CuGenDBv2

Gene ID	Spg012844
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	scaffold1:18367228..18368529
RNA-Seq Expression	Spg012844
Synteny	Spg012844
Gene Ontology terms	GO:0006913 - nucleocytoplasmic transport (biological process) GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0005643 - nuclear pore (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6575234.1 Nuclear pore complex protein NUP62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.7e-99

64.57

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFS        SSSSSSNPSSSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSPFS SLPA    +SS
Subjt:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS

Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSS----------------------------SGTSSAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAPFSGSSSASL---------
        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG SSS                            SGTS APL G+ PSSGSSP P FGAAP SGSS A L         
Subjt:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSS----------------------------SGTSSAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAPFSGSSSASL---------

Query:  ---------------------------------FAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSS
                                         F AAPSAGTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGTS  TAS G ++  AS A SGS+S LFG+   +SSS
Subjt:  ---------------------------------FAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSS

Query:  GSAGSAFFGSNPFAASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSIS
          + S  FGS+  +AS+    +  SSS S +   +SPFAA   SSSGF FSTTSLSKTTSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSIS
Subjt:  GSAGSAFFGSNPFAASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSIS

Query:  NAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSS
        NAASTGGS+APGTT  K PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSS
Subjt:  NAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSS

Query:  AIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG
        AIVSLSLPTK+LTAASSSQAP SFG
Subjt:  AIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG

XP_022959228.1 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata]

1.1e-101

65.95

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFS        SSSSSSNPSSSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSPFS SLPA    +SS
Subjt:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS

Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSS--------------------------------------------------------APLLGAPPSSGS
        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG SSSSG SS                                                        APL G+ PSSGS
Subjt:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSS--------------------------------------------------------APLLGAPPSSGS

Query:  SPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSSGSAGSAFFGSNPFA
        SP P FGAAP +GSSS+  F AAPSAGTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGTS  TAS G ++  AS A SGS+S LFG+   +SSS  + S  FGS+  +
Subjt:  SPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSSGSAGSAFFGSNPFA

Query:  ASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTT
        AS+    +  SSS S +   +SPFAA   SSSGF FSTTSLSKTTSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGTT
Subjt:  ASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTT

Query:  VTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTA
          K PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSSAIVSLSLPTK+LTA
Subjt:  VTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTA

Query:  ASSSQAPTSFG
        ASSSQAP SFG
Subjt:  ASSSQAPTSFG

XP_022959229.1 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 [Cucurbita moschata]

1.1e-101

65.95

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFS        SSSSSSNPSSSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSPFS SLPA    +SS
Subjt:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS

Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSS--------------------------------------------------------APLLGAPPSSGS
        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG SSSSG SS                                                        APL G+ PSSGS
Subjt:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSS--------------------------------------------------------APLLGAPPSSGS

Query:  SPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSSGSAGSAFFGSNPFA
        SP P FGAAP +GSSS+  F AAPSAGTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGTS  TAS G ++  AS A SGS+S LFG+   +SSS  + S  FGS+  +
Subjt:  SPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSSGSAGSAFFGSNPFA

Query:  ASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTT
        AS+    +  SSS S +   +SPFAA   SSSGF FSTTSLSKTTSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGTT
Subjt:  ASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTT

Query:  VTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTA
          K PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSSAIVSLSLPTK+LTA
Subjt:  VTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTA

Query:  ASSSQAPTSFG
        ASSSQAP SFG
Subjt:  ASSSQAPTSFG

XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.7e-100

65.14

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPAS----SS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFS        SSSSSSNPSSSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSPFS SLPA+    SS
Subjt:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPAS----SS

Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSS----------------------------SGTSSAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAPFSGSSSASL---------
        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG SSS                            SGTS APL G+ PSSGSSP P FGAAP SGSS A L         
Subjt:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSS----------------------------SGTSSAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAPFSGSSSASL---------

Query:  ---------------------------------FAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGTS---SSS
                                         F AAPSAG SA S+FGG+SS  T+SSAP FGTS  TAS G ++  ASAA SGS+S LFG+S   SSS
Subjt:  ---------------------------------FAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGTS---SSS

Query:  GSAGSAFFGSNPFAASSS----GTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSIS
          + S  FGS+  +AS+S      SSS S +   +SPFAA   SSSGF FSTTSLSKTTSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSIS
Subjt:  GSAGSAFFGSNPFAASSS----GTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSIS

Query:  NAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSS
        NAASTGGS+APGTT  K PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASSAPST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSS
Subjt:  NAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSS

Query:  AIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG
        AIVSLSLPTK+LTAASSSQAP SFG
Subjt:  AIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG

XP_038874708.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]

7.8e-100

68.85

Show/hide

Query:  SGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL--------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFG---FPSSTSSPFSLSLPASSSGSSGSSLFGAT
        S   + SSSSPFSS+TGF+FGSTSAFS          SSSSSSNP+SSSS FSNQ+ NPA SSS  FG   FPSS SSPFS SLP          LFG+ 
Subjt:  SGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL--------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFG---FPSSTSSPFSLSLPASSSGSSGSSLFGAT

Query:  SSSGGLTSFAFGTSSSSGTSSAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFG-TSVSTASQGLTLLAASA
         SSG  ++  FG++SSSG+S AP  G   SSGSS  P FGA P SGSSSA LF A PSAG SA S+FGG+SS T+SSAP FG TS STAS G  L  AS 
Subjt:  SSSGGLTSFAFGTSSSSGTSSAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFG-TSVSTASQGLTLLAASA

Query:  AVSGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSI---STSTLFTSPF-------------------AASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSS
        A SGS+S LFGTS++SGS+GSA FGS+PF ASSS ++S++   S+S+  TSPF                   A+SSSSSSGF FST SLSKTTSIT  +S
Subjt:  AVSGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSI---STSTLFTSPF-------------------AASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSS

Query:  SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAAT
        SSSSLT+ASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+AP TT TK PTSLS S+SVAPLFSTVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFS SSSAAT
Subjt:  SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAAT

Query:  TLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG
        TLSIAASS PS +SSGA SSFTGFGVTS ASSSSAI SLSLPTKT TAASSSQAP SFG
Subjt:  TLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

8.4e-100

66.34

Show/hide

Query:  MSGFSFG------SSSSPFSSATGFAFGST--------SAFSLRSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFG-----FPSSTSSPFSLSLPASSSGS
        MSGF FG      SSSSPFSS TGF+FGST        S  SL SSSSSSNP+SSSS F N +SNP PSSS SFG     F SSTSSPFS SL ++S+G+
Subjt:  MSGFSFG------SSSSPFSSATGFAFGST--------SAFSLRSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFG-----FPSSTSSPFSLSLPASSSGS

Query:  -----------SGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSSAPLLGAPPSS----------GSSPAPLFGAAPFSGS---------------SSASLFAA
                   S SSLFG +SSS G  SF FG SSSS  SSAPL GA  SS          GSSPAP FGAAP SGS               SSA LF A
Subjt:  -----------SGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSSAPLLGAPPSS----------GSSPAPLFGAAPFSGS---------------SSASLFAA

Query:  APSAG-TSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGTSS-SSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLF-----TSP
        APSAG +SA S+FGG SS T+SSAP FGT+ S AS G  L  ASA  SGS + LFGTS+ SSGS GS  FGS+PF ASSSGTSSS+STS LF     +SP
Subjt:  APSAG-TSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGTSS-SSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLF-----TSP

Query:  FAASSSSS---------------SGFPFSTTSLSKTTSITNV--SSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTTVTKQPT
        F +S SSS               SGF F T++LSKTTSITNV  SSSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGS+AP TT TK PT
Subjt:  FAASSSSS---------------SGFPFSTTSLSKTTSITNV--SSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTTVTKQPT

Query:  SLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTAASSSQA
        SLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFS SSSAATTLSIAASSAPS ASSG  SSFTGFGVTS+ASSSSAI SLSLPTKT TAASSSQA
Subjt:  SLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTAASSSQA

Query:  PTSFG
        P SFG
Subjt:  PTSFG

A0A6J1CMQ9 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X2

2.1e-79

61.08

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSS---------SPFSSATGFAFGSTSAFSLRSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPFSLSLPASSSGSSGSSLFGATS
        MSGF FGSSS         SPFSS++GFAFGSTS FS     SS  P++S       SSNP    SP FG PSS                          
Subjt:  MSGFSFGSSS---------SPFSSATGFAFGSTSAFSLRSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPFSLSLPASSSGSSGSSLFGATS

Query:  SSGGLTSFAFGTSSSSGTSSAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAP------FSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLL
        SSGGL SF FGT+ S+G+SS  L GA P++GSS   +FGAAP       +GSSS SLF AAPSAG SA S+FGG     +SSAP       T + G  L 
Subjt:  SSGGLTSFAFGTSSSSGTSSAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAP------FSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLL

Query:  AASAAVSGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFF---------GSNPFAASSSG---TSSSISTSTLFTSPFAASS------------SSSSGFPFSTTSLSKTTS
         ASAA SGS SPLFGT+SSSGS+GSA F         GSNPF  SSSG   +S+S+++++ F + F++SS            SSSSGF F TTS SK T+
Subjt:  AASAAVSGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFF---------GSNPFAASSSG---TSSSISTSTLFTSPFAASS------------SSSSGFPFSTTSLSKTTS

Query:  ITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSL
            SSSSS LTSASTSS SFSFGTPASSASQSSFGFS SNAAST  SAAPGTT TK PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQ SFSVPAFSL
Subjt:  ITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSL

Query:  SSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG
        SSSAATT+S AASS PS ASSGAASS+TGFGVT+TASSSSAIVSLSLPTKTLTA+SSSQAP SFG
Subjt:  SSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

5.3e-102

65.95

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFS        SSSSSSNPSSSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSPFS SLPA    +SS
Subjt:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS

Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSS--------------------------------------------------------APLLGAPPSSGS
        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG SSSSG SS                                                        APL G+ PSSGS
Subjt:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSS--------------------------------------------------------APLLGAPPSSGS

Query:  SPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSSGSAGSAFFGSNPFA
        SP P FGAAP +GSSS+  F AAPSAGTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGTS  TAS G ++  AS A SGS+S LFG+   +SSS  + S  FGS+  +
Subjt:  SPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSSGSAGSAFFGSNPFA

Query:  ASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTT
        AS+    +  SSS S +   +SPFAA   SSSGF FSTTSLSKTTSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGTT
Subjt:  ASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTT

Query:  VTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTA
          K PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSSAIVSLSLPTK+LTA
Subjt:  VTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTA

Query:  ASSSQAPTSFG
        ASSSQAP SFG
Subjt:  ASSSQAPTSFG

A0A6J1H7F5 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2

5.3e-102

65.95

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFS        SSSSSSNPSSSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSPFS SLPA    +SS
Subjt:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS

Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSS--------------------------------------------------------APLLGAPPSSGS
        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG SSSSG SS                                                        APL G+ PSSGS
Subjt:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSS--------------------------------------------------------APLLGAPPSSGS

Query:  SPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSSGSAGSAFFGSNPFA
        SP P FGAAP +GSSS+  F AAPSAGTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGTS  TAS G ++  AS A SGS+S LFG+   +SSS  + S  FGS+  +
Subjt:  SPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGT---SSSSGSAGSAFFGSNPFA

Query:  ASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTT
        AS+    +  SSS S +   +SPFAA   SSSGF FSTTSLSKTTSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGTT
Subjt:  ASS----SGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTT

Query:  VTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTA
          K PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSSAIVSLSLPTK+LTA
Subjt:  VTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTA

Query:  ASSSQAPTSFG
        ASSSQAP SFG
Subjt:  ASSSQAPTSFG

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

5.1e-97

62.43

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFS        SSSSSSNPSSSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSPFS SLPA    +SS
Subjt:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSL------RSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPFSLSLPA----SSS

Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSSAPLLGAPPSSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSSTTS
        G SGS+LF A+SSSGGL+SF FG SSSSG SSAP  GA P+SGSSP              APLFG+AP SGSS    F AAP++G+S + +FG   S+ S
Subjt:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTSSAPLLGAPPSSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSSTTS

Query:  SSAPSFGTSVSTASQGLTLLAA-----------------------------SAAVSGSNSPLFGTSSSSGSAG--------------SAFFGSNPFAASS
        S  PSFG S S  S  L    A                             S+A + S++PLFGTS+ + S G              S+ FGSN FA+SS
Subjt:  SSAPSFGTSVSTASQGLTLLAA-----------------------------SAAVSGSNSPLFGTSSSSGSAG--------------SAFFGSNPFAASS

Query:  SGTSSSISTSTLF--------TSPFAAS---------------SSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS
        SGT SS+STS LF        T+PF  S               ++SSSGF FSTTSLSKTTSIT V+SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+
Subjt:  SGTSSSISTSTLF--------TSPFAAS---------------SSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS

Query:  ISNAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASS
        ISNAAS  GS+APGTT  K PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASSAPS  SSGAASSFTGFG+TSTA+S
Subjt:  ISNAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASS

Query:  SSAIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG
        SSAIVSLSLPTK+LTAASSSQAP SFG
Subjt:  SSAIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFG

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

1.6e-10

37.98

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSLRSSSS-----------SSNPSSSSSAF-SNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPFSLSLPASSS------GSS
        MSGF FG S    +S  GF+FGS+SA +  S+SS           SSNPSS+   F S+ SS PA S++PSFGF +S++  F     ASSS      GSS
Subjt:  MSGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSLRSSSS-----------SSNPSSSSSAF-SNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPFSLSLPASSS------GSS

Query:  GS-----------------------SLFG-----ATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTS--SAPLLGAPPSSGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSASLFAAA
         S                       SLFG     A+S++ G + F F TSS+S T+  S+ L GAP SS ++P+   FGAAP SGS     SS SLF+A 
Subjt:  GS-----------------------SLFG-----ATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTS--SAPLLGAPPSSGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSASLFAAA

Query:  PSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASSSGTSSSISTSTL
         SA  S SS+FG  SS  +S++P FG + S+A+      + +++  GS+S +FG           SS+SGS+ S F   GS+PF  SS   SS+ ST +L
Subjt:  PSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASSSGTSSSISTSTL

Query:  F-TSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSA-----STSSSSFSFGTP------ASSASQSSFGFSISNA--ASTGGSAAPGTTVTKQP
        F +S   A++SS S F  ST + S T++ +N S+S  S ++      ST+SS+ S  TP      ASS+S  SFG S ++    STG SAAP ++ +   
Subjt:  F-TSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSA-----STSSSSFSFGTP------ASSASQSSFGFSISNA--ASTGGSAAPGTTVTKQP

Query:  TSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSL----SSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SAIVSLSL
         S++ +T+ +      T+  AS+  A++   PSF V + +     +SSAAT  +     A ST ++G+ +SFTGF V  TST +SS      S   S SL
Subjt:  TSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSL----SSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SAIVSLSL

Query:  PTKTLTAASSSQAPTS
        P+ T T A ++ + T+
Subjt:  PTKTLTAASSSQAPTS

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

1.1e-11

37.98

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSLRSSSS-----------SSNPSSSSSAF-SNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPFSLSLPASSS------GSS
        MSGF FG S    +S  GF+FGS+SA +  S+SS           SSNPSS+   F S+ SS PA S++PSFGF +S++  F     ASSS      GSS
Subjt:  MSGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSLRSSSS-----------SSNPSSSSSAF-SNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPFSLSLPASSS------GSS

Query:  GS-----------------------SLFG-----ATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTS--SAPLLGAPPSSGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSASLFAAA
         S                       SLFG     A+S++ G + F F TSS+S T+  S+ L GAP SS ++P+   FGAAP SGS     SS SLF+A 
Subjt:  GS-----------------------SLFG-----ATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTS--SAPLLGAPPSSGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSASLFAAA

Query:  PSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASSSGTSSSISTSTL
         SA  S SS+FG  SS  +S++P FG + S+A+      + +++  GS+S +FG           SS+SGS+ S F   GS+PF  SS   SS+ ST +L
Subjt:  PSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASSSGTSSSISTSTL

Query:  F-TSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSA-----STSSSSFSFGTP------ASSASQSSFGFSISNA--ASTGGSAAPGTTVTKQP
        F +S   A++SS S F  ST + S T++ +N S+S  S ++      ST+SS+ S  TP      ASS+S  SFG S ++    STG SAAP ++ +   
Subjt:  F-TSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSA-----STSSSSFSFGTP------ASSASQSSFGFSISNA--ASTGGSAAPGTTVTKQP

Query:  TSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSL----SSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SAIVSLSL
         S++ +T+ +      T+  AS+  A++   PSF V + +     +SSAAT  +     A ST ++G+ +SFTGF V  TST +SS      S   S SL
Subjt:  TSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSL----SSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SAIVSLSL

Query:  PTKTLTAASSSQAPTS
        P+ T T A ++ + T+
Subjt:  PTKTLTAASSSQAPTS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCAGGATTCTCGTTCGGATCTTCTTCTTCGCCATTTTCATCGGCCACTGGTTTCGCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCCTCAGATCCTCCTCCTCCTCCTCAAA
CCCTAGCTCCTCATCCTCCGCATTTTCAAATCAAAGCTCCAATCCTGCCCCCTCCTCTTCCCCTTCGTTCGGCTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCTTTCTCTCTCTCGT
TGCCCGCTTCGTCTTCTGGAAGTTCAGGTTCTTCCCTCTTTGGTGCTACTTCATCCTCAGGAGGATTGACTTCTTTCGCGTTTGGGACTTCATCTTCATCGGGAACCTCA
TCTGCGCCATTGCTTGGGGCTCCTCCGTCCTCTGGGAGCTCACCTGCGCCCTTGTTTGGGGCAGCTCCGTTCTCTGGGAGCTCATCTGCGTCCTTGTTTGCTGCTGCTCC
ATCTGCTGGGACCTCGGCCTCGTCCGTTTTCGGAGGGCTGTCTTCTACAACTTCTTCTAGTGCGCCATCGTTTGGCACGTCTGTATCCACTGCAAGTCAGGGACTGACGT
TGCTTGCCGCATCTGCAGCGGTTTCAGGTTCTAATTCGCCCCTGTTTGGGACATCTTCATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAGCTTTTTTTGGGTCTAATCCCTTTGCTGCT
TCTTCTTCGGGCACGTCGTCTTCGATTTCTACTTCGACCTTGTTTACGTCACCTTTCGCGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTCCATTTTCAACCACTTCTTTATC
CAAAACTACTAGTATTACCAATGTGTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCGTCGAGCTTCTCATTTGGAACGCCTGCTTCCTCGGCATCTCAAT
CTTCTTTTGGGTTTAGTATCAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTGCTGCTCCAGGCACTACAGTTACAAAGCAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCAACTTCTGTGGCA
CCTTTATTCTCTACGGTAACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCTAATAGCACAACCCAGCCATCTTTCTCTGTGCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCCGCTAC
TACCTTATCGATAGCAGCATCCTCCGCCCCCTCAACTGCTTCCTCAGGTGCTGCGAGTTCGTTTACAGGTTTTGGTGTCACAAGCACAGCTTCTTCATCAAGTGCAATTG
TTTCCTTATCGTTGCCAACCAAAACATTGACGGCTGCTTCATCATCGCAAGCCCCAACCTCTTTCGGTAAGTTCTTCAATTTCTTCTTTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSLRSSSSSSNPSSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPFSLSLPASSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGTSSSSGTS
SAPLLGAPPSSGSSPAPLFGAAPFSGSSSASLFAAAPSAGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTSVSTASQGLTLLAASAAVSGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAA
SSSGTSSSISTSTLFTSPFAASSSSSSGFPFSTTSLSKTTSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTTVTKQPTSLSFSTSVA
PLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSAIVSLSLPTKTLTAASSSQAPTSFGKFFNFFF

Spg012844 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome