; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg016250 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg016250
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionthioredoxin-related transmembrane protein 2
Genome locationscaffold9:41425444..41431048
RNA-Seq ExpressionSpg016250
SyntenySpg016250
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008466069.1 PREDICTED: thioredoxin-related transmembrane protein 2 [Cucumis melo]1.9e-12292.31Show/hide
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XP_011652613.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X1 [Cucumis sativus]1.3e-12191.5Show/hide
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XP_022157869.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X2 [Momordica charantia]1.6e-11689.34Show/hide
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XP_031738425.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X2 [Cucumis sativus]4.3e-12291.53Show/hide
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XP_038897990.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 [Benincasa hispida]7.4e-12291.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEV3 Uncharacterized protein6.1e-12291.5Show/hide
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A0A1S3CQP7 thioredoxin-related transmembrane protein 29.4e-12392.31Show/hide
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A0A6J1DU44 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X17.7e-11789.34Show/hide
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A0A6J1DXS7 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X27.7e-11789.34Show/hide
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A0A6J1F6Q2 thioredoxin-related transmembrane protein 25.2e-11386.48Show/hide
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        YHLA WYVIVF GIYVFTQQPV+QGS TCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWL    VEFRVSFSA+CIR SRCLPEL+VTY+NKHLSFGVVDLGLFPNVA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TBU2 Thioredoxin-related transmembrane protein 23.0e-0925.14Show/hide
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        RE++ ++      M K  R  T E  + ++ +F KV    L   +D  +   Y+ +     +  + P++ G       +   ++  L    +K   W+  
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          VEF  ++S++C   +    +LS+ Y    L+FG VD+G + +V+ ++ +S      QLPT ILF+   E+ R P +D
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Q58E26 Thioredoxin-related transmembrane protein 22.7e-1027.48Show/hide
Query:  VTEPYYLSHFLAFFSYFVIRS--SASHILAYNITHILLC----RELQAILVFFIFYMFKMVRRETPEAFIADMLLFVKVFLVALASMMDYHLAFWYVIVF
        V++PYYL   L   S+ ++R    A  +L         C    RE++ ++      M K  R  T E  I ++ +F KV    L   +D  +   Y+ + 
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Query:  TGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVHSTVEFRVSFSANCIRSSRCLPELSVTYANKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFGISLGGSM
            +  + P++ G       +   LE  +      S  W+    VEF  ++S+ C   +    ELS+ Y    L FG VD+G +P V+ ++ IS     
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Query:  NQLPTYILFENAAEIARLPDLD
         QLPT ILF+   E+ R P +D
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Q6DFS0 Thioredoxin-related transmembrane protein 21.2e-1027.48Show/hide
Query:  VTEPYYLSHFLAFFSYFVIRS--SASHILAYNITHILLC----RELQAILVFFIFYMFKMVRRETPEAFIADMLLFVKVFLVALASMMDYHLAFWYVIVF
        V++PYYL   L   S+ ++R       +L         C    RE++ ++      M K  R  T E  I ++ +F KV    L   +D  +   Y+ + 
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Query:  TGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVHSTVEFRVSFSANCIRSSRCLPELSVTYANKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFGISLGGSM
            +  + P++ G       +   LE  L      S  W+    +EF  ++S+ C   +    ELS+ Y    L FG VD+G +P V+ ++ IS     
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         QLPT ILF+   EI R P +D
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Q6IQC7 Thioredoxin-related transmembrane protein 2-B1.4e-0925.7Show/hide
Query:  RELQAILVFFIFYMFKMVRRETPEAFIADMLLFVKVFLVALASMMDYHLAFWYVIVFTGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVH
        RE++ ++      M K  R  T E  + +++LF KV  V L   +D  L   Y+ +     +  + P++ G       +   ++  L + +  +  W+  
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Query:  STVEFRVSFSANCIRSSRCLPELSVTYANKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFGISLGGSMNQLPTYILFENAAEIARLPDLD
          VEF  ++S  C   +    +LS+ Y    L FG VD+G +  V++K+ +S      QLP+ +LF+   E+ R P +D
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Q7JW12 Thioredoxin-related transmembrane protein 2 homolog6.7e-0925.76Show/hide
Query:  MVTEPYYLSHFLAFFSYFVIRS-----SASHILA-YNITHILLCRELQAILVFFIFYMFKMVRRETPEA----FIADMLLFVKVFLVALASMMDYHLAFW
        ++ +PYY  + L   SY + +      +   ILA  +    L  RE++  ++FF+  +  +  R+T       ++A   L+ KV    L +  D+     
Subjt:  MVTEPYYLSHFLAFFSYFVIRS-----SASHILA-YNITHILLCRELQAILVFFIFYMFKMVRRETPEA----FIADMLLFVKVFLVALASMMDYHLAFW

Query:  YVIVFTGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTE--GNNKSRFWLVHSTVEFRVSFSANCIRSSRCLPELSVTYANKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFG
        ++++   + +   +P ++G      +T  +   +  E    +K   WL+     F   ++ +C+  +    ELS  Y   HL FG +D+G FP+VA+K+ 
Subjt:  YVIVFTGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTE--GNNKSRFWLVHSTVEFRVSFSANCIRSSRCLPELSVTYANKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFG

Query:  ISLGGSMNQLPTYILFENAAEIARLPDLD
        IS      QLPT ILF+   E  R P +D
Subjt:  ISLGGSMNQLPTYILFENAAEIARLPDLD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G11640.1 Thioredoxin superfamily protein8.3e-6354.08Show/hide
Query:  EWLNLMVTEPYYLSHFLAFFSYFVIRSSASHILAYNITHILLCRELQAILVFFIFYMFKMVRRETPEAFIADMLLFVKVFLVALASMMDYHLAFWYVIVF
        E ++ +V++PYY  HF+AFFSY  IRSSA    A   +H L  RE+QA L F +F   KMVR ET EAF+AD LL+ K+FL+A++ +MDY +A W+ I+F
Subjt:  EWLNLMVTEPYYLSHFLAFFSYFVIRSSASHILAYNITHILLCRELQAILVFFIFYMFKMVRRETPEAFIADMLLFVKVFLVALASMMDYHLAFWYVIVF

Query:  TGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVHSTVEFRVSFSANCIRSSRCLPELSVTYANKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFGISLGGSM
        + IY+  QQP F   GT  KLTP+QLE LL++GN  +++WL    +EF    S+ C+RSSRC PELS+TY+N  LSFG VDLGLFPN A KFGISL G M
Subjt:  TGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVHSTVEFRVSFSANCIRSSRCLPELSVTYANKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFGISLGGSM

Query:  NQLPTYILFENAAEIARLPDLDFELKAYPPITK
        +QLPTYILFE   E++R PD   +     PITK
Subjt:  NQLPTYILFENAAEIARLPDLDFELKAYPPITK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCGATAGAAAGAAGGAGCAGAGCAACTTTCGACCGGGGGAGTGGCTGAATCTAATGGTGACAGAGCCCTATTATCTCTCTCATTTTCTAGCCTTCTTTTCCTATTT
TGTAATTCGAAGTTCCGCAAGTCATATCCTCGCCTATAACATCACACATATTCTCCTTTGCCGGGAGCTGCAAGCGATTCTGGTCTTTTTTATTTTCTACATGTTTAAGA
TGGTGAGAAGAGAGACGCCAGAGGCCTTTATTGCCGATATGCTGTTGTTTGTTAAGGTTTTTCTCGTTGCTCTCGCTTCTATGATGGATTATCACCTTGCATTTTGGTAT
GTAATCGTGTTTACAGGGATATACGTTTTTACTCAACAACCCGTCTTCCAAGGATCAGGTACCTGCAGTAAGTTAACTCCATTGCAGTTGGAATCCTTGCTGACTGAGGG
GAACAACAAGTCAAGATTCTGGCTGGTTCATTCTACAGTAGAATTTCGGGTATCCTTCTCAGCTAATTGCATACGTTCAAGTCGATGCTTGCCTGAGCTATCAGTTACAT
ATGCAAACAAACATCTATCATTTGGAGTAGTTGATCTTGGGCTCTTTCCAAATGTTGCTGAAAAGTTTGGAATATCACTGGGTGGAAGTATGAACCAGCTTCCTACCTAT
ATCTTATTTGAGAATGCAGCTGAGATTGCTCGCCTTCCAGATTTGGATTTTGAATTAAAAGCATACCCTCCAATAACCAAGGTCACTGGGGCTCCTGTAAAGTTGTATAC
TGATACTGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTCGATAGAAAGAAGGAGCAGAGCAACTTTCGACCGGGGGAGTGGCTGAATCTAATGGTGACAGAGCCCTATTATCTCTCTCATTTTCTAGCCTTCTTTTCCTATTT
TGTAATTCGAAGTTCCGCAAGTCATATCCTCGCCTATAACATCACACATATTCTCCTTTGCCGGGAGCTGCAAGCGATTCTGGTCTTTTTTATTTTCTACATGTTTAAGA
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