; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg017223 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg017223
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionCyclic nucleotide-gated channel 5
Genome locationscaffold4:43233405..43236865
RNA-Seq ExpressionSpg017223
SyntenySpg017223
Gene Ontology termsGO:0071805 - potassium ion transmembrane transport (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005249 - voltage-gated potassium channel activity (molecular function)
GO:0030552 - cAMP binding (molecular function)
GO:0030553 - cGMP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005821 - Ion transport domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586053.1 putative cyclic nucleotide-gated ion channel 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.9e-10696.63Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCG NIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISC LAISVDPLFFYVPVINQ S+CLGIDRKLAITVTTLRT+IDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

XP_004144729.1 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5 isoform X1 [Cucumis sativus]5.8e-10796.63Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKK+IFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISCILA+SVDPLFFYVPVINQ+SNCLGID+KLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFI+DLV
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

XP_022158175.1 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5 [Momordica charantia]4.9e-10696.15Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSD GMRRCGFNIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISCILA+SVDPLFFYVPVIN+ SNCLGIDRKLAI VTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDL+
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

XP_022938012.1 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5 [Cucurbita moschata]4.9e-10696.63Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCG NIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISC LAISVDPLFFYVPVINQ S+CLGIDRKLAITVTTLRT+IDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

XP_023537311.1 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.9e-10696.63Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCG NIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISC LAISVDPLFFYVPVINQ S+CLGIDRKLAITVTTLRT+IDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJ35 Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein2.8e-10796.63Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKK+IFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISCILA+SVDPLFFYVPVINQ+SNCLGID+KLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFI+DLV
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

A0A1S3BVZ5 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 51.5e-10594.71Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHG++KPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKK+IFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISCI A+SVDPLFFYVPVIN++SNCLGID+KLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFI+DL+
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

A0A6J1DV33 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 52.4e-10696.15Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSD GMRRCGFNIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISCILA+SVDPLFFYVPVIN+ SNCLGIDRKLAI VTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDL+
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

A0A6J1FCT8 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 52.4e-10696.63Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCG NIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISC LAISVDPLFFYVPVINQ S+CLGIDRKLAITVTTLRT+IDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

A0A6J1I302 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 56.9e-10696.15Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
        SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSG+RRCG NIDGFNRAVHG+DKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLL

Query:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
        FLNKLFVISC LAISVDPLFFYVPVINQ S+CLGIDRKLAITVTTLRT+IDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV
Subjt:  FLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLV

Query:  SVLPLPQV
        SVLPLPQ+
Subjt:  SVLPLPQV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82226 Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 62.6e-7871.29Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGF-NRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLL
        SQ++ GQRE FVRLD +DSR S  S++G+ +C  NI G   R   GS   SGSFK+G RKGSEGL SIGRS+  GVSRAVFPEDL+ S+KKIFDPQDK L
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGF-NRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLL

Query:  LFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDL
        L  NKLFV SCILA+SVDPLF Y+P IN  + C+GIDRKLAI VTT+RT+ID FYL HMAL+FRTAY+APSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYL++YFIIDL
Subjt:  LFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDL

Query:  VSVLPLPQV
        +SVLP+PQ+
Subjt:  VSVLPLPQV

Q8RWS9 Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 51.4e-7672.2Show/hide
Query:  MGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLLFLN
        M G+RE FVR+DDLDSRL S S +  +    N  G    +H S++ S SFK+G++KGS+GLKSIGRSL FGV RAVFPEDLK S+KKIFDPQDK LL+ N
Subjt:  MGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLLFLN

Query:  KLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVL
        KLFV SCIL++ VDP FFY+PVIN  S CLGIDRKLAIT +TLRT IDVFYL HMALQ RTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYL+R+FIID +SVL
Subjt:  KLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVL

Query:  PLPQV
        PLPQ+
Subjt:  PLPQV

Q9FXH6 Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 81.5e-7066.67Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSD-SGM-RRCGFNIDGFNRAVHGSDK---PSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQ
        SQ + G REKFVRLDD DSR+S  S+ +GM +R  F +  FN    G  K    S SF+ G++ GSEGLK+IG+S   GV+RAVFPEDL+ S+KKIFDPQ
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSD-SGM-RRCGFNIDGFNRAVHGSDK---PSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQ

Query:  DKLLLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYF
        DK LL  N++FVISCILA+SVDPLFFY+P+++ + NC+GID KLA+T TTLRTIIDVFYL  MALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPA+IA+RYL RYF
Subjt:  DKLLLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYF

Query:  IIDLVSVLPLPQV
        I+D ++VLPLPQ+
Subjt:  IIDLVSVLPLPQV

Q9M0A4 Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 92.9e-7769.52Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNR--AVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKL
        SQ++ G+ EKFVRLD +DSR S  SD+G+ RC  N+ G  R     G++  SGSFK+G RKGS+GL SIGRS+  GVSRAVFPEDLK S+KKIFDPQDK 
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNR--AVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKL

Query:  LLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIID
        LL  NKLFV SCILA+SVDPLF Y+P +  N  C+GIDRKLAI  TTLRT+ID FYL HMAL+FRTA++APSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYL++YFIID
Subjt:  LLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIID

Query:  LVSVLPLPQV
         +SVLPLPQ+
Subjt:  LVSVLPLPQV

Q9S9N5 Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 78.8e-6665.09Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSD--KPSGSFKRGMRK-GSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDK
        SQ + GQREKFVRLDD+DS  S  +   M+R   N  GFN    G +  K S SF+ G++K  SEGL +IG+S    V+RAVFPEDL+ ++KKIFDPQDK
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSD--KPSGSFKRGMRK-GSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDK

Query:  LLLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVI-NQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFI
         LL  N+LFVISCILA+SVDPLFFY+P++ N  S+C+GID KLA+T TTLRTI+DVFYL  MALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPA+IA+RYL RYF+
Subjt:  LLLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVI-NQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFI

Query:  IDLVSVLPLPQV
        +D ++VLPLPQ+
Subjt:  IDLVSVLPLPQV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G23980.1 cyclic nucleotide-gated channel 61.9e-7971.29Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGF-NRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLL
        SQ++ GQRE FVRLD +DSR S  S++G+ +C  NI G   R   GS   SGSFK+G RKGSEGL SIGRS+  GVSRAVFPEDL+ S+KKIFDPQDK L
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGF-NRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLL

Query:  LFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDL
        L  NKLFV SCILA+SVDPLF Y+P IN  + C+GIDRKLAI VTT+RT+ID FYL HMAL+FRTAY+APSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYL++YFIIDL
Subjt:  LFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDL

Query:  VSVLPLPQV
        +SVLP+PQ+
Subjt:  VSVLPLPQV

AT4G30560.1 cyclic nucleotide gated channel 92.1e-7869.52Show/hide
Query:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNR--AVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKL
        SQ++ G+ EKFVRLD +DSR S  SD+G+ RC  N+ G  R     G++  SGSFK+G RKGS+GL SIGRS+  GVSRAVFPEDLK S+KKIFDPQDK 
Subjt:  SQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNR--AVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKL

Query:  LLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIID
        LL  NKLFV SCILA+SVDPLF Y+P +  N  C+GIDRKLAI  TTLRT+ID FYL HMAL+FRTA++APSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYL++YFIID
Subjt:  LLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIID

Query:  LVSVLPLPQV
         +SVLPLPQ+
Subjt:  LVSVLPLPQV

AT4G30560.2 cyclic nucleotide gated channel 92.2e-7270.1Show/hide
Query:  LDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNR--AVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLLFLNKLFVISCILAI
        +DSR S  SD+G+ RC  N+ G  R     G++  SGSFK+G RKGS+GL SIGRS+  GVSRAVFPEDLK S+KKIFDPQDK LL  NKLFV SCILA+
Subjt:  LDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNR--AVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLLFLNKLFVISCILAI

Query:  SVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVLPLPQV
        SVDPLF Y+P +  N  C+GIDRKLAI  TTLRT+ID FYL HMAL+FRTA++APSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYL++YFIID +SVLPLPQ+
Subjt:  SVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVLPLPQV

AT5G57940.1 cyclic nucleotide gated channel 51.0e-7772.2Show/hide
Query:  MGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLLFLN
        M G+RE FVR+DDLDSRL S S +  +    N  G    +H S++ S SFK+G++KGS+GLKSIGRSL FGV RAVFPEDLK S+KKIFDPQDK LL+ N
Subjt:  MGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLLFLN

Query:  KLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVL
        KLFV SCIL++ VDP FFY+PVIN  S CLGIDRKLAIT +TLRT IDVFYL HMALQ RTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYL+R+FIID +SVL
Subjt:  KLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVL

Query:  PLPQV
        PLPQ+
Subjt:  PLPQV

AT5G57940.2 cyclic nucleotide gated channel 51.0e-7772.2Show/hide
Query:  MGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLLFLN
        M G+RE FVR+DDLDSRL S S +  +    N  G    +H S++ S SFK+G++KGS+GLKSIGRSL FGV RAVFPEDLK S+KKIFDPQDK LL+ N
Subjt:  MGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKLLLFLN

Query:  KLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVL
        KLFV SCIL++ VDP FFY+PVIN  S CLGIDRKLAIT +TLRT IDVFYL HMALQ RTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYL+R+FIID +SVL
Subjt:  KLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVL

Query:  PLPQV
        PLPQ+
Subjt:  PLPQV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTTTTCTCTCAGCGTTCGTTGAGAGTCCCATGTCACAACTGATGGGTGGTCAACGAGAAAAGTTCGTGAGGTTGGATGACTTGGACTCTAGATTGTCATCCCCATC
AGATAGTGGAATGAGAAGATGTGGTTTTAATATAGATGGATTTAACCGTGCAGTCCATGGAAGTGATAAGCCATCTGGATCCTTTAAGAGAGGAATGAGAAAAGGGTCCG
AAGGACTTAAATCAATCGGCCGATCACTCAAGTTTGGGGTTTCTCGAGCTGTATTTCCAGAGGATCTTAAAGAGTCAAAGAAGAAGATCTTTGATCCTCAAGACAAATTG
CTCTTATTTTTGAATAAACTTTTTGTCATATCATGTATTTTGGCAATATCTGTGGACCCACTATTCTTTTATGTTCCTGTCATTAACCAAAACTCAAACTGTCTTGGCAT
TGATAGAAAGCTGGCAATTACAGTGACAACATTGCGGACAATTATTGATGTTTTCTATCTTATTCATATGGCTCTCCAATTCCGGACAGCTTATATTGCTCCATCATCTC
GGGTGTTTGGGAGAGGTGAACTTGTGATTGATCCTGCACAAATAGCAAAGCGATACTTGCGGCGGTATTTCATCATTGATTTGGTGTCTGTGCTGCCTCTTCCACAGGTT
TATAAACACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATTTTTCTCTCAGCGTTCGTTGAGAGTCCCATGTCACAACTGATGGGTGGTCAACGAGAAAAGTTCGTGAGGTTGGATGACTTGGACTCTAGATTGTCATCCCCATC
AGATAGTGGAATGAGAAGATGTGGTTTTAATATAGATGGATTTAACCGTGCAGTCCATGGAAGTGATAAGCCATCTGGATCCTTTAAGAGAGGAATGAGAAAAGGGTCCG
AAGGACTTAAATCAATCGGCCGATCACTCAAGTTTGGGGTTTCTCGAGCTGTATTTCCAGAGGATCTTAAAGAGTCAAAGAAGAAGATCTTTGATCCTCAAGACAAATTG
CTCTTATTTTTGAATAAACTTTTTGTCATATCATGTATTTTGGCAATATCTGTGGACCCACTATTCTTTTATGTTCCTGTCATTAACCAAAACTCAAACTGTCTTGGCAT
TGATAGAAAGCTGGCAATTACAGTGACAACATTGCGGACAATTATTGATGTTTTCTATCTTATTCATATGGCTCTCCAATTCCGGACAGCTTATATTGCTCCATCATCTC
GGGTGTTTGGGAGAGGTGAACTTGTGATTGATCCTGCACAAATAGCAAAGCGATACTTGCGGCGGTATTTCATCATTGATTTGGTGTCTGTGCTGCCTCTTCCACAGGTT
TATAAACACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIFLSAFVESPMSQLMGGQREKFVRLDDLDSRLSSPSDSGMRRCGFNIDGFNRAVHGSDKPSGSFKRGMRKGSEGLKSIGRSLKFGVSRAVFPEDLKESKKKIFDPQDKL
LLFLNKLFVISCILAISVDPLFFYVPVINQNSNCLGIDRKLAITVTTLRTIIDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPAQIAKRYLRRYFIIDLVSVLPLPQV
YKH