; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg011819 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg011819
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionU-box domain-containing protein 35-like
Genome locationscaffold1:4445477..4446114
RNA-Seq ExpressionSpg011819
SyntenySpg011819
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6594711.1 U-box domain-containing protein 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-6989.38Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE
        +GKIPINQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCS AKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLG NKSRKLRSRGGSGI NEILQKAP FCE
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE

Query:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        VKVVCEGKETSQLGG PS +SSPRYQDD+SK  D NS+I VAEEQ+N SVSCMCFKTKFV
Subjt:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

XP_022926786.1 U-box domain-containing protein 35-like isoform X3 [Cucurbita moschata]7.0e-7088.89Show/hide
Query:  MTVGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGF
        MTVGKIP+NQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCS AKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLG NKSRKLRSRGGSGI NEILQKAP F
Subjt:  MTVGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGF

Query:  CEVKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        CEVKVVCE KETSQLGG PS +SSPRYQDD+SK  D NS+I VAEEQ+N SVSCMCFKTKFV
Subjt:  CEVKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

XP_022926787.1 U-box domain-containing protein 35-like isoform X4 [Cucurbita moschata]2.2e-6888.12Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE
        +GKIP+NQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCS AKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLG NKSRKLRSRGGSGI NEILQKAP FCE
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE

Query:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        VKVVCE KETSQLGG PS +SSPRYQDD+SK  D NS+I VAEEQ+N SVSCMCFKTKFV
Subjt:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

XP_023003371.1 U-box domain-containing protein 35-like isoform X4 [Cucurbita maxima]2.0e-6989.38Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE
        +GKIPINQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCS AKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLG NKSRKLRSRGGSGI NEILQKAP FCE
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE

Query:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        VKVVCEGKETSQLGG PS +SSPRYQDD+SK  D NS+I VAEEQ+N SVSCMCFKTKFV
Subjt:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

XP_023518700.1 U-box domain-containing protein 35-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.7e-6988.75Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE
        +GKIP+NQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCS AKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLG NKSRKLRSRGGSGI NEILQKAP FCE
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE

Query:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        VKVVCEGKETSQLGG PS +SSPRYQDD+SK  D NS+I VAEEQ+N SVSCMCFKTKFV
Subjt:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1EFC8 U-box domain-containing protein 35-like isoform X41.1e-6888.12Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE
        +GKIP+NQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCS AKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLG NKSRKLRSRGGSGI NEILQKAP FCE
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE

Query:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        VKVVCE KETSQLGG PS +SSPRYQDD+SK  D NS+I VAEEQ+N SVSCMCFKTKFV
Subjt:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

A0A6J1EFV0 U-box domain-containing protein 35-like isoform X33.4e-7088.89Show/hide
Query:  MTVGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGF
        MTVGKIP+NQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCS AKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLG NKSRKLRSRGGSGI NEILQKAP F
Subjt:  MTVGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGF

Query:  CEVKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        CEVKVVCE KETSQLGG PS +SSPRYQDD+SK  D NS+I VAEEQ+N SVSCMCFKTKFV
Subjt:  CEVKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

A0A6J1GDQ0 U-box domain-containing protein 35-like4.6e-6784.76Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE
        +GKIPINQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQ+FIDSCSAAKVKADTVLIESD VARAILDVIPILNIRKLVLGVN+SRK RSRGGSGI NE+LQKAPGFCE
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE

Query:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSK----SRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        VK+VCEGKETSQLGGSPS L SPRYQDDNS     + D NSS+  A+EQ+N+SVSCMCFKTKFV
Subjt:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSK----SRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

A0A6J1IS65 U-box domain-containing protein 352.3e-6684.15Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE
        +GKIPINQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQ+FIDSCSAAKVKADTVLIESD VARAILDVIPILNIRKLVLGVN+SRK RSRGGSGI NE+LQKAPGFCE
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE

Query:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSK----SRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        VK+VCEGKETSQ GGSPS L SPRYQDDNS     + D NSS+  A+EQ+N+SVSCMCFKTKFV
Subjt:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSK----SRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

A0A6J1KP30 U-box domain-containing protein 35-like isoform X49.8e-7089.38Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE
        +GKIPINQVSK+QVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCS AKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLG NKSRKLRSRGGSGI NEILQKAP FCE
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCE

Query:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV
        VKVVCEGKETSQLGG PS +SSPRYQDD+SK  D NS+I VAEEQ+N SVSCMCFKTKFV
Subjt:  VKVVCEGKETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8GUH1 U-box domain-containing protein 338.2e-0527.07Show/hide
Query:  KIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSR-------KLRSRGGSGITNEILQKA
        K P+  V +E+V +   +E  K    L +++  C    V+A+ + IE + +   I+ +I  L IRKLV+G    R        L+SR    +  E    A
Subjt:  KIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSR-------KLRSRGGSGITNEILQKA

Query:  PGFCEVKVVCEG----KETSQLGGSPSALSSPR
        P  C++   C+G       + +  + S  +SPR
Subjt:  PGFCEVKVVCEG----KETSQLGGSPSALSSPR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45910.1 U-box domain-containing protein kinase family protein5.8e-0627.07Show/hide
Query:  KIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSR-------KLRSRGGSGITNEILQKA
        K P+  V +E+V +   +E  K    L +++  C    V+A+ + IE + +   I+ +I  L IRKLV+G    R        L+SR    +  E    A
Subjt:  KIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSR-------KLRSRGGSGITNEILQKA

Query:  PGFCEVKVVCEG----KETSQLGGSPSALSSPR
        P  C++   C+G       + +  + S  +SPR
Subjt:  PGFCEVKVVCEG----KETSQLGGSPSALSSPR

AT2G45920.1 U-box domain-containing protein1.1e-0426.24Show/hide
Query:  NQVSKEQVAIHVAQ-----EESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNE---ILQKAPGF
        N   KE   +HV Q     E+ K +  L  ++  C   +V A+ + I+ + V + I+ +I   N++KLV+G     +   R    ++ +   I Q+AP  
Subjt:  NQVSKEQVAIHVAQ-----EESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNE---ILQKAPGF

Query:  CEVKVVCEG----KETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDS
        C +   C+G    K  S +G +    +S     D+ +SR S
Subjt:  CEVKVVCEG----KETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDS

AT5G47740.1 Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein5.8e-2239.88Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKS--RKLRSRGGSGITNEILQ-KAPG
        +G+I   + S+EQV   ++QE  KR+  L  F+ +CSA+KVK +T+L+ESD VA+A+ D+I ILNIRKLVLG++KS  RK  +  G+ +   I++  A  
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKS--RKLRSRGGSGITNEILQ-KAPG

Query:  FCEVKVVCEGKETS--QLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTK
         CEVKV+C+GKE +  Q     S   SP  Q             +  ++Q  D  +C+CF +K
Subjt:  FCEVKVVCEGKETS--QLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTK

AT5G47740.2 Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein1.9e-2039.39Show/hide
Query:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAK--VKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKS--RKLRSRGGSGITNEILQ-KA
        +G+I   + S+EQV   ++QE  KR+  L  F+ +CSA+K  VK +T+L+ESD VA+A+ D+I ILNIRKLVLG++KS  RK  +  G+ +   I++  A
Subjt:  VGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAK--VKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKS--RKLRSRGGSGITNEILQ-KA

Query:  PGFCEVKVVCEGKETS--QLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTK
           CEVKV+C+GKE +  Q     S   SP  Q             +  ++Q  D  +C+CF +K
Subjt:  PGFCEVKVVCEGKETS--QLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTK

AT5G65500.1 U-box domain-containing protein kinase family protein1.6e-0834.78Show/hide
Query:  GKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIES--DMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRS-RGGSGITNE--ILQKAP
        GK+P + VS+E++ +    E+ K    L  +I  C   KVKA+ + +E   D +   ILD+I  L I KLV+G+   R   S +  S I+    + Q  P
Subjt:  GKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIES--DMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRS-RGGSGITNE--ILQKAP

Query:  GFCEVKVVCEGKETS
         FCE  ++C GK  S
Subjt:  GFCEVKVVCEGKETS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAGTGGGAAAGATTCCAATTAATCAGGTGAGTAAAGAACAAGTGGCTATCCATGTAGCCCAAGAAGAAAGCAAAAGGAAGGATTTTCTTCAGAATTTCATTGACTC
CTGTTCTGCTGCTAAGGTCAAGGCAGATACTGTGCTGATTGAGAGCGACATGGTGGCCAGGGCTATTTTGGATGTTATACCAATTCTCAACATAAGGAAGCTAGTTCTTG
GAGTCAACAAATCCAGGAAGTTGAGATCTCGAGGGGGAAGTGGAATAACCAATGAGATACTTCAGAAAGCTCCGGGATTTTGCGAGGTTAAGGTTGTTTGTGAAGGGAAA
GAAACGAGCCAACTCGGTGGATCGCCCTCTGCTCTCTCTTCTCCTCGCTACCAAGATGACAACTCCAAGAGTCGTGATTCTAATTCCAGCATTAAAGTGGCTGAAGAACA
ACAAAACGATTCAGTTTCTTGCATGTGTTTCAAAACTAAGTTTGTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACAGTGGGAAAGATTCCAATTAATCAGGTGAGTAAAGAACAAGTGGCTATCCATGTAGCCCAAGAAGAAAGCAAAAGGAAGGATTTTCTTCAGAATTTCATTGACTC
CTGTTCTGCTGCTAAGGTCAAGGCAGATACTGTGCTGATTGAGAGCGACATGGTGGCCAGGGCTATTTTGGATGTTATACCAATTCTCAACATAAGGAAGCTAGTTCTTG
GAGTCAACAAATCCAGGAAGTTGAGATCTCGAGGGGGAAGTGGAATAACCAATGAGATACTTCAGAAAGCTCCGGGATTTTGCGAGGTTAAGGTTGTTTGTGAAGGGAAA
GAAACGAGCCAACTCGGTGGATCGCCCTCTGCTCTCTCTTCTCCTCGCTACCAAGATGACAACTCCAAGAGTCGTGATTCTAATTCCAGCATTAAAGTGGCTGAAGAACA
ACAAAACGATTCAGTTTCTTGCATGTGTTTCAAAACTAAGTTTGTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTVGKIPINQVSKEQVAIHVAQEESKRKDFLQNFIDSCSAAKVKADTVLIESDMVARAILDVIPILNIRKLVLGVNKSRKLRSRGGSGITNEILQKAPGFCEVKVVCEGK
ETSQLGGSPSALSSPRYQDDNSKSRDSNSSIKVAEEQQNDSVSCMCFKTKFV