACTAGTGCTTCGCCAGCGGTTCGACAACCTTCTCGGTCCTATTTTGCTAATGTGAG
TATTGAGAAACTGCAAAAGGAAGCTATTCCTTGTGATTTCCTCAAATGGTGTTCGCTTGGTTTCTTTCGGACTTCGAGATTCGCTACTGGGTTCACCCCATTGCAACCAA
AGCCGTTGGATTCTATCATTGATATGGAGAGAGCGAAAGATCGGTCACCGGAGGACCTCGCTTCCATTTGGGATGATTATCACTTGGGAAGAGGTCATATTGGTGCATCA
ATGAAAGCTAAACTATATCATTTATTGGAACAACGAGCAGCAGACTGCCGATACTTTGTTCTTCCTTTGTGGCGTGGAAGTGGTTATACTAGCATGTTTGTTCAAGTACA
AATGCCGCACATCCTTTTCACTGGCCTTGAAGATTACAAGGCAAGAGGAACTCAAGCTGCTCCCTACTTCACCGTGTCCTATTATAAAGAATTTGCAGAGAGCAAGGATA
TGGTGCTTATTCGAGGTGATATTGTGTTTACAAGCAAGCTCACTGACCCGGAGGCAGAATGGCTTTTAGAGACCACCCAATCGTTCTATCTGAACGATGTTCGGTACAAG
CTGGTTGAACGGTTCAACAGACAAACACGTGATTTTGAGTTCAAGGATGTTTTACAAGCACTGGAAATGCCCATTTTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGAAGATTACGAACAGTGAGGACCGTTGCTGGTTCTGCGAAAACTCTTCTCACTAGTGCTTCGCCAGCGGTTCGACAACCTTCTCGGTCCTATTTTGCTAATGTGAG
TATTGAGAAACTGCAAAAGGAAGCTATTCCTTGTGATTTCCTCAAATGGTGTTCGCTTGGTTTCTTTCGGACTTCGAGATTCGCTACTGGGTTCACCCCATTGCAACCAA
AGCCGTTGGATTCTATCATTGATATGGAGAGAGCGAAAGATCGGTCACCGGAGGACCTCGCTTCCATTTGGGATGATTATCACTTGGGAAGAGGTCATATTGGTGCATCA
ATGAAAGCTAAACTATATCATTTATTGGAACAACGAGCAGCAGACTGCCGATACTTTGTTCTTCCTTTGTGGCGTGGAAGTGGTTATACTAGCATGTTTGTTCAAGTACA
AATGCCGCACATCCTTTTCACTGGCCTTGAAGATTACAAGGCAAGAGGAACTCAAGCTGCTCCCTACTTCACCGTGTCCTATTATAAAGAATTTGCAGAGAGCAAGGATA
TGGTGCTTATTCGAGGTGATATTGTGTTTACAAGCAAGCTCACTGACCCGGAGGCAGAATGGCTTTTAGAGACCACCCAATCGTTCTATCTGAACGATGTTCGGTACAAG
CTGGTTGAACGGTTCAACAGACAAACACGTGATTTTGAGTTCAAGGATGTTTTACAAGCACTGGAAATGCCCATTTTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRRLRTVRTVAGSAKTLLTSASPAVRQPSRSYFANVSIEKLQKEAIPCDFLKWCSLGFFRTSRFATGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIWDDYHLGRGHIGAS
MKAKLYHLLEQRAADCRYFVLPLWRGSGYTSMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDMVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLNDVRYK
LVERFNRQTRDFEFKDVLQALEMPIL