; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg016083 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg016083
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionNAC domain-containing protein
Genome locationscaffold6:43797434..43798712
RNA-Seq ExpressionSpg016083
SyntenySpg016083
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003441 - NAC domain
IPR036093 - NAC domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB4310083.1 unnamed protein product [Prunus armeniaca]1.6e-2285.94Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKK+ASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

TKY70854.1 NAC domain-containing protein 7 [Spatholobus suberectus]1.2e-2287.5Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

XP_020419044.1 NAC domain-containing protein 7 [Prunus persica]1.6e-2285.94Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKK+ASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

XP_027361849.1 NAC domain-containing protein 7-like [Abrus precatorius]1.2e-2287.5Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

XP_034215877.1 NAC domain-containing protein 7 [Prunus dulcis]1.6e-2285.94Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKK+ASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251P549 NAC domain-containing protein7.6e-2385.94Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKK+ASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

A0A5E4FWY0 PREDICTED: NAC7.6e-2385.94Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKK+ASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

A0A6J5USY8 NAC domain-containing protein7.6e-2385.94Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKK+ASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

A0A6J5XC60 NAC domain-containing protein7.6e-2385.94Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKK+ASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

W9R240 NAC domain-containing protein 77.6e-2385.94Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT
        MNT SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKK+ASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE    + KIGT
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HYV5 NAC domain-containing protein 262.3e-2185.19Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        MN+ S VPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKKVASKRI++D+IKDVDLYKIEP DLQE
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

O65508 NAC domain-containing protein 762.9e-1985.42Show/hide
Query:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        VPPGFRFHPTDEEL+ YYLRKKVAS++IDLDVI+D+DLY+IEPWDLQE
Subjt:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

Q9FH59 NAC domain-containing protein 1056.4e-1981.25Show/hide
Query:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        +PPGFRFHPTDEEL+ YYL+KK+AS+RIDLDVI+++DLYKIEPWDLQE
Subjt:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

Q9FWX2 NAC domain-containing protein 73.3e-2387.04Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        MN+ SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKKVASKRI++D IKD+DLYKIEPWDLQE
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

Q9SL41 NAC domain-containing protein 373.7e-1983.33Show/hide
Query:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        VPPGFRFHPTDEEL+ YYLRKK+AS++IDLDVI+D+DLY+IEPWDLQE
Subjt:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12260.1 NAC 0072.3e-2487.04Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        MN+ SHVPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKKVASKRI++D IKD+DLYKIEPWDLQE
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

AT1G62700.1 Arabidopsis NAC domain containing protein 261.7e-2285.19Show/hide
Query:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        MN+ S VPPGFRFHPTDEEL+DYYLRKKVASKRI++D+IKDVDLYKIEP DLQE
Subjt:  MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

AT2G18060.1 vascular related NAC-domain protein 12.7e-2083.33Show/hide
Query:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        VPPGFRFHPTDEEL+ YYLRKK+AS++IDLDVI+D+DLY+IEPWDLQE
Subjt:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

AT4G36160.1 NAC domain containing protein 762.0e-2085.42Show/hide
Query:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        VPPGFRFHPTDEEL+ YYLRKKVAS++IDLDVI+D+DLY+IEPWDLQE
Subjt:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE

AT5G66300.1 NAC domain containing protein 1054.5e-2081.25Show/hide
Query:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE
        +PPGFRFHPTDEEL+ YYL+KK+AS+RIDLDVI+++DLYKIEPWDLQE
Subjt:  VPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATACAATTTCACATGTTCCTCCAGGCTTTAGATTTCATCCAACAGATGAAGAACTCATAGATTATTATTTGAGGAAAAAAGTTGCTTCAAAAAGGATTGATCTTGA
TGTCATCAAAGATGTTGATCTCTACAAAATTGAGCCATGGGATCTTCAAGAATGGGAGGTGAAGATCAAGAAGATTGGTACTTTTTCAGCCACAAAGATAAGAAGTATCC
AACAAGCACTCGAACTAATCGAGCTACAAAAGAAGGGTTTTGGAAGGCAACAGGAAGGGACAAAGCTATTTACTCTAGGCATGGACATGGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATACAATTTCACATGTTCCTCCAGGCTTTAGATTTCATCCAACAGATGAAGAACTCATAGATTATTATTTGAGGAAAAAAGTTGCTTCAAAAAGGATTGATCTTGA
TGTCATCAAAGATGTTGATCTCTACAAAATTGAGCCATGGGATCTTCAAGAATGGGAGGTGAAGATCAAGAAGATTGGTACTTTTTCAGCCACAAAGATAAGAAGTATCC
AACAAGCACTCGAACTAATCGAGCTACAAAAGAAGGGTTTTGGAAGGCAACAGGAAGGGACAAAGCTATTTACTCTAGGCATGGACATGGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNTISHVPPGFRFHPTDEELIDYYLRKKVASKRIDLDVIKDVDLYKIEPWDLQEWEVKIKKIGTFSATKIRSIQQALELIELQKKGFGRQQEGTKLFTLGMDMA