; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg017097 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg017097
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionprefoldin subunit 1-like
Genome locationscaffold4:39429105..39433092
RNA-Seq ExpressionSpg017097
SyntenySpg017097
Gene Ontology termsGO:0006457 - protein folding (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016272 - prefoldin complex (cellular component)
GO:0044183 - protein folding chaperone (molecular function)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002777 - Prefoldin beta-like
IPR009053 - Prefoldin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586128.1 Prefoldin subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-2293.55Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+ANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQ+Q+RNKEGEKKRAFLTLEELKQLS+DTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
XP_022929581.1 prefoldin subunit 1-like [Cucurbita moschata]1.4e-2398.39Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLS+DTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
XP_022966081.1 prefoldin subunit 1 [Cucurbita maxima]1.6e-2293.55Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+ANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQ+Q+RNKEGEKKRAFLTLEELKQLS+DTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
XP_023536940.1 prefoldin subunit 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-2293.55Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+ANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQ+Q+RNKEGEKKRAFLTLEELKQLS+DTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
XP_023546624.1 prefoldin subunit 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-2398.39Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLS+DTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJF7 Uncharacterized protein3.8e-2291.94Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+ NRATFLEIQGRMIEITGKLKQ+QTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQL+EDTN YKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
A0A6J1D9I1 prefoldin subunit 13.8e-2291.94Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+ANR  FLEIQGRMIE+TGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEEL+QLSEDTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
A0A6J1ENI7 prefoldin subunit 1-like7.0e-2498.39Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLS+DTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
A0A6J1FB94 prefoldin subunit 1-like7.7e-2393.55Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+ANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQ+Q+RNKEGEKKRAFLTLEELKQLS+DTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
A0A6J1HND5 prefoldin subunit 17.7e-2393.55Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+ANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQ+Q+RNKEGEKKRAFLTLEELKQLS+DTNAYKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07340.1 PREFOLDIN 13.5e-2074.19Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+A RA F+EIQ  MIE+TGKLKQVQ Q+RNKEG++KRAFLTLEEL+ L E+TN YKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
AT2G07340.2 PREFOLDIN 13.5e-2074.19Show/hide
Query:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG
        MAD+A RA F+EIQ  MIE+TGKLKQVQ Q+RNKEG++KRAFLTLEEL+ L E+TN YKSIG
Subjt:  MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGACGACGCGAACAGAGCTACTTTCTTGGAAATTCAAGGTCGCATGATTGAGATTACTGGAAAGCTCAAGCAGGTGCAGACACAGATACGAAACAAGGAGGGAGA
AAAGAAGCGCGCTTTTTTAACCTTGGAGGAACTTAAGCAGTTGTCTGAAGACACTAATGCATACAAATCTATAGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGACGACGCGAACAGAGCTACTTTCTTGGAAATTCAAGGTCGCATGATTGAGATTACTGGAAAGCTCAAGCAGGTGCAGACACAGATACGAAACAAGGAGGGAGA
AAAGAAGCGCGCTTTTTTAACCTTGGAGGAACTTAAGCAGTTGTCTGAAGACACTAATGCATACAAATCTATAGGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADDANRATFLEIQGRMIEITGKLKQVQTQIRNKEGEKKRAFLTLEELKQLSEDTNAYKSIG