| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575551.1 Nuclear pore complex protein NUP50B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.5e-213 | 87.55 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEED+SEQE GTFKRAS+EVLATRRIVKVRRGQTASA SSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDA+A GEKTG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
SDEA KDVSH + +KDG H+DEPAE K+DTSEAESVPNVQNVDQNSTV SESAI ++DD V E NKIENE AGEDK NEELVRD KAENDECVSGG
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
Query: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
KN+N DPA+G+KNENEDPAR KNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEE KE+GSE +P K+A PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTG +TSTFSFGNIPK
Subjt: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
DGVGLTASFGLS NGSSALFG+SGSS VSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNV TSGTGR RILMRARGNYR
Subjt: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
Query: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
LILNASLYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS SEGKDGLST+ LKF+D SIVEEFRAA+TEHKGKASTVLKTPENSP
Subjt: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
|
|
| KAG7014097.1 Nuclear pore complex protein NUP50A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 6.7e-214 | 87.55 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEED+SEQE GTFKRAS+EVLATRRIVKVRRGQTASA SSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDA+A GEKTG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
SDEA KDVSH + +KDG H+DEPAE K+DTSEAESVPNVQNVDQNSTV SESAI ++DD V E NKIENE AGEDK NEELVRD+KAENDECVSGG
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
Query: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
KN+N DPA+G+KNENEDPAR KNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEE KE+GSE +P K+A PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTG +TSTFSFGNIPK
Subjt: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
DGVGLTASFGLS NGSSALFG+SGSS VSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNV TSGTGR RILMRARGNYR
Subjt: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
Query: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
LILNASLYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS SEGKDGLST+ LKF+D SIVEEFRAA+TEHKGKASTVLKTPENSP
Subjt: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
|
|
| XP_022953734.1 nuclear pore complex protein NUP50B-like [Cucurbita moschata] | 2.5e-216 | 88.19 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEED+SEQE GTFKRAS+EVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQA GEKTG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
SDEA KDVSH + +KDG H+DEPAE K+DTSEAESVPNVQNVDQNSTV SESAI ++DD V E NKIENE AGEDK NEELVRD+KAENDECVSGG
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
Query: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
KN+N DPA+G+KNENEDPAR KNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEE KE+GSE +P K+A PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTG +TSTFSFGNIPK
Subjt: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
DGVGLTASFGLS NGSSALFG+SGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVF+ADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGR RILMRARGNYR
Subjt: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
Query: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
LILNASLYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS SEGKDGLST+ LKF+D SIVEEFRAA+TEHKGKASTVLKTPENSP
Subjt: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
|
|
| XP_023548163.1 nuclear pore complex protein NUP50B-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.1e-216 | 88.19 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEED+SEQETGTFKRAS+EVLATRRIVKVRRGQ ASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQA GEKTG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
SDEAN KDVSH + +KDG H+DEPAE K+DTSEAESVPNV +VDQNSTV SESAI ++DD V E NKIENE AGEDK NEELVRD+KAENDECVSGG
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
Query: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
KN+N DPA+G+KNENEDPAR KNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEE KE+GSE +P K+A PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTG +TSTFSFGNIPK
Subjt: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
DGVGLTASFGLS NGSSALFG+SGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGR RILMRARGNYR
Subjt: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
Query: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
LILNASLYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS SEGKDGLST+ LKF+D SIVEEFRAA+TEHKGKASTVLKTPENSP
Subjt: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
|
|
| XP_038898125.1 nuclear pore complex protein NUP50A-like [Benincasa hispida] | 3.8e-217 | 89.52 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEED+SEQETGTFKRAS+EVLATRRIVKVRRG TASAPSSNPFAGIRLVPPTE+SGS +EVKSD Q GEK
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRD--DKAENDECVS
SDEANGKDVS+ T+KDGDH+DEPAE K DTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAI KVDD VAESNKIENEE AG DKT NEE+VRD +AENDECVS
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRD--DKAENDECVS
Query: GGKNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNI
GGKNENEDPARGDKNENED AR DKNENEEPS GNEI+NKETG+QEKTENE KE SEAEP KEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNI
Subjt: GGKNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNI
Query: PKDGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGN
PKDG GLT SFGLSNNGSSALFG+SGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGR RILMRARGN
Subjt: PKDGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGN
Query: YRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGK-ASTVLKTPENSP
YRLILNASLYPDMKLTNMDK+GITFAC+NSTSEGKDGLSTF +KFKD SIVEEFRAAVTEHKGK ASTVLKTPENSP
Subjt: YRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGK-ASTVLKTPENSP
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S4E3Q0 nuclear pore complex protein NUP50A isoform X1 | 2.6e-203 | 84.7 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DD+ED+SEQETGTFKRAS+EVLATRRIVKVRRG TASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGS +EV+ D +A EK G
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRD--DKAENDECVS
SDEANGKD+ H T+KDGDH+DEP + KIDTSEA+SVP VQ VDQNSTV+SESAI KVDD LV ESNKIENEE AG DKT NEELVRD ++ENDECVS
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRD--DKAENDECVS
Query: GGKNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNI
DKNE+E PAR DKNENEEPSEGNEIQNKETG+QEKTENEE KED SE EP KEAAPL+SFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNI
Subjt: GGKNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNI
Query: PKDGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGN
PKDGVGLT SFGLSNNGSSALFG+SGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGR RILMRARGN
Subjt: PKDGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGN
Query: YRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKA-STVLKTPENSP
YRLILNASLYPDMKLTNMDK+GITFAC+NST +GKDGLSTF +KFKD SIVEEFRAAVTEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt: YRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKA-STVLKTPENSP
|
|
| A0A6J1GQJ1 nuclear pore complex protein NUP50B-like | 1.2e-216 | 88.19 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEED+SEQE GTFKRAS+EVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQA GEKTG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
SDEA KDVSH + +KDG H+DEPAE K+DTSEAESVPNVQNVDQNSTV SESAI ++DD V E NKIENE AGEDK NEELVRD+KAENDECVSGG
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
Query: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
KN+N DPA+G+KNENEDPAR KNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEE KE+GSE +P K+A PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTG +TSTFSFGNIPK
Subjt: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
DGVGLTASFGLS NGSSALFG+SGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVF+ADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGR RILMRARGNYR
Subjt: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
Query: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
LILNASLYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS SEGKDGLST+ LKF+D SIVEEFRAA+TEHKGKASTVLKTPENSP
Subjt: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
|
|
| A0A6J1HNF6 nuclear pore complex protein NUP50A-like | 3.9e-207 | 86.95 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDE+D+SEQ TGTFKRASDEVLA RRIVKVRRGQTAS PSSNPFAGIRLVPPT+NSGSASE KS AQAVGEKTG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
SDEANGKDVSH E KKDGDHNDEPAE KIDTSEAES NVQNVDQNST VSESAIPKVDD LVAESNKIENE AGEDKTKNEEL+ D AEND CVSGG
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
Query: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
KNENEDPARG ++NENEEP EGNE+ NKETGDQEK E+EE KE+GSEA+ KEA+PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFST+TFSFGN+ K
Subjt: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
DG GL++SFGLSNNGSSALF + SS VSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF+DGSWKERGKGELKVNVPT GTGR RILMRARGNYR
Subjt: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
Query: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKA-STVLKTPENSP
LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFAC+NSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKA-STVLKTPENSP
|
|
| A0A6J1JV59 nuclear pore complex protein NUP50B-like | 4.7e-213 | 87 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEED+SEQE GTFKRAS+EVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTEN+GSASEVKSDAQA GEKTG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
S+EA KDVSH + +KDG H+DEPAE K+DTSEAESVPNVQNVDQNSTV SESAI ++DD V E NKIENE AGEDK NEELVRD+KAENDECVSGG
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
Query: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENE---ETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGN
KN+N DPA+G+KNENEDPAR KNENEEP EGNEIQNKETGDQEK ENE E KE+GSE +P K+A PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTG TSTFSFGN
Subjt: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENE---ETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGN
Query: IPKDGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARG
IPKDGVGLTASFGLS NGSSALFG+SGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGR RILMRARG
Subjt: IPKDGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARG
Query: NYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
NYRLILNASLYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS SEGKDGLST+ LKF+D SIVEEFRAA+TEHKGKASTVLKTPENSP
Subjt: NYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPENSP
|
|
| A0A6J1KFN4 nuclear pore complex protein NUP50A-like | 3.0e-207 | 87.16 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDE+D+SEQ TGTFKRASDEVLA RRIVKVRRGQTAS PSSNPFAGIRLVPPT+NSGSASE KS+AQAVGEKTG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGEKTG
Query: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
SDEANGKDVSH E KKDGDHNDEPAE KIDTSEAES NVQNVDQNST+VSESAIPKVDD LVAESNKIENE AGEDKTKNEEL+ + AEND CVSGG
Subjt: SDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAENDECVSGG
Query: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
KNENEDPA+G ++NENEEP EGNEIQNKETGDQEK ENEE KE GSEA+ KEA+PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFST+TFSFGNI K
Subjt: KNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
DG GL++SFGLSNNGSSALF + SS VSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF+DGSWKERGKGELKVNVPT GTGR RILMRARGNYR
Subjt: DGVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYR
Query: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKA-STVLKTPENSP
LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFAC+NSTSE KDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt: LILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKA-STVLKTPENSP
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0B4K7J2 E3 SUMO-protein ligase RanBP2 | 1.8e-12 | 34.53 | Show/hide |
Query: PSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT----NMDKKGITFACVNSTSEG
P EV V TGEE E + F + + LF ++D WKERG G +K+ + TG R+LMR +++ N ++ D+ + + DKK + +A N ++
Subjt: PSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT----NMDKKGITFACVNSTSEG
Query: KDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPE
+ L F ++FK + EEFR A T KAS K+ E
Subjt: KDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASTVLKTPE
|
|
| Q6PDH4 Ran-binding protein 3-like | 2.6e-06 | 29.93 | Show/hide |
Query: LSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF--IDGSWKERGKGELKVNVPTS---GTGRPRILMRARGNYRLILNA
+SN+ S S+ S+ S ++++ V TGEE E V + +F F SW ERG+G L++N GT + R++MR +G+ RL+LN+
Subjt: LSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF--IDGSWKERGKGELKVNVPTS---GTGRPRILMRARGNYRLILNA
Query: SLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALK
L+ MK+ +K + + +T DG+ F ++
Subjt: SLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALK
|
|
| Q9C829 Nuclear pore complex protein NUP50A | 9.2e-89 | 47.26 | Show/hide |
Query: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAP--SSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGE
MGD+EN +KKR A ++LSRDNPGLDD++D +E E+GTFK+ASDEVLA+RRIV+V+R + ++AP +SNPFAGI+LVP T + +++ V ++A
Subjt: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRRGQTASAP--SSNPFAGIRLVPPTENSGSASEVKSDAQAVGE
Query: KTGSDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAE----SNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAEN
K EA +D + D + DE +K+D +A + D++ +SA +V VA+ + N + G D+T D E
Subjt: KTGSDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAE----SNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAEN
Query: DECVSGGKNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTF
D SGG D+ E +E EGN I+ EA+ + SSFQQ SS++NAFTGLA T S S+F
Subjt: DECVSGGKNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSEAEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTF
Query: SFGNIPKD---GVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPR
SFG + +D G G FGL ++ SS++FG++GSSI+ KSE SGFP QEV+ ETGEENE+V F+ADSI+FE++DG WKERGKGELKVNV +S G+ R
Subjt: SFGNIPKD---GVGLTASFGLSNNGSSALFGSSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRPR
Query: ILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKG---------KASTVLKTPENSP
++MRA+GNYRLILNASLYP+MKL NMDKKGITFACVNS SEGK+GLSTFALKFKD +IVEEFR A+ +HK K++ LKTPENSP
Subjt: ILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKG---------KASTVLKTPENSP
|
|
| Q9LW88 Nuclear pore complex protein NUP50B | 1.3e-82 | 44.87 | Show/hide |
Query: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGL-DDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRR-GQTASA-PSSNPFAGIRLVP---PTENSGSASEVKSDAQ
MGD++NA ++KR A +ELSRDNPGL DD+ED S E+GTF AS EVLA+RRI++VRR ++A+A P+SNPF GIRLVP P ++ +A K +
Subjt: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGL-DDEEDISEQETGTFKRASDEVLATRRIVKVRR-GQTASA-PSSNPFAGIRLVP---PTENSGSASEVKSDAQ
Query: AVGEKTGSDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAEN
E ++ + G++K+ D D +++ E S +D +SE A+ V+ N+ E + + EE V+DD
Subjt: AVGEKTGSDEANGKDVSHGETKKDGDHNDEPAERKIDTSEAESVPNVQNVDQNSTVVSESAIPKVDDILVAESNKIENEELAGEDKTKNEELVRDDKAEN
Query: DECVSGGKNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSE-AEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTST
N N EG++ K+TG + TE E + DG+E E ++ LSSF Q SSS+NAFTGLA TGFS S+
Subjt: DECVSGGKNENEDPARGDKNENEDPARSDKNENEEPSEGNEIQNKETGDQEKTENEETKEDGSE-AEPGKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTST
Query: FSFGNIPKDG------VGLTASFGLSNNGSSALFGSS-GSSIVSKSEK--SGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPT
FSFG +P++G + SFG +NNG+S+LFG+S +SI +KS + + FPS Q+V+VETGEENE+ F ADS++FE+++G WKERGKGELKVN+ T
Subjt: FSFGNIPKDG------VGLTASFGLSNNGSSALFGSS-GSSIVSKSEK--SGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPT
Query: SGTGRPRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHK------GKASTVLKTPENSP
+ + R++MR++GNYRL LNASLYP+MKL MDKKGITFACVNS S+ KDGLST ALKFKD ++VEEFRA + EHK +A+ LKTPENSP
Subjt: SGTGRPRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACVNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHK------GKASTVLKTPENSP
|
|