| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA8542646.1 hypothetical protein F0562_023855 [Nyssa sinensis] | 1.2e-38 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAA8547639.1 hypothetical protein F0562_004068 [Nyssa sinensis] | 1.2e-38 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAB1227682.1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 [Morella rubra] | 1.2e-38 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAG8373548.1 hypothetical protein BUALT_Bualt11G0036000 [Buddleja alternifolia] | 5.5e-39 | 94.44 | Show/hide |
Query: VENFETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
VE ETIS+ITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELD++LDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VENFETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_022155134.1 sm-like protein LSM8 [Momordica charantia] | 1.2e-38 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LT86 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 5.9e-39 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A1S3ATI1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 5.9e-39 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6A1WQX6 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 5.9e-39 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1GT46 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 5.9e-39 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1K221 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 5.9e-39 | 98.84 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O95777 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.6e-28 | 63.04 | Show/hide |
Query: VENF--ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+EN+ T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: VENF--ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q3ZCE0 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.6e-28 | 63.04 | Show/hide |
Query: VENF--ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+EN+ T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: VENF--ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q5RCP3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.6e-28 | 63.04 | Show/hide |
Query: VENF--ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+EN+ T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: VENF--ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q6ZWM4 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.6e-28 | 63.04 | Show/hide |
Query: VENF--ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+EN+ T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: VENF--ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q8VYI0 Sm-like protein LSM8 | 2.4e-37 | 87.21 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G19120.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 9.7e-10 | 46.77 | Show/hide |
Query: VITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
V+ DGR ++G+L+ FDQ N +L+E++ERV + + LGLYIIRG+N+ ++GELD E
Subjt: VITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
| AT1G65700.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-38 | 87.21 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.2 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-38 | 87.21 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.3 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 3.1e-32 | 58.14 | Show/hide |
Query: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVLGLYIIRGDNI
+ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STK EGVQQ VLGLYIIRGDNI
Subjt: ETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVLGLYIIRGDNI
Query: SIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: SIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT3G14080.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 8.2e-09 | 45.16 | Show/hide |
Query: VITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
V+ DGR ++G L+ FDQ N +L+ + ERV E + LGLY+IRG+N+ ++GELD E
Subjt: VITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
