CuGenDBv2

Gene ID	Spg016364
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	ARM repeat superfamily protein
Genome location	scaffold9:37977905..37990866
RNA-Seq Expression	Spg016364
Synteny	Spg016364
Gene Ontology terms	GO:0043248 - proteasome assembly (biological process)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6607893.1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7037420.1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.0e-264

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XP_022940916.1 uncharacterized protein LOC111446360 [Cucurbita moschata]

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XP_022981236.1 uncharacterized protein LOC111480433 [Cucurbita maxima]

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XP_023525525.1 uncharacterized protein LOC111789113 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A0A0L246 Uncharacterized protein

1.9e-248

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A0A1S3CKC0 uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1

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        Q LSSIISN SAESILRSRAMVI GRLLSKENIFSLVDESCVR LI+A+D ILGSSEG+DV+V E+A EALGQIGSS WGATLLLSSFPTCVKH I  AF
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A0A6J1CFN3 uncharacterized protein LOC111010386 isoform X1

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80.92

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        RVRVMALVVKLFSVS SVASA+ NSNLL+LLESEINNSNDTLVTLSVLELLYE                              LVEIEHGTKFLPRTS L
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Query:  QQLSSIISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDESCVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAF
        Q LSSIISN S ESILRSRAMVISGRLLSKEN++ LVDESCVRILI+AIDE LGSSEGQDV+VCESAFEALGQIGS+  GATLLLSSF TCVK +I+AAF
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Query:  DRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMMPSGFFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVSRPWCLMEICSKQDIINIVT
        DRHEHGKQLAAMHALGNI GETRSENDIMLND AEENLRDL+YQIASRSSK+MPSG FLAVLQQDSEIRLASYRMITGLV+RPWCLMEICSKQ+IINIVT
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Query:  DASTETTKIVSSRFVWSRFFVCFLLGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLSRRNLETQPAVMTAERF
        DASTETTKI                GMEARYNCC+AIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYL+RRN ETQPAVMTAERF
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A0A6J1FJQ7 uncharacterized protein LOC111446360

1.4e-259

82.96

Show/hide

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        MEEFAVDDPTQLLEAAADFANYPGVRTDASVKEF +RFPLPV+IN                ALQ KAE PGLENTLVACLDRIFKTK+GASLIPH+MPFV
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Query:  QVGLRADSQTIRSLACKTVTRLLEESDETAHLAVQLILDYNIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEIIFPANKTEATHLGTVASTCSSLG
        QVGL+ADSQ +RSLACKTVTRLLEE+D T  LA QLI+DYNIYPLL+ECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEIIFP NKTEATHLGTVASTCSSLG
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Query:  RVRVMALVVKLFSVSSSVASAVCNSNLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYEVYHLLFPDYFGLIMQEKSLWSVIVHYVNEVLVEIEHGTKFLPRTSFL
        RVRVMAL+VKLFSVSSSVASAV NSNLL+LLESEI+NSNDTLVTLSVLELLYE                              LVEIEHGT FLPRTSFL
Subjt:  RVRVMALVVKLFSVSSSVASAVCNSNLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYEVYHLLFPDYFGLIMQEKSLWSVIVHYVNEVLVEIEHGTKFLPRTSFL

Query:  QQLSSIISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDESCVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAF
        Q LSSIISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDESCVRILI+AIDEILGSSEGQDV+VCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSS+PTCVK+VINAAF
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Query:  DRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMMPSGFFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVSRPWCLMEICSKQDIINIVT
        DRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQ ASRS KM PSG  LAVLQQDSEIRLASYRMITGLV+RPWCLMEICSKQDIINIV+
Subjt:  DRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMMPSGFFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVSRPWCLMEICSKQDIINIVT

Query:  DASTETTKIVSSRFVWSRFFVCFLLGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLSRRNLETQPAVMTAERF
        DASTETTKI                GMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAV+NGPYLSRR LETQPA+MTAERF
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A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC111480433

3.9e-257

82.11

Show/hide

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        MEEFAVDDPTQLLEAAADFANYPGVRTD SVKEF +RFPLPV+IN                ALQ KAE PGLENTLVACLDRIFKTK+GASLIPH+MPFV
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Query:  QVGLRADSQTIRSLACKTVTRLLEESDETAHLAVQLILDYNIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEIIFPANKTEATHLGTVASTCSSLG
        QVGL+ADSQ +RSLACKTVTRLLEE+D T  LA QLI+DYNIYPLL+ECLLNGNEQVANSSMDA+KKLAAFPKGMEIIFP NKTEATHLGTVASTCSSLG
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Query:  RVRVMALVVKLFSVSSSVASAVCNSNLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYEVYHLLFPDYFGLIMQEKSLWSVIVHYVNEVLVEIEHGTKFLPRTSFL
        RVRVMAL+VKLFSVSSSVASAV NSNLL+LLESEI+NSNDTLVTLSVLELLYE                              LVEIEHGT FLPRTSFL
Subjt:  RVRVMALVVKLFSVSSSVASAVCNSNLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYEVYHLLFPDYFGLIMQEKSLWSVIVHYVNEVLVEIEHGTKFLPRTSFL

Query:  QQLSSIISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDESCVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAF
        Q LSSIISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDESCVRILI++IDEILGSSEGQDV+VCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSS+PTCVK+VINAAF
Subjt:  QQLSSIISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDESCVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAF

Query:  DRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMMPSGFFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVSRPWCLMEICSKQDIINIVT
        DRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENL DLIYQ ASRS K+ PSG  LAVLQQDSEIRLASYRMITGLV+RPWCLMEICSKQDIINIV+
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Query:  DASTETTKIVSSRFVWSRFFVCFLLGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLSRRNLETQPAVMTAERF
        DASTETTKI                GMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAV+NGPYLSRR LETQPA+MTAERF
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein

3.3e-152

50.69

Show/hide

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        ++D  QL +AA +FA+YPG + + SVKEFL+RFPLPVI N                ALQT  + PG ENTLV CL+R+FKTK+GASLIP +MP +QVGL+
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Query:  ADSQTIRSLACKTVTRLLEESDETAHLAVQLILDYNIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEIIFPANKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVM
        ADS  ++SLACKTV  LLE+ D     +VQL+++  IYPLLL+ ++N +++VAN++ + IK LA FP  M +IFP+   + THL  +A+ CSSL RVRV+
Subjt:  ADSQTIRSLACKTVTRLLEESDETAHLAVQLILDYNIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEIIFPANKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVM

Query:  ALVVKLFSVSSSVASAVCNSNLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYEVYHLLFPDYFGLIMQEKSLWSVIVHYVNEVLVEIEHGTKFLPRTSFLQQLSS
        +L+VKLFS+S  VAS V  S LL LLE+E+  + DTLV L+VLEL YE                              L+E+EH ++F+P+TS +Q L S
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Query:  IISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDESCVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAFDRHEH
        IIS  S     + RAM+ISGRLLSKENI+ +V+E+ V+ LI+AID  L S E  D D  E+A +ALGQ+GS+  GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ H
Subjt:  IISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDESCVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAFDRHEH

Query:  GKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMMPSGFFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVSRPWCLMEICSKQDIINIVTDASTE
        GKQLAA+HAL NI GETR +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K+ PSG FL+VLQQ SEIRLA YR +T LV+RPWCL+EI +K++IINIVTDA+TE
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Query:  TTKIVSSRFVWSRFFVCFLLGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLSRRNLETQPAVMTAERF
        T KI                 MEARYNCC AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+GPY+S+++   +P VMT E F
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AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein

2.2e-148

48.21

Show/hide

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        ++D  QL +AA +FA+YPG + + SVKEFL+RFPLPVI N                ALQT  + PG ENTLV CL+R+FKTK+GASLIP +MP +QVGL+
Subjt:  VDDPTQLLEAAADFANYPGVRTDASVKEFLNRFPLPVIINGCQFSFVTWAIFSSASALQTKAEFPGLENTLVACLDRIFKTKFGASLIPHFMPFVQVGLR

Query:  ADSQTIRSLACKTVTRLLEESDETAHLAVQLILDYNIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEIIFPANKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVM
        ADS  ++SLACKTV  LLE+ D     +VQL+++  IYPLLL+ ++N +++VAN++ + IK LA FP  M +IFP+   + THL  +A+ CSSL RVRV+
Subjt:  ADSQTIRSLACKTVTRLLEESDETAHLAVQLILDYNIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEIIFPANKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVM

Query:  ALVVKLFSVSSSVASAVCNSNLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYEVYHLLFPDYFGLIMQEKSLWSVIVHYVNEVLVEIEHGTKFLPRTSFLQQLSS
        +L+VKLFS+S  VAS V  S LL LLE+E+  + DTLV L+VLEL YE                              L+E+EH ++F+P+TS +Q L S
Subjt:  ALVVKLFSVSSSVASAVCNSNLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYEVYHLLFPDYFGLIMQEKSLWSVIVHYVNEVLVEIEHGTKFLPRTSFLQQLSS

Query:  IISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDES--------------------------------CVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQ
        IIS  S     + RAM+ISGRLLSKENI+ +V+E+                                CV+ LI+AID  L S E  D D  E+A +ALGQ
Subjt:  IISNRSAESILRSRAMVISGRLLSKENIFSLVDES--------------------------------CVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQ

Query:  IGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMMPSGFFLAVLQQDSEIRLASY
        +GS+  GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI GETR +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K+ PSG FL+VLQQ SEIRLA Y
Subjt:  IGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMMPSGFFLAVLQQDSEIRLASY

Query:  RMITGLVSRPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIVSSRFVWSRFFVCFLLGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLSRR
        R +T LV+RPWCL+EI +K++IINIVTDA+TET KI                 MEARYNCC AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+GPY+S++
Subjt:  RMITGLVSRPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIVSSRFVWSRFFVCFLLGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLSRR

Query:  NLETQPAVMTAERF
        +   +P VMT E F
Subjt:  NLETQPAVMTAERF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGAATTTGCTGTGGATGATCCGACTCAGCTCCTCGAAGCAGCTGCAGACTTCGCAAATTATCCCGGTGTTCGGACCGATGCGTCGGTGAAGGAATTTCTCAACCG
CTTCCCCCTTCCCGTCATCATCAATGGTTGTCAGTTTTCTTTTGTGACTTGGGCTATTTTTTCTTCTGCAAGTGCTTTACAAACGAAAGCAGAATTTCCTGGTTTGGAGA
ACACTTTGGTCGCATGTCTCGACAGGATATTCAAAACTAAGTTTGGTGCTTCTCTTATACCACATTTTATGCCTTTTGTACAGGTTGGACTACGAGCAGATTCTCAAACA
ATTAGAAGCTTAGCTTGTAAAACGGTCACTCGCCTTTTGGAGGAGTCCGATGAGACTGCTCATTTGGCCGTACAACTGATTCTTGACTATAACATCTATCCACTTTTGCT
CGAGTGCCTTCTTAATGGTAACGAACAAGTTGCTAACTCATCAATGGATGCAATAAAGAAATTGGCTGCATTTCCAAAGGGGATGGAAATCATCTTCCCAGCAAATAAAA
CGGAAGCAACACACCTTGGAACTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGGGAAGAGTTCGAGTTATGGCTTTGGTAGTGAAACTGTTTTCGGTTTCTAGCTCTGTAGCATCG
GCAGTATGCAATTCAAATTTATTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAACAACTCAAACGACACACTTGTAACTTTAAGCGTGCTGGAACTCTTGTATGAGGTTTACCATCT
CTTATTCCCTGACTACTTTGGTTTGATCATGCAAGAAAAATCATTATGGTCAGTCATTGTACATTACGTCAATGAAGTGTTAGTGGAGATTGAACATGGTACAAAGTTTT
TGCCAAGGACCAGCTTTCTCCAACAACTAAGCTCTATAATCAGCAACCGATCTGCTGAGTCTATTTTAAGATCAAGAGCAATGGTCATTAGTGGAAGACTTTTGTCCAAA
GAGAATATTTTCTCGCTCGTAGATGAATCTTGTGTACGAATTTTAATAACTGCTATAGATGAAATTCTTGGGTCATCGGAAGGTCAGGATGTAGATGTATGTGAATCTGC
ATTTGAAGCACTGGGTCAAATAGGGTCAAGCAAATGGGGAGCCACTTTACTGCTGTCAAGTTTTCCGACTTGTGTGAAGCATGTAATTAATGCAGCTTTTGATCGGCATG
AACATGGTAAACAGCTGGCAGCTATGCATGCTCTTGGTAACATCTTTGGAGAAACTCGATCTGAGAATGATATTATGCTGAATGATAATGCCGAAGAAAATTTACGGGAC
TTGATATATCAAATTGCATCCAGAAGTTCAAAAATGATGCCATCAGGCTTTTTTCTAGCTGTCCTTCAACAGGATTCTGAGATTCGCTTGGCGAGTTATAGAATGATTAC
TGGGTTGGTCTCTCGACCTTGGTGCCTTATGGAAATCTGCTCGAAACAAGACATAATAAATATAGTGACTGATGCAAGTACCGAGACTACAAAAATAGTCTCTTCCCGTT
TTGTTTGGTCTAGATTTTTTGTTTGTTTTCTTTTAGGAATGGAAGCTAGATATAACTGTTGTTTGGCTATCCACAAGGCCTTCATGTCTTCAACTAGACTTACTGGCGAT
CCTGCTCTTGCTGGAATAGCCTCGAAGTTGCAGGAAGCTGTAAGAAATGGTCCATATCTTAGTAGAAGGAATCTTGAAACTCAACCAGCAGTAATGACAGCTGAAAGATT
TTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEEFAVDDPTQLLEAAADFANYPGVRTDASVKEFLNRFPLPVIINGCQFSFVTWAIFSSASALQTKAEFPGLENTLVACLDRIFKTKFGASLIPHFMPFVQVGLRADSQT
IRSLACKTVTRLLEESDETAHLAVQLILDYNIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEIIFPANKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVAS
AVCNSNLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYEVYHLLFPDYFGLIMQEKSLWSVIVHYVNEVLVEIEHGTKFLPRTSFLQQLSSIISNRSAESILRSRAMVISGRLLSK
ENIFSLVDESCVRILITAIDEILGSSEGQDVDVCESAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVKHVINAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGETRSENDIMLNDNAEENLRD
LIYQIASRSSKMMPSGFFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVSRPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIVSSRFVWSRFFVCFLLGMEARYNCCLAIHKAFMSSTRLTGD
PALAGIASKLQEAVRNGPYLSRRNLETQPAVMTAERF

Spg016364 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome