| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025634.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo var. makuwa] | 3.0e-107 | 88.66 | Show/hide |
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+G+LDLL PGELLQDQD DL HD GPG D GQGQ +VVEDQGPEVV ASSR++A NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEPRTR
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ISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRG RYR GGS R+DYGYRRSPRRSPYRGAREYSPR
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H+PPY GGRSRRDHSRS PPYSPPY GSPDRRYPRGSR
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|
|
| XP_016899368.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo] | 1.7e-86 | 92.97 | Show/hide |
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R++A NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
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|
| XP_022926991.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucurbita moschata] | 3.7e-89 | 89.58 | Show/hide |
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|
| XP_023003930.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucurbita maxima] | 7.4e-90 | 89.58 | Show/hide |
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|
| XP_038881911.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Benincasa hispida] | 7.6e-87 | 92.97 | Show/hide |
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R++A NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
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LKSTRD+GYRGDRG RYR GGS RDDYGYRRSPRRSPYRGAREYS PRH+PPYGGRSRRDHSRSPPY+PP GSPDRRYPRGSR
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KMM4 RRM domain-containing protein | 5.3e-86 | 93.09 | Show/hide |
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RE+A NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
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LKSTRDSGYR GDRG RYR GGS R+DYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRH+PPY GGRSRRDHSRS PPYSPPY GSPDRRYPRGSR
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|
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| A0A1S4DTT1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 8.2e-87 | 92.97 | Show/hide |
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R++A NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
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|
| A0A5A7SJ12 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.4e-107 | 88.66 | Show/hide |
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+G+LDLL PGELLQDQD DL HD GPG D GQGQ +VVEDQGPEVV ASSR++A NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEPRTR
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H+PPY GGRSRRDHSRS PPYSPPY GSPDRRYPRGSR
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| A0A6J1EGF8 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 1.8e-89 | 89.58 | Show/hide |
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+ +G + RENALNPGNTLYVTGLS RVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFV MDNVDDANR VKHLNQSILEGRYITVEKSRRK
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|
|
| A0A6J1KT61 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 3.6e-90 | 89.58 | Show/hide |
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+ +G + RENALNPGNTLYVTGLS RVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFV MDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRK
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RPRTPTPGHYLGLK+TRDSGYR DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPRRSPYRG REYSPRH+P YGGRSRRDHSRSPPYS PYGSPD RYPRGSR
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 3.9e-17 | 43.35 | Show/hide |
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+P L V GLS TERDL E FSK G +A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G +
Subjt: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
Query: DSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPR-----RSPYRGARE----YSPRHTPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
S R DRG RG RD Y RS R +R A++ Y R PY R R SRS YSP
Subjt: DSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPR-----RSPYRGARE----YSPRHTPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
|
|
| P62996 Transformer-2 protein homolog beta | 3.9e-17 | 43.35 | Show/hide |
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+P L V GLS TERDL E FSK G +A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G +
Subjt: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
Query: DSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPR-----RSPYRGARE----YSPRHTPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
S R DRG RG RD Y RS R +R A++ Y R PY R R SRS YSP
Subjt: DSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPR-----RSPYRGARE----YSPRHTPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
|
|
| Q10422 Uncharacterized RNA-binding protein C25G10.01 | 3.0e-17 | 33.07 | Show/hide |
Query: SDAGSL-----DLLRPGELLQDQDLDLGHDLGPGLDLDLGQGQGLEVVEDQGPEVVEASSRENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFL
SDAGS+ L GE LQ + D ++ P + L+ E Q S+ E + N GN L+V+G+++R+ E +L++ FSK G V +
Subjt: SDAGSL-----DLLRPGELLQDQDLDLGHDLGPGLDLDLGQGQGLEVVEDQGPEVVEASSRENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFL
Query: VVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGL----------KSTRDSGYRGDRGRYRGGSLRDDYGYRRS
+ EP T+ SRGF F++ V++A + +LN GR + V+K++R RP +PTPG Y+G + +D GYR R YR RD YR S
Subjt: VVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGL----------KSTRDSGYRGDRGRYRGGSLRDDYGYRRS
Query: PRRSPYRGAREYSP----RHTPPYGGRSRRD---HSRSPPYSPPYGSPDRR
R P R RE+SP + R RR+ H RS ++ + P+ R
Subjt: PRRSPYRGAREYSP----RHTPPYGGRSRRD---HSRSPPYSPPYGSPDRR
|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 3.9e-17 | 43.35 | Show/hide |
Query: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
+P L V GLS TERDL E FSK G +A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G +
Subjt: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
Query: DSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPR-----RSPYRGARE----YSPRHTPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
S R DRG RG RD Y RS R +R A++ Y R PY R R SRS YSP
Subjt: DSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPR-----RSPYRGARE----YSPRHTPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 4.9e-36 | 49.51 | Show/hide |
Query: SSRENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHY
S +A NPGN+LYVTGLS RVTERDLE+HF+KEGKV LV++P TR SRGF F++M +V DANRC++ L+ S+L+GR ITVEK+RR+R RTPTPG Y
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Query: LGLKS--------------------TRDSGYRGDRGRYRGGSLRDDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHTPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPYGSPD--RR
LGL++ +R Y DRGR S YG R RS SP YR R YSP +P R R RS YSP Y D R
Subjt: LGLKS--------------------TRDSGYRGDRGRYRGGSLRDDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHTPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPYGSPD--RR
Query: YPRGSR
Y R R
Subjt: YPRGSR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G07350.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.5e-37 | 49.51 | Show/hide |
Query: SSRENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHY
S +A NPGN+LYVTGLS RVTERDLE+HF+KEGKV LV++P TR SRGF F++M +V DANRC++ L+ S+L+GR ITVEK+RR+R RTPTPG Y
Subjt: SSRENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHY
Query: LGLKS--------------------TRDSGYRGDRGRYRGGSLRDDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHTPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPYGSPD--RR
LGL++ +R Y DRGR S YG R RS SP YR R YSP +P R R RS YSP Y D R
Subjt: LGLKS--------------------TRDSGYRGDRGRYRGGSLRDDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHTPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPYGSPD--RR
Query: YPRGSR
Y R R
Subjt: YPRGSR
|
|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 7.7e-53 | 67.05 | Show/hide |
Query: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLKS+R
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Query: DSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHTPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPYGSPDRRYPRGS
DS G RGR+ RDDY RRSPR R+YSPR RSRRD S YSP SP+RR R S
Subjt: DSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHTPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPYGSPDRRYPRGS
|
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| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.5e-53 | 65.75 | Show/hide |
Query: RENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
R NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLG
Subjt: RENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
Query: LKSTRDSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHTPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPYGSPDRRYPRGS
LKS+RDS G RGR+ RDDY RRSPR R+YSPR RSRRD S YSP SP+RR R S
Subjt: LKSTRDSGYRG--DRGRYRGGSLRDDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHTPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPYGSPDRRYPRGS
|
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| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.8e-33 | 76.19 | Show/hide |
Query: RENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
R NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: RENALNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
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| AT4G35785.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.0e-33 | 79.75 | Show/hide |
Query: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
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