CuGenDBv2

Gene ID	Spg013280
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	BTP domain-containing protein
Genome location	scaffold1:7166295..7170836
RNA-Seq Expression	Spg013280
Synteny	Spg013280
Gene Ontology terms	GO:0046982 - protein heterodimerization activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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XP_008440528.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484926 isoform X1 [Cucumis melo]

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XP_022133243.1 uncharacterized protein LOC111005886 isoform X1 [Momordica charantia]

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XP_038883592.1 uncharacterized protein LOC120074514 isoform X1 [Benincasa hispida]

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XP_038883593.1 uncharacterized protein LOC120074514 isoform X2 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

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A0A1S3B1B3 uncharacterized protein LOC103484926 isoform X1

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A0A1S3B1Y3 uncharacterized protein LOC103484926 isoform X2

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A0A5A7SZ36 Transcription initiation factor TFIID subunit 8, putative isoform 1

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A0A6J1BUQ7 uncharacterized protein LOC111005886 isoform X2

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A0A6J1BYK1 uncharacterized protein LOC111005886 isoform X1

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT5G65540.1 unknown protein

3.2e-46

67.57

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        S+A+SKLNPNYL LHGDDVY+TLEN S +   QREG +  N +  K L
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Sequences

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CDS sequence

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ATGGCTCTCCTCGGCGACGATGGTCGGGGCTATGAGCTAGCTCGAAAACTTGAGACGCTTGGTGTATGGCGGACTTGGCTCGGAGATTTCAACTACTCCATCTTCGTGCC
CTTTCTCTCTTCGACTTCCACATGGGAAACATTCATGAGAACTGACGATTCAAAATCTAGGGCTCAGATCCAGCTTCAACTCAGGGCTCGAGCCCTCCTCTTCGACAAAG
CAAGCGTCTCCCTCTTCCTGCGTTCCACTCCCTCACCTTCTTCGCCTTCTTATTCTGCTCCGAATCCTTTATCGTCCTCTTCTCTGGCTATTTCGAAGCTCAATCCTAAT
TACTTGCTGCTTCATGGTGACGATGTGTATTTTACACTAGAAAACCCTTCAAAAGATGGGGTTCAACAGCGGGAGGGTCATGTTTCATCCAATAAGGCTTCCGGCAAGGT
TCTATGCTATGCTCCTTAA

mRNA sequence

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Protein sequence

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YLLLHGDDVYFTLENPSKDGVQQREGHVSSNKASGKVLCYAP

Spg013280 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome