; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg014613 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg014613
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionextensin-like
Genome locationscaffold3:41760065..41762849
RNA-Seq ExpressionSpg014613
SyntenySpg014613
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576117.1 hypothetical protein SDJN03_26756, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-18281.24Show/hide
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KAG7014636.1 hypothetical protein SDJN02_24815 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-18281.24Show/hide
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XP_022953380.1 formin-2-like [Cucurbita moschata]1.6e-18281.46Show/hide
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XP_022991372.1 extensin-like [Cucurbita maxima]7.8e-18582.11Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.6e-18381.69Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein4.2e-17678.23Show/hide
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A0A1S3CB81 extensin1.8e-17479.08Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin1.4e-17479.08Show/hide
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        RTWIPH+PPF PPPPPA                                              FDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPP F+PRDPR+WIP IP
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A0A6J1GPH0 formin-2-like7.9e-18381.46Show/hide
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        IPPFF PPPP FDLRDPRTWIPHFPPSPPQ  QNQKP
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A0A6J1JLM5 extensin-like3.8e-18582.11Show/hide
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Query:  PRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHI
        PRTWIPHVPPF PPPPPAFDPRDPRTWIPHIPP + PPPPA                       FDPRDPRTWIP+IPPF+  PPP FDPRDPRTWIPHI
Subjt:  PRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHI

Query:  PPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP
        PPFF PPPP FDLRDPRTWIPHFPPSPPQ  QNQKP
Subjt:  PPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P13983 Extensin1.3e-0441.11Show/hide
Query:  AKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPL-PPFPSF-PLPPLPPLPPL--PPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP--SPPPPSAPPPPPPFSL
        A++P P   S  + P  P YS P P P   PP P++ P PP  P P    PP  Y P PT   PP    P P  P   P PP  SPPPP +  PPPP  L
Subjt:  AKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPL-PPFPSF-PLPPLPPLPPL--PPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP--SPPPPSAPPPPPPFSL

Query:  SDPRTWIPYISPFSPPPP--PPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPF--D
          P    P    FSPPPP    SPPPP + S P   +P  P + PPPP    P       P +PP   PPPPA+ P  P T+ P  P +SP PPP +   
Subjt:  SDPRTWIPYISPFSPPPP--PPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPF--D

Query:  PRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP
        P  P T+ P  P +SP PP P     P    P  P F PPPP    L  P    PH  P PP  T  Q P
Subjt:  PRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 31.4e-0638.43Show/hide
Query:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP---PSP
        LS  P+   +  CG   +  P  +T         PP S P P PP P F + P    PP P  PP  Y P P  P PP +  P PP PP  P P   P P
Subjt:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP---PSP

Query:  PPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPP
        PPP  PPPPP +S   P    P    +SPPPPPP PPPP   S P    P      PPPPP+  P       P  PP   PPPP F P  P  +  + PP
Subjt:  PPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPP

Query:  FSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFF-PPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP
           S PPP  P  P +  P I P+   PPPP     P    P  P +  PPPPP  +   P   I + PP PP       P
Subjt:  FSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFF-PPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.4e-3543.93Show/hide
Query:  SLLLFLFTASFF----DYSFGLTAATPASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVD
        SL +FLF    F      S   ++  P     IT++G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E +TFS NRTT+++G+Y++ I S+D
Subjt:  SLLLFLFTASFF----DYSFGLTAATPASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVD

Query:  GINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSKVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGHK
           C D  ++ S CQASLIG    S   CN+PG RTT++++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
Subjt:  GINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSKVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGHK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein9.7e-0838.43Show/hide
Query:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP---PSP
        LS  P+   +  CG   +  P  +T         PP S P P PP P F + P    PP P  PP  Y P P  P PP +  P PP PP  P P   P P
Subjt:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP---PSP

Query:  PPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPP
        PPP  PPPPP +S   P    P    +SPPPPPP PPPP   S P    P      PPPPP+  P       P  PP   PPPP F P  P  +  + PP
Subjt:  PPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPP

Query:  FSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFF-PPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP
           S PPP  P  P +  P I P+   PPPP     P    P  P +  PPPPP  +   P   I + PP PP       P
Subjt:  FSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFF-PPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP

AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein5.0e-0441.16Show/hide
Query:  PFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP------PSPPPPSAPPP---PPPFSLSDPRTWIPYIS
        P  P  S P P PP P  P  P+ P    PP+ P P F   T P+PPS   P PPLPP+ PSP      PS PPPS P P   PPP S   P    P  +
Subjt:  PFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP------PSPPPPSAPPP---PPPFSLSDPRTWIPYIS

Query:  PFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVP-----PFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP-PLSPPPPPAF--DPRDPRTWIPNIPPF-SPSPPPPF---DPRD
         +SPP PPP PPP FS   P   IP  P     PFPPPPPP      P+T+ P  P P  PP  P +   P  P  ++P+ P F SP PP P+    P+ 
Subjt:  PFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVP-----PFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP-PLSPPPPPAF--DPRDPRTWIPNIPPF-SPSPPPPF---DPRD

Query:  PRTWIPNIPPFSP-----SPPPPFDP--RDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIP-HF--PPSPPQATQNQKP
        P     ++PP +P     SPPPP  P    P    P    + PPPPPT     P    P H+  PPSPP    N  P
Subjt:  PRTWIPNIPPFSP-----SPPPPFDP--RDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIP-HF--PPSPPQATQNQKP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein4.3e-4844.22Show/hide
Query:  ISLLLFLFTASFFDY-SFGLTAATPA------SVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL  LF AS   + + G     P+        +RITVVG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLFLFTASFFDY-SFGLTAATPA------SVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSK---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGH-------KKAKNPDPLTSSKFFLP
        P VDGI+CVDG+ + S C A ++ +SS     C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCG+       K  K       SKFF P
Subjt:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSK---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGH-------KKAKNPDPLTSSKFFLP

Query:  FFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSP
        +  PY FP           +P P LPPLP LPPFP FP       PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+  F P
Subjt:  FFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.1e-3847.02Show/hide
Query:  ISLLLFLFTASFFDYSFGLTAATPASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN
        I LLL L   S    S   ++A P    +ITV+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E +TFS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ 
Subjt:  ISLLLFLFTASFFDYSFGLTAATPASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN

Query:  CVDGM---TMQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCG
        C       ++ + CQASLIG S   CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RPL+KN  LCG
Subjt:  CVDGM---TMQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTCAACCATTTCTCTCCTTCTCTTCCTTTTTACTGCATCTTTCTTCGATTACTCGTTTGGTCTAACGGCTGCAACCCCTGCTTCGGTCACTCGAATCACGGTAGT
CGGCGCGGTATATTGTGACACTTGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAATGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCA
AAATGGCAGAGCAGATGACCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACG
ATGCAGTCGTTTTGCCAAGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCTAAAGTGTGCAATGTCCCGGGTTTAAGAACTACATCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAA
TCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCATTGAAGAAGAATGCAAGCTTATGTGGGCATAAGAAAGCAAAAAATCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGT
TTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCTTCCCTTTCCCCTTACCTCCTTTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTTCCTCCATTGCCCCCT
TTTCCATATTTTCCACTCCCTACTTGTCCAAACCCGCCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCCTTGCCTCCTTTATTCCCTTCACCTCCTAGTCCACCTCCCCCATCTGC
ACCACCTCCGCCGCCTCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATATTTCTCCATTTTCTCCACCACCGCCTCCGCCATCTCCGCCACCTCCATTTAGTC
TCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTCCCCCTCCTCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCCCCATTA
TCTCCTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCTAGAGACCCCAG
AACATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCCAGAGACCCTAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCAC
CTCCTACATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACCTGGATACCCCATTTCCCTCCATCCCCACCACAGGCCACTCAAAATCAAAAGCCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTCAACCATTTCTCTCCTTCTCTTCCTTTTTACTGCATCTTTCTTCGATTACTCGTTTGGTCTAACGGCTGCAACCCCTGCTTCGGTCACTCGAATCACGGTAGT
CGGCGCGGTATATTGTGACACTTGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAATGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCA
AAATGGCAGAGCAGATGACCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACG
ATGCAGTCGTTTTGCCAAGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCTAAAGTGTGCAATGTCCCGGGTTTAAGAACTACATCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAA
TCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCATTGAAGAAGAATGCAAGCTTATGTGGGCATAAGAAAGCAAAAAATCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGT
TTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCTTCCCTTTCCCCTTACCTCCTTTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTTCCTCCATTGCCCCCT
TTTCCATATTTTCCACTCCCTACTTGTCCAAACCCGCCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCCTTGCCTCCTTTATTCCCTTCACCTCCTAGTCCACCTCCCCCATCTGC
ACCACCTCCGCCGCCTCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATATTTCTCCATTTTCTCCACCACCGCCTCCGCCATCTCCGCCACCTCCATTTAGTC
TCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTCCCCCTCCTCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCCCCATTA
TCTCCTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCTAGAGACCCCAG
AACATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCCAGAGACCCTAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCAC
CTCCTACATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACCTGGATACCCCATTTCCCTCCATCCCCACCACAGGCCACTCAAAATCAAAAGCCCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSTISLLLFLFTASFFDYSFGLTAATPASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMT
MQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPP
FPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPL
SPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP