; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg012954 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg012954
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionTranscription factor SPATULA
Genome locationscaffold1:8639937..8642339
RNA-Seq ExpressionSpg012954
SyntenySpg012954
Gene Ontology termsGO:0006468 - protein phosphorylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004672 - protein kinase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR031066 - Basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factors ALC-like, plant
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142005.2 transcription factor SPATULA isoform X1 [Cucumis sativus]5.1e-17082.79Show/hide
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XP_031742540.1 transcription factor SPATULA isoform X2 [Cucumis sativus]1.1e-16982.75Show/hide
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XP_038883118.1 transcription factor APG-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.1e-18083.97Show/hide
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XP_038883119.1 transcription factor APG-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.6e-17983.93Show/hide
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XP_038883120.1 transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR-LIKE 13-like isoform X3 [Benincasa hispida]4.8e-16884.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KLD3 BHLH domain-containing protein2.5e-17082.79Show/hide
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A0A1S3B0R8 transcription factor SPATULA1.4e-16581.05Show/hide
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A0A5D3CR49 Transcription factor SPATULA1.4e-16581.05Show/hide
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A0A6J1HHP8 uncharacterized protein LOC1114630735.0e-16377.56Show/hide
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        MDHSISNKCD NAC SSTWT PA ++      DEISLFLQ IL R            SSPSIFS+L+ N+R  TPL+ NIPPSY  PNA+P D ISAVDS
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        TPFELVPPVQAHL+PFYLSE S   KEI  DV RD QVN +Q ETTPF  VS  YNIAAPDL+ELQN VS+EPCII+GNRSGV+LNTPEH     SL NG
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        IDTGRPTETT
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A0A6J1KP34 uncharacterized protein LOC1114974226.7e-16076.59Show/hide
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        MDHSISNKCD NAC SSTWT PA ++      DEISLFLQ IL R            SSPSIFS+L+ N R  TPL  NIPPSY  PNA+P   ISAVDS
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Query:  IDTGRPTETT
        IDTGRPTETT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80536 Transcription factor PIF33.5e-2049.66Show/hide
Query:  SSSSVLYDPLRSCPTPTAPNASSTSVGANDHNENDEFDCESEEGLEPLVEDQPTKPNPRS--SSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNK
        S  +V+   + S  +   P+ S +      H+   + DC SE+  E   + +      R+   SKRSR+AEVHNLSE+RRR RINEKM+ALQ LIPN NK
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         DKASMLDEAIEYLK LQLQVQ++SM  G  L P  M  PG   Y
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Q0JNI9 Transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR-LIKE 155.2e-2465.35Show/hide
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        ++D+P   + +   S+KRSR AEVHNLSE+RRR RINEKM+ALQ LIPN NK DKASMLDEAIEYLK LQLQVQM+SM  GL + PM LP ++Q+LQ+  
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Query:  M
        M
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Q8GZM7 Transcription factor PIF11.7e-2239.17Show/hide
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        P   N         +    DE +  SEE  +  V          +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K L
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Query:  QLQVQMLSMRHGLNLHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSLPSDRERPNQIFLSLPDQKAASIHPFMSDIGRTNVETPFELVPPVQAHLV------PF
        QLQ+QM+SM  G  + PM  PG  QY  + HM M  G        ++  P   F+  P+  AA              + P     P Q H+       P 
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        + S+PS+    +   DP
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Q9FHA2 Transcription factor ALC1.2e-2046.91Show/hide
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        PP +  DE+S+     Q  + + ++    P +S    +A    P+ S  +V +  +         SE G +    E + +    R+S KR+  A+ HNLS
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Query:  EKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRHGLNLHPMNLP
        EK+RRS+INEKMKALQ LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ L++ +GL L+PM LP
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Q9FUA4 Transcription factor SPATULA1.9e-4254.88Show/hide
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        SS+SVGA+  NE DE+DCESEEG E +V++ P+    P+ RSSSKR RAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQ+LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQ
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Query:  VQMLSMRHGLNLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSLPSDRERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNVETPFELVPPVQAHLVPFYLSEPSK
        VQML+MR+G+NLHP+ LPG +L  LQLS +R              E  N   L+  +Q A++ + P M +     V + + L P +++H  PF L     
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Query:  EICRD-VLRDPQVNV
        E+ R+  L  P++N+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20180.1 phytochrome interacting factor 3-like 51.2e-2339.17Show/hide
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        P   N         +    DE +  SEE  +  V          +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K L
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Query:  QLQVQMLSMRHGLNLHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSLPSDRERPNQIFLSLPDQKAASIHPFMSDIGRTNVETPFELVPPVQAHLV------PF
        QLQ+QM+SM  G  + PM  PG  QY  + HM M  G        ++  P   F+  P+  AA              + P     P Q H+       P 
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Query:  YLSEPSKEICRDVLRDP
        + S+PS+    +   DP
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AT2G20180.2 phytochrome interacting factor 3-like 51.2e-2339.17Show/hide
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        P   N         +    DE +  SEE  +  V          +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K L
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Query:  QLQVQMLSMRHGLNLHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSLPSDRERPNQIFLSLPDQKAASIHPFMSDIGRTNVETPFELVPPVQAHLV------PF
        QLQ+QM+SM  G  + PM  PG  QY  + HM M  G        ++  P   F+  P+  AA              + P     P Q H+       P 
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Query:  YLSEPSKEICRDVLRDP
        + S+PS+    +   DP
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AT2G20180.3 phytochrome interacting factor 3-like 51.2e-2339.17Show/hide
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Query:  YLSEPSKEICRDVLRDP
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AT4G36930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.3e-4354.88Show/hide
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        E+ R+  L  P++N+
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AT5G67110.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.5e-2246.91Show/hide
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Query:  EKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRHGLNLHPMNLP
        EK+RRS+INEKMKALQ LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ L++ +GL L+PM LP
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTTTCTGCAACAGATTTTGCTACGTTCCTCTTCCGCTACTCCCCACTCCTCTCTCCTCTCTTCCTCTCCCTCCATCTTCTCCGAACTCACCTGCAACATTAGAGCCTTCA
CCCCCCTGTCTCATAACATTCCCCCTTCTTATGGGCCGCCTAATGCAGTACCCGACGAGATCTCTGCCGTCGATTCTTCGGAACAATTTGCAAATTCCTCGTCATCCAGT
GTACTGTATGATCCGTTGCGCTCTTGTCCCACGCCCACTGCTCCTAATGCGTCTTCTACGTCGGTTGGAGCCAATGATCACAACGAAAACGATGAGTTCGACTGCGAAAG
TGAGGAGGGTCTGGAGCCATTGGTTGAAGACCAGCCTACAAAGCCTAATCCTCGCAGTTCTTCCAAGAGAAGCAGAGCCGCCGAAGTTCATAATCTCTCTGAAAAGAGAA
GAAGGAGCAGAATTAATGAGAAAATGAAGGCCCTGCAAAATCTGATCCCCAATTCTAACAAGACAGACAAGGCCTCGATGCTGGACGAAGCAATTGAATATCTGAAGCAG
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TGGTGAAGAAAACAGGTCACTTCCTTCTGACCGAGAGAGACCAAACCAGATTTTTCTGAGTTTGCCTGACCAAAAGGCTGCCTCCATCCATCCTTTCATGTCAGACATTG
GAAGAACTAATGTAGAAACTCCATTTGAATTGGTCCCGCCCGTCCAGGCTCACCTAGTCCCATTTTACTTGAGTGAACCTTCCAAGGAGATTTGCAGAGATGTGCTGCGA
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AGAACCGTGCATCATTCAAGGAAATCGGTCAGGTGTGCTTCTAAACACTCCAGAGCACAGCCTTTTGAATGGCATTGACACAGGAAGACCAACTGAAACAACAGAGCTGC
AATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GTACTGTATGATCCGTTGCGCTCTTGTCCCACGCCCACTGCTCCTAATGCGTCTTCTACGTCGGTTGGAGCCAATGATCACAACGAAAACGATGAGTTCGACTGCGAAAG
TGAGGAGGGTCTGGAGCCATTGGTTGAAGACCAGCCTACAAAGCCTAATCCTCGCAGTTCTTCCAAGAGAAGCAGAGCCGCCGAAGTTCATAATCTCTCTGAAAAGAGAA
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TGGTGAAGAAAACAGGTCACTTCCTTCTGACCGAGAGAGACCAAACCAGATTTTTCTGAGTTTGCCTGACCAAAAGGCTGCCTCCATCCATCCTTTCATGTCAGACATTG
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AATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DPQVNVSQLETTPFVAVSRSYNIAAPDLEELQNGVSIEPCIIQGNRSGVLLNTPEHSLLNGIDTGRPTETTELQ