; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg013750 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg013750
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationscaffold3:44536145..44536501
RNA-Seq ExpressionSpg013750
SyntenySpg013750
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-4985.59Show/hide
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XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]6.3e-4478.81Show/hide
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XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]9.0e-5188.14Show/hide
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XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]2.2e-4985.59Show/hide
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XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]4.5e-5086.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein3.0e-4478.81Show/hide
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A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like1.2e-4378.81Show/hide
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A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like1.2e-4378.81Show/hide
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A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 334.4e-5188.14Show/hide
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A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like1.1e-4985.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 337.2e-2759.09Show/hide
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        P   I AILTV       TS  S  +V     ++C+G++A+C +   + EFEMDSEINRRILA  KYISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY+
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Q945T0 Rapid alkalinization factor6.1e-2654.95Show/hide
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        L  C +     +S  A  A  + +  WV+   +   C GS+ +C+ ++ EFE+DSE NRRILA  KYISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+PGA+ANPY+
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        RGCSAI RCRS
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 235.4e-2250.82Show/hide
Query:  ITAILTVSSTAVLATSTESPSWVLD--GARARCHGSMAKCMMD-------DI---------EFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYY
        I  IL V + +V A S++S  +  D       C G++A+C +        D+         EFEMDSEINRRILA  +YISY AL+ N +PCSRRGASYY
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        NC+ GA+ANPY+RGCSAI RCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.4e-2454.95Show/hide
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        + AIL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+A+C+ ++ E E DS+I+RRILA  KYISY A++ N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY
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        +RGCS I RCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.4e-2558.72Show/hide
Query:  ITAILTVSSTAV---LATSTESPSWVLDGAR-ARCHGSMAKCMMDDIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I  +  +SS  V    A      +W   G   + CHGS+A+C+  + E EMDSEINRRILA  KYISY +LK N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY+RG
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Query:  CSAIARCRS
        CS IARCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 19.7e-2758.72Show/hide
Query:  ITAILTVSSTAV---LATSTESPSWVLDGAR-ARCHGSMAKCMMDDIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I  +  +SS  V    A      +W   G   + CHGS+A+C+  + E EMDSEINRRILA  KYISY +LK N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY+RG
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Query:  CSAIARCRS
        CS IARCRS
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AT1G28270.1 ralf-like 45.9e-1662.5Show/hide
Query:  DDIEFEMDSEINRRILA-DLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAIARC
        D++E  MDSE NRR LA   +YI YDALK N VPCSRRG SYY+C+     NPY RGCSAI  C
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AT3G05490.1 ralf-like 222.4e-2554.95Show/hide
Query:  ITAILTVSSTAVLATSTESPSWVLDGARA-------RCHGSMAKCMMDDIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPY
        + AIL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+A+C+ ++ E E DS+I+RRILA  KYISY A++ N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY
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Query:  NRGCSAIARCR
        +RGCS I RCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 233.8e-2350.82Show/hide
Query:  ITAILTVSSTAVLATSTESPSWVLD--GARARCHGSMAKCMMD-------DI---------EFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYY
        I  IL V + +V A S++S  +  D       C G++A+C +        D+         EFEMDSEINRRILA  +YISY AL+ N +PCSRRGASYY
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Query:  NCQPGAEANPYNRGCSAIARCR
        NC+ GA+ANPY+RGCSAI RCR
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AT4G15800.1 ralf-like 335.1e-2859.09Show/hide
Query:  PFCFITAILTVSSTAVLATSTESPSWVLDGARARCHGSMAKCMMD--DIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYN
        P   I AILTV       TS  S  +V     ++C+G++A+C +   + EFEMDSEINRRILA  KYISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY+
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Query:  RGCSAIARCR
        RGCSAI RCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCAAGGTTTCTTTTCTCCTTCCATTCTGCTTCATCACTGCAATCCTTACCGTCTCCTCCACTGCAGTATTGGCCACCAGCACCGAGAGTCCGAGCTGGGTCTT
GGATGGAGCTCGAGCTCGCTGTCACGGCTCCATGGCAAAGTGCATGATGGACGACATTGAATTCGAGATGGACTCAGAAATCAATAGGCGCATATTGGCAGATCTAAAGT
ACATAAGCTATGACGCACTCAAGGCCAACAAGGTGCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCCGAGGCGAACCCCTACAACCGAGGCTGC
AGTGCTATTGCTCGTTGCCGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCAAGGTTTCTTTTCTCCTTCCATTCTGCTTCATCACTGCAATCCTTACCGTCTCCTCCACTGCAGTATTGGCCACCAGCACCGAGAGTCCGAGCTGGGTCTT
GGATGGAGCTCGAGCTCGCTGTCACGGCTCCATGGCAAAGTGCATGATGGACGACATTGAATTCGAGATGGACTCAGAAATCAATAGGCGCATATTGGCAGATCTAAAGT
ACATAAGCTATGACGCACTCAAGGCCAACAAGGTGCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCCGAGGCGAACCCCTACAACCGAGGCTGC
AGTGCTATTGCTCGTTGCCGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKVSFLLPFCFITAILTVSSTAVLATSTESPSWVLDGARARCHGSMAKCMMDDIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGC
SAIARCRS