; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg014261 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg014261
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionHelicase protein MOM1
Genome locationscaffold3:29974613..29979857
RNA-Seq ExpressionSpg014261
SyntenySpg014261
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
GO:0043167 - ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011011 - Zinc finger, FYVE/PHD-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR016197 - Chromo-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607145.1 Helicase protein MOM1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-5073.38Show/hide
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KAG7036834.1 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-5073.38Show/hide
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XP_022949439.1 helicase protein MOM1 isoform X1 [Cucurbita moschata]2.3e-5073.38Show/hide
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XP_022949441.1 helicase protein MOM1 isoform X2 [Cucurbita moschata]2.3e-5073.38Show/hide
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XP_038894573.1 helicase protein MOM1 [Benincasa hispida]8.1e-5172.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GC12 helicase protein MOM1 isoform X31.9e-5073.72Show/hide
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A0A6J1GC13 helicase protein MOM1 isoform X21.1e-5073.38Show/hide
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A0A6J1GCT4 helicase protein MOM1 isoform X11.1e-5073.38Show/hide
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A0A6J1KBB3 helicase protein MOM1 isoform X29.6e-5072.66Show/hide
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A0A6J1KDL3 helicase protein MOM1 isoform X19.6e-5072.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2A8L1 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 57.4e-0726.03Show/hide
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        L CC+   C  S+HL CL+PPL  +P G W CP C    +K  V  +            V      E+    G+ P +P                    L
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        +G+  ++++FVK+  L++ H  W+ E +L L    +   + R+N +
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O16102 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 31.2e-0926.24Show/hide
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        L CC+   C   +H +CL PPL ++P G W CP CI    K       K +   W   R  E+  + G                              ++
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        +++YF+K+  +++ H  W+PE ++LL   S+V+ F RR+ +
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O97159 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein Mi-2 homolog3.3e-0724.09Show/hide
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        L CC+   C  ++H  CL+PPLD +P G W CP C           ++   E +   R  + S+ DG    +                          R 
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Query:  KQYFVKFKDLAHAHNRWLPESELLLEALSLVSRFNRR
        ++YF+K+ ++++ H  W+PE +L +    ++  F R+
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Q14839 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 48.8e-0826.76Show/hide
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        L CC+   C  S+H+ CL+PPL  +P G W CP C    +K  V  +   K  +    T      DAD   P                       L+G +
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         ++Q+FVK++ +++ H  W+ E +L L    +   + R+N +
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Q6PDQ2 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 48.8e-0826.76Show/hide
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        L CC+   C  S+H+ CL+PPL  +P G W CP C    +K  V  +   K  +    T      DAD   P                       L+G +
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Query:  RQKQYFVKFKDLAHAHNRWLPESELLLEALSLVSRFNRRNQV
         ++Q+FVK++ +++ H  W+ E +L L    +   + R+N +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G01460.1 methyl-CPG-binding domain 96.0e-0445.16Show/hide
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        C   +H  CL+PPL  +P G W+CP C+  K
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AT4G12620.1 origin of replication complex 1B3.5e-0448.57Show/hide
Query:  EGKECRRSFHLSCLDPPLDNVPLGVWHCPMCIRRK
        E  +C   FHL CL PPL  VP G W C  C  +K
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AT4G14700.1 origin recognition complex 12.7e-0448.57Show/hide
Query:  EGKECRRSFHLSCLDPPLDNVPLGVWHCPMCIRRK
        E  +C   FHL+CL PPL  VP G W C  C  +K
Subjt:  EGKECRRSFHLSCLDPPLDNVPLGVWHCPMCIRRK

AT5G44800.1 chromatin remodeling 41.4e-0548.57Show/hide
Query:  LRCCEGKECRRSFHLSCLDPPLDNVPLGVWHCPMC
        L CC+   C R++H +CL+PPL  +P G W CP C
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCATCACAGATCCTGCTGGAAATTGTGTTTGGTGTAAGCTGGAAAAAGTATCATGTGACATCGACCCAAATGCATGTCTCATCTGCAAAGTTGGGGGAAAGCTCTTG
TGGGTGTTTCTTCGGCAAGGTGCTGGTTCGTGTTCGGGTTGTTGGGTTCGCCATTGTTGCTGCGTTCGTCTTCTTCGTATTTCGTCATGAACTGAAAACCGATGCCGGTG
AAAAGAAAACTGTTATCATGCTGATTGGTTTCTACTTTATCGCATTTACTTTAAGATGCTGTGAAGGAAAAGAATGCAGAAGAAGCTTCCATCTTTCTTGTCTAGATCCT
CCCTTGGACAATGTTCCTCTTGGAGTTTGGCATTGTCCAATGTGTATTAGAAGGAAGATCAAGTTTGGTGTCCATGCTGTGTCAAAGGGTGTAGAGTCTGTCTGGGATAC
AAGAGAAACAGAGATATCGGATGCTGACGGTGTATGTCCTTTTCAGCCTTTTCTTCTTCTATATGATAATTTTATAATTCTCTTCAGATTCTTTGTTGTCTGTTGTTATC
TTCAAGGGTTGCAAAGGCAGAAGCAATATTTTGTGAAATTTAAAGATCTTGCTCATGCTCATAATCGATGGTTGCCGGAGAGTGAATTGCTTTTAGAAGCCTTAAGCCTT
GTTTCAAGATTTAACAGAAGAAATCAGGTTAGGATTTGTTCTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCATCACAGATCCTGCTGGAAATTGTGTTTGGTGTAAGCTGGAAAAAGTATCATGTGACATCGACCCAAATGCATGTCTCATCTGCAAAGTTGGGGGAAAGCTCTTG
TGGGTGTTTCTTCGGCAAGGTGCTGGTTCGTGTTCGGGTTGTTGGGTTCGCCATTGTTGCTGCGTTCGTCTTCTTCGTATTTCGTCATGAACTGAAAACCGATGCCGGTG
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CCCTTGGACAATGTTCCTCTTGGAGTTTGGCATTGTCCAATGTGTATTAGAAGGAAGATCAAGTTTGGTGTCCATGCTGTGTCAAAGGGTGTAGAGTCTGTCTGGGATAC
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TTCAAGGGTTGCAAAGGCAGAAGCAATATTTTGTGAAATTTAAAGATCTTGCTCATGCTCATAATCGATGGTTGCCGGAGAGTGAATTGCTTTTAGAAGCCTTAAGCCTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSQILLEIVFGVSWKKYHVTSTQMHVSSAKLGESSCGCFFGKVLVRVRVVGFAIVAAFVFFVFRHELKTDAGEKKTVIMLIGFYFIAFTLRCCEGKECRRSFHLSCLDP
PLDNVPLGVWHCPMCIRRKIKFGVHAVSKGVESVWDTRETEISDADGVCPFQPFLLLYDNFIILFRFFVVCCYLQGLQRQKQYFVKFKDLAHAHNRWLPESELLLEALSL
VSRFNRRNQVRICSF