; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg012326 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg012326
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP62
Genome locationscaffold1:18354059..18359037
RNA-Seq ExpressionSpg012326
SyntenySpg012326
Gene Ontology termsGO:0006913 - nucleocytoplasmic transport (biological process)
GO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0005643 - nuclear pore (cellular component)
GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK24755.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo var. makuwa]8.0e-1466.33Show/hide
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XP_008459731.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo]8.0e-1466.33Show/hide
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XP_022142426.1 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X1 [Momordica charantia]9.8e-1287.5Show/hide
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XP_022156652.1 nuclear pore complex protein NUP62, partial [Momordica charantia]2.3e-1388.89Show/hide
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XP_031743587.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus]8.0e-1466.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA27 Nsp1_C domain-containing protein3.9e-1466.33Show/hide
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A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP623.9e-1466.33Show/hide
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A0A5D3DMB1 Nuclear pore complex protein NUP623.9e-1466.33Show/hide
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A0A6J1CMQ9 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X24.7e-1287.5Show/hide
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A0A6J1DSI7 nuclear pore complex protein NUP621.1e-1388.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGGTACCTCCATGCATGATCCTCTTACTCAGTACAATGACTTTTCGGACCGTTGCCCTTAAACTAGAAGATTTGGAACAGAATGCCCTTTGTGGGGACAAGCAGATCATG
GTGCTTCAGCTGCAGTTTTGGAGTGATGTTTTGTTTTGCCTTCTAAATTCTGCTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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TSFPALASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVSSSSSGTTSTVSAAVSTAPKLPSEITGKTVEEPLFMTPALSVPPCMILLLSTMTFRTVALKLEDLEQNALCGDKQIM
VLQLQFWSDVLFCLLNSAS