; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg014932 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg014932
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionPectin lyase-like superfamily protein
Genome locationscaffold3:44796675..44797554
RNA-Seq ExpressionSpg014932
SyntenySpg014932
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043575.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-9181.16Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M+IIAP NSPNTD MHLSTSKLVTI+NSVIGTGDDCVSIG   + I VTN+TCGPGHG+SVGSLGKY KEKSV+ VLV+NCTIFN TNGARIKTWA  +S
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        G A+GIIF DIVMYNVK PIIIDQTYGTKK K S WKISDVHFKNIRGT+ TNVAVLLECS L PC+GVELRDINLTYGG NLRNTTIVSSC NAKI   
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNPLP
        G+QNP P
Subjt:  GMQNPLP

KAA0048661.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-9181.16Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M+IIAP NSPNTD MHLSTSKLVTI+NSVIGTGDDCVSIG   + I VTN+TCGPGHG+SVGSLGKY KEKSV+ VLV+NCTIFN TNGARIKTWA  +S
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        G A+GIIF DIVMYNVK PIIIDQTYGTKK K S WKISDVHFKNIRGT+ TNVAVLLECS L PC+GVELRDINLTYGG NLRNTTIVSSC NAKI   
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNPLP
        G+QNP P
Subjt:  GMQNPLP

KAG7014351.1 Exopolygalacturonase-like 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-9282.44Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M IIAPGNSPNTD MHLSTSKLVTIS+S IGTGDDCVSIG  C+KITVTN+TCGPGHGIS+GSLGKY  EKSV  VLVQNCTIFN TNGARIKTWA T+S
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        GSA GIIF++IVM  VK PIIIDQTYGTKK KASKWKIS+VHFKNIRGT+ TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG +L+NTTIVSSCLNAKI   
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNP
        G+QNP
Subjt:  GMQNP

XP_022153668.1 exopolygalacturonase-like [Momordica charantia]4.1e-9482.61Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M+I APGNSPNTD MHLSTSKLVTIS+SVIGTGDDC+SIG  C+K+TVTN+TCGPGHG+SVGSLGKYPKEKSV GVLV+NCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        GSAT IIF DI+M NVK PIIIDQTYGTK+ K SKW+ISDVHFKNIRGT+ TNVAVLLECSALFPC+GVEL+DINL Y G N RNTTIVSSCLNAKI   
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNPLP
        G+Q P P
Subjt:  GMQNPLP

XP_023549400.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-9181.64Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M IIAPGNSPNTD MHLSTSKLVTIS+S IGTGDDCVSIG  C+KITVTNITCGPGHGIS+GSLG+Y  EKSV  VLVQNCTIFN TNGARIKTWA T+S
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        GSA GIIF++IVM  VK PIIIDQTYGTKK KASKWKIS+VHFKNIRGT+ TNVAVLLECS LFPC+GVELRDINL+YGG + +NTTIVSSCLNAKI+  
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNPLP
        G+QNP P
Subjt:  GMQNPLP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TQ89 Exopolygalacturonase-like5.4e-9281.16Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M+IIAP NSPNTD MHLSTSKLVTI+NSVIGTGDDCVSIG   + I VTN+TCGPGHG+SVGSLGKY KEKSV+ VLV+NCTIFN TNGARIKTWA  +S
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        G A+GIIF DIVMYNVK PIIIDQTYGTKK K S WKISDVHFKNIRGT+ TNVAVLLECS L PC+GVELRDINLTYGG NLRNTTIVSSC NAKI   
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNPLP
        G+QNP P
Subjt:  GMQNPLP

A0A5A7U0D6 Exopolygalacturonase-like7.1e-9281.16Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M+IIAP NSPNTD MHLSTSKLVTI+NSVIGTGDDCVSIG   + I VTN+TCGPGHG+SVGSLGKY KEKSV+ VLV+NCTIFN TNGARIKTWA  +S
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        G A+GIIF DIVMYNVK PIIIDQTYGTKK K S WKISDVHFKNIRGT+ TNVAVLLECS L PC+GVELRDINLTYGG NLRNTTIVSSC NAKI   
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNPLP
        G+QNP P
Subjt:  GMQNPLP

A0A5A7U4W1 Exopolygalacturonase-like5.4e-9281.16Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M+IIAP NSPNTD MHLSTSKLVTI+NSVIGTGDDCVSIG   + I VTN+TCGPGHG+SVGSLGKY KEKSV+ VLV+NCTIFN TNGARIKTWA  +S
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        G A+GIIF DIVMYNVK PIIIDQTYGTKK K S WKISDVHFKNIRGT+ TNVAVLLECS L PC+GVELRDINLTYGG NLRNTTIVSSC NAKI   
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNPLP
        G+QNP P
Subjt:  GMQNPLP

A0A6J1DI36 exopolygalacturonase-like2.0e-9482.61Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M+I APGNSPNTD MHLSTSKLVTIS+SVIGTGDDC+SIG  C+K+TVTN+TCGPGHG+SVGSLGKYPKEKSV GVLV+NCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        GSAT IIF DI+M NVK PIIIDQTYGTK+ K SKW+ISDVHFKNIRGT+ TNVAVLLECSALFPC+GVEL+DINL Y G N RNTTIVSSCLNAKI   
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNPLP
        G+Q P P
Subjt:  GMQNPLP

A0A6J1JSB0 exopolygalacturonase clone GBGE184-like7.1e-9280Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        M I+APGNSPNTD MHLSTS L++ISNS+IGTGDDCVSIG  C+K+TVTN+TCGPGHGISVGSLGKY  E+SV  +LVQNCT+FNTTNG RIKTWAGTVS
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH
        GSA GI F++IVM  VK PIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGT+ TNVAV+LECS LFPC+GVELRDINL+YGG +L+NTT VSSCLNAKI+  
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHH

Query:  GMQNP
        G+QNP
Subjt:  GMQNP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P49062 Exopolygalacturonase clone GBGE1849.3e-4952.22Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        +++ AP  SPNTD +HLS +  V+I +S I TGDDCVS+G+G   +TV  + CGPGHG+SVGSLGKY  E+ V G+ V NCT+  T NG RIKTW G+  
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGG
          A  I F +I+M +VK PIIIDQ YG++    S+  ISD+ FKNIRGT +T   V + CS   PC+GV + D+NL Y G
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGG

Q05967 Polygalacturonase2.7e-4848.31Show/hide
Query:  IIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGS
        + AP NSPNTD +H+S S  V I++S   TGDDC+S+G   +++ +T +TCGPGHGISVGSLG  P EK V GV V+NCT  NT NG RIKTW  +  G 
Subjt:  IIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGS

Query:  ATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIE
           + F DI++ NV  P++IDQ Y       K+  S+ KIS V F+NI+GT+ T  AV L  S   PC+G+E+ DI++TY G   +     SSC N K  
Subjt:  ATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIE

Query:  HHGMQNP
          G QNP
Subjt:  HHGMQNP

Q39766 Polygalacturonase1.3e-5049.29Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        ++I AP  SPNTD +H+  S+ V I  S I TGDDC+SIG G + + +  ITCGPGHGIS+GSLGK+  E+ V G+ + NCTI NT+NGARIKTW G   
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAK
        G+ + I F DI M NV  PI+IDQ Y      KKN+ SK K+S++ FKNIRGT+    A+   CS   PC+ VEL DI++ + G         S CLN K
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAK

Query:  IEHHGMQNPLP
            G  NP+P
Subjt:  IEHHGMQNPLP

Q39786 Polygalacturonase7.6e-5149.29Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        ++I AP  SPNTD +H+  S+ V I  S I TGDDC+SIG G + + +  ITCGPGHGIS+GSLGK+  E+ V G+ + NCTI NT+NGARIKTW G   
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAK
        G+ + I F DI M NV  PI+IDQ Y      KKN+ SK K+S++ FKNIRGT+    A+   CS   PC+ VEL DI++ + G         S CLN K
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAK

Query:  IEHHGMQNPLP
            G  NP+P
Subjt:  IEHHGMQNPLP

Q6H9K0 Exopolygalacturonase (Fragment)3.2e-4945.89Show/hide
Query:  IIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGS
        + APG S NTD +H+  SK VTI+N+ I TGDDC+SIG G Q +T+T + CGPGHGIS+GSLG+Y  EK V G+ V+ CT   T NG R+KTW  +  G+
Subjt:  IIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGS

Query:  ATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIE
        AT + F D+ M NV+ P+I+DQ Y       +   S+ K+S+++F NIRGT+   VAV++ CS   PC  +++ +INL+Y G         S+C N K  
Subjt:  ATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIE

Query:  HHGMQNP
          G Q P
Subjt:  HHGMQNP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02790.1 polygalacturonase 46.6e-5052.22Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        +++ AP  SPNTD +HLS +  V+I +S I TGDDCVS+G+G   +TV  + CGPGHG+SVGSLGKY  E+ V G+ V NCT+  T NG RIKTW G+  
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGG
          A  I F +I+M +VK PIIIDQ YG++    S+  ISD+ FKNIRGT +T   V + CS   PC+GV + D+NL Y G
Subjt:  GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGG

AT3G07840.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.1e-4748.1Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTW-AGTV
        +++IAP  SPNTD +HL  S+ V I NS I TGDDC+S+G G + + V N+ CGPGHGISVGSLG+Y  E+ V G+ V NCT+  T NG RIKTW +   
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTW-AGTV

Query:  SGSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNA
        + +A+GI F +I++ NV  PI+IDQ Y       K K S  K+ D+ FKNIRGT+    AV L CS   PC  VE+ +INL Y G +   T +   C N 
Subjt:  SGSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNA

Query:  KIEHHGMQNP
          +  G QNP
Subjt:  KIEHHGMQNP

AT3G07850.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.1e-4749.49Show/hide
Query:  IIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGS
        I AP  S NTD +H+  S  V +  + I TGDDCVSIG G + + V N+ CGPGHGIS+GSLG+YP E+ V GV V+ C I NT NG RIKTW G+  G 
Subjt:  IIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGS

Query:  ATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAK
        A+ I+F DI M NV  P++IDQ Y      K    S+ K+SDV  K I+GT+ T VAV L CS   PC  + L DINL + G   +    VS+C N K
Subjt:  ATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAK

AT3G14040.1 Pectin lyase-like superfamily protein2.1e-4850.51Show/hide
Query:  IIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGS
        I AP  S NTD +H+  S  V +  + I TGDDCVSIG G + + V N+ CGPGHGIS+GSLG+YP E+ V GV V+ C I NT NG RIKTW G+  G 
Subjt:  IIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGS

Query:  ATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAK
        A+ I+F DI M NV  P++IDQ Y      K    SK K+SDV  KNI+GT+ T VAV L CS   PC  + L DINL + G   +    VS+C N K
Subjt:  ATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAK

AT4G18180.1 Pectin lyase-like superfamily protein9.2e-5250Show/hide
Query:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS
        + I AP +SPNTD +H+  S  V  S S I TGDDCVSIGQG  +IT+T+I CGPGHGISVGSLG+YP EK V G++V++C I  TTNG RIKTWA +  
Subjt:  MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVS

Query:  -GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINL----TYGG----NNLRNTT
          +AT + F +I+M NV  PIIIDQ+Y        N  SK ++S+++FKNIRGT+ + VAV L CS   PCK V L +++L    + GG    +N  N  
Subjt:  -GSATGIIFNDIVMYNVKYPIIIDQTY----GTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINL----TYGG----NNLRNTT

Query:  IVSSCLNAKIEHHGMQNPLP
        + SSC N +  + G Q P P
Subjt:  IVSSCLNAKIEHHGMQNPLP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGCATTATAGCCCCCGGAAATAGTCCCAACACCGACAGAATGCACCTTAGCACCTCGAAATTGGTCACCATTTCTAACAGCGTCATTGGCACCGGTGACGACTGTGT
CTCTATTGGCCAAGGCTGTCAGAAAATCACTGTCACTAATATCACTTGCGGTCCTGGACATGGTATTAGTGTGGGAAGCTTGGGTAAGTATCCCAAAGAAAAGAGTGTCT
TCGGCGTTCTTGTGCAAAACTGCACCATTTTTAACACCACCAATGGAGCTAGAATCAAGACATGGGCTGGCACAGTGTCGGGGTCGGCCACAGGAATAATCTTTAATGAC
ATCGTAATGTACAACGTCAAATACCCCATAATCATCGATCAAACTTATGGCACAAAGAAGAACAAGGCTTCAAAGTGGAAGATCAGCGACGTTCACTTCAAGAACATCCG
CGGGACGGCGGTGACGAACGTGGCAGTGTTGTTGGAGTGCAGCGCGTTGTTTCCGTGCAAGGGGGTGGAACTTAGGGACATTAACTTGACCTATGGGGGCAACAACTTGA
GGAATACGACCATTGTTTCTTCATGTTTGAATGCAAAAATTGAACATCATGGGATGCAGAACCCGCTGCCTTTGTTGTATAACATGCGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGCATTATAGCCCCCGGAAATAGTCCCAACACCGACAGAATGCACCTTAGCACCTCGAAATTGGTCACCATTTCTAACAGCGTCATTGGCACCGGTGACGACTGTGT
CTCTATTGGCCAAGGCTGTCAGAAAATCACTGTCACTAATATCACTTGCGGTCCTGGACATGGTATTAGTGTGGGAAGCTTGGGTAAGTATCCCAAAGAAAAGAGTGTCT
TCGGCGTTCTTGTGCAAAACTGCACCATTTTTAACACCACCAATGGAGCTAGAATCAAGACATGGGCTGGCACAGTGTCGGGGTCGGCCACAGGAATAATCTTTAATGAC
ATCGTAATGTACAACGTCAAATACCCCATAATCATCGATCAAACTTATGGCACAAAGAAGAACAAGGCTTCAAAGTGGAAGATCAGCGACGTTCACTTCAAGAACATCCG
CGGGACGGCGGTGACGAACGTGGCAGTGTTGTTGGAGTGCAGCGCGTTGTTTCCGTGCAAGGGGGTGGAACTTAGGGACATTAACTTGACCTATGGGGGCAACAACTTGA
GGAATACGACCATTGTTTCTTCATGTTTGAATGCAAAAATTGAACATCATGGGATGCAGAACCCGCTGCCTTTGTTGTATAACATGCGGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRIIAPGNSPNTDRMHLSTSKLVTISNSVIGTGDDCVSIGQGCQKITVTNITCGPGHGISVGSLGKYPKEKSVFGVLVQNCTIFNTTNGARIKTWAGTVSGSATGIIFND
IVMYNVKYPIIIDQTYGTKKNKASKWKISDVHFKNIRGTAVTNVAVLLECSALFPCKGVELRDINLTYGGNNLRNTTIVSSCLNAKIEHHGMQNPLPLLYNMR