| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575671.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.7e-118 | 90.66 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH SIKP E PQ LS+Q LRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR TRLFAVAE A Q+PSSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNTVD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022954328.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 1.7e-118 | 91.05 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH SIKP E PQ LS+Q LRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR TRLFAVAEAA Q+PSSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNTVD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022954329.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 1.7e-118 | 91.05 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH SIKP E PQ LS+Q LRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR TRLFAVAEAA Q+PSSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNTVD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022991923.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 1.3e-118 | 91.05 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH SIKP E PQ LS+Q LRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR TRLFAVAEAA Q+PSSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNTVD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_023548333.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.2e-117 | 90.27 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLI SIKP E PQ LS+Q LRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR TRLFAVAEAA Q+PSSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNTVD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVST+TLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3CEQ4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 3.0e-113 | 89.41 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEE
MASISSIL+PTNLIH S KP E Q LSSQ LRPISFH H LLRISP AA+ PTRLFAVAEAATQ SSVA RKLYIGNIPRNV+NEELTRIV+E
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEE
Query: HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFS
HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANAAIEKLNETEVGGR IKVNITEKP+VNTVDLS+LQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFS
Subjt: HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFS
Query: EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A5A7UYL6 30S ribosomal protein 2 | 3.0e-113 | 89.41 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEE
MASISSIL+PTNLIH S KP E Q LSSQ LRPISFH H LLRISP AA+ PTRLFAVAEAATQ SSVA RKLYIGNIPRNV+NEELTRIV+E
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEE
Query: HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFS
HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANAAIEKLNETEVGGR IKVNITEKP+VNTVDLS+LQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFS
Subjt: HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFS
Query: EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GQT6 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 | 8.1e-119 | 91.05 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH SIKP E PQ LS+Q LRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR TRLFAVAEAA Q+PSSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNTVD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GSN8 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 | 8.1e-119 | 91.05 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH SIKP E PQ LS+Q LRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR TRLFAVAEAA Q+PSSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNTVD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1JXN0 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 6.2e-119 | 91.05 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH SIKP E PQ LS+Q LRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR TRLFAVAEAA Q+PSSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAA--TQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNTVD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 2.8e-31 | 39.13 | Show/hide |
Query: SVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--VNTVDLSLLQAEE
SV +LY+GN+P ++ + +L+ I E G V E++YD+ + RSR FAFVTM +V++A AI + ++VGGRT+KVN E P V + +++
Subjt: SVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--VNTVDLSLLQAEE
Query: SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
F+DSP+K+YV N+S ++++ L++ F+++ +SAKV + +S G+GF+TFSS E + +A+ + N LEG+P+R+N A
Subjt: SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 2.9e-73 | 58.62 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLI-HCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAATQNPSSVA-----ARKLYIGNIPRNVDNEEL
MA+ISSIL L+ HCS + K SSQ L + L++ + ++ R E ++ + +S + AR+LY+GNIPRN++N+EL
Subjt: MASISSILSPTNLI-HCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAATQNPSSVA-----ARKLYIGNIPRNVDNEEL
Query: TRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTET
IVEEHGA+E AEVMYDKYSGRSRRF FVTMKTV+DANA IEKLN+TE+GGR IKVNITEKPL +D++ QAE+SQF++SPYKVY+GN++ TV+ E
Subjt: TRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTET
Query: LKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
LK+FFSEKGKVL AKV R PGTSKS+G+GFV+FSSEEEVEAAI + NN++LEGQ IRVNKA
Subjt: LKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q39061 RNA-binding protein CP33, chloroplastic | 2.1e-31 | 36.6 | Show/hide |
Query: VAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--VNT
V E +S +LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N +++GGRT+KVN E P N
Subjt: VAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--VNT
Query: VDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
V + ++ ++DSP+KVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: VDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 1.6e-71 | 60.63 | Show/hide |
Query: TNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISP-----GLQSSAAKRPTRLFAVAEA----ATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEH
TN++ SIKP T S+ P+ H R + P G S +++ +AV E A +PSS AAR++YIGNIPR V NE+LT++VEEH
Subjt: TNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISP-----GLQSSAAKRPTRLFAVAEA----ATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEH
Query: GAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSE
GAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ DLS+LQ+E+S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSE
Subjt: GAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSE
Query: KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
KGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q9ZUU4 RNA-binding protein CP29B, chloroplastic | 1.1e-27 | 38.92 | Show/hide |
Query: AATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSL
A + S A KL++GN+P NVD+ +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + AA ++ N E+ GR ++VN P S
Subjt: AATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSL
Query: LQAEESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRV
+ S F S +VYVGN+S V L++ FSE+GKV+ A+V + +S G+GFVT+ S +EV+ AI S + A L+G+ IRV
Subjt: LQAEESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRV
Query: NKA
++A
Subjt: NKA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.4e-32 | 35.11 | Show/hide |
Query: MASISSILS------PTNLIH-CSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEE
MA+ S +LS NL+H C+ +T + + +P+ R R ++ K +A +P + KLY GN+P NVD+
Subjt: MASISSILS------PTNLIH-CSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISPGLQSSAAKRPTRLFAVAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEE
Query: LTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTE
L +I+++ E EV+Y++ +G+SR FAFVTM V+D N I+ L+ TE GR +KVN +KP N +E + ++ +K++VGN+S TV++E
Subjt: LTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTE
Query: TLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+L F E G V+ A+V T +S GYGFV +SS+ E+E A+ S + LEG+ IRVN A
Subjt: TLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 7.7e-29 | 38.92 | Show/hide |
Query: AATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSL
A + S A KL++GN+P NVD+ +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + AA ++ N E+ GR ++VN P S
Subjt: AATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSL
Query: LQAEESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRV
+ S F S +VYVGN+S V L++ FSE+GKV+ A+V + +S G+GFVT+ S +EV+ AI S + A L+G+ IRV
Subjt: LQAEESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRV
Query: NKA
++A
Subjt: NKA
|
|
| AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-72 | 60.63 | Show/hide |
Query: TNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISP-----GLQSSAAKRPTRLFAVAEA----ATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEH
TN++ SIKP T S+ P+ H R + P G S +++ +AV E A +PSS AAR++YIGNIPR V NE+LT++VEEH
Subjt: TNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISP-----GLQSSAAKRPTRLFAVAEA----ATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEH
Query: GAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSE
GAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ DLS+LQ+E+S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSE
Subjt: GAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSE
Query: KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
KGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-72 | 60.63 | Show/hide |
Query: TNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISP-----GLQSSAAKRPTRLFAVAEA----ATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEH
TN++ SIKP T S+ P+ H R + P G S +++ +AV E A +PSS AAR++YIGNIPR V NE+LT++VEEH
Subjt: TNLIHCSIKPIETPQKLSSQILRPISFHRRHTLLRISP-----GLQSSAAKRPTRLFAVAEA----ATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEH
Query: GAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSE
GAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ DLS+LQ+E+S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSE
Subjt: GAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSE
Query: KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
KGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 1.5e-32 | 36.6 | Show/hide |
Query: VAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--VNT
V E +S +LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N +++GGRT+KVN E P N
Subjt: VAEAATQNPSSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--VNT
Query: VDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
V + ++ ++DSP+KVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: VDLSLLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
