; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg013640 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg013640
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionPPPDE domain-containing protein
Genome locationscaffold3:47129178..47131365
RNA-Seq ExpressionSpg013640
SyntenySpg013640
Gene Ontology termsGO:0016579 - protein deubiquitination (biological process)
GO:0101005 - ubiquitinyl hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008580 - PPPDE peptidase domain
IPR042266 - PPPDE peptidase domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058719.1 deSI-like protein [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-11182.81Show/hide
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XP_023515344.1 deSI-like protein At4g17486 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-11082.28Show/hide
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XP_038899104.1 deSI-like protein At4g17486 [Benincasa hispida]1.7e-11083.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBP9 PPPDE domain-containing protein4.0e-11082.03Show/hide
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A0A1S3CEJ5 deSI-like protein At4g174861.1e-11082.03Show/hide
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A0A5A7UYX3 DeSI-like protein1.3e-11182.81Show/hide
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A0A6J1H916 deSI-like protein At4g174869.6e-11282.68Show/hide
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A0A6J1KRJ3 deSI-like protein At4g174864.0e-11081.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
H2KZK4 Desumoylating isopeptidase 1 homolog2.5e-2434.52Show/hide
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        V LNVYD+  +N YA   G+G+FHSG++                               GVEYA+G H Y  +G+FE  P+      + F+F+++++VG+
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        T+   +++R L++ L + ++G+ Y+LI++NCNHF      +LTG  IP W+NRLA     I FL  C+
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Q5PQ09 Deubiquitinase DESI21.1e-2232.57Show/hide
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        P+ LNVYD+  IN Y    G+GVFHSG+Q                              +G E+A+G H Y  +G+FE  P       D F+F++ + +G
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         TD    ++  ++EEL + YKGNAY+L+ KNCNHF +     L G  IP WVNRLA     + FL +C+    L    ++         ++ E + EL  
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Query:  ESTKTPNSNSSSSATSSP
        E  +   +++S+S T+ P
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Q5R456 Deubiquitinase DESI21.5e-2131.67Show/hide
Query:  GGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQC----DGFRFRKT
        G +  V LNVYD+  +N Y    G+GVFHSG++                              +G E+A+G H Y  +GIFE  P       + F+F++ 
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Query:  VLVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLAR----IGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKK
        V++G TD    ++  ++EEL + YKGNAY+L+ KNCNHF +     L G  IP W+NRLA     I FL +C+    L    ++         V+ E + 
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Query:  ELTSESTKTPNSNSSSSATSS
        EL        +++++S+A  S
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Q6DC39 Deubiquitinase DESI21.8e-2233.17Show/hide
Query:  PVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQC----DGFRFRKTVLVG
        PV LNVYD+  IN +    G+GVFHSG++                              +G E+A+G H Y  +GIFE  P       + F+F++ +++G
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Query:  KTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLAR----IGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKKELTS
         TD    +V  ++EE+ + YKGNAY+L+ KNCNHF +     L G  IP WVNRLA     + FL +C+    L    ++     E +    E +    S
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Query:  ESTKT
         ST T
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Q93VG8 DeSI-like protein At4g174863.4e-4546.2Show/hide
Query:  PVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDM
        PVYLNVYDLTP+N Y YWFG+G+FHSG++A                             H +EY +GAHEY T+G++E  P+ C GF FR++VL+G T M
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Query:  KPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRI
          ++ R+ ME+L++ Y G+ Y+LI KNCNHF  + C++LTG  IP W+NRLAR+G  CNC+LP ++  T +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G47740.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein2.1e-5045.45Show/hide
Query:  GSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGK
        G  PVYLNVYDLTPINGY YW GLG+FHSGV+                              HGVEYAFGAH+Y+T+G+FE  P+QC GF+F+K++ +G 
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Query:  TDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKKELTSESTKT
        T++ PT+VR  ME++A  Y GN Y+LI KNCNHFC D C KLTG  IP WVNRLA+IG +C+C+LP +L  T + H    + ++   E +K     S   
Subjt:  TDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKKELTSESTKT

Query:  PNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTRRAPPPSSPLFSHSSSSS
         +S S      S  S F   +S  R   PP     S S+SSS
Subjt:  PNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTRRAPPPSSPLFSHSSSSS

AT1G80690.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein1.8e-7055.69Show/hide
Query:  LLFKKPAGKPTGGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCD
        +L +K +     G+VPVYLNVYDLTPINGYAYW GLGV+HSGV+                              HG+EYA+GAHEY +TGIFEG PKQC+
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Query:  GFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTME
        GF FRK++L+GKTD+ P EVRA ME+LA  YKG++YNLITKNCNHFC++ CIKLTGN IP+WVNRLARIGF+CNCVLP T+N+TR  ++   +DK    E
Subjt:  GFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTME

Query:  T-KKELTSESTKTPNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTR--RAPPPSSPLFSHSSS
          KK+LTS S++  ++ ++ S++SS  S   RGRSR R  RA  PSSPL   SSS
Subjt:  T-KKELTSESTKTPNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTR--RAPPPSSPLFSHSSS

AT2G25190.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein1.3e-5750.19Show/hide
Query:  MLLFK-KPAGKPTGGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQ
        ML FK     K   GSVPVYLNVYDLTP+N Y YW GLGVFHSGV+                              HGVEYAFGAHE S+TGIFE  PK+
Subjt:  MLLFK-KPAGKPTGGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQ

Query:  CDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVT
        C GF FRK++LVGKTD+   EVR  ME+LA+ Y+GN Y+LIT+NCNHFCN+ C+KL   SIP WVNRLAR+G LCNCVLP  LN  ++R   R+    ++
Subjt:  CDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVT

Query:  METKKELTSESTKTPNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTRRAPPPSSPLFSHSSSSSS
           KK+L + S   P  +SS S+     ST    RS  R     + P  S SSSS S
Subjt:  METKKELTSESTKTPNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTRRAPPPSSPLFSHSSSSSS

AT4G31980.1 unknown protein1.2e-5346.28Show/hide
Query:  KPTGGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTV
        K   G+VPVYLNVYDLTP+N Y YW G+G++HSG++                              HGVEY +GAHE S++GIFE  PK+C GF FRK++
Subjt:  KPTGGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTV

Query:  LVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHR-----IEDKVVTMETKK
        LVG+T+MK  EVR+ ME+L++ Y+GN Y+LIT+NCNHFCN   +KLT  SIP+WVNRLAR+GFLCNCVLP  LN T+++   +     +E +    + +K
Subjt:  LVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHR-----IEDKVVTMETKK

Query:  ELTSESTKTPNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTRRAPPPSSP
        +    S   P S+SSS+A      T  R  S T   P  +SP
Subjt:  ELTSESTKTPNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTRRAPPPSSP

AT5G25170.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein4.8e-6353.22Show/hide
Query:  KPTGGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTV
        K   GSVPVYLNVYDLTPINGYAYW GLG++HSGV+                              HGVEY FGAH++STTGIFE  PKQC GF FRK++
Subjt:  KPTGGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTV

Query:  LVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKKELTSE
        L+G+TD+ P  VR  ME+LA+ Y GN+Y+LITKNCNHFCND C++LT  SIP+WVNRLAR G  CNCVLP  LN T++R     E+K+  +E KK+L S 
Subjt:  LVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKKELTSE

Query:  STKTPNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTRRAPP
        S++ P   S SS  S   +  RRG  R +  PP
Subjt:  STKTPNSNSSSSATSSPCSTFRRGRSRTRRAPP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGTTGTTTAAGAAACCCGCCGGAAAACCCACCGGAGGATCCGTCCCGGTGTACCTGAATGTGTACGATCTGACCCCGATCAATGGCTACGCTTACTGGTTTGGCCT
TGGCGTTTTCCATTCCGGAGTTCAAGCTCTATTGCTGGTTTTGCGTTTTTTTTGTGATCTTGCTAATTCGTTGATGCGATGCGATGCGATATGCGGCGTTTCTCTTGTCC
TGTTTCATGGCGTGGAATACGCATTTGGAGCTCACGAGTACTCAACAACAGGAATTTTTGAAGGAGTGCCGAAGCAATGCGATGGGTTTAGATTTAGGAAGACAGTTTTG
GTAGGCAAAACAGATATGAAACCAACAGAGGTGAGAGCTTTAATGGAGGAACTTGCCCAAATCTACAAGGGAAATGCTTACAATTTAATCACCAAAAATTGCAACCATTT
TTGCAATGATGCTTGTATTAAACTCACAGGGAATTCCATTCCAAATTGGGTAAATCGCCTTGCTAGAATTGGCTTTCTTTGCAATTGTGTTCTACCGGTGACCTTGAATT
CCACCAGAATCAGGCACCACCACAGAATTGAAGACAAGGTTGTAACCATGGAAACAAAGAAGGAATTGACAAGTGAATCAACCAAAACTCCCAATTCTAATTCTTCTTCA
TCTGCAACTTCTTCCCCTTGCTCGACGTTTCGCCGAGGAAGAAGTCGGACGAGACGAGCTCCTCCTCCATCTTCTCCATTGTTTTCTCATTCTTCGTCCTCATCGTCATG
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTGTTGTTTAAGAAACCCGCCGGAAAACCCACCGGAGGATCCGTCCCGGTGTACCTGAATGTGTACGATCTGACCCCGATCAATGGCTACGCTTACTGGTTTGGCCT
TGGCGTTTTCCATTCCGGAGTTCAAGCTCTATTGCTGGTTTTGCGTTTTTTTTGTGATCTTGCTAATTCGTTGATGCGATGCGATGCGATATGCGGCGTTTCTCTTGTCC
TGTTTCATGGCGTGGAATACGCATTTGGAGCTCACGAGTACTCAACAACAGGAATTTTTGAAGGAGTGCCGAAGCAATGCGATGGGTTTAGATTTAGGAAGACAGTTTTG
GTAGGCAAAACAGATATGAAACCAACAGAGGTGAGAGCTTTAATGGAGGAACTTGCCCAAATCTACAAGGGAAATGCTTACAATTTAATCACCAAAAATTGCAACCATTT
TTGCAATGATGCTTGTATTAAACTCACAGGGAATTCCATTCCAAATTGGGTAAATCGCCTTGCTAGAATTGGCTTTCTTTGCAATTGTGTTCTACCGGTGACCTTGAATT
CCACCAGAATCAGGCACCACCACAGAATTGAAGACAAGGTTGTAACCATGGAAACAAAGAAGGAATTGACAAGTGAATCAACCAAAACTCCCAATTCTAATTCTTCTTCA
TCTGCAACTTCTTCCCCTTGCTCGACGTTTCGCCGAGGAAGAAGTCGGACGAGACGAGCTCCTCCTCCATCTTCTCCATTGTTTTCTCATTCTTCGTCCTCATCGTCATG
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLLFKKPAGKPTGGSVPVYLNVYDLTPINGYAYWFGLGVFHSGVQALLLVLRFFCDLANSLMRCDAICGVSLVLFHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVL
VGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACIKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKKELTSESTKTPNSNSSS
SATSSPCSTFRRGRSRTRRAPPPSSPLFSHSSSSSS